LOCUS CAR56282.1 2775 aa PRT BCT 06-FEB-2015
DEFINITION Burkholderia cenocepacia J2315 putative haemagglutinin-
related autotransporter protein protein.
ACCESSION AM747721-2429
PROTEIN_ID CAR56282.1
SOURCE Burkholderia cenocepacia J2315
ORGANISM Burkholderia cenocepacia J2315
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales;
Burkholderiaceae; Burkholderia; Burkholderia cepacia complex.
REFERENCE 1 (bases 1 to 3217062)
AUTHORS Holden M.T.G.
JOURNAL Submitted (20-JUN-2007) to the INSDC. Holden M.T.G., The Pathogen
Sequencing Unit, The Wellcome Trust Sanger Institute, The Wellcome
Trust Genome Campus, CB10 1SA, UNITED KINGDOM.
REFERENCE 2
AUTHORS Holden M.T., Seth-Smith H.M., Crossman L.C., Sebaihia M.,
Bentley S.D., Cerdeno-Tarraga A.M., Thomson N.R., Bason N.,
Quail M.A., Sharp S., Cherevach I., Churcher C., Goodhead I.,
Hauser H., Holroyd N., Mungall K., Scott P., Walker D., White B.,
Rose H., Iversen P., Mil-Homens D., Rocha E.P., Fialho A.M.,
Baldwin A., Dowson C., Barrell B.G., Govan J.R., Vandamme P.,
Hart C.A., Mahenthiralingam E., Parkhill J.
TITLE The genome of Burkholderia cenocepacia J2315, an epidemic pathogen
of cystic fibrosis patients
JOURNAL J. Bacteriol. 191(1), 261-277(2009).
PUBMED 18931103
FEATURES Qualifiers
source /organism="Burkholderia cenocepacia J2315"
/chromosome="2"
/strain="J2315"
/mol_type="genomic DNA"
/geo_loc_name="United Kingdom:Edinburgh"
/isolation_source="cystic fibrosis patient"
/note="representative of the ET12 epidemic lineage"
/db_xref="taxon:216591"
protein /transl_table=11
/locus_tag="BCAM2418"
/note="This CDS is highly repetitive and contains a
C-terminal YadA domain, althought the hit is before the
PFam gathering threshold."
/db_xref="EnsemblGenomes-Gn:BCAM2418"
/db_xref="EnsemblGenomes-Tr:CAR56282"
/db_xref="GOA:B4EI37"
/db_xref="InterPro:IPR008635"
/db_xref="InterPro:IPR008640"
/db_xref="InterPro:IPR011049"
/db_xref="InterPro:IPR024973"
/db_xref="UniProtKB/TrEMBL:B4EI37"
BEGIN
1 MNRTYRSIWN EALGAWVAAS EHDSARGKPN KSAVTAAVLA AVAMLPSLAG ANTFVPGTTN
61 GSQFTVSSCT SSGGNGTVGR TTTGNTNAYP VDGSGTYSTV AGCNSSGNNN LAATAYGAFA
121 QVTGTGGTAT GFLSSAALWG TSAGLESTAS GAGSTALGFG ATANALNSVA IGGAAGNGTT
181 PLSYANSTIA SGAGAVAIGS NATKGAQSAA SDGIAIGGQS SVASAATSGI AVGRGATVNG
241 AYGIAQGDGV VSGATGRNVA IGSSGTTANS ATSAGGAVAI GRGQSASGDG AVAIGDPNSA
301 TGTGALAIGA NDTSNGSGAI ALGNSSTATN SSVAIGSSAS ATGTNGAIAV GNAATANGTG
361 AIALGNVGSF AANSIASGTD ALALGNGSTA SGSAGAVAVG AAAVASGSYG TALGSNSTAS
421 VANSVALGYN ALTTSAATAT SGGTTTVSSA TIGGQTFGNF AGANSAGGVV SVGQSGSERR
481 IQNVAAGLVT ATSTDAINGS QLYSVASTTT SSITSLSTSA STGLSSANSS ISSLSTSTST
541 GINSLSTGLS SANSSVTSLS TSTSTGLSSA NSSIGSLSTS TSTGINSLST GLSSTNSSVT
601 SLSASTSTGL SSANSSIGSL STSTSTGINS LSTGLSSANS SVTSLSTSTS TGLSSANSSI
661 SSLSTSTSTG INSLSTGLSS ANSSVTSLST STSTGLSSAN SSISSLSTST STGINSLSTG
721 LSSTNSSVTS LSTSTSTGLS SANSSISSLS TSTSTGINSL STGLSSANSS VTSLSTSTST
781 GLSSANSSIS SLSTSTSTGI NSLSTGLSSA NSSVTSLSSS TSTGLSSANS SITSLSTSTS
841 TGINSLSTGL SSTNSSVTSL STSTSTGLSS ANSSISSLST STSTGINSLS TGLSSANSSI
901 TSLSSSTSTG LSSANSSISS LSTSTSTGIN SLSTGLSTVS TKTDNLGSST ASALGGGSTY
961 DPTTGKVSAP SYTTYNANGT TSTANSVGSA INNINSQGIK YFHANSTGAD STATGTDAVA
1021 IGSGAVASTI NSVAIGLGAV ASTDDSVALG ADSKTVAATP TSSATVNGVT FSGFAGAKPV
1081 GVVSVGDAGK ERQVTNVAAG QVTSTSTDAI NGSQLYSVAQ QVGTATSAIS SLSTSTSTGL
1141 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS
1201 ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST
1261 STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL
1321 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS
1381 ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST
1441 STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL
1501 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS
1561 ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST
1621 STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL
1681 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS
1741 ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST
1801 STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL
1861 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS
1921 ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST
1981 STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL
2041 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGISSLS TGLSSTNSSV SSLSTSTSTG
2101 LSSANSSITS LSTSTSTGIS SLSTGLSSTN SSVSSLSTST STGLSSANSS ISSLSTSTST
2161 GLSSATSSIT SLSTSTSTGI SSLSTGLSST DSTILSLSTS TSTGIGSLST GLSSTNSSVS
2221 SLSTSTSTAI NAAKTHYYSV NDNGVQQANY DNTGATGTNA LAAGVNASAA GASSVAVGDG
2281 SNAQTAGAVA IGQNASATGG KAVSIGSGNT ASGDGAVAIG DPNVATGTGA VAMGANNTAT
2341 GDGAVSLGNQ NTATGASALA LGSSNQATAD NTIALGSQAT ASATGAQAYG SAAKATAADA
2401 LAFGTNAQAN VANSIALGAN SVTAAAVGTS SATIGGVTYP FAGGSPVGVV SVGAPGQERQ
2461 ITNVAAGRIS ATSTDAINGS QLNATNNAIN ALSTSTASNV ASLSTGINSL STGLSTTNSN
2521 VASLSTSTST AINSLSTGLS TTNSNVNSLS TSTSTGIGSL STGLSTTNSN VASLSTGVTN
2581 INNQLNQLST SINNNTTRAA NNNGIAADMN GKGTDVPVVT AGSNSVAIGA GSNDGGRSNV
2641 VSVGSDQQQR QITNVAPGTQ GTDAVNVNQL TQVQTTLSTA LSGQQAQINS LGSQLQQTDQ
2701 MAKQGIAAVG AMASIPQLDR DANFGMGVGT STFLGQKAMA VNMQARITEN LKASINGGFS
2761 GGQKVIGAGM LYQWK
//