LOCUS CAR56282.1 2775 aa PRT BCT 06-FEB-2015 DEFINITION Burkholderia cenocepacia J2315 putative haemagglutinin- related autotransporter protein protein. ACCESSION AM747721-2429 PROTEIN_ID CAR56282.1 SOURCE Burkholderia cenocepacia J2315 ORGANISM Burkholderia cenocepacia J2315 Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Burkholderia; Burkholderia cepacia complex. REFERENCE 1 (bases 1 to 3217062) AUTHORS Holden M.T.G. JOURNAL Submitted (20-JUN-2007) to the INSDC. Holden M.T.G., The Pathogen Sequencing Unit, The Wellcome Trust Sanger Institute, The Wellcome Trust Genome Campus, CB10 1SA, UNITED KINGDOM. REFERENCE 2 AUTHORS Holden M.T., Seth-Smith H.M., Crossman L.C., Sebaihia M., Bentley S.D., Cerdeno-Tarraga A.M., Thomson N.R., Bason N., Quail M.A., Sharp S., Cherevach I., Churcher C., Goodhead I., Hauser H., Holroyd N., Mungall K., Scott P., Walker D., White B., Rose H., Iversen P., Mil-Homens D., Rocha E.P., Fialho A.M., Baldwin A., Dowson C., Barrell B.G., Govan J.R., Vandamme P., Hart C.A., Mahenthiralingam E., Parkhill J. TITLE The genome of Burkholderia cenocepacia J2315, an epidemic pathogen of cystic fibrosis patients JOURNAL J. Bacteriol. 191(1), 261-277(2009). PUBMED 18931103 FEATURES Qualifiers source /organism="Burkholderia cenocepacia J2315" /chromosome="2" /strain="J2315" /mol_type="genomic DNA" /geo_loc_name="United Kingdom:Edinburgh" /isolation_source="cystic fibrosis patient" /note="representative of the ET12 epidemic lineage" /db_xref="taxon:216591" protein /transl_table=11 /locus_tag="BCAM2418" /note="This CDS is highly repetitive and contains a C-terminal YadA domain, althought the hit is before the PFam gathering threshold." /db_xref="EnsemblGenomes-Gn:BCAM2418" /db_xref="EnsemblGenomes-Tr:CAR56282" /db_xref="GOA:B4EI37" /db_xref="InterPro:IPR008635" /db_xref="InterPro:IPR008640" /db_xref="InterPro:IPR011049" /db_xref="InterPro:IPR024973" /db_xref="UniProtKB/TrEMBL:B4EI37" BEGIN 1 MNRTYRSIWN EALGAWVAAS EHDSARGKPN KSAVTAAVLA AVAMLPSLAG ANTFVPGTTN 61 GSQFTVSSCT SSGGNGTVGR TTTGNTNAYP VDGSGTYSTV AGCNSSGNNN LAATAYGAFA 121 QVTGTGGTAT GFLSSAALWG TSAGLESTAS GAGSTALGFG ATANALNSVA IGGAAGNGTT 181 PLSYANSTIA SGAGAVAIGS NATKGAQSAA SDGIAIGGQS SVASAATSGI AVGRGATVNG 241 AYGIAQGDGV VSGATGRNVA IGSSGTTANS ATSAGGAVAI GRGQSASGDG AVAIGDPNSA 301 TGTGALAIGA NDTSNGSGAI ALGNSSTATN SSVAIGSSAS ATGTNGAIAV GNAATANGTG 361 AIALGNVGSF AANSIASGTD ALALGNGSTA SGSAGAVAVG AAAVASGSYG TALGSNSTAS 421 VANSVALGYN ALTTSAATAT SGGTTTVSSA TIGGQTFGNF AGANSAGGVV SVGQSGSERR 481 IQNVAAGLVT ATSTDAINGS QLYSVASTTT SSITSLSTSA STGLSSANSS ISSLSTSTST 541 GINSLSTGLS SANSSVTSLS TSTSTGLSSA NSSIGSLSTS TSTGINSLST GLSSTNSSVT 601 SLSASTSTGL SSANSSIGSL STSTSTGINS LSTGLSSANS SVTSLSTSTS TGLSSANSSI 661 SSLSTSTSTG INSLSTGLSS ANSSVTSLST STSTGLSSAN SSISSLSTST STGINSLSTG 721 LSSTNSSVTS LSTSTSTGLS SANSSISSLS TSTSTGINSL STGLSSANSS VTSLSTSTST 781 GLSSANSSIS SLSTSTSTGI NSLSTGLSSA NSSVTSLSSS TSTGLSSANS SITSLSTSTS 841 TGINSLSTGL SSTNSSVTSL STSTSTGLSS ANSSISSLST STSTGINSLS TGLSSANSSI 901 TSLSSSTSTG LSSANSSISS LSTSTSTGIN SLSTGLSTVS TKTDNLGSST ASALGGGSTY 961 DPTTGKVSAP SYTTYNANGT TSTANSVGSA INNINSQGIK YFHANSTGAD STATGTDAVA 1021 IGSGAVASTI NSVAIGLGAV ASTDDSVALG ADSKTVAATP TSSATVNGVT FSGFAGAKPV 1081 GVVSVGDAGK ERQVTNVAAG QVTSTSTDAI NGSQLYSVAQ QVGTATSAIS SLSTSTSTGL 1141 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS 1201 ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST 1261 STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL 1321 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS 1381 ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST 1441 STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL 1501 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS 1561 ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST 1621 STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL 1681 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS 1741 ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST 1801 STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL 1861 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS 1921 ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST 1981 STSTGLSSAN SSITSLSTST STGLSSANSS ITSLSTSTST GLSSANSSIT SLSTSTSTGL 2041 SSANSSITSL STSTSTGLSS ANSSITSLST STSTGISSLS TGLSSTNSSV SSLSTSTSTG 2101 LSSANSSITS LSTSTSTGIS SLSTGLSSTN SSVSSLSTST STGLSSANSS ISSLSTSTST 2161 GLSSATSSIT SLSTSTSTGI SSLSTGLSST DSTILSLSTS TSTGIGSLST GLSSTNSSVS 2221 SLSTSTSTAI NAAKTHYYSV NDNGVQQANY DNTGATGTNA LAAGVNASAA GASSVAVGDG 2281 SNAQTAGAVA IGQNASATGG KAVSIGSGNT ASGDGAVAIG DPNVATGTGA VAMGANNTAT 2341 GDGAVSLGNQ NTATGASALA LGSSNQATAD NTIALGSQAT ASATGAQAYG SAAKATAADA 2401 LAFGTNAQAN VANSIALGAN SVTAAAVGTS SATIGGVTYP FAGGSPVGVV SVGAPGQERQ 2461 ITNVAAGRIS ATSTDAINGS QLNATNNAIN ALSTSTASNV ASLSTGINSL STGLSTTNSN 2521 VASLSTSTST AINSLSTGLS TTNSNVNSLS TSTSTGIGSL STGLSTTNSN VASLSTGVTN 2581 INNQLNQLST SINNNTTRAA NNNGIAADMN GKGTDVPVVT AGSNSVAIGA GSNDGGRSNV 2641 VSVGSDQQQR QITNVAPGTQ GTDAVNVNQL TQVQTTLSTA LSGQQAQINS LGSQLQQTDQ 2701 MAKQGIAAVG AMASIPQLDR DANFGMGVGT STFLGQKAMA VNMQARITEN LKASINGGFS 2761 GGQKVIGAGM LYQWK //