LOCUS AEE86401.1 113 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana small subunit ribosomal protein 16 protein.
ACCESSION CP002687-6411
PROTEIN_ID AEE86401.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="SSR16"
/locus_tag="AT4G34620"
/gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN S16"
/gene_synonym="small subunit ribosomal protein 16"
/gene_synonym="T4L20.200"
/gene_synonym="T4L20_200"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR308229.1,INSD:EG430510.1,INSD:BP812006.1,
INSD:EL260433.1,INSD:AV789451.1,INSD:DR374566.1,
INSD:EH819333.1,INSD:DR308152.1,INSD:EL121401.1,
INSD:EL104043.1,INSD:EL273056.1,INSD:DR308269.1,
INSD:EL133156.1,INSD:EH826320.1,INSD:BP836431.1,
INSD:DR308284.1,INSD:EL158149.1,INSD:EH864173.1,
INSD:EH850035.1,INSD:DR308106.1,INSD:EL127378.1,
INSD:AV535743.1,INSD:EL125170.1,INSD:DR308144.1,
INSD:EH934619.1,INSD:BP665515.1,INSD:BP846667.1,
INSD:DR308111.1,INSD:DR308103.1,INSD:DR308223.1,
INSD:EL051380.1,INSD:EL217485.1,INSD:ES049775.1,
INSD:EH933272.1,INSD:EH939036.1,INSD:T21653.1,
INSD:EH846548.1,INSD:EH926355.1,INSD:EH800075.1,
INSD:BP623378.1,INSD:DR308140.1,INSD:DR308260.1,
INSD:DR308151.1,INSD:EH809326.1,INSD:DR308101.1,
INSD:DR308179.1,INSD:AA042692.1,INSD:EH894755.1,
INSD:EL118913.1,INSD:ES066677.1,INSD:T22965.1,
INSD:ES143992.1,INSD:EL066326.1,INSD:DR308268.1,
INSD:BP835325.1,INSD:EL224131.1,INSD:CF774312.1,
INSD:DR308228.1,INSD:ES002703.1,INSD:DR308113.1,
INSD:DR308226.1,INSD:BP649398.1,INSD:DR308116.1,
INSD:EL129843.1,INSD:EL132051.1,INSD:DR377084.1,
INSD:EL333885.1,INSD:EL113874.1,INSD:EL024316.1,
INSD:DR308081.1,INSD:DR308146.1,INSD:EL106360.1,
INSD:EL311388.1,INSD:EH880020.1,INSD:DR308208.1,
INSD:EH926042.1,INSD:EH864636.1,INSD:EL246688.1,
INSD:EH806728.1,INSD:EL248323.1,INSD:BP603536.1,
INSD:EG496602.1,INSD:DR308159.1,INSD:DR308261.1,
INSD:EH949461.1,INSD:EL246885.1,INSD:EH808185.1,
INSD:EH900685.1,INSD:EH868714.1,INSD:CB262436.1,
INSD:EH934755.1,INSD:EL332672.1,INSD:ES199615.1,
INSD:AV825875.1,INSD:DR308270.1,INSD:ES212347.1,
INSD:EH983229.1,INSD:EL069170.1,INSD:DR308164.1,
INSD:DR308160.1,INSD:BP842003.1,INSD:EG528464.1,
INSD:EL171348.1,INSD:EH992543.1,INSD:EH877446.1,
INSD:EH931708.1,INSD:EL097501.1,INSD:DR308203.1,
INSD:EH826210.1,INSD:EL099787.1,INSD:EL055098.1,
INSD:DR308222.1,INSD:DR308232.1,INSD:BP846043.1,
INSD:EL179486.1,INSD:BP665533.1,INSD:DR308078.1,
INSD:EL109227.1,INSD:DR308099.1,INSD:EL193454.1,
INSD:EL047575.1,INSD:EG495581.1,INSD:EH927516.1,
INSD:DR308264.1,INSD:DR378013.1,INSD:EL114760.1,
INSD:ES037079.1,INSD:BP664817.1,INSD:EH798104.1,
INSD:BP866731.1,INSD:ES199006.1,INSD:DR308137.1,
INSD:EL217026.1,INSD:EH979059.1,INSD:DR308205.1,
INSD:DR308271.1,INSD:EH915221.1,INSD:BP842013.1,
INSD:EL330983.1,INSD:EH865874.1,INSD:EH916514.1,
INSD:EL182516.1,INSD:EH970153.1,INSD:EL264744.1,
INSD:DR308175.1,INSD:EL097225.1,INSD:DR308280.1,
INSD:EL313687.1,INSD:EL304716.1,INSD:EL123265.1,
INSD:EG510389.1,INSD:EL263853.1,INSD:AV530533.1,
INSD:BP663786.1,INSD:DR295284.1,INSD:DR308253.1,
INSD:DR308155.1,INSD:ES140236.1,INSD:DR308212.1,
INSD:EH929632.1,INSD:DR308145.1,INSD:DR308233.1,
INSD:EL288614.1,INSD:DR308230.1,INSD:DR308199.1,
INSD:ES205150.1,INSD:EH836554.1,INSD:EL157031.1,
INSD:BP634298.1,INSD:BP827218.1,INSD:EL139593.1,
INSD:BP642009.1,INSD:AV531452.1,INSD:EH971092.1,
INSD:ES008025.1,INSD:EL249070.1,INSD:BP651101.1,
INSD:EH860950.1,INSD:EL340873.1,INSD:DR308242.1,
INSD:BP660110.1,INSD:AI994329.1,INSD:EH908416.1,
INSD:BP604187.1,INSD:EL229926.1,INSD:DR308119.1,
INSD:EH818702.1,INSD:EL179287.1,INSD:EG430509.1,
INSD:DR308282.1,INSD:BP856164.1,INSD:DR308279.1,
INSD:BP866651.1,INSD:BP840076.1,INSD:DR308180.1,
INSD:EH924900.1,INSD:AV781418.1,INSD:DR308098.1,
INSD:DR308240.1,INSD:DR308097.1,INSD:EG491597.1,
INSD:EL128386.1,INSD:EL322179.1,INSD:EH827377.1,
INSD:BP641290.1,INSD:DR308163.1,INSD:DR308246.1,
INSD:DR308245.1,INSD:EL124389.1,INSD:BP613272.1,
INSD:EL255440.1,INSD:DR308265.1,INSD:ES065712.1,
INSD:EH839232.1,INSD:DR308122.1,INSD:EH854968.1,
INSD:DR308087.1,INSD:DR308196.1,INSD:EL336223.1,
INSD:EL994891.1,INSD:DR308085.1,INSD:DR308177.1,
INSD:EL098208.1,INSD:EL145496.1,INSD:EL117679.1,
INSD:EH937392.1,INSD:AV820338.1,INSD:EL147487.1,
INSD:EH947895.1,INSD:EH907584.1,INSD:EH896848.1,
INSD:EH989721.1,INSD:DR308198.1,INSD:ES018635.1,
INSD:AV789176.1,INSD:DR308135.1,INSD:DR308192.1,
INSD:DR308217.1,INSD:EH862221.1,INSD:EL250534.1,
INSD:ES115771.1,INSD:CB258309.1,INSD:DR308201.1,
INSD:EL066079.1,INSD:DR308093.1,INSD:DR308118.1,
INSD:DR308148.1,INSD:DR308204.1,INSD:EH982158.1,
INSD:BP828292.1,INSD:DR308197.1,INSD:BP818803.1,
INSD:DR308157.1,INSD:EL077742.1,INSD:DR308171.1,
INSD:DR308105.1,INSD:DR308244.1,INSD:DR308168.1,
INSD:DR308193.1,INSD:DR308289.1,INSD:EL105497.1,
INSD:BP835485.1,INSD:DR308288.1,INSD:EL194702.1,
INSD:DR308255.1,INSD:DR308277.1,INSD:ES148654.1,
INSD:DR331008.1,INSD:EH991628.1,INSD:EG508473.1,
INSD:EH900407.1,INSD:DR308186.1,INSD:BP587375.1,
INSD:BE526673.1,INSD:AV533540.1,INSD:BP665448.1,
INSD:EL076274.1,INSD:EL024831.1,INSD:EH881283.1,
INSD:EL338526.1,INSD:DR308149.1,INSD:BE039004.1,
INSD:EH882725.1,INSD:EL090979.1,INSD:DR308248.1,
INSD:DR308100.1,INSD:EL110825.1,INSD:EH957822.1,
INSD:DR308121.1,INSD:EL982635.1,INSD:BP663765.1,
INSD:DR295343.1,INSD:T88146.1,INSD:DR308082.1,
INSD:DR308124.1,INSD:DR308256.1,INSD:DR308169.1,
INSD:DR295283.1,INSD:EG528463.1,INSD:DR308182.1,
INSD:EH950942.1,INSD:AV804945.1,INSD:EH802078.1,
INSD:EL246413.1,INSD:DR308206.1,INSD:DR308132.1,
INSD:EL022140.1,INSD:EH937501.1,INSD:EL237082.1,
INSD:EL298442.1,INSD:DR308287.1,INSD:DR308130.1,
INSD:EL166726.1,INSD:EH859200.1,INSD:DR308211.1,
INSD:EL005427.1,INSD:EH965950.1,INSD:EL336445.1,
INSD:DR308235.1,INSD:EL315416.1,INSD:BE039315.1,
INSD:DR308114.1,INSD:DR308213.1,INSD:DR377740.1,
INSD:DR308104.1,INSD:BP852673.1,INSD:DR308095.1,
INSD:DR308134.1,INSD:EL196240.1,INSD:DR308109.1,
INSD:DR308184.1,INSD:DR308247.1,INSD:DR308154.1,
INSD:DR308172.1,INSD:DR308088.1,INSD:DR308125.1,
INSD:EH873332.1,INSD:EH892431.1,INSD:DR308231.1,
INSD:EL133718.1,INSD:EL317593.1,INSD:DR308091.1,
INSD:EH837402.1,INSD:DR308142.1,INSD:DR308110.1,
INSD:DR308194.1,INSD:EL223756.1,INSD:EH828863.1,
INSD:DR308273.1,INSD:BP828272.1,INSD:EL316647.1,
INSD:EL339635.1,INSD:DR308108.1,INSD:DR308283.1,
INSD:DR308275.1,INSD:DR308075.1,INSD:EH978742.1,
INSD:DR308133.1,INSD:EH894361.1,INSD:DR308127.1,
INSD:DR308158.1,INSD:EG491608.1,INSD:EH981616.1,
INSD:DR308156.1,INSD:EH829189.1,INSD:AV783912.1,
INSD:EL035039.1,INSD:EL329770.1,INSD:DR308221.1,
INSD:DR308202.1,INSD:EL249895.1,INSD:BP862037.1,
INSD:BP802245.1,INSD:EL338696.1,INSD:EL039158.1,
INSD:DR308214.1,INSD:DR308209.1,INSD:BP641278.1,
INSD:EH953292.1,INSD:EL277031.1,INSD:DR308165.1,
INSD:AV824787.1,INSD:DR308254.1,INSD:BP833720.1,
INSD:DR308120.1,INSD:DR381833.1,INSD:EH836515.1,
INSD:EL206820.1,INSD:DR308241.1,INSD:AV792767.1,
INSD:EH937616.1,INSD:EL284831.1,INSD:BP807470.1,
INSD:ES126376.1,INSD:BP642139.1,INSD:EL178084.1,
INSD:DR308188.1,INSD:DR308141.1,INSD:EL191632.1,
INSD:EH964076.1,INSD:DR308094.1,INSD:DR308117.1,
INSD:DR308224.1,INSD:AV535567.1,INSD:EL278289.1,
INSD:DR308220.1,INSD:EL216822.1,INSD:BP825134.1,
INSD:AV807944.1,INSD:EH988707.1,INSD:DR308257.1,
INSD:EL072925.1,INSD:EL050545.1,INSD:EL039679.1,
INSD:DR308178.1,INSD:EL297715.1,INSD:DR308251.1,
INSD:EH858052.1,INSD:DR308092.1,INSD:EH852132.1,
INSD:DR377476.1,INSD:DR308167.1,INSD:DR308153.1,
INSD:DR308195.1,INSD:BP864630.1,INSD:EL242555.1,
INSD:DR308161.1,INSD:AA597807.1,INSD:DR308136.1,
INSD:EH943976.1,INSD:DR308276.1,INSD:DR308278.1,
INSD:DR308250.1,INSD:BP828473.1,INSD:DR308126.1,
INSD:BP829273.1,INSD:DR308263.1,INSD:DR308086.1,
INSD:ES168961.1,INSD:DR308200.1,INSD:EH951142.1,
INSD:DR308259.1,INSD:EL093947.1,INSD:DR308218.1,
INSD:ES172209.1,INSD:DR308112.1,INSD:DR308185.1,
INSD:ES198283.1,INSD:EL284930.1,INSD:BP636307.1,
INSD:EL272322.1,INSD:BP853371.1,INSD:EH876530.1,
INSD:EL239325.1,INSD:EL272466.1,INSD:EL109730.1,
INSD:EL108412.1,INSD:EH913348.1,INSD:EL249898.1,
INSD:DR308238.1,INSD:ES017841.1,INSD:DR308102.1,
INSD:DR308131.1,INSD:DR308083.1,INSD:DR308210.1,
INSD:DR308281.1,INSD:EL000425.1,INSD:DR308239.1,
INSD:CB264755.1,INSD:DR308227.1,INSD:EL202078.1,
INSD:DR308115.1,INSD:DR308219.1,INSD:EL208877.1,
INSD:EH820780.1,INSD:EL030026.1,INSD:EH898192.1,
INSD:DR308183.1,INSD:BP851269.1,INSD:EL278894.1,
INSD:ES203413.1,INSD:BP841243.1,INSD:EH890374.1,
INSD:EH835503.1,INSD:EL196622.1,INSD:H77135.1,
INSD:DR308252.1,INSD:DR308267.1,INSD:DR308176.1,
INSD:DR308216.1,INSD:EH813376.1,INSD:EL023725.1,
INSD:EL264845.1,INSD:BP628143.1,INSD:BP821491.1,
INSD:EL014140.1,INSD:ES148657.1,INSD:EL340134.1,
INSD:BX840546.1,INSD:DR308162.1,INSD:EL234447.1,
INSD:EL250806.1,INSD:DR308076.1,INSD:ES026561.1,
INSD:DR308189.1,INSD:DR308128.1,INSD:DR308150.1,
INSD:DR308286.1,INSD:DR308243.1,INSD:EH889926.1,
INSD:DR308077.1,INSD:EL006594.1,INSD:EH980320.1,
INSD:EL234838.1,INSD:H77186.1,INSD:DR308258.1,
INSD:BP813458.1,INSD:DR308080.1,INSD:EL211841.1,
INSD:DR308187.1,INSD:ES069188.1,INSD:EL245362.1,
INSD:EH874443.1,INSD:ES069707.1,INSD:DR308123.1,
INSD:EL062990.1,INSD:EH947318.1,INSD:DR308274.1,
INSD:DR308234.1,INSD:DR308181.1,INSD:EL077891.1,
INSD:DR308090.1,INSD:AV533270.1,INSD:DR308207.1,
INSD:DR308089.1,INSD:EH931310.1,INSD:DR308143.1,
INSD:EL319346.1,INSD:DR232287.1,INSD:DR308266.1,
INSD:DR308236.1,INSD:DR308107.1,INSD:EL289481.1,
INSD:EL227455.1,INSD:DR308215.1,INSD:DR308147.1,
INSD:DR308096.1,INSD:EL043085.1,INSD:EL295905.1,
INSD:DR308249.1,INSD:DR308191.1,INSD:BP662417.1,
INSD:EL297339.1,INSD:AV533744.1,INSD:DR308079.1,
INSD:EG495580.1,INSD:BP821246.1,INSD:DR308237.1,
INSD:EL261467.1,INSD:DR308174.1,INSD:DR308262.1,
INSD:EL326709.1,INSD:DR308166.1,INSD:DR308272.1,
INSD:EL260426.1,INSD:EL211412.1,INSD:DR308084.1,
INSD:DR308139.1,INSD:DR308190.1,INSD:EH908188.1,
INSD:DR308285.1,INSD:DR308138.1,INSD:BP598612.1,
INSD:EL982401.1,INSD:BP665483.1,INSD:BP657502.1,
INSD:DR308173.1,INSD:ES115426.1,INSD:EH845011.1,
INSD:ES089784.1,INSD:AV824828.1,INSD:EH861624.1,
INSD:DR308170.1,INSD:EL235844.1,INSD:EH910673.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX828822.1,INSD:AY086956.1,INSD:AK220729.1,
INSD:AF412081.1,INSD:AY048218.1,INSD:AY143795.1,
INSD:AY052220.1,INSD:BX829251.1,INSD:AY045607.1"
/note="small subunit ribosomal protein 16 (SSR16);
FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED
IN: translation, ribosome biogenesis, embryo development
ending in seed dormancy; LOCATED IN: ribosome,
chloroplast, plastid, chloroplast envelope; EXPRESSED IN:
22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages;
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S16
(InterPro:IPR000307); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: Ribosomal protein S16 family protein
(TAIR:AT5G56940.1); Has 8683 Blast hits to 8683 proteins
in 3031 species: Archae - 0; Bacteria - 5404; Metazoa -
128; Fungi - 129; Plants - 717; Viruses - 0; Other
Eukaryotes - 2305 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G34620"
/db_xref="Araport:AT4G34620"
intron_pos 45:1 (1/2)
intron_pos 60:2 (2/2)
BEGIN
1 MTVKIRLARL GCKHRPFYRV VVADEKSRRD GKQIEVLGFY DPLQGKEDAD RVSLKFDRIK
61 YWLSVGAQPT DTVESMLFRA GLIPPKPMVV VGSKNGQKST SQHVSPITGE ILN
//