LOCUS AEE86401.1 113 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana small subunit ribosomal protein 16 protein. ACCESSION CP002687-6411 PROTEIN_ID AEE86401.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G., Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N., Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M., Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R., Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M., Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M., Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W., Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L., Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J., Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I., Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U., Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M., Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M., Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C., Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J., Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S., Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A., Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D., Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S., Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O., Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S., Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F., Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T., Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A., Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D., Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P., Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W., Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M., Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E., Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M., Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G., Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A., Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N., Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M., Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S., Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K., Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C., Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D., Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A., Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N., Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M., Martienssen,R. and McCombie,W.R. TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999) PUBMED 10617198 REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="4" /ecotype="Columbia" protein /gene="SSR16" /locus_tag="AT4G34620" /gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN S16" /gene_synonym="small subunit ribosomal protein 16" /gene_synonym="T4L20.200" /gene_synonym="T4L20_200" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:DR308229.1,INSD:EG430510.1,INSD:BP812006.1, INSD:EL260433.1,INSD:AV789451.1,INSD:DR374566.1, INSD:EH819333.1,INSD:DR308152.1,INSD:EL121401.1, INSD:EL104043.1,INSD:EL273056.1,INSD:DR308269.1, INSD:EL133156.1,INSD:EH826320.1,INSD:BP836431.1, INSD:DR308284.1,INSD:EL158149.1,INSD:EH864173.1, INSD:EH850035.1,INSD:DR308106.1,INSD:EL127378.1, INSD:AV535743.1,INSD:EL125170.1,INSD:DR308144.1, INSD:EH934619.1,INSD:BP665515.1,INSD:BP846667.1, INSD:DR308111.1,INSD:DR308103.1,INSD:DR308223.1, INSD:EL051380.1,INSD:EL217485.1,INSD:ES049775.1, INSD:EH933272.1,INSD:EH939036.1,INSD:T21653.1, INSD:EH846548.1,INSD:EH926355.1,INSD:EH800075.1, INSD:BP623378.1,INSD:DR308140.1,INSD:DR308260.1, INSD:DR308151.1,INSD:EH809326.1,INSD:DR308101.1, INSD:DR308179.1,INSD:AA042692.1,INSD:EH894755.1, INSD:EL118913.1,INSD:ES066677.1,INSD:T22965.1, INSD:ES143992.1,INSD:EL066326.1,INSD:DR308268.1, INSD:BP835325.1,INSD:EL224131.1,INSD:CF774312.1, INSD:DR308228.1,INSD:ES002703.1,INSD:DR308113.1, INSD:DR308226.1,INSD:BP649398.1,INSD:DR308116.1, INSD:EL129843.1,INSD:EL132051.1,INSD:DR377084.1, INSD:EL333885.1,INSD:EL113874.1,INSD:EL024316.1, INSD:DR308081.1,INSD:DR308146.1,INSD:EL106360.1, INSD:EL311388.1,INSD:EH880020.1,INSD:DR308208.1, INSD:EH926042.1,INSD:EH864636.1,INSD:EL246688.1, INSD:EH806728.1,INSD:EL248323.1,INSD:BP603536.1, INSD:EG496602.1,INSD:DR308159.1,INSD:DR308261.1, INSD:EH949461.1,INSD:EL246885.1,INSD:EH808185.1, INSD:EH900685.1,INSD:EH868714.1,INSD:CB262436.1, INSD:EH934755.1,INSD:EL332672.1,INSD:ES199615.1, INSD:AV825875.1,INSD:DR308270.1,INSD:ES212347.1, INSD:EH983229.1,INSD:EL069170.1,INSD:DR308164.1, INSD:DR308160.1,INSD:BP842003.1,INSD:EG528464.1, INSD:EL171348.1,INSD:EH992543.1,INSD:EH877446.1, INSD:EH931708.1,INSD:EL097501.1,INSD:DR308203.1, INSD:EH826210.1,INSD:EL099787.1,INSD:EL055098.1, INSD:DR308222.1,INSD:DR308232.1,INSD:BP846043.1, INSD:EL179486.1,INSD:BP665533.1,INSD:DR308078.1, INSD:EL109227.1,INSD:DR308099.1,INSD:EL193454.1, INSD:EL047575.1,INSD:EG495581.1,INSD:EH927516.1, INSD:DR308264.1,INSD:DR378013.1,INSD:EL114760.1, INSD:ES037079.1,INSD:BP664817.1,INSD:EH798104.1, INSD:BP866731.1,INSD:ES199006.1,INSD:DR308137.1, INSD:EL217026.1,INSD:EH979059.1,INSD:DR308205.1, INSD:DR308271.1,INSD:EH915221.1,INSD:BP842013.1, INSD:EL330983.1,INSD:EH865874.1,INSD:EH916514.1, INSD:EL182516.1,INSD:EH970153.1,INSD:EL264744.1, INSD:DR308175.1,INSD:EL097225.1,INSD:DR308280.1, INSD:EL313687.1,INSD:EL304716.1,INSD:EL123265.1, INSD:EG510389.1,INSD:EL263853.1,INSD:AV530533.1, INSD:BP663786.1,INSD:DR295284.1,INSD:DR308253.1, INSD:DR308155.1,INSD:ES140236.1,INSD:DR308212.1, INSD:EH929632.1,INSD:DR308145.1,INSD:DR308233.1, INSD:EL288614.1,INSD:DR308230.1,INSD:DR308199.1, INSD:ES205150.1,INSD:EH836554.1,INSD:EL157031.1, INSD:BP634298.1,INSD:BP827218.1,INSD:EL139593.1, INSD:BP642009.1,INSD:AV531452.1,INSD:EH971092.1, INSD:ES008025.1,INSD:EL249070.1,INSD:BP651101.1, INSD:EH860950.1,INSD:EL340873.1,INSD:DR308242.1, INSD:BP660110.1,INSD:AI994329.1,INSD:EH908416.1, INSD:BP604187.1,INSD:EL229926.1,INSD:DR308119.1, INSD:EH818702.1,INSD:EL179287.1,INSD:EG430509.1, INSD:DR308282.1,INSD:BP856164.1,INSD:DR308279.1, INSD:BP866651.1,INSD:BP840076.1,INSD:DR308180.1, INSD:EH924900.1,INSD:AV781418.1,INSD:DR308098.1, INSD:DR308240.1,INSD:DR308097.1,INSD:EG491597.1, INSD:EL128386.1,INSD:EL322179.1,INSD:EH827377.1, INSD:BP641290.1,INSD:DR308163.1,INSD:DR308246.1, INSD:DR308245.1,INSD:EL124389.1,INSD:BP613272.1, INSD:EL255440.1,INSD:DR308265.1,INSD:ES065712.1, INSD:EH839232.1,INSD:DR308122.1,INSD:EH854968.1, INSD:DR308087.1,INSD:DR308196.1,INSD:EL336223.1, INSD:EL994891.1,INSD:DR308085.1,INSD:DR308177.1, INSD:EL098208.1,INSD:EL145496.1,INSD:EL117679.1, INSD:EH937392.1,INSD:AV820338.1,INSD:EL147487.1, INSD:EH947895.1,INSD:EH907584.1,INSD:EH896848.1, INSD:EH989721.1,INSD:DR308198.1,INSD:ES018635.1, INSD:AV789176.1,INSD:DR308135.1,INSD:DR308192.1, INSD:DR308217.1,INSD:EH862221.1,INSD:EL250534.1, INSD:ES115771.1,INSD:CB258309.1,INSD:DR308201.1, INSD:EL066079.1,INSD:DR308093.1,INSD:DR308118.1, INSD:DR308148.1,INSD:DR308204.1,INSD:EH982158.1, INSD:BP828292.1,INSD:DR308197.1,INSD:BP818803.1, INSD:DR308157.1,INSD:EL077742.1,INSD:DR308171.1, INSD:DR308105.1,INSD:DR308244.1,INSD:DR308168.1, INSD:DR308193.1,INSD:DR308289.1,INSD:EL105497.1, INSD:BP835485.1,INSD:DR308288.1,INSD:EL194702.1, INSD:DR308255.1,INSD:DR308277.1,INSD:ES148654.1, INSD:DR331008.1,INSD:EH991628.1,INSD:EG508473.1, INSD:EH900407.1,INSD:DR308186.1,INSD:BP587375.1, INSD:BE526673.1,INSD:AV533540.1,INSD:BP665448.1, INSD:EL076274.1,INSD:EL024831.1,INSD:EH881283.1, INSD:EL338526.1,INSD:DR308149.1,INSD:BE039004.1, INSD:EH882725.1,INSD:EL090979.1,INSD:DR308248.1, INSD:DR308100.1,INSD:EL110825.1,INSD:EH957822.1, INSD:DR308121.1,INSD:EL982635.1,INSD:BP663765.1, INSD:DR295343.1,INSD:T88146.1,INSD:DR308082.1, INSD:DR308124.1,INSD:DR308256.1,INSD:DR308169.1, INSD:DR295283.1,INSD:EG528463.1,INSD:DR308182.1, INSD:EH950942.1,INSD:AV804945.1,INSD:EH802078.1, INSD:EL246413.1,INSD:DR308206.1,INSD:DR308132.1, INSD:EL022140.1,INSD:EH937501.1,INSD:EL237082.1, INSD:EL298442.1,INSD:DR308287.1,INSD:DR308130.1, INSD:EL166726.1,INSD:EH859200.1,INSD:DR308211.1, INSD:EL005427.1,INSD:EH965950.1,INSD:EL336445.1, INSD:DR308235.1,INSD:EL315416.1,INSD:BE039315.1, INSD:DR308114.1,INSD:DR308213.1,INSD:DR377740.1, INSD:DR308104.1,INSD:BP852673.1,INSD:DR308095.1, INSD:DR308134.1,INSD:EL196240.1,INSD:DR308109.1, INSD:DR308184.1,INSD:DR308247.1,INSD:DR308154.1, INSD:DR308172.1,INSD:DR308088.1,INSD:DR308125.1, INSD:EH873332.1,INSD:EH892431.1,INSD:DR308231.1, INSD:EL133718.1,INSD:EL317593.1,INSD:DR308091.1, INSD:EH837402.1,INSD:DR308142.1,INSD:DR308110.1, INSD:DR308194.1,INSD:EL223756.1,INSD:EH828863.1, INSD:DR308273.1,INSD:BP828272.1,INSD:EL316647.1, INSD:EL339635.1,INSD:DR308108.1,INSD:DR308283.1, INSD:DR308275.1,INSD:DR308075.1,INSD:EH978742.1, INSD:DR308133.1,INSD:EH894361.1,INSD:DR308127.1, INSD:DR308158.1,INSD:EG491608.1,INSD:EH981616.1, INSD:DR308156.1,INSD:EH829189.1,INSD:AV783912.1, INSD:EL035039.1,INSD:EL329770.1,INSD:DR308221.1, INSD:DR308202.1,INSD:EL249895.1,INSD:BP862037.1, INSD:BP802245.1,INSD:EL338696.1,INSD:EL039158.1, INSD:DR308214.1,INSD:DR308209.1,INSD:BP641278.1, INSD:EH953292.1,INSD:EL277031.1,INSD:DR308165.1, INSD:AV824787.1,INSD:DR308254.1,INSD:BP833720.1, INSD:DR308120.1,INSD:DR381833.1,INSD:EH836515.1, INSD:EL206820.1,INSD:DR308241.1,INSD:AV792767.1, INSD:EH937616.1,INSD:EL284831.1,INSD:BP807470.1, INSD:ES126376.1,INSD:BP642139.1,INSD:EL178084.1, INSD:DR308188.1,INSD:DR308141.1,INSD:EL191632.1, INSD:EH964076.1,INSD:DR308094.1,INSD:DR308117.1, INSD:DR308224.1,INSD:AV535567.1,INSD:EL278289.1, INSD:DR308220.1,INSD:EL216822.1,INSD:BP825134.1, INSD:AV807944.1,INSD:EH988707.1,INSD:DR308257.1, INSD:EL072925.1,INSD:EL050545.1,INSD:EL039679.1, INSD:DR308178.1,INSD:EL297715.1,INSD:DR308251.1, INSD:EH858052.1,INSD:DR308092.1,INSD:EH852132.1, INSD:DR377476.1,INSD:DR308167.1,INSD:DR308153.1, INSD:DR308195.1,INSD:BP864630.1,INSD:EL242555.1, INSD:DR308161.1,INSD:AA597807.1,INSD:DR308136.1, INSD:EH943976.1,INSD:DR308276.1,INSD:DR308278.1, INSD:DR308250.1,INSD:BP828473.1,INSD:DR308126.1, INSD:BP829273.1,INSD:DR308263.1,INSD:DR308086.1, INSD:ES168961.1,INSD:DR308200.1,INSD:EH951142.1, INSD:DR308259.1,INSD:EL093947.1,INSD:DR308218.1, INSD:ES172209.1,INSD:DR308112.1,INSD:DR308185.1, INSD:ES198283.1,INSD:EL284930.1,INSD:BP636307.1, INSD:EL272322.1,INSD:BP853371.1,INSD:EH876530.1, INSD:EL239325.1,INSD:EL272466.1,INSD:EL109730.1, INSD:EL108412.1,INSD:EH913348.1,INSD:EL249898.1, INSD:DR308238.1,INSD:ES017841.1,INSD:DR308102.1, INSD:DR308131.1,INSD:DR308083.1,INSD:DR308210.1, INSD:DR308281.1,INSD:EL000425.1,INSD:DR308239.1, INSD:CB264755.1,INSD:DR308227.1,INSD:EL202078.1, INSD:DR308115.1,INSD:DR308219.1,INSD:EL208877.1, INSD:EH820780.1,INSD:EL030026.1,INSD:EH898192.1, INSD:DR308183.1,INSD:BP851269.1,INSD:EL278894.1, INSD:ES203413.1,INSD:BP841243.1,INSD:EH890374.1, INSD:EH835503.1,INSD:EL196622.1,INSD:H77135.1, INSD:DR308252.1,INSD:DR308267.1,INSD:DR308176.1, INSD:DR308216.1,INSD:EH813376.1,INSD:EL023725.1, INSD:EL264845.1,INSD:BP628143.1,INSD:BP821491.1, INSD:EL014140.1,INSD:ES148657.1,INSD:EL340134.1, INSD:BX840546.1,INSD:DR308162.1,INSD:EL234447.1, INSD:EL250806.1,INSD:DR308076.1,INSD:ES026561.1, INSD:DR308189.1,INSD:DR308128.1,INSD:DR308150.1, INSD:DR308286.1,INSD:DR308243.1,INSD:EH889926.1, INSD:DR308077.1,INSD:EL006594.1,INSD:EH980320.1, INSD:EL234838.1,INSD:H77186.1,INSD:DR308258.1, INSD:BP813458.1,INSD:DR308080.1,INSD:EL211841.1, INSD:DR308187.1,INSD:ES069188.1,INSD:EL245362.1, INSD:EH874443.1,INSD:ES069707.1,INSD:DR308123.1, INSD:EL062990.1,INSD:EH947318.1,INSD:DR308274.1, INSD:DR308234.1,INSD:DR308181.1,INSD:EL077891.1, INSD:DR308090.1,INSD:AV533270.1,INSD:DR308207.1, INSD:DR308089.1,INSD:EH931310.1,INSD:DR308143.1, INSD:EL319346.1,INSD:DR232287.1,INSD:DR308266.1, INSD:DR308236.1,INSD:DR308107.1,INSD:EL289481.1, INSD:EL227455.1,INSD:DR308215.1,INSD:DR308147.1, INSD:DR308096.1,INSD:EL043085.1,INSD:EL295905.1, INSD:DR308249.1,INSD:DR308191.1,INSD:BP662417.1, INSD:EL297339.1,INSD:AV533744.1,INSD:DR308079.1, INSD:EG495580.1,INSD:BP821246.1,INSD:DR308237.1, INSD:EL261467.1,INSD:DR308174.1,INSD:DR308262.1, INSD:EL326709.1,INSD:DR308166.1,INSD:DR308272.1, INSD:EL260426.1,INSD:EL211412.1,INSD:DR308084.1, INSD:DR308139.1,INSD:DR308190.1,INSD:EH908188.1, INSD:DR308285.1,INSD:DR308138.1,INSD:BP598612.1, INSD:EL982401.1,INSD:BP665483.1,INSD:BP657502.1, INSD:DR308173.1,INSD:ES115426.1,INSD:EH845011.1, INSD:ES089784.1,INSD:AV824828.1,INSD:EH861624.1, INSD:DR308170.1,INSD:EL235844.1,INSD:EH910673.1" /inference="Similar to RNA sequence, mRNA:INSD:BX828822.1,INSD:AY086956.1,INSD:AK220729.1, INSD:AF412081.1,INSD:AY048218.1,INSD:AY143795.1, INSD:AY052220.1,INSD:BX829251.1,INSD:AY045607.1" /note="small subunit ribosomal protein 16 (SSR16); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation, ribosome biogenesis, embryo development ending in seed dormancy; LOCATED IN: ribosome, chloroplast, plastid, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S16 (InterPro:IPR000307); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S16 family protein (TAIR:AT5G56940.1); Has 8683 Blast hits to 8683 proteins in 3031 species: Archae - 0; Bacteria - 5404; Metazoa - 128; Fungi - 129; Plants - 717; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2305 (source: NCBI BLink)." /db_xref="TAIR:AT4G34620" /db_xref="Araport:AT4G34620" intron_pos 45:1 (1/2) intron_pos 60:2 (2/2) BEGIN 1 MTVKIRLARL GCKHRPFYRV VVADEKSRRD GKQIEVLGFY DPLQGKEDAD RVSLKFDRIK 61 YWLSVGAQPT DTVESMLFRA GLIPPKPMVV VGSKNGQKST SQHVSPITGE ILN //