LOCUS AEE86325.1 629 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana poly(A) binding protein 2 protein.
ACCESSION CP002687-6297
PROTEIN_ID AEE86325.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="PAB2"
/locus_tag="AT4G34110"
/gene_synonym="ARABIDOPSIS POLY(A) BINDING 2"
/gene_synonym="ATPAB2"
/gene_synonym="F28A23.130"
/gene_synonym="F28A23_130"
/gene_synonym="PABP2"
/gene_synonym="poly(A) binding protein 2"
/gene_synonym="POLY(A) BINDING PROTEIN 2"
/gene_synonym="POLY(A)-BINDING PROTEIN 2"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH897083.1,INSD:EL135840.1,INSD:EL115703.1,
INSD:EL050646.1,INSD:EL333941.1,INSD:ES108090.1,
INSD:AV540832.1,INSD:EL002766.1,INSD:EH994804.1,
INSD:EL138557.1,INSD:AV540590.1,INSD:EL303650.1,
INSD:DR201226.1,INSD:EL256975.1,INSD:EL060499.1,
INSD:EH884487.1,INSD:EH858300.1,INSD:EL230275.1,
INSD:EL024163.1,INSD:EL001740.1,INSD:EL161834.1,
INSD:EH922239.1,INSD:EL001146.1,INSD:ES000796.1,
INSD:ES038369.1,INSD:EH939882.1,INSD:DR379995.1,
INSD:EH914948.1,INSD:AV541140.1,INSD:DR245022.1,
INSD:F13881.1,INSD:EL118565.1,INSD:EL299234.1,
INSD:EH907301.1,INSD:BP610962.1,INSD:EL200181.1,
INSD:ES081139.1,INSD:DR201230.1,INSD:EH970677.1,
INSD:EH967202.1,INSD:EH888316.1,INSD:EL059565.1,
INSD:ES073981.1,INSD:ES080495.1,INSD:EL062497.1,
INSD:EL285185.1,INSD:BP786913.1,INSD:F13999.1,
INSD:EL014724.1,INSD:EH876573.1,INSD:EH916180.1,
INSD:ES135446.1,INSD:EL175727.1,INSD:EL100621.1,
INSD:ES198016.1,INSD:DR245021.1,INSD:EL305879.1,
INSD:EL316848.1,INSD:EH974455.1,INSD:EL260024.1,
INSD:ES145042.1,INSD:EL116957.1,INSD:ES074590.1,
INSD:ES199544.1,INSD:ES160858.1,INSD:ES139602.1,
INSD:AV539438.1,INSD:EH851163.1,INSD:EH879106.1,
INSD:ES017899.1,INSD:AV530000.1,INSD:ES131360.1,
INSD:EH826057.1,INSD:ES023300.1,INSD:EH858951.1,
INSD:EL225152.1,INSD:EL089515.1,INSD:ES007163.1,
INSD:ES184009.1,INSD:ES098156.1,INSD:EL032954.1,
INSD:EL108607.1,INSD:EL113844.1,INSD:EH962622.1,
INSD:EL106385.1,INSD:BP600563.1,INSD:EL099604.1,
INSD:EL268533.1,INSD:ES210915.1,INSD:EL175388.1,
INSD:EL277063.1,INSD:DR201222.1,INSD:ES149255.1,
INSD:EL279326.1,INSD:EG460859.1,INSD:EL136616.1,
INSD:EL140546.1,INSD:EL010019.1,INSD:T22153.1,
INSD:EL068619.1,INSD:ES115906.1,INSD:ES166831.1,
INSD:ES149628.1,INSD:EL315818.1,INSD:EL108849.1,
INSD:EL164621.1,INSD:EH862478.1,INSD:ES086612.1,
INSD:EH818228.1,INSD:T42829.1,INSD:EL273499.1,
INSD:EL258597.1,INSD:BE526722.1,INSD:DR201228.1,
INSD:EL135700.1,INSD:CD534987.1,INSD:EH800935.1,
INSD:AA650729.1,INSD:ES034364.1,INSD:Z17546.1,
INSD:EH919469.1,INSD:EH917046.1,INSD:EH847947.1,
INSD:T43180.1,INSD:ES106741.1,INSD:EL100854.1,
INSD:EL260466.1,INSD:EL276491.1,INSD:EH801751.1,
INSD:EH924405.1,INSD:ES130842.1,INSD:EH844780.1,
INSD:EL188681.1,INSD:EL252021.1,INSD:ES169869.1,
INSD:DR375513.1,INSD:EH823473.1,INSD:ES037524.1,
INSD:EL213071.1,INSD:EL068780.1,INSD:ES076076.1,
INSD:EL028044.1,INSD:T21738.1,INSD:EH807366.1,
INSD:EH844522.1,INSD:EL333865.1,INSD:EH860038.1,
INSD:ES104440.1,INSD:EL152815.1,INSD:EL320589.1,
INSD:EH884481.1,INSD:AI099945.1,INSD:EL323653.1,
INSD:AV551503.1,INSD:EL007956.1,INSD:EL064029.1,
INSD:EL278738.1,INSD:CD531633.1,INSD:EG522132.1,
INSD:DR201223.1,INSD:ES196749.1,INSD:EL124551.1,
INSD:EL325522.1,INSD:ES166218.1,INSD:EL046494.1,
INSD:EL284464.1,INSD:EL153670.1,INSD:EL208408.1,
INSD:ES165077.1,INSD:EH938946.1,INSD:EH843699.1,
INSD:ES133923.1,INSD:ES159707.1,INSD:ES080014.1,
INSD:EH815880.1,INSD:ES079240.1,INSD:ES185949.1,
INSD:EL987582.1,INSD:AV550127.1,INSD:DR201225.1,
INSD:ES190926.1,INSD:ES106037.1,INSD:DR201227.1,
INSD:EG489273.1,INSD:ES058569.1,INSD:EL272339.1,
INSD:EL133824.1,INSD:EL176520.1,INSD:EL206495.1,
INSD:AV535419.1,INSD:EH876840.1,INSD:EL126586.1,
INSD:ES032553.1,INSD:EL003585.1,INSD:ES168198.1,
INSD:EH865714.1,INSD:EH991678.1,INSD:BP562163.2,
INSD:AV543626.1,INSD:ES036843.1,INSD:EL089522.1,
INSD:EL218196.1,INSD:ES002402.1,INSD:EL329094.1,
INSD:EL073182.1,INSD:ES112451.1,INSD:EL201426.1,
INSD:ES068046.1,INSD:EL285652.1,INSD:ES191409.1,
INSD:ES133776.1,INSD:EL199679.1,INSD:EL290378.1,
INSD:EL069176.1,INSD:EH993954.1,INSD:EH960056.1,
INSD:EH807615.1,INSD:ES138313.1,INSD:EL290349.1,
INSD:EL339364.1,INSD:BP804651.1,INSD:EL970564.1,
INSD:EL232610.1,INSD:EL218179.1,INSD:EL227732.1,
INSD:EH910330.1,INSD:EL195311.1,INSD:ES100951.1,
INSD:EL028711.1,INSD:EL333494.1,INSD:ES102201.1,
INSD:EL097183.1,INSD:AV542616.1,INSD:ES094174.1,
INSD:EH901060.1,INSD:ES014895.1,INSD:EH931926.1,
INSD:AV550355.1,INSD:EL163297.1,INSD:CB262638.1,
INSD:ES107260.1,INSD:ES161316.1,INSD:EL217647.1,
INSD:ES171963.1,INSD:ES115053.1,INSD:EL256788.1,
INSD:EL241657.1,INSD:AV546718.1,INSD:EL052676.1,
INSD:EL212447.1,INSD:EH949329.1,INSD:EG429419.1,
INSD:ES088477.1,INSD:AV542842.1,INSD:ES167245.1,
INSD:BP835089.1,INSD:N38707.1,INSD:EH930392.1,
INSD:ES101176.1,INSD:CD530521.1,INSD:ES112478.1,
INSD:EH916424.1,INSD:T44688.1,INSD:EL159920.1,
INSD:T75626.1,INSD:DR201221.1,INSD:EG479263.1,
INSD:EL100125.1,INSD:ES195038.1,INSD:ES131346.1,
INSD:ES151914.1,INSD:EH834180.1,INSD:H77066.1,
INSD:DR201229.1,INSD:EH874765.1,INSD:ES091266.1,
INSD:AV534659.1,INSD:ES063075.1,INSD:EH948182.1,
INSD:EH977106.1,INSD:T13643.1,INSD:EH844397.1,
INSD:ES141047.1,INSD:DR276370.1,INSD:EH818869.1,
INSD:T42229.1,INSD:AV548802.1,INSD:ES180238.1,
INSD:DR377150.1,INSD:DR376297.1,INSD:EH840117.1,
INSD:AV808981.1,INSD:AV535661.1,INSD:EL272407.1,
INSD:T44856.1,INSD:ES092426.1,INSD:EL150466.1,
INSD:EH941027.1,INSD:EH959632.1,INSD:ES106828.1,
INSD:EH863966.1,INSD:AV543597.1,INSD:EL127036.1,
INSD:EL069036.1,INSD:EL180616.1,INSD:EL222180.1,
INSD:EL002564.1,INSD:ES151340.1,INSD:ES118768.1,
INSD:EH809737.1,INSD:CB264216.1,INSD:T46434.1,
INSD:ES095649.1,INSD:ES047384.1,INSD:EL050884.1,
INSD:EL246597.1,INSD:ES150118.1,INSD:ES001648.1,
INSD:DR201231.1,INSD:EL043462.1,INSD:ES069459.1,
INSD:ES165717.1,INSD:ES064698.1,INSD:ES087515.1,
INSD:ES001931.1,INSD:EL017649.1,INSD:EL189834.1,
INSD:ES108573.1,INSD:ES052249.1,INSD:ES051287.1,
INSD:EH991052.1,INSD:EL333791.1,INSD:EH841214.1,
INSD:EL038820.1,INSD:EL220651.1,INSD:ES059752.1,
INSD:ES194461.1,INSD:ES201753.1,INSD:EL041884.1,
INSD:AV524158.1,INSD:EL967244.1,INSD:ES214468.1,
INSD:EL132615.1,INSD:EL103593.1,INSD:ES138908.1,
INSD:ES183211.1,INSD:ES209707.1,INSD:EL083117.1,
INSD:EL289504.1,INSD:EH870588.1,INSD:EL144937.1,
INSD:CK118056.1,INSD:ES181085.1,INSD:R90714.1,
INSD:CA963932.1,INSD:EH994482.1,INSD:EH890784.1,
INSD:EL120109.1,INSD:EH859332.1,INSD:EH917296.1,
INSD:EH943098.1,INSD:EL187953.1,INSD:EH910405.1,
INSD:EG498092.1,INSD:EL288076.1,INSD:EL006698.1,
INSD:ES075860.1,INSD:ES185302.1,INSD:H37466.1,
INSD:AV525349.1,INSD:EL122465.1,INSD:EH834673.1,
INSD:EH903253.1,INSD:ES142350.1,INSD:EL316093.1,
INSD:T43891.1,INSD:EL034003.1,INSD:EL253561.1,
INSD:EL306686.1,INSD:ES165873.1,INSD:AV539121.1,
INSD:ES190722.1,INSD:ES141626.1,INSD:ES076411.1,
INSD:DR201224.1,INSD:CK119721.1,INSD:EL115756.1,
INSD:EL282828.1,INSD:EH938656.1,INSD:EH838905.1,
INSD:EL979739.1,INSD:AV546406.1,INSD:AV538187.1,
INSD:EH856543.1,INSD:EL211149.1,INSD:EL061228.1,
INSD:ES185433.1,INSD:ES119232.1,INSD:H36506.1,
INSD:ES065189.1,INSD:EL285970.1,INSD:EH897724.1,
INSD:ES039829.1,INSD:EL250549.1,INSD:AI993263.1,
INSD:BP828790.2,INSD:EL080153.1,INSD:EL015349.1,
INSD:EH909107.1,INSD:EL288785.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BT002354.1,INSD:AK222061.1,INSD:L19418.1,
INSD:BX827355.1,INSD:BX828392.1,INSD:AY080718.1"
/note="poly(A) binding protein 2 (PAB2); FUNCTIONS IN: RNA
binding, translation initiation factor activity; INVOLVED
IN: response to salt stress, translational initiation;
EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 17
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Polyadenylate-binding protein/Hyperplastic disc protein
(InterPro:IPR002004), RNA recognition motif, RNP-1
(InterPro:IPR000504), Polyadenylate binding protein, human
types 1, 2, 3, 4 (InterPro:IPR006515), Paraneoplastic
encephalomyelitis antigen (InterPro:IPR002343),
Nucleotide-binding, alpha-beta plait (InterPro:IPR012677);
BEST Arabidopsis thaliana protein match is: poly(A)
binding protein 8 (TAIR:AT1G49760.2); Has 987994 Blast
hits to 947802 proteins in 35008 species: Archae - 20430;
Bacteria - 568582; Metazoa - 213912; Fungi - 30250; Plants
- 62241; Viruses - 64851; Other Eukaryotes - 27728
(source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G34110"
/db_xref="Araport:AT4G34110"
intron_pos 90:1 (1/8)
intron_pos 130:0 (2/8)
intron_pos 349:0 (3/8)
intron_pos 375:0 (4/8)
intron_pos 405:0 (5/8)
intron_pos 451:0 (6/8)
intron_pos 508:0 (7/8)
intron_pos 558:0 (8/8)
BEGIN
1 MAQVQLQGQT PNGSTAAVTS APATSGGATA TQFGNTSLYV GDLDFNVTDS QLFDAFGQMG
61 TVVTVRVCRD LVTRRSLGYG YVNFTNPQDA ARAIQELNYI PLYGKPIRVM YSHRDPSVRR
121 SGAGNIFIKN LDESIDHKAL HDTFSSFGNI VSCKVAVDSS GQSKGYGFVQ YANEESAQKA
181 IEKLNGMLLN DKQVYVGPFL RRQERDSTAN KTKFTNVYVK NLAESTTDDD LKNAFGEYGK
241 ITSAVVMKDG EGKSKGFGFV NFENADDAAR AVESLNGHKF DDKEWYVGRA QKKSERETEL
301 RVRYEQNLKE AADKFQSSNL YVKNLDPSIS DEKLKEIFSP FGTVTSSKVM RDPNGTSKGS
361 GFVAFATPEE ATEAMSQLSG KMIESKPLYV AIAQRKEDRR VRLQAQFSQV RPVAMQPSVG
421 PRMPVYPPGG PGIGQQMFYG QAPPAMIPPQ PGYGYQQQLV PGMRPGGGPV PSFFMPMVQP
481 QQQRPGGGRR PGGIQHSQQQ NPMMQQQMHP RGRMFRYPQG RGGSGDVPPY DMGNNMPLTI
541 GALASNLSNA TPEQQRTMLG EVLYPLVEQV EAESAAKVTG MLLEMDQTEV LHLLESPEAL
601 KAKVAEAMDV LRSVAAGGAT EQLASLNLS
//