LOCUS AEE86325.1 629 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana poly(A) binding protein 2 protein. ACCESSION CP002687-6297 PROTEIN_ID AEE86325.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G., Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N., Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M., Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R., Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M., Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M., Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W., Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L., Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J., Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I., Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U., Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M., Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M., Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C., Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J., Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S., Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A., Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D., Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S., Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O., Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S., Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F., Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T., Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A., Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D., Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P., Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W., Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M., Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E., Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M., Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G., Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A., Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N., Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M., Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S., Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K., Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C., Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D., Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A., Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N., Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M., Martienssen,R. and McCombie,W.R. TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999) PUBMED 10617198 REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="4" /ecotype="Columbia" protein /gene="PAB2" /locus_tag="AT4G34110" /gene_synonym="ARABIDOPSIS POLY(A) BINDING 2" /gene_synonym="ATPAB2" /gene_synonym="F28A23.130" /gene_synonym="F28A23_130" /gene_synonym="PABP2" /gene_synonym="poly(A) binding protein 2" /gene_synonym="POLY(A) BINDING PROTEIN 2" /gene_synonym="POLY(A)-BINDING PROTEIN 2" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:EH897083.1,INSD:EL135840.1,INSD:EL115703.1, INSD:EL050646.1,INSD:EL333941.1,INSD:ES108090.1, INSD:AV540832.1,INSD:EL002766.1,INSD:EH994804.1, INSD:EL138557.1,INSD:AV540590.1,INSD:EL303650.1, INSD:DR201226.1,INSD:EL256975.1,INSD:EL060499.1, INSD:EH884487.1,INSD:EH858300.1,INSD:EL230275.1, INSD:EL024163.1,INSD:EL001740.1,INSD:EL161834.1, INSD:EH922239.1,INSD:EL001146.1,INSD:ES000796.1, INSD:ES038369.1,INSD:EH939882.1,INSD:DR379995.1, INSD:EH914948.1,INSD:AV541140.1,INSD:DR245022.1, INSD:F13881.1,INSD:EL118565.1,INSD:EL299234.1, INSD:EH907301.1,INSD:BP610962.1,INSD:EL200181.1, INSD:ES081139.1,INSD:DR201230.1,INSD:EH970677.1, INSD:EH967202.1,INSD:EH888316.1,INSD:EL059565.1, INSD:ES073981.1,INSD:ES080495.1,INSD:EL062497.1, INSD:EL285185.1,INSD:BP786913.1,INSD:F13999.1, INSD:EL014724.1,INSD:EH876573.1,INSD:EH916180.1, INSD:ES135446.1,INSD:EL175727.1,INSD:EL100621.1, INSD:ES198016.1,INSD:DR245021.1,INSD:EL305879.1, INSD:EL316848.1,INSD:EH974455.1,INSD:EL260024.1, INSD:ES145042.1,INSD:EL116957.1,INSD:ES074590.1, INSD:ES199544.1,INSD:ES160858.1,INSD:ES139602.1, INSD:AV539438.1,INSD:EH851163.1,INSD:EH879106.1, INSD:ES017899.1,INSD:AV530000.1,INSD:ES131360.1, INSD:EH826057.1,INSD:ES023300.1,INSD:EH858951.1, INSD:EL225152.1,INSD:EL089515.1,INSD:ES007163.1, INSD:ES184009.1,INSD:ES098156.1,INSD:EL032954.1, INSD:EL108607.1,INSD:EL113844.1,INSD:EH962622.1, INSD:EL106385.1,INSD:BP600563.1,INSD:EL099604.1, INSD:EL268533.1,INSD:ES210915.1,INSD:EL175388.1, INSD:EL277063.1,INSD:DR201222.1,INSD:ES149255.1, INSD:EL279326.1,INSD:EG460859.1,INSD:EL136616.1, INSD:EL140546.1,INSD:EL010019.1,INSD:T22153.1, INSD:EL068619.1,INSD:ES115906.1,INSD:ES166831.1, INSD:ES149628.1,INSD:EL315818.1,INSD:EL108849.1, INSD:EL164621.1,INSD:EH862478.1,INSD:ES086612.1, INSD:EH818228.1,INSD:T42829.1,INSD:EL273499.1, INSD:EL258597.1,INSD:BE526722.1,INSD:DR201228.1, INSD:EL135700.1,INSD:CD534987.1,INSD:EH800935.1, INSD:AA650729.1,INSD:ES034364.1,INSD:Z17546.1, INSD:EH919469.1,INSD:EH917046.1,INSD:EH847947.1, INSD:T43180.1,INSD:ES106741.1,INSD:EL100854.1, INSD:EL260466.1,INSD:EL276491.1,INSD:EH801751.1, INSD:EH924405.1,INSD:ES130842.1,INSD:EH844780.1, INSD:EL188681.1,INSD:EL252021.1,INSD:ES169869.1, INSD:DR375513.1,INSD:EH823473.1,INSD:ES037524.1, INSD:EL213071.1,INSD:EL068780.1,INSD:ES076076.1, INSD:EL028044.1,INSD:T21738.1,INSD:EH807366.1, INSD:EH844522.1,INSD:EL333865.1,INSD:EH860038.1, INSD:ES104440.1,INSD:EL152815.1,INSD:EL320589.1, INSD:EH884481.1,INSD:AI099945.1,INSD:EL323653.1, INSD:AV551503.1,INSD:EL007956.1,INSD:EL064029.1, INSD:EL278738.1,INSD:CD531633.1,INSD:EG522132.1, INSD:DR201223.1,INSD:ES196749.1,INSD:EL124551.1, INSD:EL325522.1,INSD:ES166218.1,INSD:EL046494.1, INSD:EL284464.1,INSD:EL153670.1,INSD:EL208408.1, INSD:ES165077.1,INSD:EH938946.1,INSD:EH843699.1, INSD:ES133923.1,INSD:ES159707.1,INSD:ES080014.1, INSD:EH815880.1,INSD:ES079240.1,INSD:ES185949.1, INSD:EL987582.1,INSD:AV550127.1,INSD:DR201225.1, INSD:ES190926.1,INSD:ES106037.1,INSD:DR201227.1, INSD:EG489273.1,INSD:ES058569.1,INSD:EL272339.1, INSD:EL133824.1,INSD:EL176520.1,INSD:EL206495.1, INSD:AV535419.1,INSD:EH876840.1,INSD:EL126586.1, INSD:ES032553.1,INSD:EL003585.1,INSD:ES168198.1, INSD:EH865714.1,INSD:EH991678.1,INSD:BP562163.2, INSD:AV543626.1,INSD:ES036843.1,INSD:EL089522.1, INSD:EL218196.1,INSD:ES002402.1,INSD:EL329094.1, INSD:EL073182.1,INSD:ES112451.1,INSD:EL201426.1, INSD:ES068046.1,INSD:EL285652.1,INSD:ES191409.1, INSD:ES133776.1,INSD:EL199679.1,INSD:EL290378.1, INSD:EL069176.1,INSD:EH993954.1,INSD:EH960056.1, INSD:EH807615.1,INSD:ES138313.1,INSD:EL290349.1, INSD:EL339364.1,INSD:BP804651.1,INSD:EL970564.1, INSD:EL232610.1,INSD:EL218179.1,INSD:EL227732.1, INSD:EH910330.1,INSD:EL195311.1,INSD:ES100951.1, INSD:EL028711.1,INSD:EL333494.1,INSD:ES102201.1, INSD:EL097183.1,INSD:AV542616.1,INSD:ES094174.1, INSD:EH901060.1,INSD:ES014895.1,INSD:EH931926.1, INSD:AV550355.1,INSD:EL163297.1,INSD:CB262638.1, INSD:ES107260.1,INSD:ES161316.1,INSD:EL217647.1, INSD:ES171963.1,INSD:ES115053.1,INSD:EL256788.1, INSD:EL241657.1,INSD:AV546718.1,INSD:EL052676.1, INSD:EL212447.1,INSD:EH949329.1,INSD:EG429419.1, INSD:ES088477.1,INSD:AV542842.1,INSD:ES167245.1, INSD:BP835089.1,INSD:N38707.1,INSD:EH930392.1, INSD:ES101176.1,INSD:CD530521.1,INSD:ES112478.1, INSD:EH916424.1,INSD:T44688.1,INSD:EL159920.1, INSD:T75626.1,INSD:DR201221.1,INSD:EG479263.1, INSD:EL100125.1,INSD:ES195038.1,INSD:ES131346.1, INSD:ES151914.1,INSD:EH834180.1,INSD:H77066.1, INSD:DR201229.1,INSD:EH874765.1,INSD:ES091266.1, INSD:AV534659.1,INSD:ES063075.1,INSD:EH948182.1, INSD:EH977106.1,INSD:T13643.1,INSD:EH844397.1, INSD:ES141047.1,INSD:DR276370.1,INSD:EH818869.1, INSD:T42229.1,INSD:AV548802.1,INSD:ES180238.1, INSD:DR377150.1,INSD:DR376297.1,INSD:EH840117.1, INSD:AV808981.1,INSD:AV535661.1,INSD:EL272407.1, INSD:T44856.1,INSD:ES092426.1,INSD:EL150466.1, INSD:EH941027.1,INSD:EH959632.1,INSD:ES106828.1, INSD:EH863966.1,INSD:AV543597.1,INSD:EL127036.1, INSD:EL069036.1,INSD:EL180616.1,INSD:EL222180.1, INSD:EL002564.1,INSD:ES151340.1,INSD:ES118768.1, INSD:EH809737.1,INSD:CB264216.1,INSD:T46434.1, INSD:ES095649.1,INSD:ES047384.1,INSD:EL050884.1, INSD:EL246597.1,INSD:ES150118.1,INSD:ES001648.1, INSD:DR201231.1,INSD:EL043462.1,INSD:ES069459.1, INSD:ES165717.1,INSD:ES064698.1,INSD:ES087515.1, INSD:ES001931.1,INSD:EL017649.1,INSD:EL189834.1, INSD:ES108573.1,INSD:ES052249.1,INSD:ES051287.1, INSD:EH991052.1,INSD:EL333791.1,INSD:EH841214.1, INSD:EL038820.1,INSD:EL220651.1,INSD:ES059752.1, INSD:ES194461.1,INSD:ES201753.1,INSD:EL041884.1, INSD:AV524158.1,INSD:EL967244.1,INSD:ES214468.1, INSD:EL132615.1,INSD:EL103593.1,INSD:ES138908.1, INSD:ES183211.1,INSD:ES209707.1,INSD:EL083117.1, INSD:EL289504.1,INSD:EH870588.1,INSD:EL144937.1, INSD:CK118056.1,INSD:ES181085.1,INSD:R90714.1, INSD:CA963932.1,INSD:EH994482.1,INSD:EH890784.1, INSD:EL120109.1,INSD:EH859332.1,INSD:EH917296.1, INSD:EH943098.1,INSD:EL187953.1,INSD:EH910405.1, INSD:EG498092.1,INSD:EL288076.1,INSD:EL006698.1, INSD:ES075860.1,INSD:ES185302.1,INSD:H37466.1, INSD:AV525349.1,INSD:EL122465.1,INSD:EH834673.1, INSD:EH903253.1,INSD:ES142350.1,INSD:EL316093.1, INSD:T43891.1,INSD:EL034003.1,INSD:EL253561.1, INSD:EL306686.1,INSD:ES165873.1,INSD:AV539121.1, INSD:ES190722.1,INSD:ES141626.1,INSD:ES076411.1, INSD:DR201224.1,INSD:CK119721.1,INSD:EL115756.1, INSD:EL282828.1,INSD:EH938656.1,INSD:EH838905.1, INSD:EL979739.1,INSD:AV546406.1,INSD:AV538187.1, INSD:EH856543.1,INSD:EL211149.1,INSD:EL061228.1, INSD:ES185433.1,INSD:ES119232.1,INSD:H36506.1, INSD:ES065189.1,INSD:EL285970.1,INSD:EH897724.1, INSD:ES039829.1,INSD:EL250549.1,INSD:AI993263.1, INSD:BP828790.2,INSD:EL080153.1,INSD:EL015349.1, INSD:EH909107.1,INSD:EL288785.1" /inference="Similar to RNA sequence, mRNA:INSD:BT002354.1,INSD:AK222061.1,INSD:L19418.1, INSD:BX827355.1,INSD:BX828392.1,INSD:AY080718.1" /note="poly(A) binding protein 2 (PAB2); FUNCTIONS IN: RNA binding, translation initiation factor activity; INVOLVED IN: response to salt stress, translational initiation; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 17 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Polyadenylate-binding protein/Hyperplastic disc protein (InterPro:IPR002004), RNA recognition motif, RNP-1 (InterPro:IPR000504), Polyadenylate binding protein, human types 1, 2, 3, 4 (InterPro:IPR006515), Paraneoplastic encephalomyelitis antigen (InterPro:IPR002343), Nucleotide-binding, alpha-beta plait (InterPro:IPR012677); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: poly(A) binding protein 8 (TAIR:AT1G49760.2); Has 987994 Blast hits to 947802 proteins in 35008 species: Archae - 20430; Bacteria - 568582; Metazoa - 213912; Fungi - 30250; Plants - 62241; Viruses - 64851; Other Eukaryotes - 27728 (source: NCBI BLink)." /db_xref="TAIR:AT4G34110" /db_xref="Araport:AT4G34110" intron_pos 90:1 (1/8) intron_pos 130:0 (2/8) intron_pos 349:0 (3/8) intron_pos 375:0 (4/8) intron_pos 405:0 (5/8) intron_pos 451:0 (6/8) intron_pos 508:0 (7/8) intron_pos 558:0 (8/8) BEGIN 1 MAQVQLQGQT PNGSTAAVTS APATSGGATA TQFGNTSLYV GDLDFNVTDS QLFDAFGQMG 61 TVVTVRVCRD LVTRRSLGYG YVNFTNPQDA ARAIQELNYI PLYGKPIRVM YSHRDPSVRR 121 SGAGNIFIKN LDESIDHKAL HDTFSSFGNI VSCKVAVDSS GQSKGYGFVQ YANEESAQKA 181 IEKLNGMLLN DKQVYVGPFL RRQERDSTAN KTKFTNVYVK NLAESTTDDD LKNAFGEYGK 241 ITSAVVMKDG EGKSKGFGFV NFENADDAAR AVESLNGHKF DDKEWYVGRA QKKSERETEL 301 RVRYEQNLKE AADKFQSSNL YVKNLDPSIS DEKLKEIFSP FGTVTSSKVM RDPNGTSKGS 361 GFVAFATPEE ATEAMSQLSG KMIESKPLYV AIAQRKEDRR VRLQAQFSQV RPVAMQPSVG 421 PRMPVYPPGG PGIGQQMFYG QAPPAMIPPQ PGYGYQQQLV PGMRPGGGPV PSFFMPMVQP 481 QQQRPGGGRR PGGIQHSQQQ NPMMQQQMHP RGRMFRYPQG RGGSGDVPPY DMGNNMPLTI 541 GALASNLSNA TPEQQRTMLG EVLYPLVEQV EAESAAKVTG MLLEMDQTEV LHLLESPEAL 601 KAKVAEAMDV LRSVAAGGAT EQLASLNLS //