LOCUS AEE85946.1 250 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana ribosomal protein S6 protein.
ACCESSION CP002687-5789
PROTEIN_ID AEE85946.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="RPS6"
/locus_tag="AT4G31700"
/gene_synonym="AtRPS6"
/gene_synonym="F28M20.110"
/gene_synonym="F28M20_110"
/gene_synonym="ribosomal protein S6"
/gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN S6"
/gene_synonym="RPS6A"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR333668.1,INSD:ES009606.1,INSD:BP648837.1,
INSD:DR333677.1,INSD:ES007702.1,INSD:DR333710.1,
INSD:EH810325.1,INSD:DR333666.1,INSD:EL983752.1,
INSD:DR333688.1,INSD:EL171460.1,INSD:EL201051.1,
INSD:ES161700.1,INSD:DR333655.1,INSD:ES092125.1,
INSD:EH918666.1,INSD:EL017131.1,INSD:EH917478.1,
INSD:ES171541.1,INSD:ES135316.1,INSD:ES176528.1,
INSD:ES109500.1,INSD:EL174174.1,INSD:ES087986.1,
INSD:ES151350.1,INSD:DR375328.1,INSD:BP641264.1,
INSD:DR333693.1,INSD:DR333654.1,INSD:EL169728.1,
INSD:EL223301.1,INSD:ES135185.1,INSD:DR333658.1,
INSD:EL121011.1,INSD:EH937094.1,INSD:EL984436.1,
INSD:AV555414.1,INSD:ES123096.1,INSD:DR333679.1,
INSD:EL996763.1,INSD:ES012692.1,INSD:EL978171.1,
INSD:DR333673.1,INSD:DR333676.1,INSD:DR333642.1,
INSD:BP857869.1,INSD:BP791686.1,INSD:ES104326.1,
INSD:EL995192.1,INSD:DR333649.1,INSD:ES212881.1,
INSD:EG444328.1,INSD:ES105593.1,INSD:DR333685.1,
INSD:EL124338.1,INSD:EL972846.1,INSD:Z26511.1,
INSD:EH834570.1,INSD:BP657995.1,INSD:ES044916.1,
INSD:AI100228.1,INSD:BP577131.1,INSD:EG472245.1,
INSD:EL253803.1,INSD:EL999129.1,INSD:AV791144.1,
INSD:DR333643.1,INSD:DR226333.1,INSD:EL171099.1,
INSD:EH888595.1,INSD:EL321221.1,INSD:EL999483.1,
INSD:ES034912.1,INSD:EL016535.1,INSD:DR333684.1,
INSD:EL295713.1,INSD:EH911136.1,INSD:EL998515.1,
INSD:ES128668.1,INSD:EH965030.1,INSD:EL008042.1,
INSD:EG439875.1,INSD:ES102158.1,INSD:DR333709.1,
INSD:BP793261.1,INSD:BE039444.1,INSD:EL325211.1,
INSD:AV804183.1,INSD:DR333651.1,INSD:ES101571.1,
INSD:ES094934.1,INSD:EL066626.1,INSD:ES203956.1,
INSD:AV550020.1,INSD:ES093007.1,INSD:ES075634.1,
INSD:BP793808.1,INSD:CK118498.1,INSD:ES080616.1,
INSD:DR333671.1,INSD:ES168763.1,INSD:DR333639.1,
INSD:DR333636.1,INSD:ES094316.1,INSD:EL051822.1,
INSD:DR333663.1,INSD:EL142417.1,INSD:DR333662.1,
INSD:ES147528.1,INSD:ES011077.1,INSD:ES122288.1,
INSD:DR333653.1,INSD:DR336326.1,INSD:ES095542.1,
INSD:EH906377.1,INSD:CK119198.1,INSD:ES200215.1,
INSD:EL131095.1,INSD:EL065927.1,INSD:BP781854.1,
INSD:EL055040.1,INSD:EL263453.1,INSD:EL997196.1,
INSD:ES132122.1,INSD:EH929887.1,INSD:DR333694.1,
INSD:BP663057.1,INSD:EL982946.1,INSD:EL015105.1,
INSD:ES109693.1,INSD:EL058672.1,INSD:ES125141.1,
INSD:DR333701.1,INSD:ES061976.1,INSD:ES166553.1,
INSD:EL980701.1,INSD:ES169778.1,INSD:ES069046.1,
INSD:EL058126.1,INSD:EL996761.1,INSD:EL272107.1,
INSD:EL326049.1,INSD:DR333641.1,INSD:ES130324.1,
INSD:ES059687.1,INSD:EG494946.1,INSD:DR333674.1,
INSD:DR333644.1,INSD:EL970780.1,INSD:EH869918.1,
INSD:BP586474.1,INSD:EL166972.1,INSD:ES084742.1,
INSD:ES104914.1,INSD:EL987965.1,INSD:DR333670.1,
INSD:EH877669.1,INSD:DR333681.1,INSD:EL992133.1,
INSD:ES161109.1,INSD:EL993136.1,INSD:EH884456.1,
INSD:EL061732.1,INSD:BP789206.1,INSD:DR333665.1,
INSD:EH913496.1,INSD:ES006740.1,INSD:EH809571.1,
INSD:EH865701.1,INSD:DR333708.1,INSD:EH833256.1,
INSD:ES166304.1,INSD:ES096505.1,INSD:ES065445.1,
INSD:DR333687.1,INSD:ES047552.1,INSD:ES024896.1,
INSD:EL969422.1,INSD:ES078119.1,INSD:EL275243.1,
INSD:ES156065.1,INSD:EH968441.1,INSD:DR333697.1,
INSD:EL338661.1,INSD:DR333657.1,INSD:EL335123.1,
INSD:Z26047.1,INSD:DR333656.1,INSD:EH934111.1,
INSD:ES060998.1,INSD:AV800990.1,INSD:ES058734.1,
INSD:ES011915.1,INSD:EL975344.1,INSD:EL268285.1,
INSD:ES020097.1,INSD:EG480811.1,INSD:DR333640.1,
INSD:EL309845.1,INSD:EG486624.1,INSD:EH855330.1,
INSD:EH974079.1,INSD:DR333686.1,INSD:ES172063.1,
INSD:EL334469.1,INSD:DR333638.1,INSD:EL998257.1,
INSD:ES211564.1,INSD:DR333652.1,INSD:ES159504.1,
INSD:EL193077.1,INSD:EL006643.1,INSD:EL286577.1,
INSD:EH871778.1,INSD:ES161201.1,INSD:DR333698.1,
INSD:EH968934.1,INSD:ES082599.1,INSD:EL074291.1,
INSD:EH921753.1,INSD:EL976828.1,INSD:ES032106.1,
INSD:ES214697.1,INSD:EG439876.1,INSD:CK119740.1,
INSD:EL981106.1,INSD:BP561437.1,INSD:EH958358.1,
INSD:DR333647.1,INSD:ES180740.1,INSD:DR333689.1,
INSD:DR375238.1,INSD:DR333705.1,INSD:EH907515.1,
INSD:DR242031.1,INSD:ES147764.1,INSD:EL985364.1,
INSD:ES074398.1,INSD:DR333637.1,INSD:DR333695.1,
INSD:DR226332.1,INSD:ES212198.1,INSD:DR333669.1,
INSD:ES137010.1,INSD:AV814810.1,INSD:EG422230.1,
INSD:EL977195.1,INSD:ES010774.1,INSD:ES026956.1,
INSD:DR333683.1,INSD:DR333659.1,INSD:ES188794.1,
INSD:ES044934.1,INSD:EL231591.1,INSD:EL199523.1,
INSD:EL968390.1,INSD:ES015304.1,INSD:EL986211.1,
INSD:EL148253.1,INSD:EL030129.1,INSD:T14075.1,
INSD:EL272433.1,INSD:EL310798.1,INSD:BP782916.1,
INSD:EL287802.1,INSD:EL986783.1,INSD:DR333680.1,
INSD:EL102962.1,INSD:EL998972.1,INSD:EH802691.1,
INSD:ES184679.1,INSD:DR333672.1,INSD:EG468413.1,
INSD:EH858550.1,INSD:DR333703.1,INSD:Z26048.1,
INSD:DR333696.1,INSD:EH926032.1,INSD:ES154621.1,
INSD:EL187193.1,INSD:ES068625.1,INSD:EG468412.1,
INSD:ES153510.1,INSD:DR333699.1,INSD:ES043019.1,
INSD:ES023016.1,INSD:DR333675.1,INSD:EL240805.1,
INSD:EL970392.1,INSD:EL135999.1,INSD:ES014424.1,
INSD:ES205702.1,INSD:EH863092.1,INSD:ES113403.1,
INSD:ES097960.1,INSD:ES160737.1,INSD:EL144816.1,
INSD:ES209700.1,INSD:DR333690.1,INSD:EL107903.1,
INSD:EG468951.1,INSD:EL976491.1,INSD:EL025148.1,
INSD:DR333691.1,INSD:EL214235.1,INSD:ES101958.1,
INSD:EL302377.1,INSD:EL982210.1,INSD:EH973117.1,
INSD:ES106109.1,INSD:ES055260.1,INSD:EL990999.1,
INSD:DR333661.1,INSD:BP793805.1,INSD:EL094907.1,
INSD:ES075347.1,INSD:AV549246.1,INSD:DR333692.1,
INSD:ES214269.1,INSD:AV537918.1,INSD:DR333645.1,
INSD:EL045420.1,INSD:EH983341.1,INSD:ES043532.1,
INSD:AV808855.1,INSD:EG480810.1,INSD:EL300963.1,
INSD:EH832496.1,INSD:ES214712.1,INSD:EG468940.1,
INSD:ES201060.1,INSD:ES201831.1,INSD:ES143446.1,
INSD:AV791312.1,INSD:EH843211.1,INSD:ES065450.1,
INSD:EH965554.1,INSD:AV567584.1,INSD:ES118832.1,
INSD:EG439277.1,INSD:ES090366.1,INSD:EH976377.1,
INSD:ES190218.1,INSD:ES152761.1,INSD:EL127483.1,
INSD:DR377056.1,INSD:DR333707.1,INSD:EL983438.1,
INSD:EH880629.1,INSD:ES007525.1,INSD:EL990892.1,
INSD:EL995565.1,INSD:DR333682.1,INSD:EL974747.1,
INSD:ES160706.1,INSD:DR333664.1,INSD:ES017622.1,
INSD:EG445041.1,INSD:DR333702.1,INSD:BP780993.1,
INSD:ES184258.1,INSD:DR333704.1,INSD:EH796272.1,
INSD:DR333650.1,INSD:AV799241.1,INSD:DR333678.1,
INSD:EL057358.1,INSD:EL149345.1,INSD:EL117802.1,
INSD:BP778907.1,INSD:EL325793.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BT000693.1,INSD:BX827692.1,INSD:BX828344.1"
/note="ribosomal protein S6 (RPS6); FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: growth,
translation; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 29
plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages;
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S6e
(InterPro:IPR001377), Ribosomal protein S6, eukaryotic
(InterPro:IPR014401); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: Ribosomal protein S6e (TAIR:AT5G10360.1); Has
1159 Blast hits to 1155 proteins in 426 species: Archae -
247; Bacteria - 0; Metazoa - 418; Fungi - 171; Plants -
143; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 180 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G31700"
/db_xref="Araport:AT4G31700"
intron_pos 3:0 (1/5)
intron_pos 24:2 (2/5)
intron_pos 44:0 (3/5)
intron_pos 80:1 (4/5)
intron_pos 171:1 (5/5)
BEGIN
1 MKFNVANPTT GCQKKLEIDD DQKLRAFYDK RISQEVSGDA LGEEFKGYVF KIKGGCDKQG
61 FPMKQGVLTP GRVRLLLHRG TPCFRGHGRR TGERRRKSVR GCIVSPDLSV LNLVIVKKGE
121 NDLPGLTDTE KPRMRGPKRA SKIRKLFNLK KEDDVRTYVN TYRRKFTNKK GKEVSKAPKI
181 QRLVTPLTLQ RKRARIADKK KKIAKANSDA ADYQKLLASR LKEQRDRRSE SLAKKRSRLS
241 SAAAKPSVTA
//