LOCUS AEE85946.1 250 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana ribosomal protein S6 protein. ACCESSION CP002687-5789 PROTEIN_ID AEE85946.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G., Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N., Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M., Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R., Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M., Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M., Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W., Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L., Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J., Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I., Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U., Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M., Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M., Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C., Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J., Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S., Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A., Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D., Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S., Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O., Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S., Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F., Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T., Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A., Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D., Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P., Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W., Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M., Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E., Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M., Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G., Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A., Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N., Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M., Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S., Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K., Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C., Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D., Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A., Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N., Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M., Martienssen,R. and McCombie,W.R. TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999) PUBMED 10617198 REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="4" /ecotype="Columbia" protein /gene="RPS6" /locus_tag="AT4G31700" /gene_synonym="AtRPS6" /gene_synonym="F28M20.110" /gene_synonym="F28M20_110" /gene_synonym="ribosomal protein S6" /gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN S6" /gene_synonym="RPS6A" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:DR333668.1,INSD:ES009606.1,INSD:BP648837.1, INSD:DR333677.1,INSD:ES007702.1,INSD:DR333710.1, INSD:EH810325.1,INSD:DR333666.1,INSD:EL983752.1, INSD:DR333688.1,INSD:EL171460.1,INSD:EL201051.1, INSD:ES161700.1,INSD:DR333655.1,INSD:ES092125.1, INSD:EH918666.1,INSD:EL017131.1,INSD:EH917478.1, INSD:ES171541.1,INSD:ES135316.1,INSD:ES176528.1, INSD:ES109500.1,INSD:EL174174.1,INSD:ES087986.1, INSD:ES151350.1,INSD:DR375328.1,INSD:BP641264.1, INSD:DR333693.1,INSD:DR333654.1,INSD:EL169728.1, INSD:EL223301.1,INSD:ES135185.1,INSD:DR333658.1, INSD:EL121011.1,INSD:EH937094.1,INSD:EL984436.1, INSD:AV555414.1,INSD:ES123096.1,INSD:DR333679.1, INSD:EL996763.1,INSD:ES012692.1,INSD:EL978171.1, INSD:DR333673.1,INSD:DR333676.1,INSD:DR333642.1, INSD:BP857869.1,INSD:BP791686.1,INSD:ES104326.1, INSD:EL995192.1,INSD:DR333649.1,INSD:ES212881.1, INSD:EG444328.1,INSD:ES105593.1,INSD:DR333685.1, INSD:EL124338.1,INSD:EL972846.1,INSD:Z26511.1, INSD:EH834570.1,INSD:BP657995.1,INSD:ES044916.1, INSD:AI100228.1,INSD:BP577131.1,INSD:EG472245.1, INSD:EL253803.1,INSD:EL999129.1,INSD:AV791144.1, INSD:DR333643.1,INSD:DR226333.1,INSD:EL171099.1, INSD:EH888595.1,INSD:EL321221.1,INSD:EL999483.1, INSD:ES034912.1,INSD:EL016535.1,INSD:DR333684.1, INSD:EL295713.1,INSD:EH911136.1,INSD:EL998515.1, INSD:ES128668.1,INSD:EH965030.1,INSD:EL008042.1, INSD:EG439875.1,INSD:ES102158.1,INSD:DR333709.1, INSD:BP793261.1,INSD:BE039444.1,INSD:EL325211.1, INSD:AV804183.1,INSD:DR333651.1,INSD:ES101571.1, INSD:ES094934.1,INSD:EL066626.1,INSD:ES203956.1, INSD:AV550020.1,INSD:ES093007.1,INSD:ES075634.1, INSD:BP793808.1,INSD:CK118498.1,INSD:ES080616.1, INSD:DR333671.1,INSD:ES168763.1,INSD:DR333639.1, INSD:DR333636.1,INSD:ES094316.1,INSD:EL051822.1, INSD:DR333663.1,INSD:EL142417.1,INSD:DR333662.1, INSD:ES147528.1,INSD:ES011077.1,INSD:ES122288.1, INSD:DR333653.1,INSD:DR336326.1,INSD:ES095542.1, INSD:EH906377.1,INSD:CK119198.1,INSD:ES200215.1, INSD:EL131095.1,INSD:EL065927.1,INSD:BP781854.1, INSD:EL055040.1,INSD:EL263453.1,INSD:EL997196.1, INSD:ES132122.1,INSD:EH929887.1,INSD:DR333694.1, INSD:BP663057.1,INSD:EL982946.1,INSD:EL015105.1, INSD:ES109693.1,INSD:EL058672.1,INSD:ES125141.1, INSD:DR333701.1,INSD:ES061976.1,INSD:ES166553.1, INSD:EL980701.1,INSD:ES169778.1,INSD:ES069046.1, INSD:EL058126.1,INSD:EL996761.1,INSD:EL272107.1, INSD:EL326049.1,INSD:DR333641.1,INSD:ES130324.1, INSD:ES059687.1,INSD:EG494946.1,INSD:DR333674.1, INSD:DR333644.1,INSD:EL970780.1,INSD:EH869918.1, INSD:BP586474.1,INSD:EL166972.1,INSD:ES084742.1, INSD:ES104914.1,INSD:EL987965.1,INSD:DR333670.1, INSD:EH877669.1,INSD:DR333681.1,INSD:EL992133.1, INSD:ES161109.1,INSD:EL993136.1,INSD:EH884456.1, INSD:EL061732.1,INSD:BP789206.1,INSD:DR333665.1, INSD:EH913496.1,INSD:ES006740.1,INSD:EH809571.1, INSD:EH865701.1,INSD:DR333708.1,INSD:EH833256.1, INSD:ES166304.1,INSD:ES096505.1,INSD:ES065445.1, INSD:DR333687.1,INSD:ES047552.1,INSD:ES024896.1, INSD:EL969422.1,INSD:ES078119.1,INSD:EL275243.1, INSD:ES156065.1,INSD:EH968441.1,INSD:DR333697.1, INSD:EL338661.1,INSD:DR333657.1,INSD:EL335123.1, INSD:Z26047.1,INSD:DR333656.1,INSD:EH934111.1, INSD:ES060998.1,INSD:AV800990.1,INSD:ES058734.1, INSD:ES011915.1,INSD:EL975344.1,INSD:EL268285.1, INSD:ES020097.1,INSD:EG480811.1,INSD:DR333640.1, INSD:EL309845.1,INSD:EG486624.1,INSD:EH855330.1, INSD:EH974079.1,INSD:DR333686.1,INSD:ES172063.1, INSD:EL334469.1,INSD:DR333638.1,INSD:EL998257.1, INSD:ES211564.1,INSD:DR333652.1,INSD:ES159504.1, INSD:EL193077.1,INSD:EL006643.1,INSD:EL286577.1, INSD:EH871778.1,INSD:ES161201.1,INSD:DR333698.1, INSD:EH968934.1,INSD:ES082599.1,INSD:EL074291.1, INSD:EH921753.1,INSD:EL976828.1,INSD:ES032106.1, INSD:ES214697.1,INSD:EG439876.1,INSD:CK119740.1, INSD:EL981106.1,INSD:BP561437.1,INSD:EH958358.1, INSD:DR333647.1,INSD:ES180740.1,INSD:DR333689.1, INSD:DR375238.1,INSD:DR333705.1,INSD:EH907515.1, INSD:DR242031.1,INSD:ES147764.1,INSD:EL985364.1, INSD:ES074398.1,INSD:DR333637.1,INSD:DR333695.1, INSD:DR226332.1,INSD:ES212198.1,INSD:DR333669.1, INSD:ES137010.1,INSD:AV814810.1,INSD:EG422230.1, INSD:EL977195.1,INSD:ES010774.1,INSD:ES026956.1, INSD:DR333683.1,INSD:DR333659.1,INSD:ES188794.1, INSD:ES044934.1,INSD:EL231591.1,INSD:EL199523.1, INSD:EL968390.1,INSD:ES015304.1,INSD:EL986211.1, INSD:EL148253.1,INSD:EL030129.1,INSD:T14075.1, INSD:EL272433.1,INSD:EL310798.1,INSD:BP782916.1, INSD:EL287802.1,INSD:EL986783.1,INSD:DR333680.1, INSD:EL102962.1,INSD:EL998972.1,INSD:EH802691.1, INSD:ES184679.1,INSD:DR333672.1,INSD:EG468413.1, INSD:EH858550.1,INSD:DR333703.1,INSD:Z26048.1, INSD:DR333696.1,INSD:EH926032.1,INSD:ES154621.1, INSD:EL187193.1,INSD:ES068625.1,INSD:EG468412.1, INSD:ES153510.1,INSD:DR333699.1,INSD:ES043019.1, INSD:ES023016.1,INSD:DR333675.1,INSD:EL240805.1, INSD:EL970392.1,INSD:EL135999.1,INSD:ES014424.1, INSD:ES205702.1,INSD:EH863092.1,INSD:ES113403.1, INSD:ES097960.1,INSD:ES160737.1,INSD:EL144816.1, INSD:ES209700.1,INSD:DR333690.1,INSD:EL107903.1, INSD:EG468951.1,INSD:EL976491.1,INSD:EL025148.1, INSD:DR333691.1,INSD:EL214235.1,INSD:ES101958.1, INSD:EL302377.1,INSD:EL982210.1,INSD:EH973117.1, INSD:ES106109.1,INSD:ES055260.1,INSD:EL990999.1, INSD:DR333661.1,INSD:BP793805.1,INSD:EL094907.1, INSD:ES075347.1,INSD:AV549246.1,INSD:DR333692.1, INSD:ES214269.1,INSD:AV537918.1,INSD:DR333645.1, INSD:EL045420.1,INSD:EH983341.1,INSD:ES043532.1, INSD:AV808855.1,INSD:EG480810.1,INSD:EL300963.1, INSD:EH832496.1,INSD:ES214712.1,INSD:EG468940.1, INSD:ES201060.1,INSD:ES201831.1,INSD:ES143446.1, INSD:AV791312.1,INSD:EH843211.1,INSD:ES065450.1, INSD:EH965554.1,INSD:AV567584.1,INSD:ES118832.1, INSD:EG439277.1,INSD:ES090366.1,INSD:EH976377.1, INSD:ES190218.1,INSD:ES152761.1,INSD:EL127483.1, INSD:DR377056.1,INSD:DR333707.1,INSD:EL983438.1, INSD:EH880629.1,INSD:ES007525.1,INSD:EL990892.1, INSD:EL995565.1,INSD:DR333682.1,INSD:EL974747.1, INSD:ES160706.1,INSD:DR333664.1,INSD:ES017622.1, INSD:EG445041.1,INSD:DR333702.1,INSD:BP780993.1, INSD:ES184258.1,INSD:DR333704.1,INSD:EH796272.1, INSD:DR333650.1,INSD:AV799241.1,INSD:DR333678.1, INSD:EL057358.1,INSD:EL149345.1,INSD:EL117802.1, INSD:BP778907.1,INSD:EL325793.1" /inference="Similar to RNA sequence, mRNA:INSD:BT000693.1,INSD:BX827692.1,INSD:BX828344.1" /note="ribosomal protein S6 (RPS6); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: growth, translation; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 29 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S6e (InterPro:IPR001377), Ribosomal protein S6, eukaryotic (InterPro:IPR014401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S6e (TAIR:AT5G10360.1); Has 1159 Blast hits to 1155 proteins in 426 species: Archae - 247; Bacteria - 0; Metazoa - 418; Fungi - 171; Plants - 143; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 180 (source: NCBI BLink)." /db_xref="TAIR:AT4G31700" /db_xref="Araport:AT4G31700" intron_pos 3:0 (1/5) intron_pos 24:2 (2/5) intron_pos 44:0 (3/5) intron_pos 80:1 (4/5) intron_pos 171:1 (5/5) BEGIN 1 MKFNVANPTT GCQKKLEIDD DQKLRAFYDK RISQEVSGDA LGEEFKGYVF KIKGGCDKQG 61 FPMKQGVLTP GRVRLLLHRG TPCFRGHGRR TGERRRKSVR GCIVSPDLSV LNLVIVKKGE 121 NDLPGLTDTE KPRMRGPKRA SKIRKLFNLK KEDDVRTYVN TYRRKFTNKK GKEVSKAPKI 181 QRLVTPLTLQ RKRARIADKK KKIAKANSDA ADYQKLLASR LKEQRDRRSE SLAKKRSRLS 241 SAAAKPSVTA //