LOCUS AEE85834.1 448 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana fatty acid desaturase 6 protein.
ACCESSION CP002687-5628
PROTEIN_ID AEE85834.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="FAD6"
/locus_tag="AT4G30950"
/gene_synonym="CHLOROPLAST PRECURSOR"
/gene_synonym="F6I18.140"
/gene_synonym="F6I18_140"
/gene_synonym="FADC"
/gene_synonym="fatty acid desaturase 6"
/gene_synonym="FATTY ACID DESATURASE C"
/gene_synonym="OMEGA-6 FATTY ACID DESATURASE"
/gene_synonym="SFD4"
/gene_synonym="STEAROYL DESATURASE DEFICIENCY 4"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH907572.1,INSD:EL038102.1,INSD:BP792683.1,
INSD:EL007999.1,INSD:EL277465.1,INSD:DR238859.1,
INSD:EL326730.1,INSD:EL032888.1,INSD:EH943771.1,
INSD:EH945113.1,INSD:EL140788.1,INSD:EH922588.1,
INSD:EG419464.1,INSD:DR238865.1,INSD:DR238881.1,
INSD:EL126569.1,INSD:EH800997.1,INSD:EH940567.1,
INSD:BP590296.1,INSD:EL085766.1,INSD:ES103437.1,
INSD:EH861479.1,INSD:EL309346.1,INSD:BP598347.1,
INSD:EH820379.1,INSD:ES077549.1,INSD:AV812586.1,
INSD:EL089065.1,INSD:DR238854.1,INSD:DR238858.1,
INSD:AV802336.1,INSD:EL254312.1,INSD:BP780715.1,
INSD:BP850063.1,INSD:EH980410.1,INSD:BP853568.1,
INSD:EL335359.1,INSD:EL286856.1,INSD:EH927128.1,
INSD:EL269481.1,INSD:ES195127.1,INSD:DR238878.1,
INSD:BP667980.1,INSD:ES139106.1,INSD:EL045215.1,
INSD:EL303248.1,INSD:BP617356.1,INSD:R83991.1,
INSD:EH883187.1,INSD:EL073483.1,INSD:EL008115.1,
INSD:EH965830.1,INSD:BP791391.1,INSD:EH906120.1,
INSD:EH891503.1,INSD:EL212140.1,INSD:EH828545.1,
INSD:EH925225.1,INSD:BP639712.1,INSD:ES109405.1,
INSD:BP845965.1,INSD:EH899612.1,INSD:DR238860.1,
INSD:EL095893.1,INSD:EL298069.1,INSD:EL125464.1,
INSD:BP844456.1,INSD:BP791399.1,INSD:BP795251.1,
INSD:EH797069.1,INSD:EL130039.1,INSD:BP561909.1,
INSD:EL119184.1,INSD:EL052375.1,INSD:EH946660.1,
INSD:AV788254.1,INSD:EL193893.1,INSD:BP788540.1,
INSD:BP787864.1,INSD:DR238861.1,INSD:EL000779.1,
INSD:BP633098.1,INSD:BP787081.1,INSD:BP817269.1,
INSD:EL274319.1,INSD:AV810741.1,INSD:EL164499.1,
INSD:EH886087.1,INSD:EH889964.1,INSD:EL170655.1,
INSD:EL280794.1,INSD:BP794190.1,INSD:BP855020.1,
INSD:BP796207.1,INSD:EH901103.1,INSD:DR238874.1,
INSD:EL247606.1,INSD:EH982003.1,INSD:EL125566.1,
INSD:EL102269.1,INSD:EL072976.1,INSD:EH952419.1,
INSD:EH950218.1,INSD:EL329755.1,INSD:DR238871.1,
INSD:BP636538.1,INSD:EL050621.1,INSD:EL140161.1,
INSD:EL051370.1,INSD:AV813763.1,INSD:EH924929.1,
INSD:EL234390.1,INSD:EH841672.1,INSD:EH821782.1,
INSD:EL179255.1,INSD:EH905073.1,INSD:EH811418.1,
INSD:BP790781.1,INSD:EH916266.1,INSD:EH835463.1,
INSD:EL069742.1,INSD:ES080198.1,INSD:BP600625.1,
INSD:AV796655.1,INSD:EL332760.1,INSD:BP837473.1,
INSD:EL012495.1,INSD:EH826226.1,INSD:EL019901.1,
INSD:EL063195.1,INSD:EH961344.1,INSD:AV815380.1,
INSD:AV798081.1,INSD:EH879005.1,INSD:EH827548.1,
INSD:EL049106.1,INSD:EL021260.1,INSD:EL164153.1,
INSD:EL075336.1,INSD:DR238857.1,INSD:BP778093.1,
INSD:AV792476.1,INSD:EL094801.1,INSD:EL026399.1,
INSD:BP783563.1,INSD:EL134127.1,INSD:EH959863.1,
INSD:EH834564.1,INSD:EH968070.1,INSD:DR238852.1,
INSD:EH925676.1,INSD:EL337931.1,INSD:EH809284.1,
INSD:EG464525.1,INSD:BP780499.1,INSD:EG464526.1,
INSD:EL160168.1,INSD:EH875270.1,INSD:EH931886.1,
INSD:DR238870.1,INSD:AV565348.1,INSD:EL223331.1,
INSD:AV556695.1,INSD:EH976816.1,INSD:EH855424.1,
INSD:EL328610.1,INSD:EL192903.1,INSD:EL227642.1,
INSD:EH939930.1,INSD:AW004278.1,INSD:AV522545.1,
INSD:EH966571.1,INSD:AV826874.2,INSD:BP792934.1,
INSD:DR238868.1,INSD:AV792925.1,INSD:AV786930.1,
INSD:EL114303.1,INSD:AV796755.1,INSD:EL047050.1,
INSD:BP786445.1,INSD:ES123954.1,INSD:EL021902.1,
INSD:DR238877.1,INSD:T13807.1,INSD:EH864746.1,
INSD:DR238867.1,INSD:DR238882.1,INSD:EL331504.1,
INSD:EL339701.1,INSD:EL124637.1,INSD:DR238883.1,
INSD:EH889487.1,INSD:AV815789.1,INSD:EL306138.1,
INSD:EL097648.1,INSD:EH977363.1,INSD:EH913510.1,
INSD:EL077964.1,INSD:BP662471.1,INSD:AV817104.1,
INSD:AV817043.1,INSD:EL006674.1,INSD:EL009101.1,
INSD:EH838421.1,INSD:EL057891.1,INSD:EL067919.1,
INSD:EL979615.1,INSD:EL024982.1,INSD:CB256368.1,
INSD:DR238853.1,INSD:EH813507.1,INSD:EL241735.1,
INSD:EL064075.1,INSD:EH943757.1,INSD:EL325335.1,
INSD:ES175594.1,INSD:EL064251.1,INSD:EL075344.1,
INSD:DR376622.1,INSD:EH859567.1,INSD:EL275970.1,
INSD:DR238856.1,INSD:EL085334.1,INSD:DR238880.1,
INSD:EL298649.1,INSD:DR238892.1,INSD:BP790183.1,
INSD:DR238875.1,INSD:EH994907.1,INSD:EL303872.1,
INSD:EL048554.1,INSD:EH988934.1,INSD:DR238876.1,
INSD:BP587071.1,INSD:EL212500.1,INSD:BP783794.1,
INSD:EH935997.1,INSD:EH978156.1,INSD:BP658094.1,
INSD:EL140527.1,INSD:DR238886.1,INSD:AV521662.1,
INSD:EL232368.1,INSD:EL012392.1,INSD:DR238893.1,
INSD:DR238889.1,INSD:EL032380.1,INSD:EL278697.1,
INSD:DR238888.1,INSD:BP795742.1,INSD:EH857831.1,
INSD:AV793015.1,INSD:AV787251.1,INSD:EL280898.1,
INSD:EL090181.1,INSD:DR238864.1,INSD:EL335430.1,
INSD:BP657521.1,INSD:BP782525.1,INSD:EH836403.1,
INSD:BP665457.1,INSD:EL187742.1,INSD:EL334451.1,
INSD:EL003493.1,INSD:EH893444.1,INSD:EL250089.1,
INSD:EH963768.1,INSD:EL297589.1,INSD:EL284007.1,
INSD:EL302378.1,INSD:BP780018.1,INSD:EL091514.1,
INSD:EL117601.1,INSD:EL266104.1,INSD:EL089794.1,
INSD:EL278234.1,INSD:EH827419.1,INSD:BP785854.1,
INSD:EL051693.1,INSD:EL266832.1,INSD:EL165140.1,
INSD:BP667853.1,INSD:EH861083.1,INSD:EH942443.1,
INSD:BP793665.1,INSD:EL091454.1,INSD:BP795200.1,
INSD:DR238863.1,INSD:EH840465.1,INSD:EL026963.1,
INSD:BP790531.1,INSD:EH960525.1,INSD:EL232802.1,
INSD:EL080762.1,INSD:EL007466.1,INSD:EH964275.1,
INSD:EH921809.1,INSD:EL267900.1,INSD:EL238360.1,
INSD:EH904625.1,INSD:EH844263.1,INSD:EL275885.1,
INSD:EH983598.1,INSD:AV813921.1,INSD:EL047409.1,
INSD:EL220013.1,INSD:EL161019.1,INSD:EL295187.1,
INSD:DR238872.1,INSD:EL104140.1,INSD:EL222396.1,
INSD:EL178007.1,INSD:BP666668.1,INSD:AV526504.1,
INSD:EH968053.1,INSD:BP591379.1,INSD:EL173455.1,
INSD:DR238873.1,INSD:EL235409.1,INSD:EL284382.1,
INSD:EL129748.1,INSD:EL127855.1,INSD:BP624724.1,
INSD:BP622926.1,INSD:EL212251.1,INSD:EL207586.1,
INSD:ES127651.1,INSD:AV547819.1,INSD:BP823494.1,
INSD:EH972036.1,INSD:EH890807.1,INSD:EL274624.1,
INSD:AA712148.1,INSD:EL096243.1,INSD:EL185762.1,
INSD:EL249387.1,INSD:EL117595.1,INSD:EH994548.1,
INSD:DR238866.1,INSD:EL266165.1,INSD:EL000240.1,
INSD:EL320168.1,INSD:DR238895.1,INSD:EH798479.1,
INSD:BP656567.1,INSD:BP784385.1,INSD:EL183243.1,
INSD:EL014798.1,INSD:EH915194.1,INSD:BP654395.1,
INSD:EL302635.1,INSD:EL293034.1,INSD:EL210682.1,
INSD:EL001224.1,INSD:EL993926.1,INSD:EL028259.1,
INSD:BP778843.1,INSD:EL082242.1,INSD:EH879498.1,
INSD:EH920479.1,INSD:EH939643.1,INSD:EH806238.1,
INSD:EH807912.1,INSD:BP853479.1,INSD:EL285552.1,
INSD:AV825921.1,INSD:EL191964.1,INSD:DR238885.1,
INSD:DR238884.1,INSD:EL261596.1,INSD:BP838762.1,
INSD:BP848469.1,INSD:DR238890.1,INSD:EH917123.1,
INSD:DR238894.1,INSD:EL174927.1,INSD:EL288592.1,
INSD:EL156843.1,INSD:EH957653.1,INSD:DR238862.1,
INSD:EL089754.1,INSD:EL967339.1,INSD:DR238879.1,
INSD:EL108994.1,INSD:EL316689.1,INSD:EL194032.1,
INSD:EL092287.1,INSD:BP655970.1,INSD:DR238855.1,
INSD:EL026991.1,INSD:BP790673.1,INSD:EH905269.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY058078.1,INSD:U09503.1,INSD:AY045621.1,
INSD:AY058852.1,INSD:AY079039.1,INSD:AY088002.1,
INSD:BX827369.1"
/note="fatty acid desaturase 6 (FAD6); FUNCTIONS IN:
omega-6 fatty acid desaturase activity; INVOLVED IN:
photoinhibition, fatty acid biosynthetic process; LOCATED
IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 22
plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages;
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Fatty acid desaturase, type 1
(InterPro:IPR005804); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: fatty acid desaturase 8 (TAIR:AT5G05580.1); Has
3227 Blast hits to 3218 proteins in 733 species: Archae -
0; Bacteria - 1371; Metazoa - 67; Fungi - 380; Plants -
896; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 513 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G30950"
/db_xref="Araport:AT4G30950"
intron_pos 14:0 (1/9)
intron_pos 35:1 (2/9)
intron_pos 118:0 (3/9)
intron_pos 166:0 (4/9)
intron_pos 216:2 (5/9)
intron_pos 257:2 (6/9)
intron_pos 317:0 (7/9)
intron_pos 356:2 (8/9)
intron_pos 395:0 (9/9)
BEGIN
1 MASRIADSLF AFTGPQQCLP RVPKLAASSA RVSPGVYAVK PIDLLLKGRT HRSRRCVAPV
61 KRRIGCIKAV AAPVAPPSAD SAEDREQLAE SYGFRQIGED LPENVTLKDI MDTLPKEVFE
121 IDDLKALKSV LISVTSYTLG LFMIAKSPWY LLPLAWAWTG TAITGFFVIG HDCAHKSFSK
181 NKLVEDIVGT LAFLPLVYPY EPWRFKHDRH HAKTNMLVHD TAWQPVPPEE FESSPVMRKA
241 IIFGYGPIRP WLSIAHWVNW HFNLKKFRAS EVNRVKISLA CVFAFMAVGW PLIVYKVGIL
301 GWVKFWLMPW LGYHFWMSTF TMVHHTAPHI PFKPADEWNA AQAQLNGTVH CDYPSWIEIL
361 CHDINVHIPH HISPRIPSYN LRAAHESIQE NWGKYTNLAT WNWRLMKTIM TVCHVYDKEE
421 NYIPFDRLAP EESQPITFLK KAMPNYTA
//