LOCUS AEE85834.1 448 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana fatty acid desaturase 6 protein. ACCESSION CP002687-5628 PROTEIN_ID AEE85834.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G., Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N., Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M., Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R., Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M., Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M., Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W., Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L., Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J., Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I., Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U., Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M., Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M., Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C., Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J., Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S., Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A., Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D., Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S., Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O., Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S., Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F., Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T., Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A., Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D., Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P., Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W., Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M., Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E., Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M., Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G., Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A., Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N., Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M., Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S., Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K., Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C., Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D., Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A., Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N., Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M., Martienssen,R. and McCombie,W.R. TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999) PUBMED 10617198 REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="4" /ecotype="Columbia" protein /gene="FAD6" /locus_tag="AT4G30950" /gene_synonym="CHLOROPLAST PRECURSOR" /gene_synonym="F6I18.140" /gene_synonym="F6I18_140" /gene_synonym="FADC" /gene_synonym="fatty acid desaturase 6" /gene_synonym="FATTY ACID DESATURASE C" /gene_synonym="OMEGA-6 FATTY ACID DESATURASE" /gene_synonym="SFD4" /gene_synonym="STEAROYL DESATURASE DEFICIENCY 4" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:EH907572.1,INSD:EL038102.1,INSD:BP792683.1, INSD:EL007999.1,INSD:EL277465.1,INSD:DR238859.1, INSD:EL326730.1,INSD:EL032888.1,INSD:EH943771.1, INSD:EH945113.1,INSD:EL140788.1,INSD:EH922588.1, INSD:EG419464.1,INSD:DR238865.1,INSD:DR238881.1, INSD:EL126569.1,INSD:EH800997.1,INSD:EH940567.1, INSD:BP590296.1,INSD:EL085766.1,INSD:ES103437.1, INSD:EH861479.1,INSD:EL309346.1,INSD:BP598347.1, INSD:EH820379.1,INSD:ES077549.1,INSD:AV812586.1, INSD:EL089065.1,INSD:DR238854.1,INSD:DR238858.1, INSD:AV802336.1,INSD:EL254312.1,INSD:BP780715.1, INSD:BP850063.1,INSD:EH980410.1,INSD:BP853568.1, INSD:EL335359.1,INSD:EL286856.1,INSD:EH927128.1, INSD:EL269481.1,INSD:ES195127.1,INSD:DR238878.1, INSD:BP667980.1,INSD:ES139106.1,INSD:EL045215.1, INSD:EL303248.1,INSD:BP617356.1,INSD:R83991.1, INSD:EH883187.1,INSD:EL073483.1,INSD:EL008115.1, INSD:EH965830.1,INSD:BP791391.1,INSD:EH906120.1, INSD:EH891503.1,INSD:EL212140.1,INSD:EH828545.1, INSD:EH925225.1,INSD:BP639712.1,INSD:ES109405.1, INSD:BP845965.1,INSD:EH899612.1,INSD:DR238860.1, INSD:EL095893.1,INSD:EL298069.1,INSD:EL125464.1, INSD:BP844456.1,INSD:BP791399.1,INSD:BP795251.1, INSD:EH797069.1,INSD:EL130039.1,INSD:BP561909.1, INSD:EL119184.1,INSD:EL052375.1,INSD:EH946660.1, INSD:AV788254.1,INSD:EL193893.1,INSD:BP788540.1, INSD:BP787864.1,INSD:DR238861.1,INSD:EL000779.1, INSD:BP633098.1,INSD:BP787081.1,INSD:BP817269.1, INSD:EL274319.1,INSD:AV810741.1,INSD:EL164499.1, INSD:EH886087.1,INSD:EH889964.1,INSD:EL170655.1, INSD:EL280794.1,INSD:BP794190.1,INSD:BP855020.1, INSD:BP796207.1,INSD:EH901103.1,INSD:DR238874.1, INSD:EL247606.1,INSD:EH982003.1,INSD:EL125566.1, INSD:EL102269.1,INSD:EL072976.1,INSD:EH952419.1, INSD:EH950218.1,INSD:EL329755.1,INSD:DR238871.1, INSD:BP636538.1,INSD:EL050621.1,INSD:EL140161.1, INSD:EL051370.1,INSD:AV813763.1,INSD:EH924929.1, INSD:EL234390.1,INSD:EH841672.1,INSD:EH821782.1, INSD:EL179255.1,INSD:EH905073.1,INSD:EH811418.1, INSD:BP790781.1,INSD:EH916266.1,INSD:EH835463.1, INSD:EL069742.1,INSD:ES080198.1,INSD:BP600625.1, INSD:AV796655.1,INSD:EL332760.1,INSD:BP837473.1, INSD:EL012495.1,INSD:EH826226.1,INSD:EL019901.1, INSD:EL063195.1,INSD:EH961344.1,INSD:AV815380.1, INSD:AV798081.1,INSD:EH879005.1,INSD:EH827548.1, INSD:EL049106.1,INSD:EL021260.1,INSD:EL164153.1, INSD:EL075336.1,INSD:DR238857.1,INSD:BP778093.1, INSD:AV792476.1,INSD:EL094801.1,INSD:EL026399.1, INSD:BP783563.1,INSD:EL134127.1,INSD:EH959863.1, INSD:EH834564.1,INSD:EH968070.1,INSD:DR238852.1, INSD:EH925676.1,INSD:EL337931.1,INSD:EH809284.1, INSD:EG464525.1,INSD:BP780499.1,INSD:EG464526.1, INSD:EL160168.1,INSD:EH875270.1,INSD:EH931886.1, INSD:DR238870.1,INSD:AV565348.1,INSD:EL223331.1, INSD:AV556695.1,INSD:EH976816.1,INSD:EH855424.1, INSD:EL328610.1,INSD:EL192903.1,INSD:EL227642.1, INSD:EH939930.1,INSD:AW004278.1,INSD:AV522545.1, INSD:EH966571.1,INSD:AV826874.2,INSD:BP792934.1, INSD:DR238868.1,INSD:AV792925.1,INSD:AV786930.1, INSD:EL114303.1,INSD:AV796755.1,INSD:EL047050.1, INSD:BP786445.1,INSD:ES123954.1,INSD:EL021902.1, INSD:DR238877.1,INSD:T13807.1,INSD:EH864746.1, INSD:DR238867.1,INSD:DR238882.1,INSD:EL331504.1, INSD:EL339701.1,INSD:EL124637.1,INSD:DR238883.1, INSD:EH889487.1,INSD:AV815789.1,INSD:EL306138.1, INSD:EL097648.1,INSD:EH977363.1,INSD:EH913510.1, INSD:EL077964.1,INSD:BP662471.1,INSD:AV817104.1, INSD:AV817043.1,INSD:EL006674.1,INSD:EL009101.1, INSD:EH838421.1,INSD:EL057891.1,INSD:EL067919.1, INSD:EL979615.1,INSD:EL024982.1,INSD:CB256368.1, INSD:DR238853.1,INSD:EH813507.1,INSD:EL241735.1, INSD:EL064075.1,INSD:EH943757.1,INSD:EL325335.1, INSD:ES175594.1,INSD:EL064251.1,INSD:EL075344.1, INSD:DR376622.1,INSD:EH859567.1,INSD:EL275970.1, INSD:DR238856.1,INSD:EL085334.1,INSD:DR238880.1, INSD:EL298649.1,INSD:DR238892.1,INSD:BP790183.1, INSD:DR238875.1,INSD:EH994907.1,INSD:EL303872.1, INSD:EL048554.1,INSD:EH988934.1,INSD:DR238876.1, INSD:BP587071.1,INSD:EL212500.1,INSD:BP783794.1, INSD:EH935997.1,INSD:EH978156.1,INSD:BP658094.1, INSD:EL140527.1,INSD:DR238886.1,INSD:AV521662.1, INSD:EL232368.1,INSD:EL012392.1,INSD:DR238893.1, INSD:DR238889.1,INSD:EL032380.1,INSD:EL278697.1, INSD:DR238888.1,INSD:BP795742.1,INSD:EH857831.1, INSD:AV793015.1,INSD:AV787251.1,INSD:EL280898.1, INSD:EL090181.1,INSD:DR238864.1,INSD:EL335430.1, INSD:BP657521.1,INSD:BP782525.1,INSD:EH836403.1, INSD:BP665457.1,INSD:EL187742.1,INSD:EL334451.1, INSD:EL003493.1,INSD:EH893444.1,INSD:EL250089.1, INSD:EH963768.1,INSD:EL297589.1,INSD:EL284007.1, INSD:EL302378.1,INSD:BP780018.1,INSD:EL091514.1, INSD:EL117601.1,INSD:EL266104.1,INSD:EL089794.1, INSD:EL278234.1,INSD:EH827419.1,INSD:BP785854.1, INSD:EL051693.1,INSD:EL266832.1,INSD:EL165140.1, INSD:BP667853.1,INSD:EH861083.1,INSD:EH942443.1, INSD:BP793665.1,INSD:EL091454.1,INSD:BP795200.1, INSD:DR238863.1,INSD:EH840465.1,INSD:EL026963.1, INSD:BP790531.1,INSD:EH960525.1,INSD:EL232802.1, INSD:EL080762.1,INSD:EL007466.1,INSD:EH964275.1, INSD:EH921809.1,INSD:EL267900.1,INSD:EL238360.1, INSD:EH904625.1,INSD:EH844263.1,INSD:EL275885.1, INSD:EH983598.1,INSD:AV813921.1,INSD:EL047409.1, INSD:EL220013.1,INSD:EL161019.1,INSD:EL295187.1, INSD:DR238872.1,INSD:EL104140.1,INSD:EL222396.1, INSD:EL178007.1,INSD:BP666668.1,INSD:AV526504.1, INSD:EH968053.1,INSD:BP591379.1,INSD:EL173455.1, INSD:DR238873.1,INSD:EL235409.1,INSD:EL284382.1, INSD:EL129748.1,INSD:EL127855.1,INSD:BP624724.1, INSD:BP622926.1,INSD:EL212251.1,INSD:EL207586.1, INSD:ES127651.1,INSD:AV547819.1,INSD:BP823494.1, INSD:EH972036.1,INSD:EH890807.1,INSD:EL274624.1, INSD:AA712148.1,INSD:EL096243.1,INSD:EL185762.1, INSD:EL249387.1,INSD:EL117595.1,INSD:EH994548.1, INSD:DR238866.1,INSD:EL266165.1,INSD:EL000240.1, INSD:EL320168.1,INSD:DR238895.1,INSD:EH798479.1, INSD:BP656567.1,INSD:BP784385.1,INSD:EL183243.1, INSD:EL014798.1,INSD:EH915194.1,INSD:BP654395.1, INSD:EL302635.1,INSD:EL293034.1,INSD:EL210682.1, INSD:EL001224.1,INSD:EL993926.1,INSD:EL028259.1, INSD:BP778843.1,INSD:EL082242.1,INSD:EH879498.1, INSD:EH920479.1,INSD:EH939643.1,INSD:EH806238.1, INSD:EH807912.1,INSD:BP853479.1,INSD:EL285552.1, INSD:AV825921.1,INSD:EL191964.1,INSD:DR238885.1, INSD:DR238884.1,INSD:EL261596.1,INSD:BP838762.1, INSD:BP848469.1,INSD:DR238890.1,INSD:EH917123.1, INSD:DR238894.1,INSD:EL174927.1,INSD:EL288592.1, INSD:EL156843.1,INSD:EH957653.1,INSD:DR238862.1, INSD:EL089754.1,INSD:EL967339.1,INSD:DR238879.1, INSD:EL108994.1,INSD:EL316689.1,INSD:EL194032.1, INSD:EL092287.1,INSD:BP655970.1,INSD:DR238855.1, INSD:EL026991.1,INSD:BP790673.1,INSD:EH905269.1" /inference="Similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AY058078.1,INSD:U09503.1,INSD:AY045621.1, INSD:AY058852.1,INSD:AY079039.1,INSD:AY088002.1, INSD:BX827369.1" /note="fatty acid desaturase 6 (FAD6); FUNCTIONS IN: omega-6 fatty acid desaturase activity; INVOLVED IN: photoinhibition, fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Fatty acid desaturase, type 1 (InterPro:IPR005804); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fatty acid desaturase 8 (TAIR:AT5G05580.1); Has 3227 Blast hits to 3218 proteins in 733 species: Archae - 0; Bacteria - 1371; Metazoa - 67; Fungi - 380; Plants - 896; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 513 (source: NCBI BLink)." /db_xref="TAIR:AT4G30950" /db_xref="Araport:AT4G30950" intron_pos 14:0 (1/9) intron_pos 35:1 (2/9) intron_pos 118:0 (3/9) intron_pos 166:0 (4/9) intron_pos 216:2 (5/9) intron_pos 257:2 (6/9) intron_pos 317:0 (7/9) intron_pos 356:2 (8/9) intron_pos 395:0 (9/9) BEGIN 1 MASRIADSLF AFTGPQQCLP RVPKLAASSA RVSPGVYAVK PIDLLLKGRT HRSRRCVAPV 61 KRRIGCIKAV AAPVAPPSAD SAEDREQLAE SYGFRQIGED LPENVTLKDI MDTLPKEVFE 121 IDDLKALKSV LISVTSYTLG LFMIAKSPWY LLPLAWAWTG TAITGFFVIG HDCAHKSFSK 181 NKLVEDIVGT LAFLPLVYPY EPWRFKHDRH HAKTNMLVHD TAWQPVPPEE FESSPVMRKA 241 IIFGYGPIRP WLSIAHWVNW HFNLKKFRAS EVNRVKISLA CVFAFMAVGW PLIVYKVGIL 301 GWVKFWLMPW LGYHFWMSTF TMVHHTAPHI PFKPADEWNA AQAQLNGTVH CDYPSWIEIL 361 CHDINVHIPH HISPRIPSYN LRAAHESIQE NWGKYTNLAT WNWRLMKTIM TVCHVYDKEE 421 NYIPFDRLAP EESQPITFLK KAMPNYTA //