LOCUS AEE84954.1 329 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana 31-kDa RNA binding protein protein.
ACCESSION CP002687-4432
PROTEIN_ID AEE84954.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="RBP31"
/locus_tag="AT4G24770"
/gene_synonym="31-kDa RNA binding protein"
/gene_synonym="APPROXIMATELY 31 KD"
/gene_synonym="ARABIDOPSIS THALIANA RNA BINDING PROTEIN"
/gene_synonym="ATRBP31"
/gene_synonym="ATRBP33"
/gene_synonym="CP31"
/gene_synonym="F6I7.11"
/gene_synonym="STEP1"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR271230.1,INSD:EL131051.1,INSD:DR271273.1,
INSD:AV546081.1,INSD:ES216227.1,INSD:EH993823.1,
INSD:EL081043.1,INSD:EL147088.1,INSD:EL149384.1,
INSD:AV785242.1,INSD:EL061214.1,INSD:EL035112.1,
INSD:BP786287.1,INSD:DR271221.1,INSD:EL291097.1,
INSD:EL029794.1,INSD:EH873883.1,INSD:DR231389.1,
INSD:EH862706.1,INSD:AV535554.1,INSD:DR271265.1,
INSD:EH860391.1,INSD:AV815257.1,INSD:EL159161.1,
INSD:EL143549.1,INSD:EH877294.1,INSD:EG496257.1,
INSD:EL020334.1,INSD:EL129177.1,INSD:DR271224.1,
INSD:AV559316.1,INSD:EH969870.1,INSD:AI100105.1,
INSD:EL026547.1,INSD:EH887551.1,INSD:DR271257.1,
INSD:AV783120.1,INSD:DR271231.1,INSD:EL090728.1,
INSD:BP829088.1,INSD:DR271266.1,INSD:EL337768.1,
INSD:EH977694.1,INSD:DR271232.1,INSD:EL315552.1,
INSD:EH912873.1,INSD:BP816514.1,INSD:DR271291.1,
INSD:DR271275.1,INSD:AV788790.1,INSD:AV518608.1,
INSD:EH903337.1,INSD:EH862124.1,INSD:EL018641.1,
INSD:DR271252.1,INSD:EH837993.1,INSD:BP826558.1,
INSD:EL036848.1,INSD:BP788596.1,INSD:EL252575.1,
INSD:EL303543.1,INSD:EL131158.1,INSD:DR271222.1,
INSD:EH957446.1,INSD:AV527838.1,INSD:T22781.1,
INSD:DR271247.1,INSD:BP655406.1,INSD:DR271239.1,
INSD:EH872812.1,INSD:AV518968.1,INSD:DR271285.1,
INSD:DR383164.1,INSD:EL086362.1,INSD:AV518476.1,
INSD:BP865978.1,INSD:BP635258.1,INSD:EH802263.1,
INSD:AV830788.1,INSD:BP824225.1,INSD:BP644475.1,
INSD:EL088457.1,INSD:DR271290.1,INSD:EL068319.1,
INSD:DR271282.1,INSD:EL149164.1,INSD:DR271220.1,
INSD:BP793931.1,INSD:BP859862.1,INSD:BP796801.1,
INSD:EL328143.1,INSD:BP648021.1,INSD:EL045957.1,
INSD:EL037067.1,INSD:BP847064.1,INSD:DR271238.1,
INSD:EH949551.1,INSD:AV819402.1,INSD:AV525646.1,
INSD:EL142980.1,INSD:AV562068.1,INSD:DR271241.1,
INSD:DR271287.1,INSD:EG468798.1,INSD:DR271244.1,
INSD:EG444953.1,INSD:EH964856.1,INSD:BP653167.1,
INSD:ES107331.1,INSD:EH870976.1,INSD:EL123576.1,
INSD:EL256168.1,INSD:ES206268.1,INSD:BP829795.1,
INSD:ES071031.1,INSD:EL157106.1,INSD:DR271289.1,
INSD:EL136850.1,INSD:CK119192.1,INSD:DR271279.1,
INSD:BP818724.1,INSD:EH806426.1,INSD:EL041521.1,
INSD:BP789442.1,INSD:EL329351.1,INSD:DR271270.1,
INSD:EL163846.1,INSD:DR271218.1,INSD:BX836802.1,
INSD:EG444951.1,INSD:DR271284.1,INSD:EL261677.1,
INSD:EH954138.1,INSD:EL258167.1,INSD:EH839981.1,
INSD:EH829184.1,INSD:DR231387.1,INSD:EH800662.1,
INSD:AV785128.1,INSD:EL276744.1,INSD:BP591468.1,
INSD:DR271214.1,INSD:EH877700.1,INSD:EH805428.1,
INSD:EL314805.1,INSD:BP788040.1,INSD:AV531948.1,
INSD:EH845665.1,INSD:DR271268.1,INSD:DR271280.1,
INSD:EH886951.1,INSD:EL280314.1,INSD:EH942784.1,
INSD:ES039615.1,INSD:DR271226.1,INSD:DR271236.1,
INSD:EL247723.1,INSD:EL331572.1,INSD:EH849161.1,
INSD:AV796075.1,INSD:EH869960.1,INSD:BP596052.1,
INSD:AA713138.1,INSD:AV525667.1,INSD:EL234734.1,
INSD:EL215649.1,INSD:EL014510.1,INSD:AV797428.1,
INSD:EH803818.1,INSD:EL157327.1,INSD:DR271228.1,
INSD:DR271267.1,INSD:EL172542.1,INSD:EL218525.1,
INSD:AV789573.1,INSD:EL278059.1,INSD:BP868808.1,
INSD:EL301220.1,INSD:EL004689.1,INSD:EL137533.1,
INSD:AV795585.1,INSD:EL288469.1,INSD:BP595433.1,
INSD:BP645467.1,INSD:DR271250.1,INSD:DR271227.1,
INSD:DR271245.1,INSD:BP626484.1,INSD:DR271271.1,
INSD:DR271272.1,INSD:BP858530.1,INSD:EL998764.1,
INSD:EH965911.1,INSD:EL094449.1,INSD:EL318616.1,
INSD:EL143295.1,INSD:BP637980.1,INSD:BE530247.1,
INSD:EG514114.1,INSD:EL221139.1,INSD:EL006098.1,
INSD:AV824094.1,INSD:EH881243.1,INSD:T43174.1,
INSD:EL066218.1,INSD:BP816129.1,INSD:DR271254.1,
INSD:AV525977.1,INSD:BP820390.1,INSD:DR271263.1,
INSD:BP646624.1,INSD:BP622136.1,INSD:BP812581.1,
INSD:BP824405.1,INSD:AV439846.1,INSD:EH964040.1,
INSD:DR271256.1,INSD:BP865981.1,INSD:BU635901.1,
INSD:AV810090.1,INSD:EL187916.1,INSD:DR271229.1,
INSD:EL107100.1,INSD:EL175352.1,INSD:AV798427.1,
INSD:BP625770.1,INSD:EL032459.1,INSD:EH952415.1,
INSD:DR271219.1,INSD:AV519828.1,INSD:EL148131.1,
INSD:EL054682.1,INSD:DR271216.1,INSD:EL073662.1,
INSD:BE038715.1,INSD:BP653015.1,INSD:AV563389.1,
INSD:DR271240.1,INSD:EH923271.1,INSD:CB074136.1,
INSD:DR271253.1,INSD:EH874106.1,INSD:N96937.1,
INSD:BP594272.1,INSD:EL143877.1,INSD:EL038037.1,
INSD:EH950106.1,INSD:EH937178.1,INSD:ES121010.1,
INSD:BP783416.1,INSD:EH918778.1,INSD:AV532577.1,
INSD:DR271261.1,INSD:EH869608.1,INSD:DR271235.1,
INSD:EL211553.1,INSD:EL056686.1,INSD:EH913502.1,
INSD:EH894828.1,INSD:BE529871.1,INSD:EH888923.1,
INSD:DR271233.1,INSD:EH924294.1,INSD:AV532822.1,
INSD:DR271281.1,INSD:EL276433.1,INSD:DR271293.1,
INSD:EH869889.1,INSD:EL234975.1,INSD:EH954047.1,
INSD:EG486974.1,INSD:EL197756.1,INSD:EL337986.1,
INSD:AV559690.1,INSD:DR271248.1,INSD:ES030613.1,
INSD:DR271276.1,INSD:EL131755.1,INSD:EL223175.1,
INSD:AV566305.1,INSD:AV795831.1,INSD:DR271249.1,
INSD:DR271225.1,INSD:EL095317.1,INSD:EH801966.1,
INSD:DR271288.1,INSD:EL009850.1,INSD:EL080642.1,
INSD:BP589771.1,INSD:DR271223.1,INSD:DR271292.1,
INSD:EH966322.1,INSD:EL225739.1,INSD:DR271283.1,
INSD:EL171549.1,INSD:AV566658.1,INSD:BP820650.1,
INSD:EL112501.1,INSD:DR271217.1,INSD:EH911939.1,
INSD:DR271255.1,INSD:DR271246.1,INSD:AV525330.1,
INSD:EL185076.1,INSD:EH930721.1,INSD:DR271264.1,
INSD:DR271259.1,INSD:EH856169.1,INSD:EH922042.1,
INSD:EH956462.1,INSD:EL332917.1,INSD:EL306191.1,
INSD:DR231388.1,INSD:EH818651.1,INSD:AV813031.1,
INSD:EL146179.1,INSD:EL048128.1,INSD:EH968991.1,
INSD:EL030401.1,INSD:EH993483.1,INSD:EH971376.1,
INSD:ES047963.1,INSD:AV810449.1,INSD:AV555007.1,
INSD:EL211913.1,INSD:DR271278.1,INSD:DR271274.1,
INSD:EL044677.1,INSD:EL265005.1,INSD:AV535461.1,
INSD:BE037776.1,INSD:EL134495.1,INSD:AV802735.1,
INSD:DR271262.1,INSD:EL000316.1,INSD:DR271215.1,
INSD:DR271242.1,INSD:BP604005.1,INSD:AV526546.1,
INSD:EH804583.1,INSD:DR382302.1,INSD:EL169414.1,
INSD:DR271277.1,INSD:EG486755.1,INSD:AV830292.1,
INSD:BP560800.1,INSD:BP609752.1,INSD:DR271260.1,
INSD:BP592308.1,INSD:T21054.1,INSD:EL290991.1,
INSD:EG527117.1,INSD:EH849937.1,INSD:EL110223.1,
INSD:DR271269.1,INSD:ES145838.1,INSD:BP635151.1,
INSD:EL247952.1,INSD:ES160274.1,INSD:EL137492.1,
INSD:BP813679.1,INSD:AV564206.1,INSD:BP587632.1,
INSD:EH882780.1,INSD:BP642712.1,INSD:AV534482.1,
INSD:AV811081.1,INSD:DR271237.1,INSD:R90420.1,
INSD:DR271251.1,INSD:EH907891.1,INSD:AA395600.1,
INSD:EG486985.1,INSD:T45260.1,INSD:ES006879.1,
INSD:EG527116.1,INSD:EL171611.1,INSD:BP820478.1,
INSD:ES168462.1,INSD:BE524358.1,INSD:R64751.1,
INSD:AV567702.1,INSD:BP824336.1,INSD:AV787327.1,
INSD:AV820902.1,INSD:EH910690.1,INSD:EL319188.1,
INSD:BP590242.1,INSD:EH847077.1,INSD:DR271258.1,
INSD:DR271286.1,INSD:DR271234.1,INSD:EL337781.1,
INSD:DR271243.1,INSD:T76407.1,INSD:AV824015.1,
INSD:BP787595.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX826929.1,INSD:AF410318.1,INSD:X65255.1,
INSD:AK229861.1,INSD:X61108.1,INSD:AY143865.1,
INSD:X63157.1,INSD:M94554.1"
/note="31-kDa RNA binding protein (RBP31); FUNCTIONS IN:
RNA binding, poly(U) RNA binding; INVOLVED IN: RNA
modification, RNA processing, innate immune response;
LOCATED IN: thylakoid, chloroplast thylakoid membrane,
chloroplast stroma, chloroplast, chloroplast envelope;
EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 14
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: RNA recognition
motif, RNP-1 (InterPro:IPR000504), Nucleotide-binding,
alpha-beta plait (InterPro:IPR012677); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: chloroplast RNA-binding protein
31B (TAIR:AT5G50250.1); Has 997248 Blast hits to 498569
proteins in 22111 species: Archae - 21618; Bacteria -
606023; Metazoa - 186637; Fungi - 27654; Plants - 60055;
Viruses - 71042; Other Eukaryotes - 24219 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G24770"
/db_xref="Araport:AT4G24770"
intron_pos 181:0 (1/3)
intron_pos 215:0 (2/3)
intron_pos 309:0 (3/3)
BEGIN
1 MASSIVTSSL KPLAMADSSS STIFSHPSIS STISSSRIRS SSVSLLTGRI NLPLSFSRVS
61 LSLKTKTHLK KSPFVSFVAQ TSDWAEEGGE GSVAVEETEN SLESQDVSEG DESEGDASEG
121 DVSEGDESEG DVSEGAVSER AEFPEPSEEA KLFVGNLAYD VNSQALAMLF EQAGTVEIAE
181 VIYNRETDQS RGFGFVTMSS VDEAETAVEK FNRYDLNGRL LTVNKAAPRG SRPERAPRVY
241 EPAFRVYVGN LPWDVDNGRL EQLFSEHGKV VEARVVYDRE TGRSRGFGFV TMSDVDELNE
301 AISALDGQNL EGRAIRVNVA EERPPRRGY
//