LOCUS AEE84954.1 329 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana 31-kDa RNA binding protein protein. ACCESSION CP002687-4432 PROTEIN_ID AEE84954.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G., Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N., Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M., Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R., Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M., Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M., Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W., Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L., Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J., Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I., Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U., Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M., Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M., Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C., Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J., Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S., Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A., Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D., Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S., Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O., Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S., Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F., Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T., Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A., Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D., Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P., Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W., Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M., Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E., Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M., Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G., Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A., Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N., Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M., Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S., Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K., Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C., Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D., Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A., Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N., Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M., Martienssen,R. and McCombie,W.R. TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999) PUBMED 10617198 REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="4" /ecotype="Columbia" protein /gene="RBP31" /locus_tag="AT4G24770" /gene_synonym="31-kDa RNA binding protein" /gene_synonym="APPROXIMATELY 31 KD" /gene_synonym="ARABIDOPSIS THALIANA RNA BINDING PROTEIN" /gene_synonym="ATRBP31" /gene_synonym="ATRBP33" /gene_synonym="CP31" /gene_synonym="F6I7.11" /gene_synonym="STEP1" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:DR271230.1,INSD:EL131051.1,INSD:DR271273.1, INSD:AV546081.1,INSD:ES216227.1,INSD:EH993823.1, INSD:EL081043.1,INSD:EL147088.1,INSD:EL149384.1, INSD:AV785242.1,INSD:EL061214.1,INSD:EL035112.1, INSD:BP786287.1,INSD:DR271221.1,INSD:EL291097.1, INSD:EL029794.1,INSD:EH873883.1,INSD:DR231389.1, INSD:EH862706.1,INSD:AV535554.1,INSD:DR271265.1, INSD:EH860391.1,INSD:AV815257.1,INSD:EL159161.1, INSD:EL143549.1,INSD:EH877294.1,INSD:EG496257.1, INSD:EL020334.1,INSD:EL129177.1,INSD:DR271224.1, INSD:AV559316.1,INSD:EH969870.1,INSD:AI100105.1, INSD:EL026547.1,INSD:EH887551.1,INSD:DR271257.1, INSD:AV783120.1,INSD:DR271231.1,INSD:EL090728.1, INSD:BP829088.1,INSD:DR271266.1,INSD:EL337768.1, INSD:EH977694.1,INSD:DR271232.1,INSD:EL315552.1, INSD:EH912873.1,INSD:BP816514.1,INSD:DR271291.1, INSD:DR271275.1,INSD:AV788790.1,INSD:AV518608.1, INSD:EH903337.1,INSD:EH862124.1,INSD:EL018641.1, INSD:DR271252.1,INSD:EH837993.1,INSD:BP826558.1, INSD:EL036848.1,INSD:BP788596.1,INSD:EL252575.1, INSD:EL303543.1,INSD:EL131158.1,INSD:DR271222.1, INSD:EH957446.1,INSD:AV527838.1,INSD:T22781.1, INSD:DR271247.1,INSD:BP655406.1,INSD:DR271239.1, INSD:EH872812.1,INSD:AV518968.1,INSD:DR271285.1, INSD:DR383164.1,INSD:EL086362.1,INSD:AV518476.1, INSD:BP865978.1,INSD:BP635258.1,INSD:EH802263.1, INSD:AV830788.1,INSD:BP824225.1,INSD:BP644475.1, INSD:EL088457.1,INSD:DR271290.1,INSD:EL068319.1, INSD:DR271282.1,INSD:EL149164.1,INSD:DR271220.1, INSD:BP793931.1,INSD:BP859862.1,INSD:BP796801.1, INSD:EL328143.1,INSD:BP648021.1,INSD:EL045957.1, INSD:EL037067.1,INSD:BP847064.1,INSD:DR271238.1, INSD:EH949551.1,INSD:AV819402.1,INSD:AV525646.1, INSD:EL142980.1,INSD:AV562068.1,INSD:DR271241.1, INSD:DR271287.1,INSD:EG468798.1,INSD:DR271244.1, INSD:EG444953.1,INSD:EH964856.1,INSD:BP653167.1, INSD:ES107331.1,INSD:EH870976.1,INSD:EL123576.1, INSD:EL256168.1,INSD:ES206268.1,INSD:BP829795.1, INSD:ES071031.1,INSD:EL157106.1,INSD:DR271289.1, INSD:EL136850.1,INSD:CK119192.1,INSD:DR271279.1, INSD:BP818724.1,INSD:EH806426.1,INSD:EL041521.1, INSD:BP789442.1,INSD:EL329351.1,INSD:DR271270.1, INSD:EL163846.1,INSD:DR271218.1,INSD:BX836802.1, INSD:EG444951.1,INSD:DR271284.1,INSD:EL261677.1, INSD:EH954138.1,INSD:EL258167.1,INSD:EH839981.1, INSD:EH829184.1,INSD:DR231387.1,INSD:EH800662.1, INSD:AV785128.1,INSD:EL276744.1,INSD:BP591468.1, INSD:DR271214.1,INSD:EH877700.1,INSD:EH805428.1, INSD:EL314805.1,INSD:BP788040.1,INSD:AV531948.1, INSD:EH845665.1,INSD:DR271268.1,INSD:DR271280.1, INSD:EH886951.1,INSD:EL280314.1,INSD:EH942784.1, INSD:ES039615.1,INSD:DR271226.1,INSD:DR271236.1, INSD:EL247723.1,INSD:EL331572.1,INSD:EH849161.1, INSD:AV796075.1,INSD:EH869960.1,INSD:BP596052.1, INSD:AA713138.1,INSD:AV525667.1,INSD:EL234734.1, INSD:EL215649.1,INSD:EL014510.1,INSD:AV797428.1, INSD:EH803818.1,INSD:EL157327.1,INSD:DR271228.1, INSD:DR271267.1,INSD:EL172542.1,INSD:EL218525.1, INSD:AV789573.1,INSD:EL278059.1,INSD:BP868808.1, INSD:EL301220.1,INSD:EL004689.1,INSD:EL137533.1, INSD:AV795585.1,INSD:EL288469.1,INSD:BP595433.1, INSD:BP645467.1,INSD:DR271250.1,INSD:DR271227.1, INSD:DR271245.1,INSD:BP626484.1,INSD:DR271271.1, INSD:DR271272.1,INSD:BP858530.1,INSD:EL998764.1, INSD:EH965911.1,INSD:EL094449.1,INSD:EL318616.1, INSD:EL143295.1,INSD:BP637980.1,INSD:BE530247.1, INSD:EG514114.1,INSD:EL221139.1,INSD:EL006098.1, INSD:AV824094.1,INSD:EH881243.1,INSD:T43174.1, INSD:EL066218.1,INSD:BP816129.1,INSD:DR271254.1, INSD:AV525977.1,INSD:BP820390.1,INSD:DR271263.1, INSD:BP646624.1,INSD:BP622136.1,INSD:BP812581.1, INSD:BP824405.1,INSD:AV439846.1,INSD:EH964040.1, INSD:DR271256.1,INSD:BP865981.1,INSD:BU635901.1, INSD:AV810090.1,INSD:EL187916.1,INSD:DR271229.1, INSD:EL107100.1,INSD:EL175352.1,INSD:AV798427.1, INSD:BP625770.1,INSD:EL032459.1,INSD:EH952415.1, INSD:DR271219.1,INSD:AV519828.1,INSD:EL148131.1, INSD:EL054682.1,INSD:DR271216.1,INSD:EL073662.1, INSD:BE038715.1,INSD:BP653015.1,INSD:AV563389.1, INSD:DR271240.1,INSD:EH923271.1,INSD:CB074136.1, INSD:DR271253.1,INSD:EH874106.1,INSD:N96937.1, INSD:BP594272.1,INSD:EL143877.1,INSD:EL038037.1, INSD:EH950106.1,INSD:EH937178.1,INSD:ES121010.1, INSD:BP783416.1,INSD:EH918778.1,INSD:AV532577.1, INSD:DR271261.1,INSD:EH869608.1,INSD:DR271235.1, INSD:EL211553.1,INSD:EL056686.1,INSD:EH913502.1, INSD:EH894828.1,INSD:BE529871.1,INSD:EH888923.1, INSD:DR271233.1,INSD:EH924294.1,INSD:AV532822.1, INSD:DR271281.1,INSD:EL276433.1,INSD:DR271293.1, INSD:EH869889.1,INSD:EL234975.1,INSD:EH954047.1, INSD:EG486974.1,INSD:EL197756.1,INSD:EL337986.1, INSD:AV559690.1,INSD:DR271248.1,INSD:ES030613.1, INSD:DR271276.1,INSD:EL131755.1,INSD:EL223175.1, INSD:AV566305.1,INSD:AV795831.1,INSD:DR271249.1, INSD:DR271225.1,INSD:EL095317.1,INSD:EH801966.1, INSD:DR271288.1,INSD:EL009850.1,INSD:EL080642.1, INSD:BP589771.1,INSD:DR271223.1,INSD:DR271292.1, INSD:EH966322.1,INSD:EL225739.1,INSD:DR271283.1, INSD:EL171549.1,INSD:AV566658.1,INSD:BP820650.1, INSD:EL112501.1,INSD:DR271217.1,INSD:EH911939.1, INSD:DR271255.1,INSD:DR271246.1,INSD:AV525330.1, INSD:EL185076.1,INSD:EH930721.1,INSD:DR271264.1, INSD:DR271259.1,INSD:EH856169.1,INSD:EH922042.1, INSD:EH956462.1,INSD:EL332917.1,INSD:EL306191.1, INSD:DR231388.1,INSD:EH818651.1,INSD:AV813031.1, INSD:EL146179.1,INSD:EL048128.1,INSD:EH968991.1, INSD:EL030401.1,INSD:EH993483.1,INSD:EH971376.1, INSD:ES047963.1,INSD:AV810449.1,INSD:AV555007.1, INSD:EL211913.1,INSD:DR271278.1,INSD:DR271274.1, INSD:EL044677.1,INSD:EL265005.1,INSD:AV535461.1, INSD:BE037776.1,INSD:EL134495.1,INSD:AV802735.1, INSD:DR271262.1,INSD:EL000316.1,INSD:DR271215.1, INSD:DR271242.1,INSD:BP604005.1,INSD:AV526546.1, INSD:EH804583.1,INSD:DR382302.1,INSD:EL169414.1, INSD:DR271277.1,INSD:EG486755.1,INSD:AV830292.1, INSD:BP560800.1,INSD:BP609752.1,INSD:DR271260.1, INSD:BP592308.1,INSD:T21054.1,INSD:EL290991.1, INSD:EG527117.1,INSD:EH849937.1,INSD:EL110223.1, INSD:DR271269.1,INSD:ES145838.1,INSD:BP635151.1, INSD:EL247952.1,INSD:ES160274.1,INSD:EL137492.1, INSD:BP813679.1,INSD:AV564206.1,INSD:BP587632.1, INSD:EH882780.1,INSD:BP642712.1,INSD:AV534482.1, INSD:AV811081.1,INSD:DR271237.1,INSD:R90420.1, INSD:DR271251.1,INSD:EH907891.1,INSD:AA395600.1, INSD:EG486985.1,INSD:T45260.1,INSD:ES006879.1, INSD:EG527116.1,INSD:EL171611.1,INSD:BP820478.1, INSD:ES168462.1,INSD:BE524358.1,INSD:R64751.1, INSD:AV567702.1,INSD:BP824336.1,INSD:AV787327.1, INSD:AV820902.1,INSD:EH910690.1,INSD:EL319188.1, INSD:BP590242.1,INSD:EH847077.1,INSD:DR271258.1, INSD:DR271286.1,INSD:DR271234.1,INSD:EL337781.1, INSD:DR271243.1,INSD:T76407.1,INSD:AV824015.1, INSD:BP787595.1" /inference="Similar to RNA sequence, mRNA:INSD:BX826929.1,INSD:AF410318.1,INSD:X65255.1, INSD:AK229861.1,INSD:X61108.1,INSD:AY143865.1, INSD:X63157.1,INSD:M94554.1" /note="31-kDa RNA binding protein (RBP31); FUNCTIONS IN: RNA binding, poly(U) RNA binding; INVOLVED IN: RNA modification, RNA processing, innate immune response; LOCATED IN: thylakoid, chloroplast thylakoid membrane, chloroplast stroma, chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: RNA recognition motif, RNP-1 (InterPro:IPR000504), Nucleotide-binding, alpha-beta plait (InterPro:IPR012677); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: chloroplast RNA-binding protein 31B (TAIR:AT5G50250.1); Has 997248 Blast hits to 498569 proteins in 22111 species: Archae - 21618; Bacteria - 606023; Metazoa - 186637; Fungi - 27654; Plants - 60055; Viruses - 71042; Other Eukaryotes - 24219 (source: NCBI BLink)." /db_xref="TAIR:AT4G24770" /db_xref="Araport:AT4G24770" intron_pos 181:0 (1/3) intron_pos 215:0 (2/3) intron_pos 309:0 (3/3) BEGIN 1 MASSIVTSSL KPLAMADSSS STIFSHPSIS STISSSRIRS SSVSLLTGRI NLPLSFSRVS 61 LSLKTKTHLK KSPFVSFVAQ TSDWAEEGGE GSVAVEETEN SLESQDVSEG DESEGDASEG 121 DVSEGDESEG DVSEGAVSER AEFPEPSEEA KLFVGNLAYD VNSQALAMLF EQAGTVEIAE 181 VIYNRETDQS RGFGFVTMSS VDEAETAVEK FNRYDLNGRL LTVNKAAPRG SRPERAPRVY 241 EPAFRVYVGN LPWDVDNGRL EQLFSEHGKV VEARVVYDRE TGRSRGFGFV TMSDVDELNE 301 AISALDGQNL EGRAIRVNVA EERPPRRGY //