LOCUS AEE84082.1 182 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana ribosomal protein L16B protein.
ACCESSION CP002687-3215
PROTEIN_ID AEE84082.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="RPL16B"
/locus_tag="AT4G18730"
/gene_synonym="ribosomal protein L16B"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL041247.1,INSD:EL988632.1,INSD:BP587994.1,
INSD:CB259071.1,INSD:DR327475.1,INSD:AI099978.1,
INSD:ES050079.1,INSD:ES042636.1,INSD:ES098141.1,
INSD:DR327513.1,INSD:ES063251.1,INSD:BP577668.1,
INSD:DR327494.1,INSD:AV787704.1,INSD:BE530298.1,
INSD:DR327512.1,INSD:DR327489.1,INSD:DR327509.1,
INSD:EH796152.1,INSD:BP571137.1,INSD:DR327502.1,
INSD:BP657042.1,INSD:EH839801.1,INSD:AV821117.1,
INSD:DR327531.1,INSD:EL039208.1,INSD:DR327484.1,
INSD:ES043748.1,INSD:ES042196.1,INSD:BP834998.1,
INSD:ES106254.1,INSD:ES205703.1,INSD:ES090783.1,
INSD:EH867766.1,INSD:ES005965.1,INSD:DR327507.1,
INSD:BP862071.1,INSD:EL189501.1,INSD:EL149257.1,
INSD:ES184583.1,INSD:ES147271.1,INSD:DR327522.1,
INSD:EL232942.1,INSD:BP589080.1,INSD:AV557132.1,
INSD:ES051289.1,INSD:EL160840.1,INSD:CK121131.1,
INSD:AV791544.1,INSD:ES180826.1,INSD:EL142860.1,
INSD:EL003318.1,INSD:BP566805.1,INSD:EL975703.1,
INSD:AV793986.1,INSD:EL306601.1,INSD:BP625050.1,
INSD:DR327474.1,INSD:ES102474.1,INSD:BE525183.1,
INSD:ES026528.1,INSD:DR327527.1,INSD:EH950404.1,
INSD:ES083208.1,INSD:ES210472.1,INSD:BP820134.1,
INSD:EL973524.1,INSD:BP594169.1,INSD:DR370348.1,
INSD:DR327519.1,INSD:ES039003.1,INSD:DR327515.1,
INSD:BP610286.1,INSD:CK121294.1,INSD:ES069993.1,
INSD:CF651660.1,INSD:BP799297.1,INSD:BP635060.1,
INSD:EL054210.1,INSD:ES204317.1,INSD:ES086614.1,
INSD:ES038281.1,INSD:BP817863.1,INSD:BP583800.1,
INSD:ES100560.1,INSD:ES026015.1,INSD:AV532348.1,
INSD:EH804875.1,INSD:BP580471.1,INSD:EL113089.1,
INSD:ES202030.1,INSD:BP652123.1,INSD:BP579868.1,
INSD:ES079620.1,INSD:ES168940.1,INSD:EL967443.1,
INSD:DR327508.1,INSD:ES020357.1,INSD:DR327524.1,
INSD:ES147725.1,INSD:BE522833.1,INSD:AA712769.1,
INSD:DR327487.1,INSD:ES155527.1,INSD:EL316174.1,
INSD:ES111933.1,INSD:DR327533.1,INSD:AA712352.1,
INSD:BP637585.1,INSD:DR327505.1,INSD:DR327530.1,
INSD:BP612740.1,INSD:DR327534.1,INSD:DR327516.1,
INSD:BP664403.1,INSD:EH836469.1,INSD:AW004102.1,
INSD:ES048878.1,INSD:BP647459.1,INSD:ES021919.1,
INSD:CF652557.1,INSD:EL184545.1,INSD:DR327481.1,
INSD:EL089628.1,INSD:DR327529.1,INSD:DR327497.1,
INSD:BP862858.1,INSD:EG496999.1,INSD:ES094196.1,
INSD:ES011793.1,INSD:EL046433.1,INSD:EL253812.1,
INSD:BP814384.1,INSD:ES204590.1,INSD:EL993420.1,
INSD:ES133907.1,INSD:ES194123.1,INSD:EG519897.1,
INSD:EL051960.1,INSD:ES052793.1,INSD:ES176424.1,
INSD:ES197131.1,INSD:EL100795.1,INSD:DR327517.1,
INSD:ES193176.1,INSD:BP583471.1,INSD:BP671771.1,
INSD:EL986248.1,INSD:EL327493.1,INSD:ES004054.1,
INSD:EL188524.1,INSD:ES118067.1,INSD:EH841299.1,
INSD:ES167106.1,INSD:ES088248.1,INSD:DR327480.1,
INSD:EL990609.1,INSD:EH954481.1,INSD:EL223933.1,
INSD:ES201178.1,INSD:EL218307.1,INSD:ES105722.1,
INSD:AV532699.1,INSD:ES132957.1,INSD:EH917566.1,
INSD:BP568513.1,INSD:ES134353.1,INSD:BP864392.1,
INSD:ES043933.1,INSD:EH836360.1,INSD:CK121424.1,
INSD:ES081835.1,INSD:BP580962.1,INSD:EL976253.1,
INSD:BP648005.1,INSD:EL996545.1,INSD:AV535456.1,
INSD:EH868813.1,INSD:BE529758.1,INSD:BP854989.1,
INSD:EL060593.1,INSD:BP620719.1,INSD:EL981664.1,
INSD:BE521479.1,INSD:ES021097.1,INSD:EH937268.1,
INSD:BP798856.1,INSD:BP579624.1,INSD:EL305298.1,
INSD:N65373.1,INSD:CB260708.1,INSD:EH908709.1,
INSD:DR327514.1,INSD:EL209218.1,INSD:BP573229.1,
INSD:EL096591.1,INSD:BE522845.1,INSD:DR327490.1,
INSD:EL027462.1,INSD:EL045300.1,INSD:ES063312.1,
INSD:EH801652.1,INSD:ES203677.1,INSD:ES045921.1,
INSD:DR327511.1,INSD:BP633896.1,INSD:BP578226.1,
INSD:ES147440.1,INSD:AV813027.1,INSD:EL223749.1,
INSD:EL188451.1,INSD:EL105649.1,INSD:DR327528.1,
INSD:EL073466.1,INSD:EL102335.1,INSD:DR327523.1,
INSD:DR327503.1,INSD:DR327492.1,INSD:ES012028.1,
INSD:ES081734.1,INSD:AA712686.1,INSD:BP593283.1,
INSD:AW004572.1,INSD:EL321696.1,INSD:EH892148.1,
INSD:EL321776.1,INSD:EL008804.1,INSD:BP642982.1,
INSD:BP591555.1,INSD:EH979975.1,INSD:ES192457.1,
INSD:EL297551.1,INSD:ES003013.1,INSD:BP604627.1,
INSD:BP658530.1,INSD:ES092601.1,INSD:BP583766.1,
INSD:ES098213.1,INSD:DR327510.1,INSD:CB258716.1,
INSD:EL086242.1,INSD:EL047364.1,INSD:BP846428.1,
INSD:ES022890.1,INSD:ES033406.1,INSD:DR327518.1,
INSD:BP852476.1,INSD:ES168577.1,INSD:AA712813.1,
INSD:EL245024.1,INSD:DR327506.1,INSD:DR327498.1,
INSD:ES063039.1,INSD:EL981658.1,INSD:DR327504.1,
INSD:ES172786.1,INSD:BP827549.1,INSD:EG496998.1,
INSD:ES159696.1,INSD:AV551153.1,INSD:BP824013.1,
INSD:EG485726.1,INSD:BP797298.1,INSD:BP595257.1,
INSD:ES195495.1,INSD:DR327479.1,INSD:CF651666.1,
INSD:EL029118.1,INSD:ES061709.1,INSD:DR327493.1,
INSD:DR327478.1,INSD:BP584204.1,INSD:BP648887.1,
INSD:DR327526.1,INSD:CK119535.1,INSD:ES080716.1,
INSD:BP574988.1,INSD:EL334248.1,INSD:EH978271.1,
INSD:ES135781.1,INSD:BP563546.1,INSD:DR327496.1,
INSD:BP595799.1,INSD:ES086112.1,INSD:EL024015.1,
INSD:ES010793.1,INSD:T76592.1,INSD:AA651561.1,
INSD:DR327488.1,INSD:AA042256.1,INSD:EH816771.1,
INSD:ES174132.1,INSD:EL083849.1,INSD:DR327521.1,
INSD:DR327485.1,INSD:BP815162.1,INSD:BP590126.1,
INSD:EL301176.1,INSD:ES048359.1,INSD:BP580754.1,
INSD:ES046010.1,INSD:ES170790.1,INSD:DR327483.1,
INSD:DR327500.1,INSD:BP842328.1,INSD:EL129426.1,
INSD:BP798873.1,INSD:ES134065.1,INSD:ES135634.1,
INSD:ES210754.1,INSD:ES203911.1,INSD:ES180678.1,
INSD:EL986769.1,INSD:DR327476.1,INSD:BP587686.1,
INSD:ES083416.1,INSD:BP811726.1,INSD:DR327495.1,
INSD:BP565897.1,INSD:ES197609.1,INSD:CB258714.1,
INSD:ES059665.1,INSD:ES206629.1,INSD:BP648809.1,
INSD:EH853209.1,INSD:BP574955.1,INSD:DR327499.1,
INSD:EH820074.1,INSD:EH861986.1,INSD:ES098059.1,
INSD:EH969839.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AF326876.1,INSD:BX827764.1,INSD:X81798.1,
INSD:AY039570.1,INSD:AY086300.1"
/note="ribosomal protein L16B (RPL16B); FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: lateral
root morphogenesis, cell cycle, translation; LOCATED IN:
cytosolic large ribosomal subunit, vacuole, membrane;
EXPRESSED IN: lateral root primordium, leaf; CONTAINS
InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L5
(InterPro:IPR002132), Ribosomal protein L5, conserved site
(InterPro:IPR020929), Ribosomal protein L5, N-terminal
(InterPro:IPR020927), Ribosomal protein L5, C-terminal
(InterPro:IPR020928); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: Ribosomal L5P family protein (TAIR:AT5G45775.2);
Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species:
Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi -
3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996
(source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G18730"
/db_xref="Araport:AT4G18730"
intron_pos 2:0 (1/4)
intron_pos 38:0 (2/4)
intron_pos 52:1 (3/4)
intron_pos 117:2 (4/4)
BEGIN
1 MASEKKLSNP MRDIKVQKLV LNISVGESGD RLTRASKVLE QLSGQTPVFS KARYTVRSFG
61 IRRNEKIACY VTVRGEKAMQ LLESGLKVKE YELLRRNFSD TGCFGFGIQE HIDLGIKYDP
121 STGIYGMDFY VVLERPGYRV ARRRRCKTRV GIQHRVTKDD AMKWFQVKYE GVILNKSQNI
181 TG
//