LOCUS AEE84082.1 182 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana ribosomal protein L16B protein. ACCESSION CP002687-3215 PROTEIN_ID AEE84082.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G., Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N., Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M., Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R., Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M., Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M., Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W., Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L., Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J., Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I., Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U., Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M., Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M., Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C., Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J., Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S., Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A., Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D., Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S., Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O., Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S., Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F., Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T., Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A., Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D., Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P., Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W., Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M., Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E., Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M., Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G., Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A., Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N., Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M., Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S., Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K., Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C., Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D., Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A., Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N., Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M., Martienssen,R. and McCombie,W.R. TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999) PUBMED 10617198 REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="4" /ecotype="Columbia" protein /gene="RPL16B" /locus_tag="AT4G18730" /gene_synonym="ribosomal protein L16B" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:EL041247.1,INSD:EL988632.1,INSD:BP587994.1, INSD:CB259071.1,INSD:DR327475.1,INSD:AI099978.1, INSD:ES050079.1,INSD:ES042636.1,INSD:ES098141.1, INSD:DR327513.1,INSD:ES063251.1,INSD:BP577668.1, INSD:DR327494.1,INSD:AV787704.1,INSD:BE530298.1, INSD:DR327512.1,INSD:DR327489.1,INSD:DR327509.1, INSD:EH796152.1,INSD:BP571137.1,INSD:DR327502.1, INSD:BP657042.1,INSD:EH839801.1,INSD:AV821117.1, INSD:DR327531.1,INSD:EL039208.1,INSD:DR327484.1, INSD:ES043748.1,INSD:ES042196.1,INSD:BP834998.1, INSD:ES106254.1,INSD:ES205703.1,INSD:ES090783.1, INSD:EH867766.1,INSD:ES005965.1,INSD:DR327507.1, INSD:BP862071.1,INSD:EL189501.1,INSD:EL149257.1, INSD:ES184583.1,INSD:ES147271.1,INSD:DR327522.1, INSD:EL232942.1,INSD:BP589080.1,INSD:AV557132.1, INSD:ES051289.1,INSD:EL160840.1,INSD:CK121131.1, INSD:AV791544.1,INSD:ES180826.1,INSD:EL142860.1, INSD:EL003318.1,INSD:BP566805.1,INSD:EL975703.1, INSD:AV793986.1,INSD:EL306601.1,INSD:BP625050.1, INSD:DR327474.1,INSD:ES102474.1,INSD:BE525183.1, INSD:ES026528.1,INSD:DR327527.1,INSD:EH950404.1, INSD:ES083208.1,INSD:ES210472.1,INSD:BP820134.1, INSD:EL973524.1,INSD:BP594169.1,INSD:DR370348.1, INSD:DR327519.1,INSD:ES039003.1,INSD:DR327515.1, INSD:BP610286.1,INSD:CK121294.1,INSD:ES069993.1, INSD:CF651660.1,INSD:BP799297.1,INSD:BP635060.1, INSD:EL054210.1,INSD:ES204317.1,INSD:ES086614.1, INSD:ES038281.1,INSD:BP817863.1,INSD:BP583800.1, INSD:ES100560.1,INSD:ES026015.1,INSD:AV532348.1, INSD:EH804875.1,INSD:BP580471.1,INSD:EL113089.1, INSD:ES202030.1,INSD:BP652123.1,INSD:BP579868.1, INSD:ES079620.1,INSD:ES168940.1,INSD:EL967443.1, INSD:DR327508.1,INSD:ES020357.1,INSD:DR327524.1, INSD:ES147725.1,INSD:BE522833.1,INSD:AA712769.1, INSD:DR327487.1,INSD:ES155527.1,INSD:EL316174.1, INSD:ES111933.1,INSD:DR327533.1,INSD:AA712352.1, INSD:BP637585.1,INSD:DR327505.1,INSD:DR327530.1, INSD:BP612740.1,INSD:DR327534.1,INSD:DR327516.1, INSD:BP664403.1,INSD:EH836469.1,INSD:AW004102.1, INSD:ES048878.1,INSD:BP647459.1,INSD:ES021919.1, INSD:CF652557.1,INSD:EL184545.1,INSD:DR327481.1, INSD:EL089628.1,INSD:DR327529.1,INSD:DR327497.1, INSD:BP862858.1,INSD:EG496999.1,INSD:ES094196.1, INSD:ES011793.1,INSD:EL046433.1,INSD:EL253812.1, INSD:BP814384.1,INSD:ES204590.1,INSD:EL993420.1, INSD:ES133907.1,INSD:ES194123.1,INSD:EG519897.1, INSD:EL051960.1,INSD:ES052793.1,INSD:ES176424.1, INSD:ES197131.1,INSD:EL100795.1,INSD:DR327517.1, INSD:ES193176.1,INSD:BP583471.1,INSD:BP671771.1, INSD:EL986248.1,INSD:EL327493.1,INSD:ES004054.1, INSD:EL188524.1,INSD:ES118067.1,INSD:EH841299.1, INSD:ES167106.1,INSD:ES088248.1,INSD:DR327480.1, INSD:EL990609.1,INSD:EH954481.1,INSD:EL223933.1, INSD:ES201178.1,INSD:EL218307.1,INSD:ES105722.1, INSD:AV532699.1,INSD:ES132957.1,INSD:EH917566.1, INSD:BP568513.1,INSD:ES134353.1,INSD:BP864392.1, INSD:ES043933.1,INSD:EH836360.1,INSD:CK121424.1, INSD:ES081835.1,INSD:BP580962.1,INSD:EL976253.1, INSD:BP648005.1,INSD:EL996545.1,INSD:AV535456.1, INSD:EH868813.1,INSD:BE529758.1,INSD:BP854989.1, INSD:EL060593.1,INSD:BP620719.1,INSD:EL981664.1, INSD:BE521479.1,INSD:ES021097.1,INSD:EH937268.1, INSD:BP798856.1,INSD:BP579624.1,INSD:EL305298.1, INSD:N65373.1,INSD:CB260708.1,INSD:EH908709.1, INSD:DR327514.1,INSD:EL209218.1,INSD:BP573229.1, INSD:EL096591.1,INSD:BE522845.1,INSD:DR327490.1, INSD:EL027462.1,INSD:EL045300.1,INSD:ES063312.1, INSD:EH801652.1,INSD:ES203677.1,INSD:ES045921.1, INSD:DR327511.1,INSD:BP633896.1,INSD:BP578226.1, INSD:ES147440.1,INSD:AV813027.1,INSD:EL223749.1, INSD:EL188451.1,INSD:EL105649.1,INSD:DR327528.1, INSD:EL073466.1,INSD:EL102335.1,INSD:DR327523.1, INSD:DR327503.1,INSD:DR327492.1,INSD:ES012028.1, INSD:ES081734.1,INSD:AA712686.1,INSD:BP593283.1, INSD:AW004572.1,INSD:EL321696.1,INSD:EH892148.1, INSD:EL321776.1,INSD:EL008804.1,INSD:BP642982.1, INSD:BP591555.1,INSD:EH979975.1,INSD:ES192457.1, INSD:EL297551.1,INSD:ES003013.1,INSD:BP604627.1, INSD:BP658530.1,INSD:ES092601.1,INSD:BP583766.1, INSD:ES098213.1,INSD:DR327510.1,INSD:CB258716.1, INSD:EL086242.1,INSD:EL047364.1,INSD:BP846428.1, INSD:ES022890.1,INSD:ES033406.1,INSD:DR327518.1, INSD:BP852476.1,INSD:ES168577.1,INSD:AA712813.1, INSD:EL245024.1,INSD:DR327506.1,INSD:DR327498.1, INSD:ES063039.1,INSD:EL981658.1,INSD:DR327504.1, INSD:ES172786.1,INSD:BP827549.1,INSD:EG496998.1, INSD:ES159696.1,INSD:AV551153.1,INSD:BP824013.1, INSD:EG485726.1,INSD:BP797298.1,INSD:BP595257.1, INSD:ES195495.1,INSD:DR327479.1,INSD:CF651666.1, INSD:EL029118.1,INSD:ES061709.1,INSD:DR327493.1, INSD:DR327478.1,INSD:BP584204.1,INSD:BP648887.1, INSD:DR327526.1,INSD:CK119535.1,INSD:ES080716.1, INSD:BP574988.1,INSD:EL334248.1,INSD:EH978271.1, INSD:ES135781.1,INSD:BP563546.1,INSD:DR327496.1, INSD:BP595799.1,INSD:ES086112.1,INSD:EL024015.1, INSD:ES010793.1,INSD:T76592.1,INSD:AA651561.1, INSD:DR327488.1,INSD:AA042256.1,INSD:EH816771.1, INSD:ES174132.1,INSD:EL083849.1,INSD:DR327521.1, INSD:DR327485.1,INSD:BP815162.1,INSD:BP590126.1, INSD:EL301176.1,INSD:ES048359.1,INSD:BP580754.1, INSD:ES046010.1,INSD:ES170790.1,INSD:DR327483.1, INSD:DR327500.1,INSD:BP842328.1,INSD:EL129426.1, INSD:BP798873.1,INSD:ES134065.1,INSD:ES135634.1, INSD:ES210754.1,INSD:ES203911.1,INSD:ES180678.1, INSD:EL986769.1,INSD:DR327476.1,INSD:BP587686.1, INSD:ES083416.1,INSD:BP811726.1,INSD:DR327495.1, INSD:BP565897.1,INSD:ES197609.1,INSD:CB258714.1, INSD:ES059665.1,INSD:ES206629.1,INSD:BP648809.1, INSD:EH853209.1,INSD:BP574955.1,INSD:DR327499.1, INSD:EH820074.1,INSD:EH861986.1,INSD:ES098059.1, INSD:EH969839.1" /inference="Similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AF326876.1,INSD:BX827764.1,INSD:X81798.1, INSD:AY039570.1,INSD:AY086300.1" /note="ribosomal protein L16B (RPL16B); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: lateral root morphogenesis, cell cycle, translation; LOCATED IN: cytosolic large ribosomal subunit, vacuole, membrane; EXPRESSED IN: lateral root primordium, leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L5 (InterPro:IPR002132), Ribosomal protein L5, conserved site (InterPro:IPR020929), Ribosomal protein L5, N-terminal (InterPro:IPR020927), Ribosomal protein L5, C-terminal (InterPro:IPR020928); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal L5P family protein (TAIR:AT5G45775.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink)." /db_xref="TAIR:AT4G18730" /db_xref="Araport:AT4G18730" intron_pos 2:0 (1/4) intron_pos 38:0 (2/4) intron_pos 52:1 (3/4) intron_pos 117:2 (4/4) BEGIN 1 MASEKKLSNP MRDIKVQKLV LNISVGESGD RLTRASKVLE QLSGQTPVFS KARYTVRSFG 61 IRRNEKIACY VTVRGEKAMQ LLESGLKVKE YELLRRNFSD TGCFGFGIQE HIDLGIKYDP 121 STGIYGMDFY VVLERPGYRV ARRRRCKTRV GIQHRVTKDD AMKWFQVKYE GVILNKSQNI 181 TG //