LOCUS AEE80298.1 313 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana rotamase CYP 4 protein.
ACCESSION CP002686-9199
PROTEIN_ID AEE80298.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="ROC4"
/locus_tag="AT3G62030"
/gene_synonym="cyclophilin 20-3"
/gene_synonym="CYP20-3"
/gene_synonym="PEPTIDYLPROLYL ISOMERASE ROC4"
/gene_synonym="rotamase CYP 4"
/gene_synonym="T17J13.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH973946.1,INSD:EH841533.1,INSD:EH803781.1,
INSD:EH864966.1,INSD:EH843423.1,INSD:EL156486.1,
INSD:EL274525.1,INSD:EL152691.1,INSD:DR267517.1,
INSD:AV786722.1,INSD:EL145379.1,INSD:EH798620.1,
INSD:EH919239.1,INSD:EL323538.1,INSD:EL067124.1,
INSD:EH914844.1,INSD:EL341545.1,INSD:CB262570.1,
INSD:EH893174.1,INSD:EL184703.1,INSD:EH892770.1,
INSD:EL075142.1,INSD:EL074311.1,INSD:EL330648.1,
INSD:EL111930.1,INSD:ES084700.1,INSD:DR267556.1,
INSD:EH799388.1,INSD:BP612700.1,INSD:EH886847.1,
INSD:EL213245.1,INSD:EL293545.1,INSD:EH923135.1,
INSD:EL123720.1,INSD:EL205310.1,INSD:EL339056.1,
INSD:EL202593.1,INSD:EL227121.1,INSD:EH906929.1,
INSD:EH806279.1,INSD:BP647897.1,INSD:EH914579.1,
INSD:EL039020.1,INSD:EL237538.1,INSD:EL180172.1,
INSD:EH891228.1,INSD:EH864941.1,INSD:EL260760.1,
INSD:CB262402.1,INSD:EL070322.1,INSD:EH934620.1,
INSD:EL110346.1,INSD:DR377214.1,INSD:EL265633.1,
INSD:EH858815.1,INSD:EH805854.1,INSD:EL215554.1,
INSD:EL307468.1,INSD:EL205883.1,INSD:EH954876.1,
INSD:EH825076.1,INSD:EL312156.1,INSD:EL309043.1,
INSD:ES115084.1,INSD:ES197880.1,INSD:BP605999.1,
INSD:EH992762.1,INSD:EH920092.1,INSD:EL141749.1,
INSD:EL308979.1,INSD:EH970572.1,INSD:EL138553.1,
INSD:EL317026.1,INSD:ES154396.1,INSD:EH827866.1,
INSD:EL192873.1,INSD:EH897940.1,INSD:EL263485.1,
INSD:EL306188.1,INSD:EL333283.1,INSD:EL167717.1,
INSD:EL293898.1,INSD:EL103792.1,INSD:EL212543.1,
INSD:EL315325.1,INSD:EL173601.1,INSD:EL309728.1,
INSD:EH919419.1,INSD:EL119638.1,INSD:EL295331.1,
INSD:AV820833.1,INSD:AV792314.1,INSD:EL051256.1,
INSD:EL129695.1,INSD:AV521840.1,INSD:BP659158.1,
INSD:EL247866.1,INSD:EH957534.1,INSD:EL190970.1,
INSD:EL189175.1,INSD:BP788616.1,INSD:EL083617.1,
INSD:EL222028.1,INSD:EL084186.1,INSD:EH889983.1,
INSD:AV795774.1,INSD:EL288751.1,INSD:ES169693.1,
INSD:EL225503.1,INSD:EL168577.1,INSD:BP778202.1,
INSD:EL220206.1,INSD:BP789440.1,INSD:EH811160.1,
INSD:EL145989.1,INSD:BP655501.1,INSD:EL328370.1,
INSD:CB263139.1,INSD:AV793005.1,INSD:EH907071.1,
INSD:EH858984.1,INSD:EH960776.1,INSD:EL317079.1,
INSD:EL311201.1,INSD:BX838558.1,INSD:EL149990.1,
INSD:EH814182.1,INSD:EL269219.1,INSD:EH914069.1,
INSD:EL297387.1,INSD:EL245707.1,INSD:CB262040.1,
INSD:BP663118.1,INSD:AV786190.1,INSD:EG491033.1,
INSD:EL021511.1,INSD:EH827401.1,INSD:EL223224.1,
INSD:EL288494.1,INSD:BP633957.1,INSD:EH843418.1,
INSD:EL332520.1,INSD:EL068494.1,INSD:DR267560.1,
INSD:EH974240.1,INSD:EL044534.1,INSD:EL104804.1,
INSD:EL123841.1,INSD:AV795776.1,INSD:EL279360.1,
INSD:ES155560.1,INSD:EH864374.1,INSD:EL108827.1,
INSD:EL030808.1,INSD:EL298409.1,INSD:EL303533.1,
INSD:EH835575.1,INSD:EL336683.1,INSD:BE845391.1,
INSD:EL047476.1,INSD:EH891141.1,INSD:EH814584.1,
INSD:EH880869.1,INSD:EH818420.1,INSD:EL306326.1,
INSD:EL135597.1,INSD:EL261259.1,INSD:EH955353.1,
INSD:EL281349.1,INSD:EH977808.1,INSD:EL241812.1,
INSD:EL008952.1,INSD:EL028322.1,INSD:EL090829.1,
INSD:EL269110.1,INSD:BP652794.1,INSD:EL026238.1,
INSD:EL175561.1,INSD:EL280862.1,INSD:EL162261.1,
INSD:EL071450.1,INSD:EL218650.1,INSD:EL043923.1,
INSD:BP795310.1,INSD:EH872190.1,INSD:EL041094.1,
INSD:EH840023.1,INSD:AV799622.1,INSD:EL202648.1,
INSD:BP786902.1,INSD:EL213704.1,INSD:DR267521.1,
INSD:EL170823.1,INSD:EH850068.1,INSD:EL257185.1,
INSD:EL100314.1,INSD:EL134761.1,INSD:EL125771.1,
INSD:EL093327.1,INSD:EL264308.1,INSD:EH871072.1,
INSD:EL304094.1,INSD:AV787080.1,INSD:EH823349.1,
INSD:EL024715.1,INSD:EH804144.1,INSD:EL120355.1,
INSD:EL153675.1,INSD:EL317992.1,INSD:AV801085.1,
INSD:EL055846.1,INSD:EL072366.1,INSD:AV565112.1,
INSD:ES155582.1,INSD:EH902944.1,INSD:EH805347.1,
INSD:EL150752.1,INSD:EH918191.1,INSD:EL247880.1,
INSD:BP668052.1,INSD:EH928664.1,INSD:EL128427.1,
INSD:EL117657.1,INSD:ES156385.1,INSD:EL109525.1,
INSD:AV814647.1,INSD:EH865907.1,INSD:EL273117.1,
INSD:EH845492.1,INSD:EH944333.1,INSD:EL153547.1,
INSD:EH884946.1,INSD:ES016031.1,INSD:EL202104.1,
INSD:EH836085.1,INSD:EH808988.1,INSD:BU635422.1,
INSD:EL265728.1,INSD:EL197215.1,INSD:AV795901.1,
INSD:EH953101.1,INSD:ES015961.1,INSD:EL217174.1,
INSD:EH810176.1,INSD:AV787725.1,INSD:EH855883.1,
INSD:EL293721.1,INSD:EL178141.1,INSD:EL204979.1,
INSD:EL206826.1,INSD:EL215267.1,INSD:R64740.1,
INSD:BP618909.1,INSD:EH814211.1,INSD:EH988385.1,
INSD:BP639862.1,INSD:EL281569.1,INSD:EL011705.1,
INSD:EH889743.1,INSD:EL076797.1,INSD:DR267532.1,
INSD:EG491080.1,INSD:DR267542.1,INSD:DR374453.1,
INSD:BP625245.1,INSD:EH862089.1,INSD:EL201628.1,
INSD:EH917675.1,INSD:EL301015.1,INSD:EL055771.1,
INSD:CD532360.1,INSD:EL062643.1,INSD:EL194729.1,
INSD:EL255094.1,INSD:DR267550.1,INSD:EL324724.1,
INSD:EL011400.1,INSD:EH822050.1,INSD:AV788255.1,
INSD:EL114241.1,INSD:EH889404.1,INSD:EL204671.1,
INSD:EH973387.1,INSD:BP629708.1,INSD:EL212384.1,
INSD:EH962714.1,INSD:EH908063.1,INSD:EL166063.1,
INSD:BP599103.1,INSD:EL127322.1,INSD:EL252322.1,
INSD:EH888393.1,INSD:EL086813.1,INSD:Z37672.1,
INSD:EH955094.1,INSD:BP647396.1,INSD:EL251002.1,
INSD:EL104946.1,INSD:EL127671.1,INSD:EL021127.1,
INSD:EH869908.1,INSD:EL049697.1,INSD:EH910889.1,
INSD:EL180039.1,INSD:EH939485.1,INSD:EL042368.1,
INSD:EH946298.1,INSD:BP781634.1,INSD:EH826796.1,
INSD:EH890613.1,INSD:DR267536.1,INSD:BP834242.1,
INSD:EL141413.1,INSD:EL182029.1,INSD:DR267514.1,
INSD:ES054224.1,INSD:EH950672.1,INSD:EL292641.1,
INSD:EH836233.1,INSD:EL260013.1,INSD:EL059093.1,
INSD:EL059347.1,INSD:EH815125.1,INSD:EL247749.1,
INSD:EH808113.1,INSD:EL295539.1,INSD:EL253401.1,
INSD:EH976277.1,INSD:EL145127.1,INSD:EL139760.1,
INSD:EL214541.1,INSD:EL248516.1,INSD:EL015064.1,
INSD:EL305234.1,INSD:BP628386.1,INSD:EH888892.1,
INSD:AV527435.1,INSD:EL136746.1,INSD:EH984527.1,
INSD:EH968374.1,INSD:EH957805.1,INSD:EL289827.1,
INSD:AV558249.1,INSD:EL119354.1,INSD:EL159437.1,
INSD:EL032036.1,INSD:EL253143.1,INSD:EH817804.1,
INSD:EL255319.1,INSD:EL073362.1,INSD:EH862858.1,
INSD:EL036937.1,INSD:EL045724.1,INSD:EH933223.1,
INSD:EH934450.1,INSD:EH823398.1,INSD:EH893570.1,
INSD:ES002091.1,INSD:EL082817.1,INSD:EH943531.1,
INSD:EL179962.1,INSD:EH969770.1,INSD:EL155934.1,
INSD:EH957619.1,INSD:EL010616.1,INSD:BP829303.1,
INSD:ES216051.1,INSD:EL025368.1,INSD:AV785978.1,
INSD:EL136813.1,INSD:EL080000.1,INSD:EH903820.1,
INSD:EH814837.1,INSD:EL301603.1,INSD:EH864607.1,
INSD:AV795226.1,INSD:EL004676.1,INSD:EH809839.1,
INSD:EH830921.1,INSD:ES129408.1,INSD:EH938296.1,
INSD:EL174477.1,INSD:EH821302.1,INSD:EH848981.1,
INSD:ES073717.1,INSD:BP626769.1,INSD:EL151102.1,
INSD:EL122727.1,INSD:AV795228.1,INSD:EG514420.1,
INSD:EL270288.1,INSD:EL228014.1,INSD:EG514655.1,
INSD:EL332398.1,INSD:AV819118.1,INSD:EH831725.1,
INSD:EL246605.1,INSD:EL305006.1,INSD:EH848701.1,
INSD:EL079784.1,INSD:EL216926.1,INSD:EL202213.1,
INSD:EL278201.1,INSD:EH915325.1,INSD:EL238373.1,
INSD:EL301893.1,INSD:EL269633.1,INSD:EH867275.1,
INSD:EH987577.1,INSD:EL029954.1,INSD:EL188078.1,
INSD:EL245994.1,INSD:EL064509.1,INSD:EL224681.1,
INSD:EL253164.1,INSD:EL311254.1,INSD:ES153293.1,
INSD:EL251952.1,INSD:EL139998.1,INSD:EH884286.1,
INSD:EH952267.1,INSD:EL064317.1,INSD:EH900405.1,
INSD:EL074337.1,INSD:EL159925.1,INSD:EL259863.1,
INSD:EL257394.1,INSD:EH896464.1,INSD:EL050863.1,
INSD:DR267537.1,INSD:Z37673.1,INSD:BP777875.1,
INSD:EL243014.1,INSD:EL105862.1,INSD:EH863025.1,
INSD:EL125316.1,INSD:EL260294.1,INSD:EH906969.1,
INSD:EH836528.1,INSD:EL015848.1,INSD:EL171844.1,
INSD:EL249834.1,INSD:EH944511.1,INSD:EL224036.1,
INSD:EL320759.1,INSD:EL007987.1,INSD:EH837798.1,
INSD:EH796844.1,INSD:EL217703.1,INSD:EH928420.1,
INSD:EL230461.1,INSD:AV556739.1,INSD:EH969145.1,
INSD:EH809190.1,INSD:EL023125.1,INSD:EL081926.1,
INSD:EL299416.1,INSD:EH842941.1,INSD:EL239723.1,
INSD:EL335061.1,INSD:EL251842.1,INSD:ES200426.1,
INSD:EG487013.1,INSD:ES185703.1,INSD:EL089149.1,
INSD:EH810519.1,INSD:AV786892.1,INSD:EH874251.1,
INSD:AV790457.1,INSD:EL016082.1,INSD:EL313247.1,
INSD:EL150662.1,INSD:EH992827.1,INSD:EL183009.1,
INSD:EH816367.1,INSD:AI099968.1,INSD:EL079345.1,
INSD:EH901069.1,INSD:EH988858.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AF325026.2,INSD:AY093284.1,INSD:L14845.1,
INSD:BX822116.1,INSD:BX822280.1,INSD:BX822252.1"
/note="rotamase CYP 4 (ROC4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Cyclophilin-like (InterPro:IPR015891), Peptidyl-prolyl
cis-trans isomerase, cyclophilin-type
(InterPro:IPR002130), Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase,
cyclophilin-type, conserved site (InterPro:IPR020892);
BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cyclophilin
20-2 (TAIR:AT5G13120.1); Has 16678 Blast hits to 16640
proteins in 2710 species: Archae - 109; Bacteria - 6942;
Metazoa - 2940; Fungi - 1352; Plants - 1326; Viruses - 4;
Other Eukaryotes - 4005 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G62030"
/db_xref="Araport:AT3G62030"
intron_pos 30:2 (1/8)
intron_pos 37:2 (2/8)
intron_pos 72:0 (3/8)
intron_pos 135:0 (4/8)
intron_pos 186:1 (5/8)
intron_pos 216:0 (6/8)
intron_pos 234:1 (7/8)
intron_pos 263:0 (8/8)
BEGIN
1 MFRLLLLPYA VGAQQKLLQT PRETKVADAW NIKCQNLLLS KANQQKVFIF NHSMASSSSM
61 QMVHTSRSIA QIGFGVKSQL VSANRTTQSV CFGARSSGIA LSSRLHYASP IKQFSGVYAT
121 TKHQRTACVK SMAAEEEEVI EPQAKVTNKV YFDVEIGGEV AGRIVMGLFG EVVPKTVENF
181 RALCTGEKKY GYKGSSFHRI IKDFMIQGGD FTEGNGTGGI SIYGAKFEDE NFTLKHTGPG
241 ILSMANAGPN TNGSQFFICT VKTSWLDNKH VVFGQVIEGM KLVRTLESQE TRAFDVPKKG
301 CRIYACGELP LDA
//