LOCUS AEE80298.1 313 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana rotamase CYP 4 protein. ACCESSION CP002686-9199 PROTEIN_ID AEE80298.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830) AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M., Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B., Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P., Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V., Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S., Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P., Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S., Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H., Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M., Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A., Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C., Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P., Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M., Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S., Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L., Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A., Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B., Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J., Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X., Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M., Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S., Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C., Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S., Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A., Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S. CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium; Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000) PUBMED 11130713 REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="3" /ecotype="Columbia" protein /gene="ROC4" /locus_tag="AT3G62030" /gene_synonym="cyclophilin 20-3" /gene_synonym="CYP20-3" /gene_synonym="PEPTIDYLPROLYL ISOMERASE ROC4" /gene_synonym="rotamase CYP 4" /gene_synonym="T17J13.1" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:EH973946.1,INSD:EH841533.1,INSD:EH803781.1, INSD:EH864966.1,INSD:EH843423.1,INSD:EL156486.1, INSD:EL274525.1,INSD:EL152691.1,INSD:DR267517.1, INSD:AV786722.1,INSD:EL145379.1,INSD:EH798620.1, INSD:EH919239.1,INSD:EL323538.1,INSD:EL067124.1, INSD:EH914844.1,INSD:EL341545.1,INSD:CB262570.1, INSD:EH893174.1,INSD:EL184703.1,INSD:EH892770.1, INSD:EL075142.1,INSD:EL074311.1,INSD:EL330648.1, INSD:EL111930.1,INSD:ES084700.1,INSD:DR267556.1, INSD:EH799388.1,INSD:BP612700.1,INSD:EH886847.1, INSD:EL213245.1,INSD:EL293545.1,INSD:EH923135.1, INSD:EL123720.1,INSD:EL205310.1,INSD:EL339056.1, INSD:EL202593.1,INSD:EL227121.1,INSD:EH906929.1, INSD:EH806279.1,INSD:BP647897.1,INSD:EH914579.1, INSD:EL039020.1,INSD:EL237538.1,INSD:EL180172.1, INSD:EH891228.1,INSD:EH864941.1,INSD:EL260760.1, INSD:CB262402.1,INSD:EL070322.1,INSD:EH934620.1, INSD:EL110346.1,INSD:DR377214.1,INSD:EL265633.1, INSD:EH858815.1,INSD:EH805854.1,INSD:EL215554.1, INSD:EL307468.1,INSD:EL205883.1,INSD:EH954876.1, INSD:EH825076.1,INSD:EL312156.1,INSD:EL309043.1, INSD:ES115084.1,INSD:ES197880.1,INSD:BP605999.1, INSD:EH992762.1,INSD:EH920092.1,INSD:EL141749.1, INSD:EL308979.1,INSD:EH970572.1,INSD:EL138553.1, INSD:EL317026.1,INSD:ES154396.1,INSD:EH827866.1, INSD:EL192873.1,INSD:EH897940.1,INSD:EL263485.1, INSD:EL306188.1,INSD:EL333283.1,INSD:EL167717.1, INSD:EL293898.1,INSD:EL103792.1,INSD:EL212543.1, INSD:EL315325.1,INSD:EL173601.1,INSD:EL309728.1, INSD:EH919419.1,INSD:EL119638.1,INSD:EL295331.1, INSD:AV820833.1,INSD:AV792314.1,INSD:EL051256.1, INSD:EL129695.1,INSD:AV521840.1,INSD:BP659158.1, INSD:EL247866.1,INSD:EH957534.1,INSD:EL190970.1, INSD:EL189175.1,INSD:BP788616.1,INSD:EL083617.1, INSD:EL222028.1,INSD:EL084186.1,INSD:EH889983.1, INSD:AV795774.1,INSD:EL288751.1,INSD:ES169693.1, INSD:EL225503.1,INSD:EL168577.1,INSD:BP778202.1, INSD:EL220206.1,INSD:BP789440.1,INSD:EH811160.1, INSD:EL145989.1,INSD:BP655501.1,INSD:EL328370.1, INSD:CB263139.1,INSD:AV793005.1,INSD:EH907071.1, INSD:EH858984.1,INSD:EH960776.1,INSD:EL317079.1, INSD:EL311201.1,INSD:BX838558.1,INSD:EL149990.1, INSD:EH814182.1,INSD:EL269219.1,INSD:EH914069.1, INSD:EL297387.1,INSD:EL245707.1,INSD:CB262040.1, INSD:BP663118.1,INSD:AV786190.1,INSD:EG491033.1, INSD:EL021511.1,INSD:EH827401.1,INSD:EL223224.1, INSD:EL288494.1,INSD:BP633957.1,INSD:EH843418.1, INSD:EL332520.1,INSD:EL068494.1,INSD:DR267560.1, INSD:EH974240.1,INSD:EL044534.1,INSD:EL104804.1, INSD:EL123841.1,INSD:AV795776.1,INSD:EL279360.1, INSD:ES155560.1,INSD:EH864374.1,INSD:EL108827.1, INSD:EL030808.1,INSD:EL298409.1,INSD:EL303533.1, INSD:EH835575.1,INSD:EL336683.1,INSD:BE845391.1, INSD:EL047476.1,INSD:EH891141.1,INSD:EH814584.1, INSD:EH880869.1,INSD:EH818420.1,INSD:EL306326.1, INSD:EL135597.1,INSD:EL261259.1,INSD:EH955353.1, INSD:EL281349.1,INSD:EH977808.1,INSD:EL241812.1, INSD:EL008952.1,INSD:EL028322.1,INSD:EL090829.1, INSD:EL269110.1,INSD:BP652794.1,INSD:EL026238.1, INSD:EL175561.1,INSD:EL280862.1,INSD:EL162261.1, INSD:EL071450.1,INSD:EL218650.1,INSD:EL043923.1, INSD:BP795310.1,INSD:EH872190.1,INSD:EL041094.1, INSD:EH840023.1,INSD:AV799622.1,INSD:EL202648.1, INSD:BP786902.1,INSD:EL213704.1,INSD:DR267521.1, INSD:EL170823.1,INSD:EH850068.1,INSD:EL257185.1, INSD:EL100314.1,INSD:EL134761.1,INSD:EL125771.1, INSD:EL093327.1,INSD:EL264308.1,INSD:EH871072.1, INSD:EL304094.1,INSD:AV787080.1,INSD:EH823349.1, INSD:EL024715.1,INSD:EH804144.1,INSD:EL120355.1, INSD:EL153675.1,INSD:EL317992.1,INSD:AV801085.1, INSD:EL055846.1,INSD:EL072366.1,INSD:AV565112.1, INSD:ES155582.1,INSD:EH902944.1,INSD:EH805347.1, INSD:EL150752.1,INSD:EH918191.1,INSD:EL247880.1, INSD:BP668052.1,INSD:EH928664.1,INSD:EL128427.1, INSD:EL117657.1,INSD:ES156385.1,INSD:EL109525.1, INSD:AV814647.1,INSD:EH865907.1,INSD:EL273117.1, INSD:EH845492.1,INSD:EH944333.1,INSD:EL153547.1, INSD:EH884946.1,INSD:ES016031.1,INSD:EL202104.1, INSD:EH836085.1,INSD:EH808988.1,INSD:BU635422.1, INSD:EL265728.1,INSD:EL197215.1,INSD:AV795901.1, INSD:EH953101.1,INSD:ES015961.1,INSD:EL217174.1, INSD:EH810176.1,INSD:AV787725.1,INSD:EH855883.1, INSD:EL293721.1,INSD:EL178141.1,INSD:EL204979.1, INSD:EL206826.1,INSD:EL215267.1,INSD:R64740.1, INSD:BP618909.1,INSD:EH814211.1,INSD:EH988385.1, INSD:BP639862.1,INSD:EL281569.1,INSD:EL011705.1, INSD:EH889743.1,INSD:EL076797.1,INSD:DR267532.1, INSD:EG491080.1,INSD:DR267542.1,INSD:DR374453.1, INSD:BP625245.1,INSD:EH862089.1,INSD:EL201628.1, INSD:EH917675.1,INSD:EL301015.1,INSD:EL055771.1, INSD:CD532360.1,INSD:EL062643.1,INSD:EL194729.1, INSD:EL255094.1,INSD:DR267550.1,INSD:EL324724.1, INSD:EL011400.1,INSD:EH822050.1,INSD:AV788255.1, INSD:EL114241.1,INSD:EH889404.1,INSD:EL204671.1, INSD:EH973387.1,INSD:BP629708.1,INSD:EL212384.1, INSD:EH962714.1,INSD:EH908063.1,INSD:EL166063.1, INSD:BP599103.1,INSD:EL127322.1,INSD:EL252322.1, INSD:EH888393.1,INSD:EL086813.1,INSD:Z37672.1, INSD:EH955094.1,INSD:BP647396.1,INSD:EL251002.1, INSD:EL104946.1,INSD:EL127671.1,INSD:EL021127.1, INSD:EH869908.1,INSD:EL049697.1,INSD:EH910889.1, INSD:EL180039.1,INSD:EH939485.1,INSD:EL042368.1, INSD:EH946298.1,INSD:BP781634.1,INSD:EH826796.1, INSD:EH890613.1,INSD:DR267536.1,INSD:BP834242.1, INSD:EL141413.1,INSD:EL182029.1,INSD:DR267514.1, INSD:ES054224.1,INSD:EH950672.1,INSD:EL292641.1, INSD:EH836233.1,INSD:EL260013.1,INSD:EL059093.1, INSD:EL059347.1,INSD:EH815125.1,INSD:EL247749.1, INSD:EH808113.1,INSD:EL295539.1,INSD:EL253401.1, INSD:EH976277.1,INSD:EL145127.1,INSD:EL139760.1, INSD:EL214541.1,INSD:EL248516.1,INSD:EL015064.1, INSD:EL305234.1,INSD:BP628386.1,INSD:EH888892.1, INSD:AV527435.1,INSD:EL136746.1,INSD:EH984527.1, INSD:EH968374.1,INSD:EH957805.1,INSD:EL289827.1, INSD:AV558249.1,INSD:EL119354.1,INSD:EL159437.1, INSD:EL032036.1,INSD:EL253143.1,INSD:EH817804.1, INSD:EL255319.1,INSD:EL073362.1,INSD:EH862858.1, INSD:EL036937.1,INSD:EL045724.1,INSD:EH933223.1, INSD:EH934450.1,INSD:EH823398.1,INSD:EH893570.1, INSD:ES002091.1,INSD:EL082817.1,INSD:EH943531.1, INSD:EL179962.1,INSD:EH969770.1,INSD:EL155934.1, INSD:EH957619.1,INSD:EL010616.1,INSD:BP829303.1, INSD:ES216051.1,INSD:EL025368.1,INSD:AV785978.1, INSD:EL136813.1,INSD:EL080000.1,INSD:EH903820.1, INSD:EH814837.1,INSD:EL301603.1,INSD:EH864607.1, INSD:AV795226.1,INSD:EL004676.1,INSD:EH809839.1, INSD:EH830921.1,INSD:ES129408.1,INSD:EH938296.1, INSD:EL174477.1,INSD:EH821302.1,INSD:EH848981.1, INSD:ES073717.1,INSD:BP626769.1,INSD:EL151102.1, INSD:EL122727.1,INSD:AV795228.1,INSD:EG514420.1, INSD:EL270288.1,INSD:EL228014.1,INSD:EG514655.1, INSD:EL332398.1,INSD:AV819118.1,INSD:EH831725.1, INSD:EL246605.1,INSD:EL305006.1,INSD:EH848701.1, INSD:EL079784.1,INSD:EL216926.1,INSD:EL202213.1, INSD:EL278201.1,INSD:EH915325.1,INSD:EL238373.1, INSD:EL301893.1,INSD:EL269633.1,INSD:EH867275.1, INSD:EH987577.1,INSD:EL029954.1,INSD:EL188078.1, INSD:EL245994.1,INSD:EL064509.1,INSD:EL224681.1, INSD:EL253164.1,INSD:EL311254.1,INSD:ES153293.1, INSD:EL251952.1,INSD:EL139998.1,INSD:EH884286.1, INSD:EH952267.1,INSD:EL064317.1,INSD:EH900405.1, INSD:EL074337.1,INSD:EL159925.1,INSD:EL259863.1, INSD:EL257394.1,INSD:EH896464.1,INSD:EL050863.1, INSD:DR267537.1,INSD:Z37673.1,INSD:BP777875.1, INSD:EL243014.1,INSD:EL105862.1,INSD:EH863025.1, INSD:EL125316.1,INSD:EL260294.1,INSD:EH906969.1, INSD:EH836528.1,INSD:EL015848.1,INSD:EL171844.1, INSD:EL249834.1,INSD:EH944511.1,INSD:EL224036.1, INSD:EL320759.1,INSD:EL007987.1,INSD:EH837798.1, INSD:EH796844.1,INSD:EL217703.1,INSD:EH928420.1, INSD:EL230461.1,INSD:AV556739.1,INSD:EH969145.1, INSD:EH809190.1,INSD:EL023125.1,INSD:EL081926.1, INSD:EL299416.1,INSD:EH842941.1,INSD:EL239723.1, INSD:EL335061.1,INSD:EL251842.1,INSD:ES200426.1, INSD:EG487013.1,INSD:ES185703.1,INSD:EL089149.1, INSD:EH810519.1,INSD:AV786892.1,INSD:EH874251.1, INSD:AV790457.1,INSD:EL016082.1,INSD:EL313247.1, INSD:EL150662.1,INSD:EH992827.1,INSD:EL183009.1, INSD:EH816367.1,INSD:AI099968.1,INSD:EL079345.1, INSD:EH901069.1,INSD:EH988858.1" /inference="Similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AF325026.2,INSD:AY093284.1,INSD:L14845.1, INSD:BX822116.1,INSD:BX822280.1,INSD:BX822252.1" /note="rotamase CYP 4 (ROC4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclophilin-like (InterPro:IPR015891), Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type (InterPro:IPR002130), Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type, conserved site (InterPro:IPR020892); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cyclophilin 20-2 (TAIR:AT5G13120.1); Has 16678 Blast hits to 16640 proteins in 2710 species: Archae - 109; Bacteria - 6942; Metazoa - 2940; Fungi - 1352; Plants - 1326; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 4005 (source: NCBI BLink)." /db_xref="TAIR:AT3G62030" /db_xref="Araport:AT3G62030" intron_pos 30:2 (1/8) intron_pos 37:2 (2/8) intron_pos 72:0 (3/8) intron_pos 135:0 (4/8) intron_pos 186:1 (5/8) intron_pos 216:0 (6/8) intron_pos 234:1 (7/8) intron_pos 263:0 (8/8) BEGIN 1 MFRLLLLPYA VGAQQKLLQT PRETKVADAW NIKCQNLLLS KANQQKVFIF NHSMASSSSM 61 QMVHTSRSIA QIGFGVKSQL VSANRTTQSV CFGARSSGIA LSSRLHYASP IKQFSGVYAT 121 TKHQRTACVK SMAAEEEEVI EPQAKVTNKV YFDVEIGGEV AGRIVMGLFG EVVPKTVENF 181 RALCTGEKKY GYKGSSFHRI IKDFMIQGGD FTEGNGTGGI SIYGAKFEDE NFTLKHTGPG 241 ILSMANAGPN TNGSQFFICT VKTSWLDNKH VVFGQVIEGM KLVRTLESQE TRAFDVPKKG 301 CRIYACGELP LDA //