LOCUS AEE77555.1 317 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana PPR containing protein (DUF179) protein.
ACCESSION CP002686-5500
PROTEIN_ID AEE77555.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT3G29240"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR272286.1,INSD:DR198696.1,INSD:EL023840.1,
INSD:EH958139.1,INSD:DR198736.1,INSD:BP602955.1,
INSD:EL051457.1,INSD:EH990011.1,INSD:BP619388.1,
INSD:EH795358.1,INSD:DR198727.1,INSD:DR198739.1,
INSD:EL000007.1,INSD:DR198747.1,INSD:EG516251.1,
INSD:AV803954.1,INSD:AV815498.1,INSD:BP662406.1,
INSD:EH895453.1,INSD:DR272282.1,INSD:DR272292.1,
INSD:DR198753.1,INSD:DR198751.1,INSD:DR198749.1,
INSD:BP810516.1,INSD:EL088632.1,INSD:AV822078.1,
INSD:ES095334.1,INSD:BP589931.1,INSD:DR198730.1,
INSD:EL263657.1,INSD:EL308372.1,INSD:EL007360.1,
INSD:EG506203.1,INSD:BP834182.1,INSD:CB258218.1,
INSD:DR272287.1,INSD:EL155675.1,INSD:EL111658.1,
INSD:DR198725.1,INSD:BP813854.1,INSD:BP665819.1,
INSD:DR272277.1,INSD:BP808566.1,INSD:ES048361.1,
INSD:EG506258.1,INSD:EL336707.1,INSD:DR272298.1,
INSD:BE522928.1,INSD:BP615048.1,INSD:AV796262.1,
INSD:AV560351.1,INSD:DR198733.1,INSD:BP820815.1,
INSD:EH837468.1,INSD:EH860031.1,INSD:DR198703.1,
INSD:BP811440.1,INSD:AV805195.1,INSD:DR198735.1,
INSD:DR198706.1,INSD:BP806242.1,INSD:DR198689.1,
INSD:DR198690.1,INSD:EL087965.1,INSD:BP664528.1,
INSD:EL334572.1,INSD:EH928003.1,INSD:EH854792.1,
INSD:ES165355.1,INSD:BP826840.1,INSD:H36488.1,
INSD:DR198756.1,INSD:DR198720.1,INSD:BP614580.1,
INSD:EH963272.1,INSD:DR198745.1,INSD:EH872971.1,
INSD:DR198731.1,INSD:DR272278.1,INSD:EH925922.1,
INSD:EL137771.1,INSD:EL285181.1,INSD:BP613348.1,
INSD:EL241993.1,INSD:EL180552.1,INSD:EL328483.1,
INSD:BP654117.1,INSD:DR198734.1,INSD:AV825664.1,
INSD:DR198694.1,INSD:EL275332.1,INSD:BU635751.1,
INSD:BP631070.1,INSD:AV813103.1,INSD:BP833526.1,
INSD:EH834729.1,INSD:EH838727.1,INSD:DR198743.1,
INSD:DR272280.1,INSD:BP669366.1,INSD:AV813714.1,
INSD:EG495544.1,INSD:EL328032.1,INSD:AV796483.1,
INSD:DR272284.1,INSD:BP824329.1,INSD:AV785819.1,
INSD:BP601689.1,INSD:BP827814.1,INSD:EL313989.1,
INSD:DR272297.1,INSD:DR272295.1,INSD:BP809629.1,
INSD:AV830806.1,INSD:DR198697.1,INSD:EL150404.1,
INSD:DR198746.1,INSD:EL092878.1,INSD:DR198693.1,
INSD:ES094317.1,INSD:DR198695.1,INSD:EL339535.1,
INSD:EL004597.1,INSD:DR186442.1,INSD:AV792384.1,
INSD:EL081037.1,INSD:AV816458.1,INSD:BP867822.1,
INSD:EH912990.1,INSD:EL021585.1,INSD:DR272299.1,
INSD:EH872608.1,INSD:EH930805.1,INSD:EL207183.1,
INSD:BP851591.1,INSD:AI100748.1,INSD:EH850204.1,
INSD:BP865241.1,INSD:EL321798.1,INSD:EG506201.1,
INSD:DR198707.1,INSD:BP630789.1,INSD:EH852606.1,
INSD:BP617891.1,INSD:BP850912.1,INSD:AV439487.1,
INSD:EL028946.1,INSD:EH813209.1,INSD:DR272294.1,
INSD:EL285168.1,INSD:EL234454.1,INSD:DR296169.1,
INSD:DR272274.1,INSD:AV782714.1,INSD:BP833360.2,
INSD:EL037939.1,INSD:EL261545.1,INSD:DR272281.1,
INSD:DR198717.1,INSD:EL239428.1,INSD:EL052072.1,
INSD:EL253685.1,INSD:DR272288.1,INSD:DR272296.1,
INSD:DR198691.1,INSD:BP634998.1,INSD:EL285374.1,
INSD:DR198700.1,INSD:DR198750.1,INSD:DR198744.1,
INSD:ES008834.1,INSD:AV441610.1,INSD:BP630948.1,
INSD:EH888650.1,INSD:EL308709.1,INSD:EL192749.1,
INSD:EH893603.1,INSD:BP823897.1,INSD:BP805652.1,
INSD:EL332570.1,INSD:BP616973.1,INSD:EL307969.1,
INSD:CK120035.1,INSD:DR198728.1,INSD:DR198740.1,
INSD:EL075848.1,INSD:DR198719.1,INSD:EH846220.1,
INSD:EL336573.1,INSD:EL158749.1,INSD:BP811961.1,
INSD:EH993186.1,INSD:BP812713.1,INSD:EH965633.1,
INSD:BP858728.1,INSD:DR198729.1,INSD:EL016040.1,
INSD:BP606983.1,INSD:DR198712.1,INSD:DR272303.1,
INSD:BP641163.1,INSD:EL317689.1,INSD:DR198714.1,
INSD:EL223858.1,INSD:EL268662.1,INSD:EH958010.1,
INSD:AV791902.1,INSD:BP639231.1,INSD:DR198748.1,
INSD:EL301448.1,INSD:AV799675.1,INSD:EL043080.1,
INSD:BP650681.1,INSD:EL302568.1,INSD:EL197086.1,
INSD:EG506738.1,INSD:EL105573.1,INSD:T21832.1,
INSD:EL034738.1,INSD:EL037021.1,INSD:AV801963.1,
INSD:EL111577.1,INSD:ES157105.1,INSD:EH866327.1,
INSD:EH857146.1,INSD:BP620058.1,INSD:DR375999.1,
INSD:EL141627.1,INSD:AV557559.1,INSD:EL231021.1,
INSD:EL174221.1,INSD:BP807585.1,INSD:EL117272.1,
INSD:BP585015.1,INSD:EG506740.1,INSD:EH877392.1,
INSD:DR272273.1,INSD:DR198705.1,INSD:DR198741.1,
INSD:EL013324.1,INSD:EH903346.1,INSD:ES003746.1,
INSD:DR198752.1,INSD:EL206018.1,INSD:EL199363.1,
INSD:EL106932.1,INSD:EH931444.1,INSD:BX834197.1,
INSD:DR272304.1,INSD:DR198754.1,INSD:EH863664.1,
INSD:EL133264.1,INSD:ES020128.1,INSD:EG516258.1,
INSD:BP857729.1,INSD:EL053023.1,INSD:EH885118.1,
INSD:DR198704.1,INSD:DR198721.1,INSD:EL068222.1,
INSD:BP619649.1,INSD:DR296167.1,INSD:BP620329.1,
INSD:EL115950.1,INSD:EL123135.1,INSD:BE525600.1,
INSD:DR272289.1,INSD:DR186443.1,INSD:BP836373.1,
INSD:DR272291.1,INSD:EL165285.1,INSD:BP869095.1,
INSD:DR198755.1,INSD:BP617349.1,INSD:BP666445.1,
INSD:EH935566.1,INSD:DR198738.1,INSD:BX834296.1,
INSD:DR198726.1,INSD:BP642093.1,INSD:EL075502.1,
INSD:BP850170.1,INSD:BP613572.1,INSD:EL080807.1,
INSD:DR377458.1,INSD:DR272276.1,INSD:EH839744.1,
INSD:DR186445.1,INSD:BP609756.1,INSD:DR198702.1,
INSD:BP597688.1,INSD:EL259408.1,INSD:BP597538.1,
INSD:BE528381.1,INSD:DR198701.1,INSD:EL187167.1,
INSD:EL019383.1,INSD:BP650803.1,INSD:EL010476.1,
INSD:AV786652.1,INSD:DR272300.1,INSD:EG506260.1,
INSD:BP816941.1,INSD:DR198713.1,INSD:BP859429.1,
INSD:EL092100.1,INSD:EL322395.1,INSD:DR198699.1,
INSD:EH862547.1,INSD:DR272283.1,INSD:BP610172.1,
INSD:DR198709.1,INSD:ES055731.1,INSD:BP586612.1,
INSD:EH851450.1,INSD:CB185921.1,INSD:DR198718.1,
INSD:EL287063.1,INSD:EL153664.1,INSD:BP646958.1,
INSD:BP590582.1,INSD:EL102954.1,INSD:BP862243.1,
INSD:EL286059.1,INSD:EG516242.1,INSD:DR380298.1,
INSD:DR198723.1,INSD:EH867816.1,INSD:DR272285.1,
INSD:AV526052.1,INSD:DR296168.1,INSD:EH834479.1,
INSD:EL320860.1,INSD:DR272279.1,INSD:EL104616.1,
INSD:AV519498.1,INSD:DR272302.1,INSD:DR198711.1,
INSD:EL244191.1,INSD:BP664833.1,INSD:DR272301.1,
INSD:BP594158.1,INSD:EL044839.1,INSD:AV803675.1,
INSD:EH943037.1,INSD:DR198710.1,INSD:DR198722.1,
INSD:EL332580.1,INSD:BP779336.1,INSD:DR198692.1,
INSD:BP587113.1,INSD:EH804527.1,INSD:DR198715.1,
INSD:DR198742.1,INSD:EL280044.1,INSD:EH829432.1,
INSD:EH811276.1,INSD:DR198737.1,INSD:EL130768.1,
INSD:BP868905.1,INSD:EL015070.1,INSD:DR375895.1,
INSD:DR186444.1,INSD:BP633091.1,INSD:DR198716.1,
INSD:AV806703.1,INSD:EG516630.1,INSD:DR198708.1,
INSD:CA782025.1,INSD:N96556.1,INSD:BU635568.1,
INSD:AI994332.1,INSD:EH957001.1,INSD:DR198698.1,
INSD:DR198724.1,INSD:BP836389.1,INSD:DR198732.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX823475.1,INSD:BT004545.1,INSD:AY079021.1,
INSD:AY139756.1,INSD:BX825461.1"
/note="Protein of unknown function (DUF179); FUNCTIONS IN:
molecular_function unknown; INVOLVED IN:
biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast
thylakoid lumen, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant
structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS
InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF179
(InterPro:IPR003774); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: Protein of unknown function (DUF179)
(TAIR:AT1G33780.1); Has 1065 Blast hits to 1065 proteins
in 382 species: Archae - 0; Bacteria - 730; Metazoa - 0;
Fungi - 0; Plants - 124; Viruses - 0; Other Eukaryotes -
211 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G29240"
/db_xref="Araport:AT3G29240"
intron_pos 49:1 (1/1)
BEGIN
1 MDACFLTSRS ISGVKELVPF IKARIFTCPK RNSGQFVTRK VASPISVNCS LSDSWKPLED
61 DADLFKDCVN NSTSDADWRE FRARLVAGEQ AATSEKDQPS WSNPDMVVDY QPSSSSLITI
121 GSKWAHKIHE PETGCLLIAT EKLDGVHIFE KTVILLLSVG PSGPIGVILN RPSLMSIKET
181 KSTILDMAGT FSDKRLFFGG PLEEGLFLVS PRSGGDNEVG KSGVFRQVMK GLYYGTRESV
241 GLAAEMVKRN LVGRSELRFF DGYCGWEKEQ LKAEILGGYW TVAACSSTVV ELGSAVQSHG
301 LWDEVLGLIG PQTGSVI
//