LOCUS AEE77555.1 317 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana PPR containing protein (DUF179) protein. ACCESSION CP002686-5500 PROTEIN_ID AEE77555.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830) AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M., Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B., Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P., Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V., Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S., Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P., Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S., Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H., Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M., Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A., Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C., Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P., Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M., Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S., Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L., Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A., Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B., Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J., Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X., Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M., Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S., Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C., Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S., Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A., Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S. CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium; Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000) PUBMED 11130713 REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="3" /ecotype="Columbia" protein /locus_tag="AT3G29240" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:DR272286.1,INSD:DR198696.1,INSD:EL023840.1, INSD:EH958139.1,INSD:DR198736.1,INSD:BP602955.1, INSD:EL051457.1,INSD:EH990011.1,INSD:BP619388.1, INSD:EH795358.1,INSD:DR198727.1,INSD:DR198739.1, INSD:EL000007.1,INSD:DR198747.1,INSD:EG516251.1, INSD:AV803954.1,INSD:AV815498.1,INSD:BP662406.1, INSD:EH895453.1,INSD:DR272282.1,INSD:DR272292.1, INSD:DR198753.1,INSD:DR198751.1,INSD:DR198749.1, INSD:BP810516.1,INSD:EL088632.1,INSD:AV822078.1, INSD:ES095334.1,INSD:BP589931.1,INSD:DR198730.1, INSD:EL263657.1,INSD:EL308372.1,INSD:EL007360.1, INSD:EG506203.1,INSD:BP834182.1,INSD:CB258218.1, INSD:DR272287.1,INSD:EL155675.1,INSD:EL111658.1, INSD:DR198725.1,INSD:BP813854.1,INSD:BP665819.1, INSD:DR272277.1,INSD:BP808566.1,INSD:ES048361.1, INSD:EG506258.1,INSD:EL336707.1,INSD:DR272298.1, INSD:BE522928.1,INSD:BP615048.1,INSD:AV796262.1, INSD:AV560351.1,INSD:DR198733.1,INSD:BP820815.1, INSD:EH837468.1,INSD:EH860031.1,INSD:DR198703.1, INSD:BP811440.1,INSD:AV805195.1,INSD:DR198735.1, INSD:DR198706.1,INSD:BP806242.1,INSD:DR198689.1, INSD:DR198690.1,INSD:EL087965.1,INSD:BP664528.1, INSD:EL334572.1,INSD:EH928003.1,INSD:EH854792.1, INSD:ES165355.1,INSD:BP826840.1,INSD:H36488.1, INSD:DR198756.1,INSD:DR198720.1,INSD:BP614580.1, INSD:EH963272.1,INSD:DR198745.1,INSD:EH872971.1, INSD:DR198731.1,INSD:DR272278.1,INSD:EH925922.1, INSD:EL137771.1,INSD:EL285181.1,INSD:BP613348.1, INSD:EL241993.1,INSD:EL180552.1,INSD:EL328483.1, INSD:BP654117.1,INSD:DR198734.1,INSD:AV825664.1, INSD:DR198694.1,INSD:EL275332.1,INSD:BU635751.1, INSD:BP631070.1,INSD:AV813103.1,INSD:BP833526.1, INSD:EH834729.1,INSD:EH838727.1,INSD:DR198743.1, INSD:DR272280.1,INSD:BP669366.1,INSD:AV813714.1, INSD:EG495544.1,INSD:EL328032.1,INSD:AV796483.1, INSD:DR272284.1,INSD:BP824329.1,INSD:AV785819.1, INSD:BP601689.1,INSD:BP827814.1,INSD:EL313989.1, INSD:DR272297.1,INSD:DR272295.1,INSD:BP809629.1, INSD:AV830806.1,INSD:DR198697.1,INSD:EL150404.1, INSD:DR198746.1,INSD:EL092878.1,INSD:DR198693.1, INSD:ES094317.1,INSD:DR198695.1,INSD:EL339535.1, INSD:EL004597.1,INSD:DR186442.1,INSD:AV792384.1, INSD:EL081037.1,INSD:AV816458.1,INSD:BP867822.1, INSD:EH912990.1,INSD:EL021585.1,INSD:DR272299.1, INSD:EH872608.1,INSD:EH930805.1,INSD:EL207183.1, INSD:BP851591.1,INSD:AI100748.1,INSD:EH850204.1, INSD:BP865241.1,INSD:EL321798.1,INSD:EG506201.1, INSD:DR198707.1,INSD:BP630789.1,INSD:EH852606.1, INSD:BP617891.1,INSD:BP850912.1,INSD:AV439487.1, INSD:EL028946.1,INSD:EH813209.1,INSD:DR272294.1, INSD:EL285168.1,INSD:EL234454.1,INSD:DR296169.1, INSD:DR272274.1,INSD:AV782714.1,INSD:BP833360.2, INSD:EL037939.1,INSD:EL261545.1,INSD:DR272281.1, INSD:DR198717.1,INSD:EL239428.1,INSD:EL052072.1, INSD:EL253685.1,INSD:DR272288.1,INSD:DR272296.1, INSD:DR198691.1,INSD:BP634998.1,INSD:EL285374.1, INSD:DR198700.1,INSD:DR198750.1,INSD:DR198744.1, INSD:ES008834.1,INSD:AV441610.1,INSD:BP630948.1, INSD:EH888650.1,INSD:EL308709.1,INSD:EL192749.1, INSD:EH893603.1,INSD:BP823897.1,INSD:BP805652.1, INSD:EL332570.1,INSD:BP616973.1,INSD:EL307969.1, INSD:CK120035.1,INSD:DR198728.1,INSD:DR198740.1, INSD:EL075848.1,INSD:DR198719.1,INSD:EH846220.1, INSD:EL336573.1,INSD:EL158749.1,INSD:BP811961.1, INSD:EH993186.1,INSD:BP812713.1,INSD:EH965633.1, INSD:BP858728.1,INSD:DR198729.1,INSD:EL016040.1, INSD:BP606983.1,INSD:DR198712.1,INSD:DR272303.1, INSD:BP641163.1,INSD:EL317689.1,INSD:DR198714.1, INSD:EL223858.1,INSD:EL268662.1,INSD:EH958010.1, INSD:AV791902.1,INSD:BP639231.1,INSD:DR198748.1, INSD:EL301448.1,INSD:AV799675.1,INSD:EL043080.1, INSD:BP650681.1,INSD:EL302568.1,INSD:EL197086.1, INSD:EG506738.1,INSD:EL105573.1,INSD:T21832.1, INSD:EL034738.1,INSD:EL037021.1,INSD:AV801963.1, INSD:EL111577.1,INSD:ES157105.1,INSD:EH866327.1, INSD:EH857146.1,INSD:BP620058.1,INSD:DR375999.1, INSD:EL141627.1,INSD:AV557559.1,INSD:EL231021.1, INSD:EL174221.1,INSD:BP807585.1,INSD:EL117272.1, INSD:BP585015.1,INSD:EG506740.1,INSD:EH877392.1, INSD:DR272273.1,INSD:DR198705.1,INSD:DR198741.1, INSD:EL013324.1,INSD:EH903346.1,INSD:ES003746.1, INSD:DR198752.1,INSD:EL206018.1,INSD:EL199363.1, INSD:EL106932.1,INSD:EH931444.1,INSD:BX834197.1, INSD:DR272304.1,INSD:DR198754.1,INSD:EH863664.1, INSD:EL133264.1,INSD:ES020128.1,INSD:EG516258.1, INSD:BP857729.1,INSD:EL053023.1,INSD:EH885118.1, INSD:DR198704.1,INSD:DR198721.1,INSD:EL068222.1, INSD:BP619649.1,INSD:DR296167.1,INSD:BP620329.1, INSD:EL115950.1,INSD:EL123135.1,INSD:BE525600.1, INSD:DR272289.1,INSD:DR186443.1,INSD:BP836373.1, INSD:DR272291.1,INSD:EL165285.1,INSD:BP869095.1, INSD:DR198755.1,INSD:BP617349.1,INSD:BP666445.1, INSD:EH935566.1,INSD:DR198738.1,INSD:BX834296.1, INSD:DR198726.1,INSD:BP642093.1,INSD:EL075502.1, INSD:BP850170.1,INSD:BP613572.1,INSD:EL080807.1, INSD:DR377458.1,INSD:DR272276.1,INSD:EH839744.1, INSD:DR186445.1,INSD:BP609756.1,INSD:DR198702.1, INSD:BP597688.1,INSD:EL259408.1,INSD:BP597538.1, INSD:BE528381.1,INSD:DR198701.1,INSD:EL187167.1, INSD:EL019383.1,INSD:BP650803.1,INSD:EL010476.1, INSD:AV786652.1,INSD:DR272300.1,INSD:EG506260.1, INSD:BP816941.1,INSD:DR198713.1,INSD:BP859429.1, INSD:EL092100.1,INSD:EL322395.1,INSD:DR198699.1, INSD:EH862547.1,INSD:DR272283.1,INSD:BP610172.1, INSD:DR198709.1,INSD:ES055731.1,INSD:BP586612.1, INSD:EH851450.1,INSD:CB185921.1,INSD:DR198718.1, INSD:EL287063.1,INSD:EL153664.1,INSD:BP646958.1, INSD:BP590582.1,INSD:EL102954.1,INSD:BP862243.1, INSD:EL286059.1,INSD:EG516242.1,INSD:DR380298.1, INSD:DR198723.1,INSD:EH867816.1,INSD:DR272285.1, INSD:AV526052.1,INSD:DR296168.1,INSD:EH834479.1, INSD:EL320860.1,INSD:DR272279.1,INSD:EL104616.1, INSD:AV519498.1,INSD:DR272302.1,INSD:DR198711.1, INSD:EL244191.1,INSD:BP664833.1,INSD:DR272301.1, INSD:BP594158.1,INSD:EL044839.1,INSD:AV803675.1, INSD:EH943037.1,INSD:DR198710.1,INSD:DR198722.1, INSD:EL332580.1,INSD:BP779336.1,INSD:DR198692.1, INSD:BP587113.1,INSD:EH804527.1,INSD:DR198715.1, INSD:DR198742.1,INSD:EL280044.1,INSD:EH829432.1, INSD:EH811276.1,INSD:DR198737.1,INSD:EL130768.1, INSD:BP868905.1,INSD:EL015070.1,INSD:DR375895.1, INSD:DR186444.1,INSD:BP633091.1,INSD:DR198716.1, INSD:AV806703.1,INSD:EG516630.1,INSD:DR198708.1, INSD:CA782025.1,INSD:N96556.1,INSD:BU635568.1, INSD:AI994332.1,INSD:EH957001.1,INSD:DR198698.1, INSD:DR198724.1,INSD:BP836389.1,INSD:DR198732.1" /inference="Similar to RNA sequence, mRNA:INSD:BX823475.1,INSD:BT004545.1,INSD:AY079021.1, INSD:AY139756.1,INSD:BX825461.1" /note="Protein of unknown function (DUF179); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast thylakoid lumen, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF179 (InterPro:IPR003774); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein of unknown function (DUF179) (TAIR:AT1G33780.1); Has 1065 Blast hits to 1065 proteins in 382 species: Archae - 0; Bacteria - 730; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 124; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 211 (source: NCBI BLink)." /db_xref="TAIR:AT3G29240" /db_xref="Araport:AT3G29240" intron_pos 49:1 (1/1) BEGIN 1 MDACFLTSRS ISGVKELVPF IKARIFTCPK RNSGQFVTRK VASPISVNCS LSDSWKPLED 61 DADLFKDCVN NSTSDADWRE FRARLVAGEQ AATSEKDQPS WSNPDMVVDY QPSSSSLITI 121 GSKWAHKIHE PETGCLLIAT EKLDGVHIFE KTVILLLSVG PSGPIGVILN RPSLMSIKET 181 KSTILDMAGT FSDKRLFFGG PLEEGLFLVS PRSGGDNEVG KSGVFRQVMK GLYYGTRESV 241 GLAAEMVKRN LVGRSELRFF DGYCGWEKEQ LKAEILGGYW TVAACSSTVV ELGSAVQSHG 301 LWDEVLGLIG PQTGSVI //