LOCUS AEE75124.1 207 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana ribosomal protein 5A protein.
ACCESSION CP002686-2125
PROTEIN_ID AEE75124.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="RPS5A"
/locus_tag="AT3G11940"
/gene_synonym="AML1"
/gene_synonym="ARABIDOPSIS MINUTE-LIKE 1"
/gene_synonym="ATRPS5A"
/gene_synonym="MEC18.11"
/gene_synonym="ribosomal protein 5A"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:CB257800.1,INSD:BP661979.1,INSD:EL970714.1,
INSD:DR291053.1,INSD:BP585894.1,INSD:DR291047.1,
INSD:BP837727.1,INSD:CB258928.1,INSD:BP574779.1,
INSD:ES077896.1,INSD:DR291093.1,INSD:EH885393.1,
INSD:DR291046.1,INSD:ES104971.1,INSD:BP617461.1,
INSD:BP833389.1,INSD:ES003648.1,INSD:EL999042.1,
INSD:BP663224.1,INSD:BP834980.1,INSD:EL336270.1,
INSD:EL233744.1,INSD:DR291064.1,INSD:DR291052.1,
INSD:EL300221.1,INSD:ES160988.1,INSD:AV565182.1,
INSD:EL102359.1,INSD:AA712994.1,INSD:BP670521.1,
INSD:ES200172.1,INSD:BP587074.1,INSD:ES210962.1,
INSD:DR291057.1,INSD:ES169037.1,INSD:EL972330.1,
INSD:BE520183.1,INSD:EH814841.1,INSD:BP584664.1,
INSD:BP622644.1,INSD:DR291098.1,INSD:BP842821.1,
INSD:BP868159.1,INSD:ES215433.1,INSD:EL193753.1,
INSD:EL063744.1,INSD:DR291095.1,INSD:EL027305.1,
INSD:AV520490.1,INSD:BP814821.1,INSD:EH893935.1,
INSD:ES078009.1,INSD:EL070246.1,INSD:ES127433.1,
INSD:EL972406.1,INSD:EL085166.1,INSD:BP856753.1,
INSD:BP670932.1,INSD:BP572454.1,INSD:EL195401.1,
INSD:BP566336.1,INSD:ES076214.1,INSD:BP814616.1,
INSD:CB261407.1,INSD:BP629625.1,INSD:AV539002.1,
INSD:AV545161.1,INSD:EG440267.1,INSD:ES129692.1,
INSD:EL314195.1,INSD:BP819578.1,INSD:ES131201.1,
INSD:ES197993.1,INSD:DR291108.1,INSD:EL978525.1,
INSD:BP817964.1,INSD:EH868174.1,INSD:ES002261.1,
INSD:EL271404.1,INSD:DR291029.1,INSD:EL187611.1,
INSD:EL224473.1,INSD:ES028886.1,INSD:EH914926.1,
INSD:ES117736.1,INSD:EG440268.1,INSD:EL974223.1,
INSD:DR291083.1,INSD:ES093392.1,INSD:EL031787.1,
INSD:BP854082.1,INSD:BP791147.1,INSD:ES188941.1,
INSD:EL097289.1,INSD:EH832661.1,INSD:BP813001.1,
INSD:EL272851.1,INSD:BP594727.1,INSD:BP590497.1,
INSD:BP840394.1,INSD:ES083210.1,INSD:ES070764.1,
INSD:EL976017.1,INSD:AV542246.1,INSD:ES210796.1,
INSD:EH900717.1,INSD:EL979201.1,INSD:AV533693.1,
INSD:DR290474.1,INSD:DR291036.1,INSD:EH980822.1,
INSD:BP856706.1,INSD:BP848155.1,INSD:ES180935.1,
INSD:EL113228.1,INSD:ES055662.1,INSD:DR291041.1,
INSD:BP850327.1,INSD:DR291088.1,INSD:DR291040.1,
INSD:DR291062.1,INSD:AV552979.1,INSD:DR291043.1,
INSD:BP847714.1,INSD:AV552955.1,INSD:DR291050.1,
INSD:EL247325.1,INSD:ES165579.1,INSD:EH958234.1,
INSD:EH985128.1,INSD:AV553086.1,INSD:AV530291.1,
INSD:DR291102.1,INSD:AV551342.1,INSD:ES063415.1,
INSD:BP643895.1,INSD:EL309705.1,INSD:EL200550.1,
INSD:ES109293.1,INSD:EL204482.1,INSD:EL086755.1,
INSD:ES001407.1,INSD:ES167252.1,INSD:EL290441.1,
INSD:BP565337.1,INSD:EH928597.1,INSD:AV520567.1,
INSD:EL167764.1,INSD:DR291056.1,INSD:EL255497.1,
INSD:EH815307.1,INSD:EH841897.1,INSD:BP597615.1,
INSD:BP637834.1,INSD:ES118809.1,INSD:ES112816.1,
INSD:EL327403.1,INSD:EL012059.1,INSD:EL324974.1,
INSD:EH842564.1,INSD:AV534031.1,INSD:ES216013.1,
INSD:T43530.1,INSD:EH842517.1,INSD:EL293561.1,
INSD:AV542349.1,INSD:EL274264.1,INSD:BP571572.1,
INSD:ES188276.1,INSD:EH975672.1,INSD:EL996973.1,
INSD:EL996103.1,INSD:ES106686.1,INSD:DR291082.1,
INSD:ES040435.1,INSD:BP661766.1,INSD:AV545495.1,
INSD:ES167820.1,INSD:ES210357.1,INSD:BP834470.1,
INSD:EL053685.1,INSD:BP582425.1,INSD:EH810990.1,
INSD:EH960028.1,INSD:AV552967.1,INSD:AV526819.1,
INSD:EL968034.1,INSD:EL972507.1,INSD:BE038477.1,
INSD:EH826030.1,INSD:BP821420.1,INSD:DR291086.1,
INSD:DR291044.1,INSD:DR291025.1,INSD:ES196358.1,
INSD:ES041890.1,INSD:EH826967.1,INSD:BP845607.1,
INSD:AV531466.1,INSD:EL020378.1,INSD:AV562239.1,
INSD:AV556676.1,INSD:BP572738.1,INSD:ES167578.1,
INSD:BP654748.1,INSD:ES145446.1,INSD:AV554475.1,
INSD:DR291087.1,INSD:ES172701.1,INSD:BP799720.1,
INSD:EL291152.1,INSD:ES002738.1,INSD:AV552971.1,
INSD:ES144504.1,INSD:BP829046.1,INSD:BP632937.1,
INSD:BP839307.1,INSD:BP604722.1,INSD:DR291024.1,
INSD:AV798564.1,INSD:DR374542.1,INSD:EL980712.1,
INSD:EH811016.1,INSD:ES072470.1,INSD:BP813371.1,
INSD:BP850749.1,INSD:EL171086.1,INSD:DR291075.1,
INSD:EL973496.1,INSD:EL208793.1,INSD:DR291061.1,
INSD:EL058818.1,INSD:ES193116.1,INSD:EL029353.1,
INSD:AV552913.1,INSD:BP813744.1,INSD:EL136555.1,
INSD:DR290476.1,INSD:EL140342.1,INSD:BP829738.1,
INSD:BP825014.1,INSD:ES113461.1,INSD:BP585439.1,
INSD:DR290477.1,INSD:DR291039.1,INSD:ES011379.1,
INSD:EH847634.1,INSD:AV560608.1,INSD:EL229830.1,
INSD:AV564732.1,INSD:ES174606.1,INSD:EL182083.1,
INSD:ES200425.1,INSD:AV534310.1,INSD:EL970217.1,
INSD:ES058717.1,INSD:DR291089.1,INSD:ES031950.1,
INSD:EL169841.1,INSD:EH880312.1,INSD:ES186635.1,
INSD:EL086301.1,INSD:ES187380.1,INSD:EL105066.1,
INSD:AV558072.1,INSD:EL019577.1,INSD:ES123279.1,
INSD:BP844276.1,INSD:EH812625.1,INSD:EL213188.1,
INSD:DR291084.1,INSD:BP594703.1,INSD:BP656506.1,
INSD:AV784649.1,INSD:ES191022.1,INSD:DR291101.1,
INSD:AV552973.1,INSD:DR291070.1,INSD:EH921525.1,
INSD:BP864097.1,INSD:EL080654.1,INSD:DR291027.1,
INSD:BP864661.1,INSD:EL326242.1,INSD:DR291092.1,
INSD:EL121732.1,INSD:ES145357.1,INSD:BP810653.1,
INSD:ES061988.1,INSD:EH809337.1,INSD:AV785940.1,
INSD:EH818626.1,INSD:AV552898.1,INSD:EH880462.1,
INSD:EL065359.1,INSD:DR291051.1,INSD:EH922071.1,
INSD:ES214630.1,INSD:DR291042.1,INSD:CB263223.1,
INSD:EH803691.1,INSD:EL013228.1,INSD:ES150257.1,
INSD:BE528994.1,INSD:EH854512.1,INSD:BP654166.1,
INSD:EH897327.1,INSD:ES183291.1,INSD:BP647482.1,
INSD:DR291074.1,INSD:DR291105.1,INSD:AI994428.1,
INSD:AV542083.1,INSD:EL041210.1,INSD:AV535295.1,
INSD:ES213094.1,INSD:BP817340.1,INSD:DR291072.1,
INSD:BP833190.1,INSD:DR291077.1,INSD:EL973384.1,
INSD:EL183822.1,INSD:DR291097.1,INSD:DR291035.1,
INSD:EH923186.1,INSD:BP633353.1,INSD:ES197826.1,
INSD:DR291100.1,INSD:EL318988.1,INSD:BP828967.1,
INSD:EL969833.1,INSD:AV552919.1,INSD:AV559486.1,
INSD:DR291034.1,INSD:DR291054.1,INSD:ES211597.1,
INSD:DR291031.1,INSD:BP866277.1,INSD:EL058076.1,
INSD:EL998513.1,INSD:AV537454.1,INSD:ES084602.1,
INSD:DR291081.1,INSD:BP586582.1,INSD:EL186598.1,
INSD:DR291037.1,INSD:ES215375.1,INSD:EL322648.1,
INSD:DR290475.1,INSD:EL999961.1,INSD:DR370217.1,
INSD:H36513.1,INSD:EH861637.1,INSD:BP862376.1,
INSD:EL301766.1,INSD:EH926818.1,INSD:AV526921.1,
INSD:EL262990.1,INSD:EL980003.1,INSD:AV541686.1,
INSD:ES083667.1,INSD:T43533.1,INSD:BP838085.1,
INSD:BP660643.1,INSD:ES162440.1,INSD:EL028546.1,
INSD:ES152883.1,INSD:EL339346.1,INSD:BP851608.1,
INSD:DR291076.1,INSD:EL140639.1,INSD:DR291079.1,
INSD:DR291094.1,INSD:ES117256.1,INSD:EL214923.1,
INSD:EL082081.1,INSD:DR291030.1,INSD:DR291073.1,
INSD:EH874303.1,INSD:DR291048.1,INSD:ES211105.1,
INSD:AV823645.1,INSD:BP832615.1,INSD:AV549329.1,
INSD:DR377342.1,INSD:AV535392.1,INSD:EL215727.1,
INSD:EL992275.1,INSD:EL081103.1,INSD:EL084867.1,
INSD:ES151236.1,INSD:BP845087.1,INSD:DR291090.1,
INSD:DR291109.1,INSD:BP800729.1,INSD:DR291065.1,
INSD:EH881505.1,INSD:DR291080.1,INSD:ES177199.1,
INSD:EL269794.1,INSD:N37914.1,INSD:EH985687.1,
INSD:EL166538.1,INSD:EH914608.1,INSD:EL995960.1,
INSD:DR291023.1,INSD:BP851389.1,INSD:ES155636.1,
INSD:ES062691.1,INSD:ES137070.1,INSD:DR291069.1,
INSD:ES113283.1,INSD:EH959562.1,INSD:DR291099.1,
INSD:DR291104.1,INSD:ES084512.1,INSD:DR291106.1,
INSD:DR291091.1,INSD:DR291107.1,INSD:ES101335.1,
INSD:EL088524.1,INSD:EL113063.1,INSD:EL245111.1,
INSD:EH859927.1,INSD:ES084540.1,INSD:DR291059.1,
INSD:DR291026.1,INSD:EL194376.1,INSD:EH985026.1,
INSD:BP647372.1,INSD:EL267272.1,INSD:BP634783.1,
INSD:ES215981.1,INSD:DR291103.1,INSD:BP645266.1,
INSD:EH836376.1,INSD:EG521907.1,INSD:EH850332.1,
INSD:BP645844.1,INSD:BP821953.1,INSD:DR291028.1,
INSD:EL153579.1,INSD:EH982178.1,INSD:CF652963.1,
INSD:EH906041.1,INSD:EG521906.1,INSD:EH809804.1,
INSD:DR291033.1,INSD:ES197370.1,INSD:DR291063.1,
INSD:BP799293.1,INSD:EL155252.1,INSD:DR291045.1,
INSD:N37913.1,INSD:ES038581.1,INSD:BP847668.1,
INSD:EL237296.1,INSD:EL232294.1,INSD:DR291085.1,
INSD:ES182532.1,INSD:EL101152.1,INSD:ES094067.1,
INSD:DR291096.1,INSD:EH916851.1,INSD:EL140505.1,
INSD:CB255723.1,INSD:DR379975.1,INSD:EL978362.1,
INSD:ES190377.1,INSD:EH866638.1,INSD:EH888164.1,
INSD:BP804826.1,INSD:DR291071.1,INSD:BP864625.1,
INSD:EL992793.1,INSD:ES140834.1,INSD:DR291060.1,
INSD:DR291032.1,INSD:DR291068.1,INSD:ES153795.1,
INSD:EH993859.1,INSD:CB259100.1,INSD:CB258740.1,
INSD:DR291078.1,INSD:DR291055.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX824143.1,INSD:BX822969.1,INSD:BX824064.1,
INSD:AY045846.1,INSD:AY091376.1,INSD:Z18496.1,
INSD:BX822599.1"
/note="ribosomal protein 5A (RPS5A); FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome; INVOLVED IN:
translation; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 7
plant structures; EXPRESSED DURING: seedling growth;
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S7,
conserved site (InterPro:IPR020606), Ribosomal protein S7,
eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR005716), Ribosomal
protein S7 (InterPro:IPR000235); BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: ribosomal protein 5B (TAIR:AT2G37270.2);
Has 8664 Blast hits to 8664 proteins in 3504 species:
Archae - 243; Bacteria - 4586; Metazoa - 986; Fungi - 184;
Plants - 1132; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1533
(source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G11940"
/db_xref="Araport:AT3G11940"
intron_pos 32:0 (1/3)
intron_pos 122:2 (2/3)
intron_pos 190:2 (3/3)
BEGIN
1 MATAADVDAE IQQALTNEVK LFNRWTYDDV TVTDISLVDY IGVQAAKHAT FVPHTAGRYS
61 VKRFRKAQCP IVERLTNSLM MHGRNNGKKL MAVRIVKHAM EIIHLLSDLN PIQVIIDAIV
121 NSGPREDATR IGSAGVVRRQ AVDISPLRRV NQAIFLITTG AREAAFRNIK TIAECLADEL
181 INAAKGSSNS YAIKKKDEIE RVAKANR
//