LOCUS AEE75124.1 207 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana ribosomal protein 5A protein. ACCESSION CP002686-2125 PROTEIN_ID AEE75124.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830) AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M., Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B., Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P., Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V., Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S., Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P., Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S., Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H., Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M., Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A., Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C., Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P., Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M., Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S., Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L., Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A., Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B., Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J., Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X., Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M., Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S., Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C., Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S., Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A., Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S. CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium; Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000) PUBMED 11130713 REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="3" /ecotype="Columbia" protein /gene="RPS5A" /locus_tag="AT3G11940" /gene_synonym="AML1" /gene_synonym="ARABIDOPSIS MINUTE-LIKE 1" /gene_synonym="ATRPS5A" /gene_synonym="MEC18.11" /gene_synonym="ribosomal protein 5A" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:CB257800.1,INSD:BP661979.1,INSD:EL970714.1, INSD:DR291053.1,INSD:BP585894.1,INSD:DR291047.1, INSD:BP837727.1,INSD:CB258928.1,INSD:BP574779.1, INSD:ES077896.1,INSD:DR291093.1,INSD:EH885393.1, INSD:DR291046.1,INSD:ES104971.1,INSD:BP617461.1, INSD:BP833389.1,INSD:ES003648.1,INSD:EL999042.1, INSD:BP663224.1,INSD:BP834980.1,INSD:EL336270.1, INSD:EL233744.1,INSD:DR291064.1,INSD:DR291052.1, INSD:EL300221.1,INSD:ES160988.1,INSD:AV565182.1, INSD:EL102359.1,INSD:AA712994.1,INSD:BP670521.1, INSD:ES200172.1,INSD:BP587074.1,INSD:ES210962.1, INSD:DR291057.1,INSD:ES169037.1,INSD:EL972330.1, INSD:BE520183.1,INSD:EH814841.1,INSD:BP584664.1, INSD:BP622644.1,INSD:DR291098.1,INSD:BP842821.1, INSD:BP868159.1,INSD:ES215433.1,INSD:EL193753.1, INSD:EL063744.1,INSD:DR291095.1,INSD:EL027305.1, INSD:AV520490.1,INSD:BP814821.1,INSD:EH893935.1, INSD:ES078009.1,INSD:EL070246.1,INSD:ES127433.1, INSD:EL972406.1,INSD:EL085166.1,INSD:BP856753.1, INSD:BP670932.1,INSD:BP572454.1,INSD:EL195401.1, INSD:BP566336.1,INSD:ES076214.1,INSD:BP814616.1, INSD:CB261407.1,INSD:BP629625.1,INSD:AV539002.1, INSD:AV545161.1,INSD:EG440267.1,INSD:ES129692.1, INSD:EL314195.1,INSD:BP819578.1,INSD:ES131201.1, INSD:ES197993.1,INSD:DR291108.1,INSD:EL978525.1, INSD:BP817964.1,INSD:EH868174.1,INSD:ES002261.1, INSD:EL271404.1,INSD:DR291029.1,INSD:EL187611.1, INSD:EL224473.1,INSD:ES028886.1,INSD:EH914926.1, INSD:ES117736.1,INSD:EG440268.1,INSD:EL974223.1, INSD:DR291083.1,INSD:ES093392.1,INSD:EL031787.1, INSD:BP854082.1,INSD:BP791147.1,INSD:ES188941.1, INSD:EL097289.1,INSD:EH832661.1,INSD:BP813001.1, INSD:EL272851.1,INSD:BP594727.1,INSD:BP590497.1, INSD:BP840394.1,INSD:ES083210.1,INSD:ES070764.1, INSD:EL976017.1,INSD:AV542246.1,INSD:ES210796.1, INSD:EH900717.1,INSD:EL979201.1,INSD:AV533693.1, INSD:DR290474.1,INSD:DR291036.1,INSD:EH980822.1, INSD:BP856706.1,INSD:BP848155.1,INSD:ES180935.1, INSD:EL113228.1,INSD:ES055662.1,INSD:DR291041.1, INSD:BP850327.1,INSD:DR291088.1,INSD:DR291040.1, INSD:DR291062.1,INSD:AV552979.1,INSD:DR291043.1, INSD:BP847714.1,INSD:AV552955.1,INSD:DR291050.1, INSD:EL247325.1,INSD:ES165579.1,INSD:EH958234.1, INSD:EH985128.1,INSD:AV553086.1,INSD:AV530291.1, INSD:DR291102.1,INSD:AV551342.1,INSD:ES063415.1, INSD:BP643895.1,INSD:EL309705.1,INSD:EL200550.1, INSD:ES109293.1,INSD:EL204482.1,INSD:EL086755.1, INSD:ES001407.1,INSD:ES167252.1,INSD:EL290441.1, INSD:BP565337.1,INSD:EH928597.1,INSD:AV520567.1, INSD:EL167764.1,INSD:DR291056.1,INSD:EL255497.1, INSD:EH815307.1,INSD:EH841897.1,INSD:BP597615.1, INSD:BP637834.1,INSD:ES118809.1,INSD:ES112816.1, INSD:EL327403.1,INSD:EL012059.1,INSD:EL324974.1, INSD:EH842564.1,INSD:AV534031.1,INSD:ES216013.1, INSD:T43530.1,INSD:EH842517.1,INSD:EL293561.1, INSD:AV542349.1,INSD:EL274264.1,INSD:BP571572.1, INSD:ES188276.1,INSD:EH975672.1,INSD:EL996973.1, INSD:EL996103.1,INSD:ES106686.1,INSD:DR291082.1, INSD:ES040435.1,INSD:BP661766.1,INSD:AV545495.1, INSD:ES167820.1,INSD:ES210357.1,INSD:BP834470.1, INSD:EL053685.1,INSD:BP582425.1,INSD:EH810990.1, INSD:EH960028.1,INSD:AV552967.1,INSD:AV526819.1, INSD:EL968034.1,INSD:EL972507.1,INSD:BE038477.1, INSD:EH826030.1,INSD:BP821420.1,INSD:DR291086.1, INSD:DR291044.1,INSD:DR291025.1,INSD:ES196358.1, INSD:ES041890.1,INSD:EH826967.1,INSD:BP845607.1, INSD:AV531466.1,INSD:EL020378.1,INSD:AV562239.1, INSD:AV556676.1,INSD:BP572738.1,INSD:ES167578.1, INSD:BP654748.1,INSD:ES145446.1,INSD:AV554475.1, INSD:DR291087.1,INSD:ES172701.1,INSD:BP799720.1, INSD:EL291152.1,INSD:ES002738.1,INSD:AV552971.1, INSD:ES144504.1,INSD:BP829046.1,INSD:BP632937.1, INSD:BP839307.1,INSD:BP604722.1,INSD:DR291024.1, INSD:AV798564.1,INSD:DR374542.1,INSD:EL980712.1, INSD:EH811016.1,INSD:ES072470.1,INSD:BP813371.1, INSD:BP850749.1,INSD:EL171086.1,INSD:DR291075.1, INSD:EL973496.1,INSD:EL208793.1,INSD:DR291061.1, INSD:EL058818.1,INSD:ES193116.1,INSD:EL029353.1, INSD:AV552913.1,INSD:BP813744.1,INSD:EL136555.1, INSD:DR290476.1,INSD:EL140342.1,INSD:BP829738.1, INSD:BP825014.1,INSD:ES113461.1,INSD:BP585439.1, INSD:DR290477.1,INSD:DR291039.1,INSD:ES011379.1, INSD:EH847634.1,INSD:AV560608.1,INSD:EL229830.1, INSD:AV564732.1,INSD:ES174606.1,INSD:EL182083.1, INSD:ES200425.1,INSD:AV534310.1,INSD:EL970217.1, INSD:ES058717.1,INSD:DR291089.1,INSD:ES031950.1, INSD:EL169841.1,INSD:EH880312.1,INSD:ES186635.1, INSD:EL086301.1,INSD:ES187380.1,INSD:EL105066.1, INSD:AV558072.1,INSD:EL019577.1,INSD:ES123279.1, INSD:BP844276.1,INSD:EH812625.1,INSD:EL213188.1, INSD:DR291084.1,INSD:BP594703.1,INSD:BP656506.1, INSD:AV784649.1,INSD:ES191022.1,INSD:DR291101.1, INSD:AV552973.1,INSD:DR291070.1,INSD:EH921525.1, INSD:BP864097.1,INSD:EL080654.1,INSD:DR291027.1, INSD:BP864661.1,INSD:EL326242.1,INSD:DR291092.1, INSD:EL121732.1,INSD:ES145357.1,INSD:BP810653.1, INSD:ES061988.1,INSD:EH809337.1,INSD:AV785940.1, INSD:EH818626.1,INSD:AV552898.1,INSD:EH880462.1, INSD:EL065359.1,INSD:DR291051.1,INSD:EH922071.1, INSD:ES214630.1,INSD:DR291042.1,INSD:CB263223.1, INSD:EH803691.1,INSD:EL013228.1,INSD:ES150257.1, INSD:BE528994.1,INSD:EH854512.1,INSD:BP654166.1, INSD:EH897327.1,INSD:ES183291.1,INSD:BP647482.1, INSD:DR291074.1,INSD:DR291105.1,INSD:AI994428.1, INSD:AV542083.1,INSD:EL041210.1,INSD:AV535295.1, INSD:ES213094.1,INSD:BP817340.1,INSD:DR291072.1, INSD:BP833190.1,INSD:DR291077.1,INSD:EL973384.1, INSD:EL183822.1,INSD:DR291097.1,INSD:DR291035.1, INSD:EH923186.1,INSD:BP633353.1,INSD:ES197826.1, INSD:DR291100.1,INSD:EL318988.1,INSD:BP828967.1, INSD:EL969833.1,INSD:AV552919.1,INSD:AV559486.1, INSD:DR291034.1,INSD:DR291054.1,INSD:ES211597.1, INSD:DR291031.1,INSD:BP866277.1,INSD:EL058076.1, INSD:EL998513.1,INSD:AV537454.1,INSD:ES084602.1, INSD:DR291081.1,INSD:BP586582.1,INSD:EL186598.1, INSD:DR291037.1,INSD:ES215375.1,INSD:EL322648.1, INSD:DR290475.1,INSD:EL999961.1,INSD:DR370217.1, INSD:H36513.1,INSD:EH861637.1,INSD:BP862376.1, INSD:EL301766.1,INSD:EH926818.1,INSD:AV526921.1, INSD:EL262990.1,INSD:EL980003.1,INSD:AV541686.1, INSD:ES083667.1,INSD:T43533.1,INSD:BP838085.1, INSD:BP660643.1,INSD:ES162440.1,INSD:EL028546.1, INSD:ES152883.1,INSD:EL339346.1,INSD:BP851608.1, INSD:DR291076.1,INSD:EL140639.1,INSD:DR291079.1, INSD:DR291094.1,INSD:ES117256.1,INSD:EL214923.1, INSD:EL082081.1,INSD:DR291030.1,INSD:DR291073.1, INSD:EH874303.1,INSD:DR291048.1,INSD:ES211105.1, INSD:AV823645.1,INSD:BP832615.1,INSD:AV549329.1, INSD:DR377342.1,INSD:AV535392.1,INSD:EL215727.1, INSD:EL992275.1,INSD:EL081103.1,INSD:EL084867.1, INSD:ES151236.1,INSD:BP845087.1,INSD:DR291090.1, INSD:DR291109.1,INSD:BP800729.1,INSD:DR291065.1, INSD:EH881505.1,INSD:DR291080.1,INSD:ES177199.1, INSD:EL269794.1,INSD:N37914.1,INSD:EH985687.1, INSD:EL166538.1,INSD:EH914608.1,INSD:EL995960.1, INSD:DR291023.1,INSD:BP851389.1,INSD:ES155636.1, INSD:ES062691.1,INSD:ES137070.1,INSD:DR291069.1, INSD:ES113283.1,INSD:EH959562.1,INSD:DR291099.1, INSD:DR291104.1,INSD:ES084512.1,INSD:DR291106.1, INSD:DR291091.1,INSD:DR291107.1,INSD:ES101335.1, INSD:EL088524.1,INSD:EL113063.1,INSD:EL245111.1, INSD:EH859927.1,INSD:ES084540.1,INSD:DR291059.1, INSD:DR291026.1,INSD:EL194376.1,INSD:EH985026.1, INSD:BP647372.1,INSD:EL267272.1,INSD:BP634783.1, INSD:ES215981.1,INSD:DR291103.1,INSD:BP645266.1, INSD:EH836376.1,INSD:EG521907.1,INSD:EH850332.1, INSD:BP645844.1,INSD:BP821953.1,INSD:DR291028.1, INSD:EL153579.1,INSD:EH982178.1,INSD:CF652963.1, INSD:EH906041.1,INSD:EG521906.1,INSD:EH809804.1, INSD:DR291033.1,INSD:ES197370.1,INSD:DR291063.1, INSD:BP799293.1,INSD:EL155252.1,INSD:DR291045.1, INSD:N37913.1,INSD:ES038581.1,INSD:BP847668.1, INSD:EL237296.1,INSD:EL232294.1,INSD:DR291085.1, INSD:ES182532.1,INSD:EL101152.1,INSD:ES094067.1, INSD:DR291096.1,INSD:EH916851.1,INSD:EL140505.1, INSD:CB255723.1,INSD:DR379975.1,INSD:EL978362.1, INSD:ES190377.1,INSD:EH866638.1,INSD:EH888164.1, INSD:BP804826.1,INSD:DR291071.1,INSD:BP864625.1, INSD:EL992793.1,INSD:ES140834.1,INSD:DR291060.1, INSD:DR291032.1,INSD:DR291068.1,INSD:ES153795.1, INSD:EH993859.1,INSD:CB259100.1,INSD:CB258740.1, INSD:DR291078.1,INSD:DR291055.1" /inference="Similar to RNA sequence, mRNA:INSD:BX824143.1,INSD:BX822969.1,INSD:BX824064.1, INSD:AY045846.1,INSD:AY091376.1,INSD:Z18496.1, INSD:BX822599.1" /note="ribosomal protein 5A (RPS5A); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 7 plant structures; EXPRESSED DURING: seedling growth; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S7, conserved site (InterPro:IPR020606), Ribosomal protein S7, eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR005716), Ribosomal protein S7 (InterPro:IPR000235); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ribosomal protein 5B (TAIR:AT2G37270.2); Has 8664 Blast hits to 8664 proteins in 3504 species: Archae - 243; Bacteria - 4586; Metazoa - 986; Fungi - 184; Plants - 1132; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1533 (source: NCBI BLink)." /db_xref="TAIR:AT3G11940" /db_xref="Araport:AT3G11940" intron_pos 32:0 (1/3) intron_pos 122:2 (2/3) intron_pos 190:2 (3/3) BEGIN 1 MATAADVDAE IQQALTNEVK LFNRWTYDDV TVTDISLVDY IGVQAAKHAT FVPHTAGRYS 61 VKRFRKAQCP IVERLTNSLM MHGRNNGKKL MAVRIVKHAM EIIHLLSDLN PIQVIIDAIV 121 NSGPREDATR IGSAGVVRRQ AVDISPLRRV NQAIFLITTG AREAAFRNIK TIAECLADEL 181 INAAKGSSNS YAIKKKDEIE RVAKANR //