LOCUS AEC10039.1 285 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Ribosomal protein S5 family protein protein.
ACCESSION CP002685-6360
PROTEIN_ID AEC10039.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT2G41840"
/gene_synonym="T11A7.6"
/gene_synonym="T11A7_6"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR240017.1,INSD:EL125289.1,INSD:EH853338.1,
INSD:EL094074.1,INSD:EH845195.1,INSD:EH853255.1,
INSD:EL982779.1,INSD:ES076349.1,INSD:ES041166.1,
INSD:EL134264.1,INSD:EH905408.1,INSD:EL996564.1,
INSD:DR239986.1,INSD:BP578337.1,INSD:ES196954.1,
INSD:DR240009.1,INSD:ES193573.1,INSD:BP573995.1,
INSD:EL062704.1,INSD:DR240000.1,INSD:DR240005.1,
INSD:DR224889.1,INSD:ES020735.1,INSD:EL218124.1,
INSD:EH994343.1,INSD:EH991572.1,INSD:DR240026.1,
INSD:EH804213.1,INSD:DR239978.1,INSD:BP801295.1,
INSD:DR240053.1,INSD:EL260746.1,INSD:EL318037.1,
INSD:T04538.1,INSD:EL237733.1,INSD:DR240032.1,
INSD:BP812100.1,INSD:BP829706.1,INSD:DR239983.1,
INSD:ES107410.1,INSD:EH902610.1,INSD:ES140933.1,
INSD:BP818106.1,INSD:EH797446.1,INSD:EH849589.1,
INSD:EH876661.1,INSD:EL994094.1,INSD:CF651912.1,
INSD:EL117842.1,INSD:ES087981.1,INSD:DR239965.1,
INSD:DR239982.1,INSD:EL221265.1,INSD:EH977291.1,
INSD:EH896939.1,INSD:DR239997.1,INSD:ES053354.1,
INSD:EL189071.1,INSD:AV803311.1,INSD:EH807418.1,
INSD:AV567576.1,INSD:EL209071.1,INSD:EL288505.1,
INSD:DR239942.1,INSD:DR239944.1,INSD:DR239989.1,
INSD:AV804977.1,INSD:DR240048.1,INSD:ES167648.1,
INSD:DR239994.1,INSD:EH869387.1,INSD:EL120705.1,
INSD:EL053314.1,INSD:EH920069.1,INSD:DR239979.1,
INSD:EL272940.1,INSD:DR239969.1,INSD:BP835750.1,
INSD:ES108414.1,INSD:EH980858.1,INSD:DR240051.1,
INSD:EL245739.1,INSD:ES113788.1,INSD:DR239990.1,
INSD:EL155703.1,INSD:ES085687.1,INSD:EL968539.1,
INSD:EL079636.1,INSD:ES123008.1,INSD:EL225588.1,
INSD:DR240056.1,INSD:EL126379.1,INSD:BP656778.1,
INSD:ES141532.1,INSD:EL985518.1,INSD:ES083504.1,
INSD:AV785732.1,INSD:BP578029.1,INSD:DR240023.1,
INSD:BP780814.1,INSD:EL990310.1,INSD:ES119028.1,
INSD:ES167803.1,INSD:ES214350.1,INSD:EL179369.1,
INSD:DR240004.1,INSD:ES108983.1,INSD:EL222654.1,
INSD:DR239955.1,INSD:DR239998.1,INSD:ES044098.1,
INSD:DR239945.1,INSD:EL005956.1,INSD:EL170875.1,
INSD:EL257748.1,INSD:ES105819.1,INSD:EL989602.1,
INSD:EL173702.1,INSD:EH853731.1,INSD:ES035385.1,
INSD:DR381979.1,INSD:ES193144.1,INSD:DR239940.1,
INSD:ES106322.1,INSD:DR239949.1,INSD:ES081033.1,
INSD:ES153534.1,INSD:EL155615.1,INSD:EL087241.1,
INSD:DR240002.1,INSD:ES154419.1,INSD:ES089655.1,
INSD:EL310922.1,INSD:ES211805.1,INSD:ES117156.1,
INSD:BP793537.1,INSD:BP816054.1,INSD:DR239963.1,
INSD:ES211015.1,INSD:DR239985.1,INSD:ES158694.1,
INSD:DR239948.1,INSD:DR240043.1,INSD:EH841933.1,
INSD:EH887070.1,INSD:DR240019.1,INSD:ES071380.1,
INSD:EL987517.1,INSD:EL318553.1,INSD:EL970321.1,
INSD:EH867180.1,INSD:EL985394.1,INSD:EH889106.1,
INSD:ES199000.1,INSD:EH891517.1,INSD:DR239931.1,
INSD:ES103820.1,INSD:DR239971.1,INSD:EL178869.1,
INSD:ES022105.1,INSD:ES013830.1,INSD:EL300753.1,
INSD:DR239930.1,INSD:CB254640.1,INSD:EL173380.1,
INSD:EL996532.1,INSD:ES089427.1,INSD:EL253195.1,
INSD:BP591646.1,INSD:ES147013.1,INSD:ES148310.1,
INSD:ES158748.1,INSD:EL102653.1,INSD:DR239935.1,
INSD:DR240047.1,INSD:BP626749.1,INSD:EH860507.1,
INSD:ES186365.1,INSD:EH889156.1,INSD:ES175872.1,
INSD:EH914457.1,INSD:DR240013.1,INSD:EL253105.1,
INSD:EL046035.1,INSD:BP582873.1,INSD:EH943650.1,
INSD:BP595250.1,INSD:DR240006.1,INSD:EH892045.1,
INSD:EL981777.1,INSD:ES007258.1,INSD:ES047955.1,
INSD:DR240024.1,INSD:BP587871.1,INSD:DR239938.1,
INSD:DR240033.1,INSD:ES102366.1,INSD:ES163647.1,
INSD:DR240054.1,INSD:ES188649.1,INSD:DR239954.1,
INSD:EL334165.1,INSD:DR239976.1,INSD:EL305127.1,
INSD:ES187401.1,INSD:ES182700.1,INSD:ES141273.1,
INSD:ES070104.1,INSD:ES018104.1,INSD:ES022528.1,
INSD:EH853394.1,INSD:EL147213.1,INSD:EL065538.1,
INSD:ES160834.1,INSD:ES024023.1,INSD:DR239932.1,
INSD:BP583403.1,INSD:ES015550.1,INSD:DR240016.1,
INSD:DR240029.1,INSD:BP571901.1,INSD:ES145845.1,
INSD:EG483672.1,INSD:EL991016.1,INSD:DR240034.1,
INSD:DR240038.1,INSD:ES040725.1,INSD:DR240042.1,
INSD:DR240030.1,INSD:EH942480.1,INSD:DR239946.1,
INSD:BP567837.1,INSD:DR240011.1,INSD:DR239947.1,
INSD:EL137142.1,INSD:ES099243.1,INSD:ES209912.1,
INSD:ES030724.1,INSD:BP649593.1,INSD:EH875036.1,
INSD:BP597059.1,INSD:EH955652.1,INSD:DR239977.1,
INSD:DR239991.1,INSD:EL288634.1,INSD:BP624316.1,
INSD:ES073426.1,INSD:ES209996.1,INSD:ES040265.1,
INSD:ES201710.1,INSD:ES092945.1,INSD:ES048350.1,
INSD:DR240052.1,INSD:EH935385.1,INSD:ES082206.1,
INSD:EL203249.1,INSD:ES012109.1,INSD:EG493690.1,
INSD:ES128972.1,INSD:EH812879.1,INSD:ES009704.1,
INSD:EL036126.1,INSD:ES078905.1,INSD:EH833979.1,
INSD:ES100596.1,INSD:DR239960.1,INSD:BP651780.1,
INSD:EL009698.1,INSD:DR240003.1,INSD:EH840697.1,
INSD:DR240049.1,INSD:EL037433.1,INSD:ES111389.1,
INSD:EH912812.1,INSD:ES180734.1,INSD:EH835957.1,
INSD:DR376724.1,INSD:BP830062.1,INSD:ES118125.1,
INSD:EH925497.1,INSD:EL062829.1,INSD:EL222586.1,
INSD:EL187049.1,INSD:EL215022.1,INSD:EL213665.1,
INSD:BP826457.1,INSD:ES042959.1,INSD:EL104881.1,
INSD:AV826100.1,INSD:ES149142.1,INSD:ES098327.1,
INSD:EH968999.1,INSD:EL271313.1,INSD:EL178129.1,
INSD:EL316086.1,INSD:ES098835.1,INSD:ES037715.1,
INSD:ES127952.1,INSD:EL066250.1,INSD:EL284677.1,
INSD:ES195759.1,INSD:EG483660.1,INSD:EL994660.1,
INSD:BP655455.1,INSD:ES083238.1,INSD:DR239933.1,
INSD:BP823812.1,INSD:ES034240.1,INSD:EL043713.1,
INSD:BP824202.1,INSD:EL321867.1,INSD:ES128606.1,
INSD:EL990970.1,INSD:EL150208.1,INSD:EH970045.1,
INSD:ES007867.1,INSD:DR239999.1,INSD:ES141982.1,
INSD:DR239972.1,INSD:EL019007.1,INSD:EL206032.1,
INSD:ES140221.1,INSD:DR240022.1,INSD:EL968272.1,
INSD:EL070369.1,INSD:EH795999.1,INSD:ES208178.1,
INSD:EL981051.1,INSD:DR378047.1,INSD:DR240059.1,
INSD:EH833173.1,INSD:F20036.1,INSD:EH961792.1,
INSD:ES045608.1,INSD:ES038482.1,INSD:AV527050.1,
INSD:ES047599.1,INSD:EH872162.1,INSD:ES083085.1,
INSD:EH890395.1,INSD:EH809472.1,INSD:EH863730.1,
INSD:EH945630.1,INSD:ES165853.1,INSD:EL061924.1,
INSD:DR240050.1,INSD:DR240021.1,INSD:EL191305.1,
INSD:EH813959.1,INSD:EH939901.1,INSD:DR239975.1,
INSD:EL298717.1,INSD:EL999064.1,INSD:DR240001.1,
INSD:BP811790.1,INSD:ES173302.1,INSD:DR239952.1,
INSD:BP628606.1,INSD:EL240032.1,INSD:ES035439.1,
INSD:EH890456.1,INSD:EL046486.1,INSD:DR240008.1,
INSD:EL137967.1,INSD:DR240010.1,INSD:EL279333.1,
INSD:DR240039.1,INSD:EH923148.1,INSD:ES160012.1,
INSD:EL220556.1,INSD:EH933453.1,INSD:ES157061.1,
INSD:EL046106.1,INSD:ES130715.1,INSD:EH924004.1,
INSD:BP814764.1,INSD:ES212512.1,INSD:DR239934.1,
INSD:ES078752.1,INSD:EL020393.1,INSD:EL242958.1,
INSD:EH853047.1,INSD:EH983978.1,INSD:ES138878.1,
INSD:EL086309.1,INSD:BP626970.1,INSD:ES207210.1,
INSD:DR239953.1,INSD:BP820182.1,INSD:EH863802.1,
INSD:EL312521.1,INSD:BP799086.1,INSD:ES063591.1,
INSD:BP657971.1,INSD:ES106832.1,INSD:EL983033.1,
INSD:DR239996.1,INSD:ES060358.1,INSD:EL313057.1,
INSD:ES207488.1,INSD:DR240020.1,INSD:EH929604.1,
INSD:DR239987.1,INSD:EL255923.1,INSD:T46549.1,
INSD:ES199682.1,INSD:DR240041.1,INSD:EG493691.1,
INSD:EL253053.1,INSD:EL053616.1,INSD:ES008737.1,
INSD:BP825307.1,INSD:BP655245.1,INSD:EL135335.1,
INSD:DR239974.1,INSD:EH993200.1,INSD:DR240012.1,
INSD:DR378105.1,INSD:EG483670.1,INSD:BP786509.1,
INSD:DR239981.1,INSD:AV815475.1,INSD:EL291607.1,
INSD:EL016527.1,INSD:EL035896.1,INSD:EL213462.1,
INSD:EL097624.1,INSD:ES208608.1,INSD:ES186056.1,
INSD:BP653595.1,INSD:EL993127.1,INSD:DR239950.1,
INSD:CB254644.1,INSD:DR239967.1,INSD:ES142972.1,
INSD:ES036639.1,INSD:ES109415.1,INSD:ES090991.1,
INSD:EH981269.1,INSD:EH913051.1,INSD:DR240015.1,
INSD:EL024535.1,INSD:ES132170.1,INSD:BP668346.1,
INSD:ES181801.1,INSD:EL282101.1,INSD:EL976565.1,
INSD:EL070644.1,INSD:EG493693.1,INSD:EL207222.1,
INSD:EL004521.1,INSD:DR239962.1,INSD:EL206349.1,
INSD:BP567522.1,INSD:DR239968.1,INSD:ES020107.1,
INSD:EH813512.1,INSD:ES099531.1,INSD:DR240040.1,
INSD:EH905963.1,INSD:EL178952.1,INSD:DR240014.1,
INSD:DR239957.1,INSD:EH816635.1,INSD:BP816869.1,
INSD:DR239943.1,INSD:ES033858.1,INSD:EL980585.1,
INSD:EG493694.1,INSD:ES064670.1,INSD:DR240057.1,
INSD:ES069542.1,INSD:EH916192.1,INSD:EH924847.1,
INSD:BP819140.1,INSD:DR239956.1,INSD:EL277255.1,
INSD:EL296926.1,INSD:ES053869.1,INSD:EL046359.1,
INSD:DR239939.1,INSD:EL071715.1,INSD:ES200965.1,
INSD:ES048694.1,INSD:EL146769.1,INSD:EL004039.1,
INSD:ES158783.1,INSD:BP582705.1,INSD:ES040234.1,
INSD:ES201397.1,INSD:ES043664.1,INSD:EL243532.1,
INSD:ES081114.1,INSD:EG458662.1,INSD:DR239958.1,
INSD:EG483650.1,INSD:EL201648.1,INSD:EL213153.1,
INSD:EH966997.1,INSD:BP640457.1,INSD:ES190618.1,
INSD:BE526351.1,INSD:ES162523.1,INSD:ES036627.1,
INSD:EH886731.1,INSD:ES194176.1,INSD:EH971497.1,
INSD:EL971133.1,INSD:EL219772.1,INSD:DR240045.1,
INSD:DR239980.1,INSD:ES156626.1,INSD:EL247352.1,
INSD:DR239937.1,INSD:EH892089.1,INSD:EH940523.1,
INSD:DR240028.1,INSD:EL975109.1,INSD:ES129429.1,
INSD:ES208475.1,INSD:ES092615.1,INSD:ES154986.1,
INSD:ES144360.1,INSD:EH894083.1,INSD:ES173975.1,
INSD:BP658120.1,INSD:DR239988.1,INSD:ES215532.1,
INSD:ES032452.1,INSD:ES044699.1,INSD:DR239992.1,
INSD:EG483664.1,INSD:BP565549.1,INSD:ES148995.1,
INSD:ES021095.1,INSD:DR240037.1,INSD:BP665229.1,
INSD:EL989603.1,INSD:EL289292.1,INSD:EH893074.1,
INSD:DR239964.1,INSD:EH984660.1,INSD:ES068924.1,
INSD:BP815010.1,INSD:ES186375.1,INSD:ES011337.1,
INSD:EL296286.1,INSD:DR239959.1,INSD:ES166747.1,
INSD:DR240025.1,INSD:DR240007.1,INSD:ES186445.1,
INSD:EL226314.1,INSD:DR232273.1,INSD:ES059616.1,
INSD:DR240055.1,INSD:BP831178.1,INSD:EH805074.1,
INSD:ES184658.1,INSD:ES166344.1,INSD:EL164070.1,
INSD:ES053304.1,INSD:BP789436.1,INSD:EL990592.1,
INSD:ES132971.1,INSD:EL085965.1,INSD:ES008865.1,
INSD:AV520645.1,INSD:DR240018.1,INSD:EH833002.1,
INSD:EH965936.1,INSD:ES100275.1,INSD:ES006125.1,
INSD:ES149683.1,INSD:EL071530.1,INSD:ES019525.1,
INSD:EH899530.1,INSD:AV818946.1,INSD:BP822449.1,
INSD:ES172103.1,INSD:EL259810.1,INSD:AV793577.1,
INSD:EH907422.1,INSD:EH987677.1,INSD:ES104799.1,
INSD:ES195775.1,INSD:BP657550.1,INSD:EL059737.1,
INSD:EH994007.1,INSD:DR239941.1,INSD:EG483649.1,
INSD:ES149584.1,INSD:EL988183.1,INSD:ES010572.1,
INSD:ES190476.1,INSD:EL065540.1,INSD:ES093253.1,
INSD:EL097907.1,INSD:AV786871.1,INSD:EL117132.1,
INSD:EH944844.1,INSD:DR240027.1,INSD:EL981068.1,
INSD:DR239970.1,INSD:EL280150.1,INSD:DR377643.1,
INSD:BP803199.1,INSD:CB264173.1,INSD:EH943977.1,
INSD:DR239993.1,INSD:EL215831.1,INSD:EL197525.1,
INSD:EL023141.1,INSD:ES041795.1,INSD:DR240058.1,
INSD:EL206628.1,INSD:EH891521.1,INSD:EL116010.1,
INSD:DR240036.1,INSD:EL151793.1,INSD:ES041597.1,
INSD:EL999457.1,INSD:EL284730.1,INSD:BP649727.1,
INSD:EL271583.1,INSD:DR240046.1,INSD:ES080490.1,
INSD:DR239936.1,INSD:EH956261.1,INSD:DR240044.1,
INSD:EH954640.1,INSD:BP797013.1,INSD:DR239995.1,
INSD:DR372712.1,INSD:ES027237.1,INSD:ES078205.1,
INSD:DR239973.1,INSD:EL092469.1,INSD:ES175921.1,
INSD:EL984945.1,INSD:EH848826.1,INSD:ES186678.1,
INSD:DR240035.1,INSD:DR239984.1,INSD:BP798009.1,
INSD:DR239961.1,INSD:DR240031.1,INSD:EL013961.1,
INSD:EL318047.1,INSD:EH869030.1,INSD:EL061642.1,
INSD:ES145960.1,INSD:EL114699.1,INSD:ES003617.1,
INSD:DR239966.1,INSD:EL339209.1,INSD:EL140171.1,
INSD:ES108038.1,INSD:EL341362.1,INSD:EL251161.1,
INSD:EH981530.1,INSD:ES076515.1,INSD:EH875852.1,
INSD:EH889045.1,INSD:EL284779.1,INSD:BP570533.1,
INSD:ES034238.1,INSD:DR239951.1,INSD:ES093551.1,
INSD:ES153227.1,INSD:ES145282.1,INSD:EL190428.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY085726.1,INSD:AY133561.1,INSD:AY048250.1"
/note="Ribosomal protein S5 family protein; FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome; INVOLVED IN:
translation; LOCATED IN: cytosolic small ribosomal
subunit, cytosolic ribosome, nucleolus, membrane;
EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal
protein S5, eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR005711),
Ribosomal protein S5, N-terminal (InterPro:IPR013810),
Double-stranded RNA-binding-like (InterPro:IPR014720),
Ribosomal protein S5, C-terminal (InterPro:IPR005324),
Ribosomal protein S5 domain 2-type fold
(InterPro:IPR020568), Ribosomal protein S5
(InterPro:IPR000851), Ribosomal protein S5 domain 2-type
fold, subgroup (InterPro:IPR014721), Ribosomal protein S5,
N-terminal, conserved site (InterPro:IPR018192); BEST
Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein
S5 family protein (TAIR:AT1G59359.1); Has 11596 Blast hits
to 10181 proteins in 2924 species: Archae - 262; Bacteria
- 5281; Metazoa - 2114; Fungi - 831; Plants - 413; Viruses
- 20; Other Eukaryotes - 2675 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G41840"
/db_xref="TAIR:AT2G41840"
intron_pos 233:0 (1/1)
BEGIN
1 MAERGGERGV ERGGERGDFG RGFGGRGGRG DRGGRGRGGR GGRRGGRASE EEKWVPVTKL
61 GRLVAAGHIK QIEQIYLHSL PVKEYQIIDM LIGPTLKDEV MKIMPVQKQT RAGQRTRFKA
121 FVVVGDGNGH VGLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSVVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG
181 KCGSVTVRMV PAPRGSGIVA ARVPKKVLQF AGIDDVFTSS RGSTKTLGNF VKATFDCLQK
241 TYGFLTPEFW KETRFSRSPY QEHTDFLASK ALSTSKPDPV VEDQA
//