LOCUS AEC10039.1 285 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana Ribosomal protein S5 family protein protein. ACCESSION CP002685-6360 PROTEIN_ID AEC10039.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D., Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V., Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L., Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L., Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H., Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D., Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and Venter,J.C. TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999) PUBMED 10617197 REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="2" /ecotype="Columbia" protein /locus_tag="AT2G41840" /gene_synonym="T11A7.6" /gene_synonym="T11A7_6" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:DR240017.1,INSD:EL125289.1,INSD:EH853338.1, INSD:EL094074.1,INSD:EH845195.1,INSD:EH853255.1, INSD:EL982779.1,INSD:ES076349.1,INSD:ES041166.1, INSD:EL134264.1,INSD:EH905408.1,INSD:EL996564.1, INSD:DR239986.1,INSD:BP578337.1,INSD:ES196954.1, INSD:DR240009.1,INSD:ES193573.1,INSD:BP573995.1, INSD:EL062704.1,INSD:DR240000.1,INSD:DR240005.1, INSD:DR224889.1,INSD:ES020735.1,INSD:EL218124.1, INSD:EH994343.1,INSD:EH991572.1,INSD:DR240026.1, INSD:EH804213.1,INSD:DR239978.1,INSD:BP801295.1, INSD:DR240053.1,INSD:EL260746.1,INSD:EL318037.1, INSD:T04538.1,INSD:EL237733.1,INSD:DR240032.1, INSD:BP812100.1,INSD:BP829706.1,INSD:DR239983.1, INSD:ES107410.1,INSD:EH902610.1,INSD:ES140933.1, INSD:BP818106.1,INSD:EH797446.1,INSD:EH849589.1, INSD:EH876661.1,INSD:EL994094.1,INSD:CF651912.1, INSD:EL117842.1,INSD:ES087981.1,INSD:DR239965.1, INSD:DR239982.1,INSD:EL221265.1,INSD:EH977291.1, INSD:EH896939.1,INSD:DR239997.1,INSD:ES053354.1, INSD:EL189071.1,INSD:AV803311.1,INSD:EH807418.1, INSD:AV567576.1,INSD:EL209071.1,INSD:EL288505.1, INSD:DR239942.1,INSD:DR239944.1,INSD:DR239989.1, INSD:AV804977.1,INSD:DR240048.1,INSD:ES167648.1, INSD:DR239994.1,INSD:EH869387.1,INSD:EL120705.1, INSD:EL053314.1,INSD:EH920069.1,INSD:DR239979.1, INSD:EL272940.1,INSD:DR239969.1,INSD:BP835750.1, INSD:ES108414.1,INSD:EH980858.1,INSD:DR240051.1, INSD:EL245739.1,INSD:ES113788.1,INSD:DR239990.1, INSD:EL155703.1,INSD:ES085687.1,INSD:EL968539.1, INSD:EL079636.1,INSD:ES123008.1,INSD:EL225588.1, INSD:DR240056.1,INSD:EL126379.1,INSD:BP656778.1, INSD:ES141532.1,INSD:EL985518.1,INSD:ES083504.1, INSD:AV785732.1,INSD:BP578029.1,INSD:DR240023.1, INSD:BP780814.1,INSD:EL990310.1,INSD:ES119028.1, INSD:ES167803.1,INSD:ES214350.1,INSD:EL179369.1, INSD:DR240004.1,INSD:ES108983.1,INSD:EL222654.1, INSD:DR239955.1,INSD:DR239998.1,INSD:ES044098.1, INSD:DR239945.1,INSD:EL005956.1,INSD:EL170875.1, INSD:EL257748.1,INSD:ES105819.1,INSD:EL989602.1, INSD:EL173702.1,INSD:EH853731.1,INSD:ES035385.1, INSD:DR381979.1,INSD:ES193144.1,INSD:DR239940.1, INSD:ES106322.1,INSD:DR239949.1,INSD:ES081033.1, INSD:ES153534.1,INSD:EL155615.1,INSD:EL087241.1, INSD:DR240002.1,INSD:ES154419.1,INSD:ES089655.1, INSD:EL310922.1,INSD:ES211805.1,INSD:ES117156.1, INSD:BP793537.1,INSD:BP816054.1,INSD:DR239963.1, INSD:ES211015.1,INSD:DR239985.1,INSD:ES158694.1, INSD:DR239948.1,INSD:DR240043.1,INSD:EH841933.1, INSD:EH887070.1,INSD:DR240019.1,INSD:ES071380.1, INSD:EL987517.1,INSD:EL318553.1,INSD:EL970321.1, INSD:EH867180.1,INSD:EL985394.1,INSD:EH889106.1, INSD:ES199000.1,INSD:EH891517.1,INSD:DR239931.1, INSD:ES103820.1,INSD:DR239971.1,INSD:EL178869.1, INSD:ES022105.1,INSD:ES013830.1,INSD:EL300753.1, INSD:DR239930.1,INSD:CB254640.1,INSD:EL173380.1, INSD:EL996532.1,INSD:ES089427.1,INSD:EL253195.1, INSD:BP591646.1,INSD:ES147013.1,INSD:ES148310.1, INSD:ES158748.1,INSD:EL102653.1,INSD:DR239935.1, INSD:DR240047.1,INSD:BP626749.1,INSD:EH860507.1, INSD:ES186365.1,INSD:EH889156.1,INSD:ES175872.1, INSD:EH914457.1,INSD:DR240013.1,INSD:EL253105.1, INSD:EL046035.1,INSD:BP582873.1,INSD:EH943650.1, INSD:BP595250.1,INSD:DR240006.1,INSD:EH892045.1, INSD:EL981777.1,INSD:ES007258.1,INSD:ES047955.1, INSD:DR240024.1,INSD:BP587871.1,INSD:DR239938.1, INSD:DR240033.1,INSD:ES102366.1,INSD:ES163647.1, INSD:DR240054.1,INSD:ES188649.1,INSD:DR239954.1, INSD:EL334165.1,INSD:DR239976.1,INSD:EL305127.1, INSD:ES187401.1,INSD:ES182700.1,INSD:ES141273.1, INSD:ES070104.1,INSD:ES018104.1,INSD:ES022528.1, INSD:EH853394.1,INSD:EL147213.1,INSD:EL065538.1, INSD:ES160834.1,INSD:ES024023.1,INSD:DR239932.1, INSD:BP583403.1,INSD:ES015550.1,INSD:DR240016.1, INSD:DR240029.1,INSD:BP571901.1,INSD:ES145845.1, INSD:EG483672.1,INSD:EL991016.1,INSD:DR240034.1, INSD:DR240038.1,INSD:ES040725.1,INSD:DR240042.1, INSD:DR240030.1,INSD:EH942480.1,INSD:DR239946.1, INSD:BP567837.1,INSD:DR240011.1,INSD:DR239947.1, INSD:EL137142.1,INSD:ES099243.1,INSD:ES209912.1, INSD:ES030724.1,INSD:BP649593.1,INSD:EH875036.1, INSD:BP597059.1,INSD:EH955652.1,INSD:DR239977.1, INSD:DR239991.1,INSD:EL288634.1,INSD:BP624316.1, INSD:ES073426.1,INSD:ES209996.1,INSD:ES040265.1, INSD:ES201710.1,INSD:ES092945.1,INSD:ES048350.1, INSD:DR240052.1,INSD:EH935385.1,INSD:ES082206.1, INSD:EL203249.1,INSD:ES012109.1,INSD:EG493690.1, INSD:ES128972.1,INSD:EH812879.1,INSD:ES009704.1, INSD:EL036126.1,INSD:ES078905.1,INSD:EH833979.1, INSD:ES100596.1,INSD:DR239960.1,INSD:BP651780.1, INSD:EL009698.1,INSD:DR240003.1,INSD:EH840697.1, INSD:DR240049.1,INSD:EL037433.1,INSD:ES111389.1, INSD:EH912812.1,INSD:ES180734.1,INSD:EH835957.1, INSD:DR376724.1,INSD:BP830062.1,INSD:ES118125.1, INSD:EH925497.1,INSD:EL062829.1,INSD:EL222586.1, INSD:EL187049.1,INSD:EL215022.1,INSD:EL213665.1, INSD:BP826457.1,INSD:ES042959.1,INSD:EL104881.1, INSD:AV826100.1,INSD:ES149142.1,INSD:ES098327.1, INSD:EH968999.1,INSD:EL271313.1,INSD:EL178129.1, INSD:EL316086.1,INSD:ES098835.1,INSD:ES037715.1, INSD:ES127952.1,INSD:EL066250.1,INSD:EL284677.1, INSD:ES195759.1,INSD:EG483660.1,INSD:EL994660.1, INSD:BP655455.1,INSD:ES083238.1,INSD:DR239933.1, INSD:BP823812.1,INSD:ES034240.1,INSD:EL043713.1, INSD:BP824202.1,INSD:EL321867.1,INSD:ES128606.1, INSD:EL990970.1,INSD:EL150208.1,INSD:EH970045.1, INSD:ES007867.1,INSD:DR239999.1,INSD:ES141982.1, INSD:DR239972.1,INSD:EL019007.1,INSD:EL206032.1, INSD:ES140221.1,INSD:DR240022.1,INSD:EL968272.1, INSD:EL070369.1,INSD:EH795999.1,INSD:ES208178.1, INSD:EL981051.1,INSD:DR378047.1,INSD:DR240059.1, INSD:EH833173.1,INSD:F20036.1,INSD:EH961792.1, INSD:ES045608.1,INSD:ES038482.1,INSD:AV527050.1, INSD:ES047599.1,INSD:EH872162.1,INSD:ES083085.1, INSD:EH890395.1,INSD:EH809472.1,INSD:EH863730.1, INSD:EH945630.1,INSD:ES165853.1,INSD:EL061924.1, INSD:DR240050.1,INSD:DR240021.1,INSD:EL191305.1, INSD:EH813959.1,INSD:EH939901.1,INSD:DR239975.1, INSD:EL298717.1,INSD:EL999064.1,INSD:DR240001.1, INSD:BP811790.1,INSD:ES173302.1,INSD:DR239952.1, INSD:BP628606.1,INSD:EL240032.1,INSD:ES035439.1, INSD:EH890456.1,INSD:EL046486.1,INSD:DR240008.1, INSD:EL137967.1,INSD:DR240010.1,INSD:EL279333.1, INSD:DR240039.1,INSD:EH923148.1,INSD:ES160012.1, INSD:EL220556.1,INSD:EH933453.1,INSD:ES157061.1, INSD:EL046106.1,INSD:ES130715.1,INSD:EH924004.1, INSD:BP814764.1,INSD:ES212512.1,INSD:DR239934.1, INSD:ES078752.1,INSD:EL020393.1,INSD:EL242958.1, INSD:EH853047.1,INSD:EH983978.1,INSD:ES138878.1, INSD:EL086309.1,INSD:BP626970.1,INSD:ES207210.1, INSD:DR239953.1,INSD:BP820182.1,INSD:EH863802.1, INSD:EL312521.1,INSD:BP799086.1,INSD:ES063591.1, INSD:BP657971.1,INSD:ES106832.1,INSD:EL983033.1, INSD:DR239996.1,INSD:ES060358.1,INSD:EL313057.1, INSD:ES207488.1,INSD:DR240020.1,INSD:EH929604.1, INSD:DR239987.1,INSD:EL255923.1,INSD:T46549.1, INSD:ES199682.1,INSD:DR240041.1,INSD:EG493691.1, INSD:EL253053.1,INSD:EL053616.1,INSD:ES008737.1, INSD:BP825307.1,INSD:BP655245.1,INSD:EL135335.1, INSD:DR239974.1,INSD:EH993200.1,INSD:DR240012.1, INSD:DR378105.1,INSD:EG483670.1,INSD:BP786509.1, INSD:DR239981.1,INSD:AV815475.1,INSD:EL291607.1, INSD:EL016527.1,INSD:EL035896.1,INSD:EL213462.1, INSD:EL097624.1,INSD:ES208608.1,INSD:ES186056.1, INSD:BP653595.1,INSD:EL993127.1,INSD:DR239950.1, INSD:CB254644.1,INSD:DR239967.1,INSD:ES142972.1, INSD:ES036639.1,INSD:ES109415.1,INSD:ES090991.1, INSD:EH981269.1,INSD:EH913051.1,INSD:DR240015.1, INSD:EL024535.1,INSD:ES132170.1,INSD:BP668346.1, INSD:ES181801.1,INSD:EL282101.1,INSD:EL976565.1, INSD:EL070644.1,INSD:EG493693.1,INSD:EL207222.1, INSD:EL004521.1,INSD:DR239962.1,INSD:EL206349.1, INSD:BP567522.1,INSD:DR239968.1,INSD:ES020107.1, INSD:EH813512.1,INSD:ES099531.1,INSD:DR240040.1, INSD:EH905963.1,INSD:EL178952.1,INSD:DR240014.1, INSD:DR239957.1,INSD:EH816635.1,INSD:BP816869.1, INSD:DR239943.1,INSD:ES033858.1,INSD:EL980585.1, INSD:EG493694.1,INSD:ES064670.1,INSD:DR240057.1, INSD:ES069542.1,INSD:EH916192.1,INSD:EH924847.1, INSD:BP819140.1,INSD:DR239956.1,INSD:EL277255.1, INSD:EL296926.1,INSD:ES053869.1,INSD:EL046359.1, INSD:DR239939.1,INSD:EL071715.1,INSD:ES200965.1, INSD:ES048694.1,INSD:EL146769.1,INSD:EL004039.1, INSD:ES158783.1,INSD:BP582705.1,INSD:ES040234.1, INSD:ES201397.1,INSD:ES043664.1,INSD:EL243532.1, INSD:ES081114.1,INSD:EG458662.1,INSD:DR239958.1, INSD:EG483650.1,INSD:EL201648.1,INSD:EL213153.1, INSD:EH966997.1,INSD:BP640457.1,INSD:ES190618.1, INSD:BE526351.1,INSD:ES162523.1,INSD:ES036627.1, INSD:EH886731.1,INSD:ES194176.1,INSD:EH971497.1, INSD:EL971133.1,INSD:EL219772.1,INSD:DR240045.1, INSD:DR239980.1,INSD:ES156626.1,INSD:EL247352.1, INSD:DR239937.1,INSD:EH892089.1,INSD:EH940523.1, INSD:DR240028.1,INSD:EL975109.1,INSD:ES129429.1, INSD:ES208475.1,INSD:ES092615.1,INSD:ES154986.1, INSD:ES144360.1,INSD:EH894083.1,INSD:ES173975.1, INSD:BP658120.1,INSD:DR239988.1,INSD:ES215532.1, INSD:ES032452.1,INSD:ES044699.1,INSD:DR239992.1, INSD:EG483664.1,INSD:BP565549.1,INSD:ES148995.1, INSD:ES021095.1,INSD:DR240037.1,INSD:BP665229.1, INSD:EL989603.1,INSD:EL289292.1,INSD:EH893074.1, INSD:DR239964.1,INSD:EH984660.1,INSD:ES068924.1, INSD:BP815010.1,INSD:ES186375.1,INSD:ES011337.1, INSD:EL296286.1,INSD:DR239959.1,INSD:ES166747.1, INSD:DR240025.1,INSD:DR240007.1,INSD:ES186445.1, INSD:EL226314.1,INSD:DR232273.1,INSD:ES059616.1, INSD:DR240055.1,INSD:BP831178.1,INSD:EH805074.1, INSD:ES184658.1,INSD:ES166344.1,INSD:EL164070.1, INSD:ES053304.1,INSD:BP789436.1,INSD:EL990592.1, INSD:ES132971.1,INSD:EL085965.1,INSD:ES008865.1, INSD:AV520645.1,INSD:DR240018.1,INSD:EH833002.1, INSD:EH965936.1,INSD:ES100275.1,INSD:ES006125.1, INSD:ES149683.1,INSD:EL071530.1,INSD:ES019525.1, INSD:EH899530.1,INSD:AV818946.1,INSD:BP822449.1, INSD:ES172103.1,INSD:EL259810.1,INSD:AV793577.1, INSD:EH907422.1,INSD:EH987677.1,INSD:ES104799.1, INSD:ES195775.1,INSD:BP657550.1,INSD:EL059737.1, INSD:EH994007.1,INSD:DR239941.1,INSD:EG483649.1, INSD:ES149584.1,INSD:EL988183.1,INSD:ES010572.1, INSD:ES190476.1,INSD:EL065540.1,INSD:ES093253.1, INSD:EL097907.1,INSD:AV786871.1,INSD:EL117132.1, INSD:EH944844.1,INSD:DR240027.1,INSD:EL981068.1, INSD:DR239970.1,INSD:EL280150.1,INSD:DR377643.1, INSD:BP803199.1,INSD:CB264173.1,INSD:EH943977.1, INSD:DR239993.1,INSD:EL215831.1,INSD:EL197525.1, INSD:EL023141.1,INSD:ES041795.1,INSD:DR240058.1, INSD:EL206628.1,INSD:EH891521.1,INSD:EL116010.1, INSD:DR240036.1,INSD:EL151793.1,INSD:ES041597.1, INSD:EL999457.1,INSD:EL284730.1,INSD:BP649727.1, INSD:EL271583.1,INSD:DR240046.1,INSD:ES080490.1, INSD:DR239936.1,INSD:EH956261.1,INSD:DR240044.1, INSD:EH954640.1,INSD:BP797013.1,INSD:DR239995.1, INSD:DR372712.1,INSD:ES027237.1,INSD:ES078205.1, INSD:DR239973.1,INSD:EL092469.1,INSD:ES175921.1, INSD:EL984945.1,INSD:EH848826.1,INSD:ES186678.1, INSD:DR240035.1,INSD:DR239984.1,INSD:BP798009.1, INSD:DR239961.1,INSD:DR240031.1,INSD:EL013961.1, INSD:EL318047.1,INSD:EH869030.1,INSD:EL061642.1, INSD:ES145960.1,INSD:EL114699.1,INSD:ES003617.1, INSD:DR239966.1,INSD:EL339209.1,INSD:EL140171.1, INSD:ES108038.1,INSD:EL341362.1,INSD:EL251161.1, INSD:EH981530.1,INSD:ES076515.1,INSD:EH875852.1, INSD:EH889045.1,INSD:EL284779.1,INSD:BP570533.1, INSD:ES034238.1,INSD:DR239951.1,INSD:ES093551.1, INSD:ES153227.1,INSD:ES145282.1,INSD:EL190428.1" /inference="similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AY085726.1,INSD:AY133561.1,INSD:AY048250.1" /note="Ribosomal protein S5 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: cytosolic small ribosomal subunit, cytosolic ribosome, nucleolus, membrane; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR005711), Ribosomal protein S5, N-terminal (InterPro:IPR013810), Double-stranded RNA-binding-like (InterPro:IPR014720), Ribosomal protein S5, C-terminal (InterPro:IPR005324), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), Ribosomal protein S5 (InterPro:IPR000851), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup (InterPro:IPR014721), Ribosomal protein S5, N-terminal, conserved site (InterPro:IPR018192); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S5 family protein (TAIR:AT1G59359.1); Has 11596 Blast hits to 10181 proteins in 2924 species: Archae - 262; Bacteria - 5281; Metazoa - 2114; Fungi - 831; Plants - 413; Viruses - 20; Other Eukaryotes - 2675 (source: NCBI BLink)." /db_xref="Araport:AT2G41840" /db_xref="TAIR:AT2G41840" intron_pos 233:0 (1/1) BEGIN 1 MAERGGERGV ERGGERGDFG RGFGGRGGRG DRGGRGRGGR GGRRGGRASE EEKWVPVTKL 61 GRLVAAGHIK QIEQIYLHSL PVKEYQIIDM LIGPTLKDEV MKIMPVQKQT RAGQRTRFKA 121 FVVVGDGNGH VGLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSVVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG 181 KCGSVTVRMV PAPRGSGIVA ARVPKKVLQF AGIDDVFTSS RGSTKTLGNF VKATFDCLQK 241 TYGFLTPEFW KETRFSRSPY QEHTDFLASK ALSTSKPDPV VEDQA //