LOCUS AEC08194.1 257 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana expansin A6 protein.
ACCESSION CP002685-3842
PROTEIN_ID AEC08194.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="EXPA6"
/locus_tag="AT2G28950"
/gene_synonym="ARABIDOPSIS THALIANA TEXPANSIN 6"
/gene_synonym="ATEXP6"
/gene_synonym="ATEXPA6"
/gene_synonym="ATHEXP ALPHA 1.8"
/gene_synonym="expansin A6"
/gene_synonym="T9I4.3"
/gene_synonym="T9I4_3"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR346211.1,INSD:EL315781.1,INSD:EL302306.1,
INSD:DR346199.1,INSD:DR346261.1,INSD:ES169062.1,
INSD:EL036095.1,INSD:ES203995.1,INSD:EL074744.1,
INSD:EL009899.1,INSD:DR346267.1,INSD:EH941200.1,
INSD:ES181608.1,INSD:BP843374.1,INSD:BP668314.1,
INSD:EH927182.1,INSD:DR346190.1,INSD:DR362684.1,
INSD:DR346189.1,INSD:ES189338.1,INSD:ES109167.1,
INSD:EH880351.1,INSD:EL019064.1,INSD:AA712555.1,
INSD:EL213149.1,INSD:DR346236.1,INSD:DR346208.1,
INSD:AV827006.1,INSD:EH946044.1,INSD:DR346243.1,
INSD:DR346221.1,INSD:EH933853.1,INSD:ES109030.1,
INSD:ES064953.1,INSD:DR346252.1,INSD:EG456588.1,
INSD:DR346225.1,INSD:EL229191.1,INSD:ES034681.1,
INSD:EL142587.1,INSD:DR346232.1,INSD:DR346241.1,
INSD:DR346195.1,INSD:AV797014.1,INSD:ES210014.1,
INSD:DR346250.1,INSD:BP615906.1,INSD:EL051456.1,
INSD:EH966320.1,INSD:EL994108.1,INSD:DR346238.1,
INSD:DR346207.1,INSD:EH914085.1,INSD:EH985670.1,
INSD:EH825668.1,INSD:ES204174.1,INSD:EL028715.1,
INSD:AV559135.1,INSD:DR346223.1,INSD:DR346240.1,
INSD:DR346206.1,INSD:DR346198.1,INSD:EL218498.1,
INSD:EH801744.1,INSD:EL294874.1,INSD:EL975801.1,
INSD:EH863171.1,INSD:ES058072.1,INSD:DR346229.1,
INSD:DR346266.1,INSD:ES210495.1,INSD:DR346212.1,
INSD:BP605001.1,INSD:DR346215.1,INSD:EL059436.1,
INSD:EH993307.1,INSD:AV566062.1,INSD:EH967158.1,
INSD:AV527137.1,INSD:EL262045.1,INSD:DR346217.1,
INSD:BP829136.1,INSD:DR346259.1,INSD:BP817591.1,
INSD:ES030676.1,INSD:AV561045.1,INSD:EL098995.1,
INSD:DR346222.1,INSD:BP594219.1,INSD:EH875220.1,
INSD:EH879238.1,INSD:EH878722.1,INSD:EL982647.1,
INSD:DR346264.1,INSD:EL056895.1,INSD:ES205158.1,
INSD:DR346244.1,INSD:AV791553.1,INSD:BP849062.1,
INSD:EH929676.1,INSD:ES002578.1,INSD:AV535943.1,
INSD:DR346265.1,INSD:EL298084.1,INSD:DR346268.1,
INSD:ES161806.1,INSD:ES176207.1,INSD:EL123747.1,
INSD:ES079666.1,INSD:DR346201.1,INSD:DR346231.1,
INSD:BP644246.1,INSD:EH909936.1,INSD:CB254698.1,
INSD:DR346210.1,INSD:ES081057.1,INSD:EL026530.1,
INSD:EH954370.1,INSD:EH862553.1,INSD:AV830053.1,
INSD:EL100300.1,INSD:EH798153.1,INSD:EH832810.1,
INSD:DR346187.1,INSD:BP647976.1,INSD:CB264946.1,
INSD:DR346258.1,INSD:AV519980.1,INSD:DR346209.1,
INSD:EL158790.1,INSD:DR346248.1,INSD:EL037720.1,
INSD:EL052405.1,INSD:DR346202.1,INSD:DR346224.1,
INSD:DR346191.1,INSD:DR346196.1,INSD:EL052152.1,
INSD:CB256046.1,INSD:BP807944.1,INSD:EL164160.1,
INSD:ES149644.1,INSD:DR346262.1,INSD:EH908021.1,
INSD:DR346239.1,INSD:EL031864.1,INSD:EL302849.1,
INSD:DR346230.1,INSD:EG456589.1,INSD:AW004534.1,
INSD:DR357380.1,INSD:T45828.1,INSD:DR346269.1,
INSD:EH826383.1,INSD:ES027010.1,INSD:EH832254.1,
INSD:EL188079.1,INSD:DR346197.1,INSD:EH909503.1,
INSD:EL996190.1,INSD:AV560570.1,INSD:BP651011.1,
INSD:AV566065.1,INSD:AV442630.1,INSD:EH940368.1,
INSD:EH938912.1,INSD:DR346257.1,INSD:EL177743.1,
INSD:EL987603.1,INSD:DR346184.1,INSD:EL103020.1,
INSD:AV809817.1,INSD:EL311687.1,INSD:DR346218.1,
INSD:EL273377.1,INSD:EL293819.1,INSD:EL134899.1,
INSD:EH956337.1,INSD:DR346234.1,INSD:AV798655.1,
INSD:EL148999.1,INSD:EL315990.1,INSD:DR377340.1,
INSD:DR346205.1,INSD:EL150326.1,INSD:EL086347.1,
INSD:EH892318.1,INSD:BP635398.1,INSD:EL191932.1,
INSD:DR346204.1,INSD:DR346214.1,INSD:ES201825.1,
INSD:DR346255.1,INSD:ES032770.1,INSD:EL307293.1,
INSD:EL161547.1,INSD:AV791541.1,INSD:DR346247.1,
INSD:ES022875.1,INSD:EH931746.1,INSD:AV563586.1,
INSD:AV522284.1,INSD:EL021842.1,INSD:ES074534.1,
INSD:H35991.1,INSD:DR346233.1,INSD:EG456590.1,
INSD:EL075604.1,INSD:BP661027.1,INSD:BP601419.1,
INSD:EH893225.1,INSD:ES148168.1,INSD:N65153.1,
INSD:BP815304.2,INSD:EH867191.1,INSD:EH948719.1,
INSD:EH803767.1,INSD:DR346254.1,INSD:DR346253.1,
INSD:DR346213.1,INSD:EH839143.1,INSD:BP835462.1,
INSD:EH827534.1,INSD:EL017967.1,INSD:ES134201.1,
INSD:EH849303.1,INSD:EH955115.1,INSD:EL037118.1,
INSD:ES200154.1,INSD:ES039591.1,INSD:DR346193.1,
INSD:DR346249.1,INSD:EL284858.1,INSD:BP824255.1,
INSD:ES200684.1,INSD:AV531016.1,INSD:DR346228.1,
INSD:DR346263.1,INSD:EH926529.1,INSD:BP849271.1,
INSD:EL088064.1,INSD:ES053529.1,INSD:DR346219.1,
INSD:AV562061.1,INSD:EH849562.1,INSD:BP805172.1,
INSD:EL118000.1,INSD:ES001269.1,INSD:ES067082.1,
INSD:DR346245.1,INSD:EL990106.1,INSD:DR346246.1,
INSD:AV533983.1,INSD:BP646207.1,INSD:EL310872.1,
INSD:DR346203.1,INSD:DR346226.1,INSD:DR372801.1,
INSD:EL126774.1,INSD:EL075037.1,INSD:EL159150.1,
INSD:ES134842.1,INSD:DR346220.1,INSD:EL210336.1,
INSD:EL328994.1,INSD:DR346186.1,INSD:DR346216.1,
INSD:ES041063.1,INSD:DR346242.1,INSD:EH867962.1,
INSD:EL151164.1,INSD:AV567370.1,INSD:DR346227.1,
INSD:EL310174.1,INSD:ES191910.1,INSD:EL320256.1,
INSD:EL146564.1,INSD:ES208074.1,INSD:EL129283.1,
INSD:BP607234.1,INSD:EH826109.1,INSD:DR346237.1,
INSD:ES117753.1,INSD:DR346188.1,INSD:DR346260.1,
INSD:EL104709.1,INSD:AV440812.1,INSD:DR346235.1,
INSD:DR362683.1,INSD:DR346185.1,INSD:EL116884.1,
INSD:ES049130.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BT003405.1,INSD:AY085770.1,INSD:BX818806.1,
INSD:BX821775.1,INSD:BX821578.1,INSD:AY058193.1,
INSD:AY072409.1,INSD:AK221084.1,INSD:U30480.2,
INSD:BX819418.1"
/note="expansin A6 (EXPA6); CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Barwin-related endoglucanase (InterPro:IPR009009), Pollen
allergen, N-terminal (InterPro:IPR014734), Expansin
(InterPro:IPR002963), Rare lipoprotein A
(InterPro:IPR005132), Expansin/Lol pI
(InterPro:IPR007118), Expansin 45, endoglucanase-like
(InterPro:IPR007112), Pollen allergen/expansin, C-terminal
(InterPro:IPR007117); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: expansin A4 (TAIR:AT2G39700.1); Has 2139 Blast
hits to 2136 proteins in 145 species: Archae - 0; Bacteria
- 2; Metazoa - 0; Fungi - 24; Plants - 2081; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 32 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G28950"
/db_xref="TAIR:AT2G28950"
intron_pos 49:1 (1/2)
intron_pos 155:2 (2/2)
BEGIN
1 MAMLGLVLSV LTTILALSEA RIPGVYNGGG WETAHATFYG GSDASGTMGG ACGYGNLYSQ
61 GYGVNTAALS TALFNNGFSC GACFELKCAS DPKWCHSGSP SIFITATNFC PPNFAQPSDN
121 GGWCNPPRPH FDLAMPMFLK IAEYRAGIVP VSFRRVPCRK RGGIRFTING FRYFNLVLVT
181 NVAGAGNIVR LGVKGTHTSW MTMSRNWGQN WQSNSVLVGQ SLSFRVTSSD RRSSTSWNIA
241 PANWKFGQTF MGKNFRV
//