LOCUS AEC08194.1 257 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana expansin A6 protein. ACCESSION CP002685-3842 PROTEIN_ID AEC08194.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D., Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V., Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L., Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L., Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H., Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D., Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and Venter,J.C. TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999) PUBMED 10617197 REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="2" /ecotype="Columbia" protein /gene="EXPA6" /locus_tag="AT2G28950" /gene_synonym="ARABIDOPSIS THALIANA TEXPANSIN 6" /gene_synonym="ATEXP6" /gene_synonym="ATEXPA6" /gene_synonym="ATHEXP ALPHA 1.8" /gene_synonym="expansin A6" /gene_synonym="T9I4.3" /gene_synonym="T9I4_3" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:DR346211.1,INSD:EL315781.1,INSD:EL302306.1, INSD:DR346199.1,INSD:DR346261.1,INSD:ES169062.1, INSD:EL036095.1,INSD:ES203995.1,INSD:EL074744.1, INSD:EL009899.1,INSD:DR346267.1,INSD:EH941200.1, INSD:ES181608.1,INSD:BP843374.1,INSD:BP668314.1, INSD:EH927182.1,INSD:DR346190.1,INSD:DR362684.1, INSD:DR346189.1,INSD:ES189338.1,INSD:ES109167.1, INSD:EH880351.1,INSD:EL019064.1,INSD:AA712555.1, INSD:EL213149.1,INSD:DR346236.1,INSD:DR346208.1, INSD:AV827006.1,INSD:EH946044.1,INSD:DR346243.1, INSD:DR346221.1,INSD:EH933853.1,INSD:ES109030.1, INSD:ES064953.1,INSD:DR346252.1,INSD:EG456588.1, INSD:DR346225.1,INSD:EL229191.1,INSD:ES034681.1, INSD:EL142587.1,INSD:DR346232.1,INSD:DR346241.1, INSD:DR346195.1,INSD:AV797014.1,INSD:ES210014.1, INSD:DR346250.1,INSD:BP615906.1,INSD:EL051456.1, INSD:EH966320.1,INSD:EL994108.1,INSD:DR346238.1, INSD:DR346207.1,INSD:EH914085.1,INSD:EH985670.1, INSD:EH825668.1,INSD:ES204174.1,INSD:EL028715.1, INSD:AV559135.1,INSD:DR346223.1,INSD:DR346240.1, INSD:DR346206.1,INSD:DR346198.1,INSD:EL218498.1, INSD:EH801744.1,INSD:EL294874.1,INSD:EL975801.1, INSD:EH863171.1,INSD:ES058072.1,INSD:DR346229.1, INSD:DR346266.1,INSD:ES210495.1,INSD:DR346212.1, INSD:BP605001.1,INSD:DR346215.1,INSD:EL059436.1, INSD:EH993307.1,INSD:AV566062.1,INSD:EH967158.1, INSD:AV527137.1,INSD:EL262045.1,INSD:DR346217.1, INSD:BP829136.1,INSD:DR346259.1,INSD:BP817591.1, INSD:ES030676.1,INSD:AV561045.1,INSD:EL098995.1, INSD:DR346222.1,INSD:BP594219.1,INSD:EH875220.1, INSD:EH879238.1,INSD:EH878722.1,INSD:EL982647.1, INSD:DR346264.1,INSD:EL056895.1,INSD:ES205158.1, INSD:DR346244.1,INSD:AV791553.1,INSD:BP849062.1, INSD:EH929676.1,INSD:ES002578.1,INSD:AV535943.1, INSD:DR346265.1,INSD:EL298084.1,INSD:DR346268.1, INSD:ES161806.1,INSD:ES176207.1,INSD:EL123747.1, INSD:ES079666.1,INSD:DR346201.1,INSD:DR346231.1, INSD:BP644246.1,INSD:EH909936.1,INSD:CB254698.1, INSD:DR346210.1,INSD:ES081057.1,INSD:EL026530.1, INSD:EH954370.1,INSD:EH862553.1,INSD:AV830053.1, INSD:EL100300.1,INSD:EH798153.1,INSD:EH832810.1, INSD:DR346187.1,INSD:BP647976.1,INSD:CB264946.1, INSD:DR346258.1,INSD:AV519980.1,INSD:DR346209.1, INSD:EL158790.1,INSD:DR346248.1,INSD:EL037720.1, INSD:EL052405.1,INSD:DR346202.1,INSD:DR346224.1, INSD:DR346191.1,INSD:DR346196.1,INSD:EL052152.1, INSD:CB256046.1,INSD:BP807944.1,INSD:EL164160.1, INSD:ES149644.1,INSD:DR346262.1,INSD:EH908021.1, INSD:DR346239.1,INSD:EL031864.1,INSD:EL302849.1, INSD:DR346230.1,INSD:EG456589.1,INSD:AW004534.1, INSD:DR357380.1,INSD:T45828.1,INSD:DR346269.1, INSD:EH826383.1,INSD:ES027010.1,INSD:EH832254.1, INSD:EL188079.1,INSD:DR346197.1,INSD:EH909503.1, INSD:EL996190.1,INSD:AV560570.1,INSD:BP651011.1, INSD:AV566065.1,INSD:AV442630.1,INSD:EH940368.1, INSD:EH938912.1,INSD:DR346257.1,INSD:EL177743.1, INSD:EL987603.1,INSD:DR346184.1,INSD:EL103020.1, INSD:AV809817.1,INSD:EL311687.1,INSD:DR346218.1, INSD:EL273377.1,INSD:EL293819.1,INSD:EL134899.1, INSD:EH956337.1,INSD:DR346234.1,INSD:AV798655.1, INSD:EL148999.1,INSD:EL315990.1,INSD:DR377340.1, INSD:DR346205.1,INSD:EL150326.1,INSD:EL086347.1, INSD:EH892318.1,INSD:BP635398.1,INSD:EL191932.1, INSD:DR346204.1,INSD:DR346214.1,INSD:ES201825.1, INSD:DR346255.1,INSD:ES032770.1,INSD:EL307293.1, INSD:EL161547.1,INSD:AV791541.1,INSD:DR346247.1, INSD:ES022875.1,INSD:EH931746.1,INSD:AV563586.1, INSD:AV522284.1,INSD:EL021842.1,INSD:ES074534.1, INSD:H35991.1,INSD:DR346233.1,INSD:EG456590.1, INSD:EL075604.1,INSD:BP661027.1,INSD:BP601419.1, INSD:EH893225.1,INSD:ES148168.1,INSD:N65153.1, INSD:BP815304.2,INSD:EH867191.1,INSD:EH948719.1, INSD:EH803767.1,INSD:DR346254.1,INSD:DR346253.1, INSD:DR346213.1,INSD:EH839143.1,INSD:BP835462.1, INSD:EH827534.1,INSD:EL017967.1,INSD:ES134201.1, INSD:EH849303.1,INSD:EH955115.1,INSD:EL037118.1, INSD:ES200154.1,INSD:ES039591.1,INSD:DR346193.1, INSD:DR346249.1,INSD:EL284858.1,INSD:BP824255.1, INSD:ES200684.1,INSD:AV531016.1,INSD:DR346228.1, INSD:DR346263.1,INSD:EH926529.1,INSD:BP849271.1, INSD:EL088064.1,INSD:ES053529.1,INSD:DR346219.1, INSD:AV562061.1,INSD:EH849562.1,INSD:BP805172.1, INSD:EL118000.1,INSD:ES001269.1,INSD:ES067082.1, INSD:DR346245.1,INSD:EL990106.1,INSD:DR346246.1, INSD:AV533983.1,INSD:BP646207.1,INSD:EL310872.1, INSD:DR346203.1,INSD:DR346226.1,INSD:DR372801.1, INSD:EL126774.1,INSD:EL075037.1,INSD:EL159150.1, INSD:ES134842.1,INSD:DR346220.1,INSD:EL210336.1, INSD:EL328994.1,INSD:DR346186.1,INSD:DR346216.1, INSD:ES041063.1,INSD:DR346242.1,INSD:EH867962.1, INSD:EL151164.1,INSD:AV567370.1,INSD:DR346227.1, INSD:EL310174.1,INSD:ES191910.1,INSD:EL320256.1, INSD:EL146564.1,INSD:ES208074.1,INSD:EL129283.1, INSD:BP607234.1,INSD:EH826109.1,INSD:DR346237.1, INSD:ES117753.1,INSD:DR346188.1,INSD:DR346260.1, INSD:EL104709.1,INSD:AV440812.1,INSD:DR346235.1, INSD:DR362683.1,INSD:DR346185.1,INSD:EL116884.1, INSD:ES049130.1" /inference="similar to RNA sequence, mRNA:INSD:BT003405.1,INSD:AY085770.1,INSD:BX818806.1, INSD:BX821775.1,INSD:BX821578.1,INSD:AY058193.1, INSD:AY072409.1,INSD:AK221084.1,INSD:U30480.2, INSD:BX819418.1" /note="expansin A6 (EXPA6); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Barwin-related endoglucanase (InterPro:IPR009009), Pollen allergen, N-terminal (InterPro:IPR014734), Expansin (InterPro:IPR002963), Rare lipoprotein A (InterPro:IPR005132), Expansin/Lol pI (InterPro:IPR007118), Expansin 45, endoglucanase-like (InterPro:IPR007112), Pollen allergen/expansin, C-terminal (InterPro:IPR007117); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: expansin A4 (TAIR:AT2G39700.1); Has 2139 Blast hits to 2136 proteins in 145 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 24; Plants - 2081; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 32 (source: NCBI BLink)." /db_xref="Araport:AT2G28950" /db_xref="TAIR:AT2G28950" intron_pos 49:1 (1/2) intron_pos 155:2 (2/2) BEGIN 1 MAMLGLVLSV LTTILALSEA RIPGVYNGGG WETAHATFYG GSDASGTMGG ACGYGNLYSQ 61 GYGVNTAALS TALFNNGFSC GACFELKCAS DPKWCHSGSP SIFITATNFC PPNFAQPSDN 121 GGWCNPPRPH FDLAMPMFLK IAEYRAGIVP VSFRRVPCRK RGGIRFTING FRYFNLVLVT 181 NVAGAGNIVR LGVKGTHTSW MTMSRNWGQN WQSNSVLVGQ SLSFRVTSSD RRSSTSWNIA 241 PANWKFGQTF MGKNFRV //