LOCUS AEE87155.1 136 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Histone superfamily protein protein.
ACCESSION CP002687-7412
PROTEIN_ID AEE87155.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT4G40030"
/gene_synonym="H3.3"
/gene_synonym="histone 3.3"
/gene_synonym="T5J17.200"
/gene_synonym="T5J17_200"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR341607.1,INSD:BP831720.1,INSD:BP576709.1,
INSD:EH822763.1,INSD:EL213302.1,INSD:ES076158.1,
INSD:EH988859.1,INSD:ES048659.1,INSD:EL261436.1,
INSD:EL291944.1,INSD:EL968937.1,INSD:ES158510.1,
INSD:DR341641.1,INSD:CB261500.1,INSD:DR341624.1,
INSD:ES013243.1,INSD:EL992604.1,INSD:BP846333.1,
INSD:DR341588.1,INSD:EL089188.1,INSD:AV566834.1,
INSD:ES122788.1,INSD:EH980485.1,INSD:EG499417.1,
INSD:DR341546.1,INSD:EH868564.1,INSD:BP815178.1,
INSD:EL990747.1,INSD:DR341548.1,INSD:DR341586.1,
INSD:EL988086.1,INSD:EL168582.1,INSD:EL066180.1,
INSD:EL975431.1,INSD:ES016314.1,INSD:DR341636.1,
INSD:ES076140.1,INSD:EH839796.1,INSD:BP822601.1,
INSD:EL255230.1,INSD:DR341655.1,INSD:AV556918.1,
INSD:DR341634.1,INSD:DR341583.1,INSD:DR341562.1,
INSD:EH952080.1,INSD:EL975362.1,INSD:EL187572.1,
INSD:R64790.1,INSD:DR341573.1,INSD:ES158504.1,
INSD:EH956871.1,INSD:BP610882.1,INSD:DR341603.1,
INSD:EH920043.1,INSD:ES010719.1,INSD:EH965898.1,
INSD:ES088351.1,INSD:AV536412.1,INSD:CK118285.1,
INSD:ES020030.1,INSD:AV545050.1,INSD:EL080270.1,
INSD:ES200871.1,INSD:AV820575.1,INSD:EH962649.1,
INSD:EH806726.1,INSD:EH977379.1,INSD:ES111831.1,
INSD:EH839421.1,INSD:EH980280.1,INSD:BP791382.1,
INSD:ES156041.1,INSD:ES113319.1,INSD:DR341559.1,
INSD:DR341584.1,INSD:CD534379.1,INSD:CB263759.1,
INSD:R65569.1,INSD:EL207309.1,INSD:DR341657.1,
INSD:EG520815.1,INSD:T44520.1,INSD:ES042099.1,
INSD:ES115903.1,INSD:DR341664.1,INSD:DR341632.1,
INSD:DR341621.1,INSD:ES157985.1,INSD:BP812912.1,
INSD:EL147231.1,INSD:ES006449.1,INSD:ES183691.1,
INSD:EH971724.1,INSD:ES186098.1,INSD:T44968.1,
INSD:BP851535.1,INSD:AV537453.1,INSD:BP841916.1,
INSD:BP862303.1,INSD:DR341585.1,INSD:EL969090.1,
INSD:ES032670.1,INSD:EH916879.1,INSD:EL056793.1,
INSD:AV537247.1,INSD:EL995684.1,INSD:EH822951.1,
INSD:EL083132.1,INSD:EG418823.1,INSD:ES053450.1,
INSD:ES040136.1,INSD:EL968518.1,INSD:DR341611.1,
INSD:ES147499.1,INSD:EL120751.1,INSD:EH992059.1,
INSD:BE038196.1,INSD:EH862798.1,INSD:EL030482.1,
INSD:ES098805.1,INSD:EL226704.1,INSD:BP651597.1,
INSD:DR341581.1,INSD:EL332527.1,INSD:DR341659.1,
INSD:AV532838.1,INSD:DR341547.1,INSD:EG520816.1,
INSD:BP837649.1,INSD:DR341640.1,INSD:AA721863.1,
INSD:EL207681.1,INSD:EL128077.1,INSD:EL975236.1,
INSD:ES020520.1,INSD:ES016178.1,INSD:AV541209.1,
INSD:ES159880.1,INSD:R90079.1,INSD:ES090616.1,
INSD:ES062059.1,INSD:EH892479.1,INSD:ES011554.1,
INSD:DR341665.1,INSD:EL146068.1,INSD:EH920376.1,
INSD:DR341569.1,INSD:EL159208.1,INSD:EH967902.1,
INSD:ES094035.1,INSD:DR341638.1,INSD:AV553680.1,
INSD:DR341557.1,INSD:EL100752.1,INSD:DR341626.1,
INSD:EL282922.1,INSD:EH969633.1,INSD:DR341623.1,
INSD:DR341561.1,INSD:EL291283.1,INSD:DR341668.1,
INSD:DR341582.1,INSD:EL258330.1,INSD:ES141489.1,
INSD:ES008250.1,INSD:EL081912.1,INSD:BE037542.1,
INSD:EH848685.1,INSD:EG521483.1,INSD:CD531080.1,
INSD:DR341596.1,INSD:EH981875.1,INSD:EL079167.1,
INSD:EL211094.1,INSD:CD534266.1,INSD:EH799090.1,
INSD:EH795340.1,INSD:BU635074.1,INSD:DR341555.1,
INSD:DR341606.1,INSD:EL099012.1,INSD:ES140738.1,
INSD:BP817795.1,INSD:BP668378.1,INSD:EL317163.1,
INSD:DR341549.1,INSD:BE037656.1,INSD:DR341593.1,
INSD:DR341567.1,INSD:DR341602.1,INSD:ES144361.1,
INSD:ES110650.1,INSD:DR341650.1,INSD:EH823027.1,
INSD:EH955621.1,INSD:EL024525.1,INSD:ES002532.1,
INSD:BE038170.1,INSD:DR341578.1,INSD:EL992206.1,
INSD:EL089291.1,INSD:AA395781.1,INSD:EL138093.1,
INSD:ES185450.1,INSD:EL276707.1,INSD:EL158782.1,
INSD:EL239828.1,INSD:DR341669.1,INSD:EL297316.1,
INSD:BP658365.1,INSD:ES070590.1,INSD:ES214139.1,
INSD:EL280617.1,INSD:DR341568.1,INSD:BP610500.1,
INSD:DR341633.1,INSD:DR341576.1,INSD:DR341572.1,
INSD:DR341629.1,INSD:EH873441.1,INSD:ES105686.1,
INSD:CK121832.1,INSD:EH919483.1,INSD:BP588969.1,
INSD:BP592005.1,INSD:DR341558.1,INSD:BP845738.1,
INSD:EL238084.1,INSD:AV820337.1,INSD:W43067.1,
INSD:EH808327.1,INSD:EH841595.1,INSD:EH879062.1,
INSD:EL085277.1,INSD:EL233112.1,INSD:ES070048.1,
INSD:DR341619.1,INSD:EG521487.1,INSD:ES184992.1,
INSD:DR341617.1,INSD:ES202284.1,INSD:DR341630.1,
INSD:BP847780.1,INSD:DR341556.1,INSD:EL099456.1,
INSD:N37252.1,INSD:ES191274.1,INSD:AV549328.1,
INSD:DR341608.1,INSD:DR341614.1,INSD:ES197638.1,
INSD:EL147068.1,INSD:ES036272.1,INSD:BE530384.1,
INSD:EL325029.1,INSD:DR375672.1,INSD:DR341613.1,
INSD:DR341566.1,INSD:DR341592.1,INSD:DR341662.1,
INSD:ES136314.1,INSD:EH859922.1,INSD:AV822260.1,
INSD:EL326425.1,INSD:ES075772.1,INSD:ES189228.1,
INSD:EH913985.1,INSD:DR341553.1,INSD:BP849965.1,
INSD:EL265093.1,INSD:EL164158.1,INSD:DR341595.1,
INSD:ES161404.1,INSD:AV534260.1,INSD:DR341620.1,
INSD:EH928663.1,INSD:EH978836.1,INSD:BP842483.1,
INSD:BP669266.1,INSD:EL223748.1,INSD:DR341631.1,
INSD:ES021156.1,INSD:EH815140.1,INSD:DR341647.1,
INSD:EL138495.1,INSD:EL056881.1,INSD:EL124246.1,
INSD:EL112536.1,INSD:EL079797.1,INSD:BP660929.1,
INSD:EH950711.1,INSD:EL079281.1,INSD:BP828341.1,
INSD:BE038165.1,INSD:DR341575.1,INSD:EH928838.1,
INSD:EL128693.1,INSD:DR341552.1,INSD:DR341622.1,
INSD:EH799308.1,INSD:EL997493.1,INSD:ES063030.1,
INSD:DR341651.1,INSD:ES011039.1,INSD:EH847498.1,
INSD:DR341580.1,INSD:EH860451.1,INSD:DR341660.1,
INSD:BE521030.1,INSD:DR341587.1,INSD:AV533742.1,
INSD:BP822253.2,INSD:EH961472.1,INSD:CF652164.1,
INSD:BP595833.1,INSD:ES055272.1,INSD:DR341666.1,
INSD:ES044807.1,INSD:EL169692.1,INSD:ES028887.1,
INSD:EL015406.1,INSD:ES136167.1,INSD:DR341645.1,
INSD:DR341658.1,INSD:H36474.1,INSD:DR341554.1,
INSD:DR341646.1,INSD:BE527989.1,INSD:ES122584.1,
INSD:EL323448.1,INSD:AV787955.1,INSD:DR341628.1,
INSD:EH874648.1,INSD:CD534247.1,INSD:EL169175.1,
INSD:DR341610.1,INSD:EH841967.1,INSD:T04227.1,
INSD:DR341661.1,INSD:ES026824.1,INSD:ES007243.1,
INSD:EH801816.1,INSD:ES065758.1,INSD:T21176.1,
INSD:ES095710.1,INSD:ES012563.1,INSD:DR341652.1,
INSD:DR341635.1,INSD:AA394784.1,INSD:EL081810.1,
INSD:EH961896.1,INSD:ES058483.1,INSD:DR341550.1,
INSD:EL987797.1,INSD:BE527527.1,INSD:EH805832.1,
INSD:DR341604.1,INSD:EL292381.1,INSD:EH941114.1,
INSD:ES052546.1,INSD:EL161003.1,INSD:ES183035.1,
INSD:T45903.1,INSD:EH842250.1,INSD:DR341598.1,
INSD:ES013691.1,INSD:CK121563.1,INSD:EL196789.1,
INSD:EL066960.1,INSD:EL266525.1,INSD:DR341590.1,
INSD:ES017885.1,INSD:EL186480.1,INSD:ES062065.1,
INSD:DR341656.1,INSD:AV541588.1,INSD:Z34767.1,
INSD:DR341643.1,INSD:ES170846.1,INSD:DR341551.1,
INSD:EL210636.1,INSD:DR341670.1,INSD:DR341574.1,
INSD:EH851017.1,INSD:EL257658.1,INSD:DR341615.1,
INSD:ES066369.1,INSD:DR341599.1,INSD:EL250504.1,
INSD:EH797710.1,INSD:CD534579.1,INSD:ES004820.1,
INSD:EL977082.1,INSD:CB261254.1,INSD:DR341601.1,
INSD:EH853507.1,INSD:EH885545.1,INSD:EG418821.1,
INSD:ES174544.1,INSD:EH988996.1,INSD:EH903979.1,
INSD:AV532877.1,INSD:ES167042.1,INSD:DR341589.1,
INSD:EL108143.1,INSD:DR341627.1,INSD:DR341560.1,
INSD:ES128223.1,INSD:EL174823.1,INSD:ES024780.1,
INSD:DR341564.1,INSD:EL076428.1,INSD:EH837168.1,
INSD:EL012262.1,INSD:DR341612.1,INSD:EL332972.1,
INSD:BP853084.1,INSD:EL000117.1,INSD:DR341667.1,
INSD:BE527943.1,INSD:ES141504.1,INSD:EL993793.1,
INSD:EH992588.1,INSD:ES144837.1,INSD:ES063327.1,
INSD:CD531081.1,INSD:DR341591.1,INSD:EH893254.1,
INSD:EL249163.1,INSD:EL205234.1,INSD:EH844376.1,
INSD:EH920143.1,INSD:DR341579.1,INSD:DR341577.1,
INSD:DR341618.1,INSD:EL227367.1,INSD:DR341600.1,
INSD:AV521630.1,INSD:BP672162.1,INSD:AV530885.1,
INSD:EL222645.1,INSD:DR341648.1,INSD:BP600486.1,
INSD:AV567130.1,INSD:EL336955.1,INSD:ES118039.1,
INSD:AV534928.1,INSD:EL184759.1,INSD:ES004483.1,
INSD:H37104.1,INSD:EL066373.1,INSD:DR341594.1,
INSD:DR341653.1,INSD:DR341571.1,INSD:ES041763.1,
INSD:ES081832.1,INSD:DR341609.1,INSD:DR341605.1,
INSD:DR341625.1,INSD:DR341644.1,INSD:EH961581.1,
INSD:DR341565.1,INSD:DR341639.1,INSD:DR341563.1,
INSD:ES191548.1,INSD:DR341637.1,INSD:ES003123.1,
INSD:DR341663.1,INSD:BP821244.1,INSD:N37200.1,
INSD:DR341654.1,INSD:EL006559.1,INSD:N65060.1,
INSD:AV782971.1,INSD:DR341570.1,INSD:EL244343.1,
INSD:EL291047.1,INSD:EL982726.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX827037.1,INSD:BX826553.1,INSD:BX826576.1,
INSD:AY078027.1,INSD:AF385735.1,INSD:BX828225.1"
/note="Histone superfamily protein; FUNCTIONS IN: DNA
binding; INVOLVED IN: nucleosome assembly; LOCATED IN:
nucleosome; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED
DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Histone H3 (InterPro:IPR000164), Histone-fold
(InterPro:IPR009072), Histone core (InterPro:IPR007125);
BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Histone
superfamily protein (TAIR:AT5G10980.1); Has 14600 Blast
hits to 14592 proteins in 7243 species: Archae - 0;
Bacteria - 0; Metazoa - 10603; Fungi - 2037; Plants -
1258; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 702 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G40030"
/db_xref="Araport:AT4G40030"
intron_pos 25:0 (1/2)
intron_pos 50:2 (2/2)
BEGIN
1 MARTKQTARK STGGKAPRKQ LATKAARKSA PTTGGVKKPH RYRPGTVALR EIRKYQKSTE
61 LLIRKLPFQR LVREIAQDFK TDLRFQSHAV LALQEAAEAY LVGLFEDTNL CAIHAKRVTI
121 MPKDIQLARR IRGERA
//