LOCUS AEE86993.1 164 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana vacuolar-type H[+]-ATPase C3 protein.
ACCESSION CP002687-7199
PROTEIN_ID AEE86993.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="VHA-C3"
/locus_tag="AT4G38920"
/gene_synonym="ATVHA-C3"
/gene_synonym="AVA-P3"
/gene_synonym="F19H22.20"
/gene_synonym="vacuolar-type H(+)-ATPase C3"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL186211.1,INSD:EH850624.1,INSD:EL310616.1,
INSD:EL967186.1,INSD:EH915461.1,INSD:BP640945.1,
INSD:BP834923.1,INSD:EG453968.1,INSD:EL002817.1,
INSD:EL191316.1,INSD:ES040916.1,INSD:EL138195.1,
INSD:BP831927.1,INSD:ES020642.1,INSD:ES145349.1,
INSD:BP632307.1,INSD:EL967321.1,INSD:BP577165.1,
INSD:ES086107.1,INSD:BP661430.1,INSD:ES002646.1,
INSD:DR321146.1,INSD:EL986722.1,INSD:AV544265.1,
INSD:EL976414.1,INSD:EL140136.1,INSD:AI998496.1,
INSD:BP650749.1,INSD:BP623120.1,INSD:BP792556.1,
INSD:EL270159.1,INSD:AV550140.1,INSD:EH918270.1,
INSD:ES094176.1,INSD:ES070505.1,INSD:CB260688.1,
INSD:EL234757.1,INSD:BP615603.1,INSD:EG456702.1,
INSD:ES141192.1,INSD:EL097060.1,INSD:ES099669.1,
INSD:ES197155.1,INSD:AV537996.1,INSD:DR321151.1,
INSD:T45164.1,INSD:EL137067.1,INSD:BP662380.1,
INSD:EL313110.1,INSD:AV552763.1,INSD:BP807198.1,
INSD:EL023155.1,INSD:F14129.1,INSD:EH950913.1,
INSD:DR321152.1,INSD:BP645387.1,INSD:EL993990.1,
INSD:ES202369.1,INSD:DR321158.1,INSD:EL191925.1,
INSD:EL224803.1,INSD:DR321148.1,INSD:BP661771.1,
INSD:BP859680.1,INSD:ES198428.1,INSD:BP851216.1,
INSD:EL181337.1,INSD:BP846722.1,INSD:BP828514.1,
INSD:BP829661.1,INSD:BP821160.1,INSD:EL249054.1,
INSD:BP624668.1,INSD:ES071253.1,INSD:EL261549.1,
INSD:ES180596.1,INSD:AV551359.1,INSD:EL022744.1,
INSD:EH961960.1,INSD:AV539021.1,INSD:EL994864.1,
INSD:BP825090.1,INSD:BP639382.1,INSD:EL180704.1,
INSD:AV800595.1,INSD:EL059705.1,INSD:EG439150.1,
INSD:BP802622.1,INSD:EH866321.1,INSD:EH921917.1,
INSD:EL259438.1,INSD:EH850178.1,INSD:EL971934.1,
INSD:BP660675.1,INSD:DR321144.1,INSD:EL127433.1,
INSD:ES014236.1,INSD:R90510.1,INSD:EH977236.1,
INSD:BP803961.1,INSD:ES099745.1,INSD:BP848448.1,
INSD:DR321161.1,INSD:DR321166.1,INSD:EL216382.1,
INSD:BP634015.1,INSD:EH795942.1,INSD:ES215318.1,
INSD:ES116942.1,INSD:EL098084.1,INSD:EL256031.1,
INSD:CD529591.1,INSD:EL327115.1,INSD:BP839795.1,
INSD:EL305841.1,INSD:EL968528.1,INSD:BP671183.1,
INSD:EL015110.1,INSD:ES166573.1,INSD:BP837325.1,
INSD:BP578297.1,INSD:BP571068.1,INSD:BP611269.1,
INSD:ES034422.1,INSD:ES143752.1,INSD:EL203512.1,
INSD:BP787065.1,INSD:EL992049.1,INSD:BP668874.1,
INSD:BP630897.1,INSD:ES202197.1,INSD:EL176473.1,
INSD:EL047348.1,INSD:EL337803.1,INSD:ES214906.1,
INSD:EL057300.1,INSD:ES211914.1,INSD:DR321159.1,
INSD:BP623325.1,INSD:ES152357.1,INSD:ES005523.1,
INSD:ES063940.1,INSD:BP632746.1,INSD:EH965959.1,
INSD:EG517459.1,INSD:ES001769.1,INSD:DR321154.1,
INSD:EL991077.1,INSD:EG453969.1,INSD:BP602669.1,
INSD:BP571440.1,INSD:BP786791.1,INSD:ES049327.1,
INSD:BP832918.1,INSD:BP628635.1,INSD:BP815688.1,
INSD:T46102.1,INSD:AV551520.1,INSD:BP563339.1,
INSD:EL967205.1,INSD:EH852505.1,INSD:BP867080.1,
INSD:AV549358.1,INSD:EL150368.1,INSD:BP670984.1,
INSD:DR321155.1,INSD:DR321165.1,INSD:BP629455.1,
INSD:AV824789.1,INSD:BP835794.1,INSD:BP567215.1,
INSD:BP634638.1,INSD:AV542087.1,INSD:BP622829.1,
INSD:BP623596.1,INSD:ES150083.1,INSD:AV795930.1,
INSD:EH920899.1,INSD:DR374852.1,INSD:BP622227.1,
INSD:EL086310.1,INSD:EH952917.1,INSD:BP622806.1,
INSD:DR321149.1,INSD:EL967115.1,INSD:DR321164.1,
INSD:EL044723.1,INSD:ES165523.1,INSD:CF652499.1,
INSD:BP828362.1,INSD:EL299200.1,INSD:BP851014.1,
INSD:BP821907.1,INSD:CD531086.1,INSD:BP561509.2,
INSD:BP847379.1,INSD:AV541339.1,INSD:EL300045.1,
INSD:EL174734.1,INSD:EG509360.1,INSD:BP857205.1,
INSD:EH837753.1,INSD:ES211830.1,INSD:CF652388.1,
INSD:EG456701.1,INSD:ES137009.1,INSD:EL322063.1,
INSD:CD529893.1,INSD:EH838413.1,INSD:EL991337.1,
INSD:ES182746.1,INSD:ES068484.1,INSD:EL210054.1,
INSD:EG477638.1,INSD:EG517460.1,INSD:BP857951.1,
INSD:BP631363.1,INSD:EL105301.1,INSD:EH980483.1,
INSD:BP592591.1,INSD:ES027747.1,INSD:BP651892.1,
INSD:EL260807.1,INSD:BP568905.1,INSD:EH821085.1,
INSD:AV793767.1,INSD:EL297304.1,INSD:EH988467.1,
INSD:BP859527.1,INSD:ES083853.1,INSD:AV791788.1,
INSD:ES050132.1,INSD:EL060560.1,INSD:DR377023.1,
INSD:BP630624.1,INSD:BP635607.1,INSD:ES156459.1,
INSD:BP822083.1,INSD:BP799570.1,INSD:EH970052.1,
INSD:DR321160.1,INSD:EL276313.1,INSD:EL203220.1,
INSD:EH952097.1,INSD:AV787696.1,INSD:DR321163.1,
INSD:ES031392.1,INSD:EH838941.1,INSD:BP648576.1,
INSD:DR321150.1,INSD:BP779209.1,INSD:EL976718.1,
INSD:EH853250.1,INSD:BP610606.1,INSD:DR321145.1,
INSD:AV440756.1,INSD:BP659718.1,INSD:EL234952.1,
INSD:ES095099.1,INSD:ES168051.1,INSD:EL005812.1,
INSD:EL183551.1,INSD:ES023838.1,INSD:ES183924.1,
INSD:EL069608.1,INSD:EL974760.1,INSD:ES002607.1,
INSD:BP573412.1,INSD:DR321156.1,INSD:BP845107.1,
INSD:BP640761.1,INSD:ES102709.1,INSD:AV539129.1,
INSD:EL124985.1,INSD:BP846795.1,INSD:EL968554.1,
INSD:AV540560.1,INSD:EL326460.1,INSD:ES168972.1,
INSD:EG439262.1,INSD:ES067537.1,INSD:BP571103.1,
INSD:EL307367.1,INSD:EG477639.1,INSD:BP565728.1,
INSD:ES088520.1,INSD:EL973800.1,INSD:ES134821.1,
INSD:AV442561.1,INSD:BP836353.1,INSD:EL131269.1,
INSD:EH925181.1,INSD:DR321147.1,INSD:EG459721.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY093249.1,INSD:AY049249.1,INSD:AY090271.1,
INSD:AK220926.1,INSD:AY087112.1,INSD:AF412097.1,
INSD:BX828233.1,INSD:AY059836.1"
/note="vacuolar-type H(+)-ATPase C3 (VHA-C3); FUNCTIONS
IN: ATPase activity; INVOLVED IN: ATP synthesis coupled
proton transport; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 24
plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages;
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, F0/V0 complex, subunit
C (InterPro:IPR002379), ATPase, V0 complex, proteolipid
subunit C, eukaryotic (InterPro:IPR011555), ATPase, V0
complex, proteolipid subunit C (InterPro:IPR000245); BEST
Arabidopsis thaliana protein match is: ATPase, F0/V0
complex, subunit C protein (TAIR:AT4G34720.1); Has 2722
Blast hits to 2495 proteins in 678 species: Archae - 169;
Bacteria - 703; Metazoa - 633; Fungi - 468; Plants - 344;
Viruses - 0; Other Eukaryotes - 405 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G38920"
/db_xref="Araport:AT4G38920"
intron_pos 26:1 (1/2)
intron_pos 121:2 (2/2)
BEGIN
1 MSTFSGDETA PFFGFLGAAA ALVFSCMGAA YGTAKSGVGV ASMGVMRPEL VMKSIVPVVM
61 AGVLGIYGLI IAVIISTGIN PKAKSYYLFD GYAHLSSGLA CGLAGLSAGM AIGIVGDAGV
121 RANAQQPKLF VGMILILIFA EALALYGLIV GIILSSRAGQ SRAE
//