LOCUS AEE86970.1 172 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana rotamase CYP 1 protein.
ACCESSION CP002687-7174
PROTEIN_ID AEE86970.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="ROC1"
/locus_tag="AT4G38740"
/gene_synonym="CYCLOPHILIN"
/gene_synonym="rotamase CYP 1"
/gene_synonym="T9A14.20"
/gene_synonym="T9A14_20"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:ES174007.1,INSD:BP828870.1,INSD:ES074069.1,
INSD:EG514822.1,INSD:DR343598.1,INSD:DR343570.1,
INSD:ES122193.1,INSD:EL224984.1,INSD:BP816121.1,
INSD:DR343650.1,INSD:BP590866.1,INSD:ES034356.1,
INSD:CK121834.1,INSD:EL108671.1,INSD:BP660375.1,
INSD:AV819447.1,INSD:ES090934.1,INSD:EH796217.1,
INSD:BP644407.1,INSD:EH931939.1,INSD:DR343584.1,
INSD:EL022063.1,INSD:ES095109.1,INSD:BP832048.1,
INSD:EL027256.1,INSD:ES000174.1,INSD:DR343594.1,
INSD:ES056270.1,INSD:BP565721.1,INSD:BP602326.1,
INSD:BP838964.1,INSD:EH988268.1,INSD:BP814964.1,
INSD:DR343637.1,INSD:EL071564.1,INSD:ES069842.1,
INSD:DR343639.1,INSD:EL272925.1,INSD:BP569350.1,
INSD:AV789057.1,INSD:DR343582.1,INSD:DR343668.1,
INSD:AV784542.1,INSD:ES054932.1,INSD:BP583438.1,
INSD:BP652885.1,INSD:DR343621.1,INSD:BP574240.1,
INSD:BP653035.1,INSD:EL991540.1,INSD:ES077664.1,
INSD:DR343652.1,INSD:BP835621.1,INSD:BP585470.1,
INSD:ES091297.1,INSD:DR343624.1,INSD:DR343553.1,
INSD:DR343590.1,INSD:DR343556.1,INSD:EL337596.1,
INSD:EH938629.1,INSD:ES121700.1,INSD:DR343651.1,
INSD:EH855876.1,INSD:EL076764.1,INSD:ES165739.1,
INSD:DR343560.1,INSD:EL097818.1,INSD:BP565340.1,
INSD:AV553856.1,INSD:EL224714.1,INSD:BP835729.1,
INSD:EL329265.1,INSD:ES168757.1,INSD:BP636839.1,
INSD:DR244256.1,INSD:EG520542.1,INSD:ES125487.1,
INSD:DR343599.1,INSD:EL337427.1,INSD:DR343615.1,
INSD:EH818699.1,INSD:EL078145.1,INSD:ES055248.1,
INSD:AA720345.1,INSD:T03959.1,INSD:BP822852.1,
INSD:DR343604.1,INSD:EL278356.1,INSD:EG514131.1,
INSD:EG518167.1,INSD:Z46688.1,INSD:AV556953.1,
INSD:DR343566.1,INSD:DR343577.1,INSD:EL067662.1,
INSD:BP584780.1,INSD:DR343645.1,INSD:EL995682.1,
INSD:BP654086.1,INSD:BP841354.1,INSD:DR343666.1,
INSD:AV556063.1,INSD:EL167208.1,INSD:EG501840.1,
INSD:DR343620.1,INSD:ES173085.1,INSD:BP819811.1,
INSD:EG514194.1,INSD:DR343552.1,INSD:BP563770.1,
INSD:BP575847.1,INSD:ES107915.1,INSD:DR343591.1,
INSD:EL337704.1,INSD:EL241295.1,INSD:DR343630.1,
INSD:BP646683.1,INSD:DR343610.1,INSD:EH909161.1,
INSD:EL040085.1,INSD:EL266768.1,INSD:DR343562.1,
INSD:ES099567.1,INSD:BP642494.1,INSD:ES196753.1,
INSD:EG501836.1,INSD:ES094355.1,INSD:ES003926.1,
INSD:BP560786.1,INSD:AV552200.1,INSD:DR343568.1,
INSD:EL271979.1,INSD:AV544831.1,INSD:EL293588.1,
INSD:DR343609.1,INSD:EG504740.1,INSD:AV552238.1,
INSD:DR343558.1,INSD:AV823548.1,INSD:DR343646.1,
INSD:ES141292.1,INSD:DR343571.1,INSD:ES172573.1,
INSD:DR343572.1,INSD:AA598027.1,INSD:AI998620.1,
INSD:CB260585.1,INSD:BP582781.1,INSD:BP650282.1,
INSD:DR225604.1,INSD:EL998646.1,INSD:BP822600.1,
INSD:DR343588.1,INSD:BP827374.1,INSD:ES061884.1,
INSD:EH930200.1,INSD:EH898367.1,INSD:DR343631.1,
INSD:EG502091.1,INSD:EH888350.1,INSD:EL233513.1,
INSD:EL040152.1,INSD:EL313114.1,INSD:CD532898.1,
INSD:T42515.1,INSD:DR343659.1,INSD:EL327576.1,
INSD:DR343565.1,INSD:ES124204.1,INSD:EL115020.1,
INSD:BP641004.1,INSD:ES054430.1,INSD:BP576452.1,
INSD:DR343655.1,INSD:DR343611.1,INSD:T44423.1,
INSD:DR343563.1,INSD:DR343595.1,INSD:ES213041.1,
INSD:EL997129.1,INSD:EL970441.1,INSD:EH973639.1,
INSD:EL124719.1,INSD:BP587608.1,INSD:ES047190.1,
INSD:ES037007.1,INSD:BP654449.1,INSD:ES056961.1,
INSD:BP820522.1,INSD:BP595021.1,INSD:BP648665.1,
INSD:ES036557.1,INSD:H37167.1,INSD:DR343638.1,
INSD:EH892877.1,INSD:ES153880.1,INSD:BP825522.1,
INSD:BP639657.1,INSD:EL192807.1,INSD:ES004499.1,
INSD:BP637860.1,INSD:EL977080.1,INSD:EH912159.1,
INSD:EH938666.1,INSD:CF773570.1,INSD:EL038020.1,
INSD:DR343618.1,INSD:ES008067.1,INSD:EL170949.1,
INSD:EL981636.1,INSD:BP826300.1,INSD:BP641170.1,
INSD:BP820857.1,INSD:AV545171.1,INSD:BP568051.1,
INSD:BP828735.1,INSD:EL049367.1,INSD:DR343634.1,
INSD:ES136488.1,INSD:ES001907.1,INSD:BP629230.1,
INSD:BP648896.1,INSD:BP829934.1,INSD:BP822914.1,
INSD:EL101732.1,INSD:ES090852.1,INSD:EL221334.1,
INSD:DR343663.1,INSD:EL334222.1,INSD:BP638227.1,
INSD:BP836981.1,INSD:DR343554.1,INSD:ES142357.1,
INSD:BP578990.1,INSD:BP650533.1,INSD:DR343613.1,
INSD:BP564940.1,INSD:AV787544.1,INSD:DR343605.1,
INSD:BP641529.1,INSD:BP798633.1,INSD:EL254550.1,
INSD:BP816225.1,INSD:EH840947.1,INSD:T42158.1,
INSD:DR343589.1,INSD:ES049995.1,INSD:Z17452.1,
INSD:EH911602.1,INSD:BP660041.1,INSD:EL321938.1,
INSD:EL988219.1,INSD:EH899404.1,INSD:ES040643.1,
INSD:DR343641.1,INSD:DR343567.1,INSD:EL243403.1,
INSD:BP563807.1,INSD:EH921290.1,INSD:BP840240.1,
INSD:ES159443.1,INSD:ES038921.1,INSD:EL076774.1,
INSD:ES209136.1,INSD:ES127293.1,INSD:BP593723.1,
INSD:ES117262.1,INSD:DR343644.1,INSD:BP822096.1,
INSD:EL119909.1,INSD:AV557639.1,INSD:DR343626.1,
INSD:BP563273.1,INSD:ES166435.1,INSD:EL288608.1,
INSD:DR343600.1,INSD:DR343627.1,INSD:ES157093.1,
INSD:BP571585.1,INSD:BP820697.1,INSD:DR343667.1,
INSD:EH886594.1,INSD:DR343612.1,INSD:BP573057.1,
INSD:ES147108.1,INSD:DR343658.1,INSD:EG501835.1,
INSD:BP842204.1,INSD:BP590128.1,INSD:BP650635.1,
INSD:ES155153.1,INSD:BP838255.1,INSD:AV819818.1,
INSD:BP825264.1,INSD:EH973327.1,INSD:ES056557.1,
INSD:ES153659.1,INSD:DR343596.1,INSD:BP643917.1,
INSD:ES167752.1,INSD:EH944870.1,INSD:DR343629.1,
INSD:EG501839.1,INSD:DR343640.1,INSD:EL340828.1,
INSD:AI100266.1,INSD:EH947434.1,INSD:AV785746.1,
INSD:ES117617.1,INSD:BP584749.1,INSD:BE038408.1,
INSD:CF651509.1,INSD:BP582800.1,INSD:DR343593.1,
INSD:ES112750.1,INSD:EL055599.1,INSD:ES047554.1,
INSD:BP648122.1,INSD:BP564763.1,INSD:ES015458.1,
INSD:DR343654.1,INSD:BP800447.1,INSD:EL254391.1,
INSD:DR343578.1,INSD:DR343619.1,INSD:ES153690.1,
INSD:DR343555.1,INSD:DR343574.1,INSD:BP831198.1,
INSD:BP567937.1,INSD:DR343580.1,INSD:ES064917.1,
INSD:EL311397.1,INSD:ES186171.1,INSD:DR343597.1,
INSD:DR343648.1,INSD:DR343664.1,INSD:W43079.1,
INSD:BP587741.1,INSD:BP635066.1,INSD:DR343616.1,
INSD:T21687.1,INSD:BP798361.1,INSD:AV554549.1,
INSD:DR343575.1,INSD:EL069406.1,INSD:EL256733.1,
INSD:BP827909.1,INSD:DR343665.1,INSD:BP582422.1,
INSD:DR343585.1,INSD:DR343632.1,INSD:ES138945.1,
INSD:ES111625.1,INSD:BP836116.1,INSD:BP826567.1,
INSD:EH852887.1,INSD:AV787434.1,INSD:DR343592.1,
INSD:EL331599.1,INSD:AV534504.1,INSD:DR343549.1,
INSD:EL997549.1,INSD:EH868436.1,INSD:EH827331.1,
INSD:EH978471.1,INSD:BP833486.1,INSD:BP815956.1,
INSD:EH943847.1,INSD:BP822310.1,INSD:CF651508.1,
INSD:DR343569.1,INSD:CF652240.1,INSD:BP588750.1,
INSD:T42437.1,INSD:BP837385.1,INSD:ES116300.1,
INSD:ES158018.1,INSD:DR226239.1,INSD:EL334647.1,
INSD:EL050965.1,INSD:DR343606.1,INSD:EL036704.1,
INSD:EH856710.1,INSD:BP584277.1,INSD:DR343628.1,
INSD:DR343625.1,INSD:AV559409.1,INSD:EL085202.1,
INSD:ES143850.1,INSD:AV553357.1,INSD:EL997464.1,
INSD:BP563872.1,INSD:BP616930.1,INSD:DR343660.1,
INSD:BP582043.1,INSD:BP648515.1,INSD:ES147253.1,
INSD:ES058297.1,INSD:BP836408.1,INSD:DR343656.1,
INSD:BP826851.1,INSD:EL086844.1,INSD:ES049379.1,
INSD:AV787476.1,INSD:BP817552.1,INSD:DR343587.1,
INSD:ES172614.1,INSD:EL973137.1,INSD:BP650545.1,
INSD:EL982432.1,INSD:DR378403.1,INSD:EH824983.1,
INSD:EL332146.1,INSD:BP647284.1,INSD:EL073728.1,
INSD:DR343586.1,INSD:EH923754.1,INSD:BP659352.1,
INSD:DR343579.1,INSD:CF652295.1,INSD:AV543828.1,
INSD:DR343662.1,INSD:ES203345.1,INSD:BP596934.1,
INSD:ES173771.1,INSD:BP814932.1,INSD:EG502092.1,
INSD:ES137127.1,INSD:DR343623.1,INSD:BP828511.1,
INSD:DR343643.1,INSD:BP641457.1,INSD:DR343649.1,
INSD:DR343657.1,INSD:ES080009.1,INSD:EH952352.1,
INSD:BP579805.1,INSD:BP653298.1,INSD:T44867.1,
INSD:BP585351.1,INSD:DR343617.1,INSD:BP824267.1,
INSD:EL320082.1,INSD:EH836957.1,INSD:DR343653.1,
INSD:BP656404.1,INSD:BP628737.1,INSD:ES005165.1,
INSD:DR343551.1,INSD:ES200415.1,INSD:EL995086.1,
INSD:BP565136.1,INSD:EH929420.1,INSD:BP573277.1,
INSD:AV542195.1,INSD:EH986641.1,INSD:EH965112.1,
INSD:EL301837.1,INSD:DR343661.1,INSD:BP651953.1,
INSD:BP591366.1,INSD:BP645944.1,INSD:DR343607.1,
INSD:DR343602.1,INSD:AV561524.1,INSD:DR343581.1,
INSD:BP564452.1,INSD:ES088593.1,INSD:BP819605.1,
INSD:EL214487.1,INSD:ES055312.1,INSD:BP562002.2,
INSD:DR376824.1,INSD:DR343608.1,INSD:EH966227.1,
INSD:EH838814.1,INSD:ES071510.1,INSD:BP591779.1,
INSD:T75770.1,INSD:DR343642.1,INSD:ES131314.1,
INSD:ES140950.1,INSD:AV556815.1,INSD:EL339904.1,
INSD:BP646379.1,INSD:BP657172.1,INSD:EL088304.1,
INSD:BP819489.1,INSD:AV783058.1,INSD:AA712251.1,
INSD:BP836405.1,INSD:EH848966.1,INSD:BP826484.1,
INSD:ES041977.1,INSD:AV798072.1,INSD:BP648670.1,
INSD:DR343550.1,INSD:DR343564.1,INSD:AA712401.1,
INSD:EL975791.1,INSD:DR343633.1,INSD:ES193420.1,
INSD:BP857829.1,INSD:DR343635.1,INSD:DR343573.1,
INSD:ES152549.1,INSD:AV537750.1,INSD:DR343647.1,
INSD:BP645155.1,INSD:DR343583.1,INSD:ES183343.1,
INSD:ES122553.1,INSD:BP823904.1,INSD:DR343622.1,
INSD:DR377484.1,INSD:ES110387.1,INSD:BP640317.1,
INSD:EL124249.1,INSD:ES075845.1,INSD:BP827306.1,
INSD:CK120633.1,INSD:ES121104.1,INSD:ES171284.1,
INSD:BP641496.1,INSD:DR343636.1,INSD:DR343576.1,
INSD:BP643184.1,INSD:DR343559.1,INSD:ES137459.1,
INSD:DR343614.1,INSD:DR343557.1,INSD:EL098698.1,
INSD:EL192184.1,INSD:DR343561.1,INSD:EG501829.1,
INSD:EL144283.1,INSD:DR343601.1,INSD:ES101956.1,
INSD:EG514823.1,INSD:AV787970.1,INSD:EH914487.1,
INSD:BP803031.1,INSD:ES187893.1,INSD:ES208297.1,
INSD:BP811991.1,INSD:DR343603.1,INSD:ES179185.1,
INSD:EH892613.1,INSD:EH802927.1,INSD:BP812978.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AK226392.1,INSD:BX826712.1,INSD:L14844.1,
INSD:AY093227.1,INSD:AY088103.1,INSD:BT003397.1"
/note="rotamase CYP 1 (ROC1); FUNCTIONS IN:
peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity; INVOLVED IN:
protein folding, response to cadmium ion, signal
transduction; LOCATED IN: cytosol, apoplast, plasma
membrane; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED
DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Cyclophilin-like (InterPro:IPR015891), Peptidyl-prolyl
cis-trans isomerase, cyclophilin-type
(InterPro:IPR002130), Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase,
cyclophilin-type, conserved site (InterPro:IPR020892);
BEST Arabidopsis thaliana protein match is:
Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
family protein (TAIR:AT2G21130.1); Has 16514 Blast hits to
16480 proteins in 2670 species: Archae - 108; Bacteria -
6825; Metazoa - 2927; Fungi - 1383; Plants - 1289; Viruses
- 4; Other Eukaryotes - 3978 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G38740"
/db_xref="Araport:AT4G38740"
BEGIN
1 MAFPKVYFDM TIDGQPAGRI VMELYTDKTP RTAENFRALC TGEKGVGGTG KPLHFKGSKF
61 HRVIPNFMCQ GGDFTAGNGT GGESIYGSKF EDENFERKHT GPGILSMANA GANTNGSQFF
121 ICTVKTDWLD GKHVVFGQVV EGLDVVKAIE KVGSSSGKPT KPVVVADCGQ LS
//