LOCUS AEE86623.1 258 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Ribosomal protein L2 family protein.
ACCESSION CP002687-6733
PROTEIN_ID AEE86623.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT4G36130"
/gene_synonym="F23E13.20"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:ES097844.1,INSD:AV543974.1,INSD:BP658863.1,
INSD:EH934554.1,INSD:AV817785.1,INSD:EL149705.1,
INSD:ES197541.1,INSD:ES113251.1,INSD:EL997839.1,
INSD:ES140201.1,INSD:ES193877.1,INSD:BP594571.1,
INSD:ES005552.1,INSD:EL320975.1,INSD:ES049824.1,
INSD:DR250144.1,INSD:EL221659.1,INSD:EL089801.1,
INSD:ES028393.1,INSD:ES170612.1,INSD:EL211572.1,
INSD:ES072756.1,INSD:EL075760.1,INSD:ES069531.1,
INSD:EL193269.1,INSD:CK121547.1,INSD:EH823220.1,
INSD:ES212357.1,INSD:ES131387.1,INSD:ES165331.1,
INSD:EH795996.1,INSD:CK118766.1,INSD:EL987636.1,
INSD:EL067492.1,INSD:EL128929.1,INSD:AV827071.1,
INSD:ES215640.1,INSD:EL975053.1,INSD:AV554685.1,
INSD:EL083337.1,INSD:EL079603.1,INSD:EH817285.1,
INSD:EG495329.1,INSD:AV812795.1,INSD:ES124236.1,
INSD:ES205601.1,INSD:EL281365.1,INSD:EL296123.1,
INSD:EG449268.1,INSD:EL253843.1,INSD:BP863023.1,
INSD:ES037667.1,INSD:EL994190.1,INSD:ES034180.1,
INSD:AV552435.1,INSD:ES167851.1,INSD:ES038119.1,
INSD:ES062736.1,INSD:EH912595.1,INSD:DR250150.1,
INSD:ES180879.1,INSD:ES196787.1,INSD:ES105188.1,
INSD:DR250156.1,INSD:DR250139.1,INSD:ES135681.1,
INSD:AV563983.1,INSD:EL147999.1,INSD:EL285113.1,
INSD:EL981365.1,INSD:EL199946.1,INSD:ES114170.1,
INSD:EH987674.1,INSD:EL328203.1,INSD:EL994755.1,
INSD:ES138666.1,INSD:EL157157.1,INSD:EL998066.1,
INSD:EL040287.1,INSD:EL014154.1,INSD:EH967676.1,
INSD:ES108928.1,INSD:ES199895.1,INSD:ES155726.1,
INSD:ES084572.1,INSD:EL330143.1,INSD:ES113933.1,
INSD:DR250136.1,INSD:EH847120.1,INSD:EH960316.1,
INSD:ES008699.1,INSD:EL237117.1,INSD:EL149929.1,
INSD:EH817417.1,INSD:DR250145.1,INSD:DR250135.1,
INSD:H37035.1,INSD:BP582830.1,INSD:BE845331.1,
INSD:ES114687.1,INSD:ES105498.1,INSD:ES188741.1,
INSD:EL988955.1,INSD:AV827171.1,INSD:ES210782.1,
INSD:DR250151.1,INSD:ES102911.1,INSD:EL999863.1,
INSD:ES167829.1,INSD:EL114230.1,INSD:ES026599.1,
INSD:EL044384.1,INSD:EL187027.1,INSD:ES208257.1,
INSD:ES156396.1,INSD:EL095726.1,INSD:ES180901.1,
INSD:EH953855.1,INSD:EL065996.1,INSD:EL083500.1,
INSD:EL982480.1,INSD:ES167627.1,INSD:DR376785.1,
INSD:ES130789.1,INSD:DR250141.1,INSD:EH851648.1,
INSD:EL263965.1,INSD:EH988880.1,INSD:ES105417.1,
INSD:ES102766.1,INSD:DR198832.1,INSD:EG484957.1,
INSD:EL982747.1,INSD:EH931289.1,INSD:BP786183.1,
INSD:BP793368.1,INSD:ES042388.1,INSD:EL092614.1,
INSD:ES127010.1,INSD:ES004852.1,INSD:EL112850.1,
INSD:AV797146.1,INSD:EH920048.1,INSD:ES063888.1,
INSD:ES090925.1,INSD:ES091760.1,INSD:EH927984.1,
INSD:EH877177.1,INSD:ES000407.1,INSD:ES158543.1,
INSD:ES047209.1,INSD:ES079238.1,INSD:EL978106.1,
INSD:DR250140.1,INSD:EH984673.1,INSD:AV556792.1,
INSD:DR250154.1,INSD:BP636015.1,INSD:Z25971.1,
INSD:ES015006.1,INSD:BP569182.1,INSD:ES019407.1,
INSD:EL198682.1,INSD:DR250149.1,INSD:DR250138.1,
INSD:ES128853.1,INSD:ES135644.1,INSD:DR250143.1,
INSD:EL327000.1,INSD:ES029019.1,INSD:EL061072.1,
INSD:ES185472.1,INSD:ES008495.1,INSD:EH831853.1,
INSD:ES177982.1,INSD:DR250147.1,INSD:EL980578.1,
INSD:ES002503.1,INSD:ES028846.1,INSD:BP581028.1,
INSD:EL178989.1,INSD:ES207357.1,INSD:ES155120.1,
INSD:ES117398.1,INSD:EL978177.1,INSD:EL124008.1,
INSD:ES022663.1,INSD:EL319085.1,INSD:EL085713.1,
INSD:ES058527.1,INSD:ES146110.1,INSD:EH878777.1,
INSD:AV557382.1,INSD:ES181108.1,INSD:AV560378.1,
INSD:EL027934.1,INSD:EL996031.1,INSD:ES005693.1,
INSD:ES141503.1,INSD:ES028396.1,INSD:EH987234.1,
INSD:EL967155.1,INSD:AV553553.1,INSD:DR250153.1,
INSD:EL971943.1,INSD:EH820549.1,INSD:DR250155.1,
INSD:ES194720.1,INSD:AV830727.1,INSD:ES048125.1,
INSD:EH810018.1,INSD:EL137923.1,INSD:BP563422.1,
INSD:AV552714.1,INSD:DR250137.1,INSD:ES177251.1,
INSD:ES162619.1,INSD:ES124605.1,INSD:EH967549.1,
INSD:ES197102.1,INSD:EL164569.1,INSD:EL162499.1,
INSD:EL012884.1,INSD:ES150593.1,INSD:EH877776.1,
INSD:EL090467.1,INSD:EL227180.1,INSD:EH871157.1,
INSD:ES185733.1,INSD:BP567621.1,INSD:ES011209.1,
INSD:AV566971.1,INSD:EL126380.1,INSD:DR372333.1,
INSD:CK119327.1,INSD:EL184462.1,INSD:EG449267.1,
INSD:EL113581.1,INSD:BP581926.1,INSD:ES034769.1,
INSD:ES100880.1,INSD:EL182076.1,INSD:EH957649.1,
INSD:ES181015.1,INSD:DR198830.1,INSD:DR250142.1,
INSD:EL220647.1,INSD:ES022829.1,INSD:EL318922.1,
INSD:ES207804.1,INSD:EL012146.1,INSD:DR250134.1,
INSD:EH817834.1,INSD:ES196145.1,INSD:ES166088.1,
INSD:ES031410.1,INSD:EH943591.1,INSD:ES187584.1,
INSD:EH840636.1,INSD:EH795642.1,INSD:ES175289.1,
INSD:AV557213.1,INSD:AV797429.1,INSD:T21881.1,
INSD:ES168548.1,INSD:EL264816.1,INSD:AV806651.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY058221.1,INSD:AF361610.1,INSD:BX827983.1,
INSD:AF367335.1"
/note="Ribosomal protein L2 family; FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome; INVOLVED IN:
translation; LOCATED IN: cytosolic ribosome, ribosome,
cytosolic large ribosomal subunit, plasma membrane,
vacuole; EXPRESSED IN: guard cell, cultured cell; CONTAINS
InterPro DOMAIN/s: Nucleic acid-binding, OB-fold
(InterPro:IPR012340), Ribosomal protein L2
(InterPro:IPR002171), Translation protein SH3-like
(InterPro:IPR008991), Nucleic acid-binding, OB-fold-like
(InterPro:IPR016027), Ribosomal protein L2, C-terminal
(InterPro:IPR022669), Ribosomal protein L2, domain 3
(InterPro:IPR014726), Ribosomal Proteins L2, RNA binding
domain (InterPro:IPR022666), Ribosomal protein L2,
conserved site (InterPro:IPR022671); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: Ribosomal protein L2 family
(TAIR:AT2G18020.1); Has 10610 Blast hits to 10603 proteins
in 3612 species: Archae - 317; Bacteria - 5622; Metazoa -
462; Fungi - 292; Plants - 1215; Viruses - 0; Other
Eukaryotes - 2702 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G36130"
/db_xref="Araport:AT4G36130"
intron_pos 147:2 (1/1)
BEGIN
1 MGRVIRAQRK GAGSVFKSHT HHRKGPAKFR SLDFGERNGY LKGVVTEIIH DPGRGAPLAR
61 VAFRHPFRFK KQKELFVAAE GMYTGQFLYC GKKATLVVGN VLPLRSIPEG AVICNVEHHV
121 GDRGVFARAS GDYAIVIAHN PDNDTSRIKL PSGSKKIVPS GCRAMIGQVA GGGRTEKPML
181 KAGNAYHKYR VKRNCWPKVR GVAMNPVEHP HGGGNHQHIG HASTVRRDAP PGKKVGLIAA
241 RRTGRLRGQA AALASKAD
//