LOCUS AEE86412.1 117 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana LYR family of Fe/S cluster biogenesis
protein protein.
ACCESSION CP002687-6424
PROTEIN_ID AEE86412.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="CIB22"
/locus_tag="AT4G34700"
/gene_synonym="AtCIB22"
/gene_synonym="B22 subunit of eukaryotic mitochondrial
Complex I"
/gene_synonym="T4L20.280"
/gene_synonym="T4L20_280"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:ES028357.1,INSD:BP840894.1,INSD:DR374292.1,
INSD:EL069294.1,INSD:CB253744.1,INSD:EH799470.1,
INSD:EL088427.1,INSD:ES206894.1,INSD:DR208720.1,
INSD:ES171226.1,INSD:EL226652.1,INSD:EL975736.1,
INSD:EL334657.1,INSD:DR208718.1,INSD:BP667866.1,
INSD:DR186573.1,INSD:DR208723.1,INSD:EL009781.1,
INSD:EH922797.1,INSD:EH924677.1,INSD:EL063862.1,
INSD:EG445827.1,INSD:EL245837.1,INSD:EH930029.1,
INSD:EL052288.1,INSD:EH826183.1,INSD:DR208733.1,
INSD:DR208731.1,INSD:EH904735.1,INSD:BP854219.1,
INSD:DR208713.1,INSD:EL187738.1,INSD:DR208722.1,
INSD:ES127236.1,INSD:ES131017.1,INSD:DR208777.1,
INSD:EL242914.1,INSD:DR208769.1,INSD:EL238973.1,
INSD:Z33673.1,INSD:DR208758.1,INSD:DR208754.1,
INSD:DR208795.1,INSD:DR208767.1,INSD:EL165857.1,
INSD:ES020420.1,INSD:EL103317.1,INSD:EH879944.1,
INSD:EL010199.1,INSD:BP824304.1,INSD:DR208752.1,
INSD:EL180424.1,INSD:DR208779.1,INSD:T04342.1,
INSD:DR208745.1,INSD:EL218047.1,INSD:ES004110.1,
INSD:DR208751.1,INSD:DR377066.1,INSD:EL107883.1,
INSD:BP625129.1,INSD:CK120656.1,INSD:AV533800.1,
INSD:DR208707.1,INSD:EH993620.1,INSD:ES030778.1,
INSD:EL328579.1,INSD:DR208712.1,INSD:DR208726.1,
INSD:EH819145.1,INSD:DR208781.1,INSD:DR377120.1,
INSD:EL038351.1,INSD:AV556201.1,INSD:EL249222.1,
INSD:DR208797.1,INSD:DR208727.1,INSD:DR208743.1,
INSD:EL151460.1,INSD:EL065434.1,INSD:EL340308.1,
INSD:DR208790.1,INSD:ES123724.1,INSD:DR208747.1,
INSD:ES093324.1,INSD:DR208737.1,INSD:EL056375.1,
INSD:EH812219.1,INSD:DR208732.1,INSD:EG421786.1,
INSD:EL219430.1,INSD:EH801236.1,INSD:DR377070.1,
INSD:DR208765.1,INSD:DR208735.1,INSD:EH812054.1,
INSD:EL133931.1,INSD:EG445810.1,INSD:EL106175.1,
INSD:AV535187.1,INSD:EG445813.1,INSD:ES052756.1,
INSD:DR208791.1,INSD:EG498989.1,INSD:ES166615.1,
INSD:DR208746.1,INSD:EH912706.1,INSD:DR186574.1,
INSD:DR208748.1,INSD:DR208753.1,INSD:EL285451.1,
INSD:EH884488.1,INSD:DR208787.1,INSD:EL149742.1,
INSD:EL067750.1,INSD:EL304742.1,INSD:EL332759.1,
INSD:DR208782.1,INSD:DR208768.1,INSD:DR208798.1,
INSD:DR208739.1,INSD:EL103619.1,INSD:BP856804.1,
INSD:EL014940.1,INSD:EH795459.1,INSD:ES209063.1,
INSD:EH833469.1,INSD:EL220711.1,INSD:DR208740.1,
INSD:EH863944.1,INSD:AA040992.1,INSD:AV536442.1,
INSD:ES210323.1,INSD:T43433.1,INSD:DR208788.1,
INSD:DR208744.1,INSD:DR208709.1,INSD:EH973408.1,
INSD:EH883485.1,INSD:EL214024.1,INSD:DR208708.1,
INSD:EL175134.1,INSD:H36271.1,INSD:EH927329.1,
INSD:DR208749.1,INSD:DR208759.1,INSD:CK119533.1,
INSD:DR208784.1,INSD:DR208785.1,INSD:DR208783.1,
INSD:T13747.1,INSD:EL050026.1,INSD:EH964221.1,
INSD:DR208742.1,INSD:EL188438.1,INSD:EL241034.1,
INSD:EL276690.1,INSD:ES197747.1,INSD:EL099265.1,
INSD:DR208730.1,INSD:EH986268.1,INSD:Z35607.1,
INSD:DR208715.1,INSD:EL028283.1,INSD:EL230214.1,
INSD:EH872724.1,INSD:DR208780.1,INSD:ES152492.1,
INSD:EH952859.1,INSD:EH881047.1,INSD:EL033180.1,
INSD:DR208755.1,INSD:DR208789.1,INSD:DR208711.1,
INSD:EH879320.1,INSD:ES008515.1,INSD:EH864057.1,
INSD:DR208766.1,INSD:ES166403.1,INSD:EL324248.1,
INSD:DR208761.1,INSD:EL195184.1,INSD:ES063671.1,
INSD:EL080953.1,INSD:DR208772.1,INSD:ES079387.1,
INSD:EH828203.1,INSD:EL050869.1,INSD:ES091809.1,
INSD:DR208770.1,INSD:DR208756.1,INSD:EL151214.1,
INSD:EL123911.1,INSD:BP630469.1,INSD:EH901074.1,
INSD:EL132548.1,INSD:BP662237.1,INSD:DR208775.1,
INSD:DR208760.1,INSD:DR208792.1,INSD:EH950265.1,
INSD:EL235243.1,INSD:DR208738.1,INSD:EG445811.1,
INSD:AV787684.1,INSD:DR208786.1,INSD:DR208741.1,
INSD:EL131365.1,INSD:ES093941.1,INSD:EL235626.1,
INSD:EL250074.1,INSD:EH900319.1,INSD:ES127636.1,
INSD:DR208724.1,INSD:ES137635.1,INSD:DR208776.1,
INSD:DR208725.1,INSD:ES007135.1,INSD:EL974544.1,
INSD:BP640379.1,INSD:EH851422.1,INSD:EH895649.1,
INSD:EL276535.1,INSD:ES023130.1,INSD:ES111642.1,
INSD:EH994968.1,INSD:EL010995.1,INSD:EH921682.1,
INSD:CK119974.1,INSD:EL077737.1,INSD:DR208771.1,
INSD:EL024399.1,INSD:EL104541.1,INSD:CB253741.1,
INSD:EL992771.1,INSD:ES188458.1,INSD:DR208721.1,
INSD:DR208714.1,INSD:DR372916.1,INSD:DR208774.1,
INSD:EL175654.1,INSD:AV534756.1,INSD:DR208729.1,
INSD:DR208773.1,INSD:DR208710.1,INSD:EL241626.1,
INSD:T43941.1,INSD:DR186577.1,INSD:BP560571.2,
INSD:CD533209.1,INSD:DR208734.1,INSD:AV824786.1,
INSD:ES108262.1,INSD:EL031844.1,INSD:EH940397.1,
INSD:EH994702.1,INSD:DR208728.1,INSD:EL013378.1,
INSD:EL138908.1,INSD:EL126095.1,INSD:ES155247.1,
INSD:DR186578.1,INSD:DR208794.1,INSD:DR208763.1,
INSD:DR208778.1,INSD:ES175558.1,INSD:EH962656.1,
INSD:DR186571.1,INSD:DR208764.1,INSD:ES125627.1,
INSD:DR208716.1,INSD:EL249316.1,INSD:DR377110.1,
INSD:CK120109.1,INSD:DR208717.1,INSD:EL228964.1,
INSD:EH912615.1,INSD:BP832322.1,INSD:DR186572.1,
INSD:EL287385.1,INSD:ES101798.1,INSD:CK117749.1,
INSD:EH883413.1,INSD:DR208793.1,INSD:DR186575.1,
INSD:EG485467.1,INSD:EL335647.1,INSD:EL067476.1,
INSD:DR208757.1,INSD:EL031591.1,INSD:DR377527.1,
INSD:DR208736.1,INSD:AI992559.1,INSD:EL285270.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX828064.1,INSD:AY085825.1,INSD:BT001011.1,
INSD:AF412069.1"
/note="LYR family of Fe/S cluster biogenesis protein;
FUNCTIONS IN: catalytic activity; INVOLVED IN:
photorespiration; LOCATED IN: mitochondrial membrane,
plasma membrane, respiratory chain complex I; EXPRESSED
IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth
stages; Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780
species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338;
Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes
- 2996 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G34700"
/db_xref="Araport:AT4G34700"
intron_pos 45:0 (1/4)
intron_pos 59:0 (2/4)
intron_pos 86:1 (3/4)
intron_pos 105:0 (4/4)
BEGIN
1 MSGVSTAAYF ARRAAQKERV RILYRRALKD TLNWAVHRHI FYRDASDLRE KFNVNQDVED
61 VDRIDKLIAH GEAEYNKWRH PDPYIVPWAP GGSKFCRNPT PPAGIEIVYN YGLEDNP
//