LOCUS AEE86362.1 466 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana 4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate
reductase protein.
ACCESSION CP002687-6358
PROTEIN_ID AEE86362.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="HDR"
/locus_tag="AT4G34350"
/gene_synonym="4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate
reductase"
/gene_synonym="CHLOROPLAST BIOGENESIS 6"
/gene_synonym="CLB6"
/gene_synonym="F10M10.120"
/gene_synonym="F10M10_120"
/gene_synonym="ISPH"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:BP849126.1,INSD:EL124575.1,INSD:EL192400.1,
INSD:EL139746.1,INSD:EL220222.1,INSD:EL162129.1,
INSD:EL226011.1,INSD:EL202807.1,INSD:EH855878.1,
INSD:EL213227.1,INSD:EH860454.1,INSD:EL118160.1,
INSD:EH876713.1,INSD:EH947825.1,INSD:EL041632.1,
INSD:BP845970.1,INSD:EL158923.1,INSD:EH827632.1,
INSD:Z26425.1,INSD:EL091656.1,INSD:EL126583.1,
INSD:AV818752.1,INSD:EH973921.1,INSD:EL310852.1,
INSD:EL159720.1,INSD:EL146540.1,INSD:EH937872.1,
INSD:EL287059.1,INSD:EH964433.1,INSD:AV808997.1,
INSD:EH877217.1,INSD:EL166307.1,INSD:EH871578.1,
INSD:AV809010.1,INSD:EL062761.1,INSD:EL311973.1,
INSD:EL134523.1,INSD:AV828126.1,INSD:EL291015.1,
INSD:CK119038.1,INSD:BP613623.1,INSD:EL103080.1,
INSD:EL301839.1,INSD:BP858841.1,INSD:BP867489.1,
INSD:BP600156.1,INSD:EL119267.1,INSD:EH974020.1,
INSD:DR278288.1,INSD:EL142324.1,INSD:EH973068.1,
INSD:EH848258.1,INSD:EH813707.1,INSD:EL255203.1,
INSD:BP563567.1,INSD:EL137154.1,INSD:EL060161.1,
INSD:EH978459.1,INSD:EL134370.1,INSD:ES067582.1,
INSD:ES010295.1,INSD:EH827773.1,INSD:EL146192.1,
INSD:EL043339.1,INSD:EL304942.1,INSD:EH854571.1,
INSD:DR332388.1,INSD:EL217962.1,INSD:BP846689.1,
INSD:EL044607.1,INSD:EL033620.1,INSD:EG478385.1,
INSD:EL169665.1,INSD:DR374404.1,INSD:EH901196.1,
INSD:EL229962.1,INSD:EL121653.1,INSD:EH975064.1,
INSD:EL086630.1,INSD:EH890846.1,INSD:BP564436.1,
INSD:EL171131.1,INSD:EH808218.1,INSD:BP612336.1,
INSD:EG490061.1,INSD:EL241846.1,INSD:EH891824.1,
INSD:BP671257.1,INSD:AV809616.1,INSD:AV812679.1,
INSD:EH962719.1,INSD:AV804220.1,INSD:BP851623.1,
INSD:EL217357.1,INSD:ES034247.1,INSD:EH971086.1,
INSD:EL199261.1,INSD:AV813884.1,INSD:EL015662.1,
INSD:EL111301.1,INSD:EL251818.1,INSD:AV547922.1,
INSD:AV804533.1,INSD:EL217477.1,INSD:EL098362.1,
INSD:EH874576.1,INSD:BP847236.1,INSD:EL320338.1,
INSD:EL007998.1,INSD:EL141585.1,INSD:AV802637.1,
INSD:EL101048.1,INSD:AV560306.1,INSD:EL340949.1,
INSD:EH886012.1,INSD:BP828406.1,INSD:DR332391.1,
INSD:BE038689.1,INSD:EL070802.1,INSD:EL128048.1,
INSD:BP809524.1,INSD:BP575679.1,INSD:EH820497.1,
INSD:BU635200.1,INSD:EL301491.1,INSD:EL101313.1,
INSD:EL153898.1,INSD:ES215718.1,INSD:EH989736.1,
INSD:EL099814.1,INSD:EH956747.1,INSD:EL260336.1,
INSD:EL209735.1,INSD:EH819399.1,INSD:BP804100.1,
INSD:DR380603.1,INSD:ES048275.1,INSD:EL325223.1,
INSD:EL325193.1,INSD:DR278289.1,INSD:EL328699.1,
INSD:EL148460.1,INSD:EL226829.1,INSD:EH882033.1,
INSD:EL285050.1,INSD:EL178298.1,INSD:EL057183.1,
INSD:AV566283.1,INSD:EL268612.1,INSD:EL185471.1,
INSD:EL216548.1,INSD:EH845891.1,INSD:AV532741.1,
INSD:AV821818.1,INSD:EL002362.1,INSD:EH923184.1,
INSD:CD531366.1,INSD:EL318807.1,INSD:EL104211.1,
INSD:EH895760.1,INSD:EL050249.1,INSD:EL232182.1,
INSD:BP864007.1,INSD:EL210309.1,INSD:BP807406.1,
INSD:EL227219.1,INSD:EL177692.1,INSD:EL049411.1,
INSD:ES009420.1,INSD:BP669962.1,INSD:EH842573.1,
INSD:EL012696.1,INSD:EL101988.1,INSD:Z34640.1,
INSD:EH912586.1,INSD:EH990606.1,INSD:EL182473.1,
INSD:AA605545.1,INSD:CD529693.1,INSD:EL149562.1,
INSD:Z34228.1,INSD:EL226871.1,INSD:AV798401.1,
INSD:BP670757.1,INSD:EL213621.1,INSD:AV562362.1,
INSD:EL007579.1,INSD:EL186146.1,INSD:EH879746.1,
INSD:BP623085.1,INSD:EL182013.1,INSD:EL299609.1,
INSD:BP862670.1,INSD:BP801919.1,INSD:BP844483.1,
INSD:EL177451.1,INSD:EL137105.1,INSD:EL016938.1,
INSD:EL228441.1,INSD:EL243020.1,INSD:EL216652.1,
INSD:EL053628.1,INSD:BP868909.1,INSD:EH906361.1,
INSD:EL310528.1,INSD:BP848296.1,INSD:BP619851.1,
INSD:DR332390.1,INSD:EH931977.1,INSD:EH829947.1,
INSD:AV786642.1,INSD:BP860623.1,INSD:EL066839.1,
INSD:ES015716.1,INSD:EL236071.1,INSD:EL321173.1,
INSD:EL275516.1,INSD:EH953459.1,INSD:BP855560.1,
INSD:EL064916.1,INSD:EL264110.1,INSD:EL147686.1,
INSD:EH871677.1,INSD:EL051434.1,INSD:EL004120.1,
INSD:EH907497.1,INSD:EL119522.1,INSD:EL184122.1,
INSD:BP843666.1,INSD:EL151819.1,INSD:EL290002.1,
INSD:BP616077.1,INSD:EL320519.1,INSD:BP573813.1,
INSD:EL085579.1,INSD:EH935423.1,INSD:EL261445.1,
INSD:EL056065.1,INSD:EH806753.1,INSD:EH863269.1,
INSD:EL233220.1,INSD:EL068437.1,INSD:ES123633.1,
INSD:EH854467.1,INSD:EH808370.1,INSD:BP642402.1,
INSD:Z30476.1,INSD:EH926127.1,INSD:BP863811.1,
INSD:EL084670.1,INSD:EH842038.1,INSD:EL178783.1,
INSD:ES120897.1,INSD:AV555364.1,INSD:EL184588.1,
INSD:EH892647.1,INSD:DR332389.1,INSD:EH842729.1,
INSD:EL065670.1,INSD:BP851568.1,INSD:EL173767.1,
INSD:BP793598.1,INSD:EL302340.1,INSD:EL147209.1,
INSD:BP810677.1,INSD:EL036939.1,INSD:EL072581.1,
INSD:EL265626.1,INSD:EL159549.1,INSD:EH887157.1,
INSD:EL294977.1,INSD:EL329117.1,INSD:EH995090.1,
INSD:EL046057.1,INSD:CK118785.1,INSD:EL270852.1,
INSD:BP635429.1,INSD:AV788734.1,INSD:EH805795.1,
INSD:EL182997.1,INSD:BP637413.1,INSD:EH839387.1,
INSD:EH946411.1,INSD:EL150798.1,INSD:EL236263.1,
INSD:EL270544.1,INSD:BP601233.1,INSD:EL215596.1,
INSD:BP617934.1,INSD:AV805631.1,INSD:EH803253.1,
INSD:BP638892.1,INSD:EL127166.1,INSD:EH883950.1,
INSD:EH876792.1,INSD:BP812652.1,INSD:EL010181.1,
INSD:EL025194.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY168881.1,INSD:AY081454.1,INSD:AY042877.1,
INSD:AK222055.1"
/note="4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase
(HDR); FUNCTIONS IN: 4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl
diphosphate reductase activity,
4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase
activity; INVOLVED IN: response to antibiotic, isopentenyl
diphosphate biosynthetic process, mevalonate-independent
pathway; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast;
EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: LytB protein
(InterPro:IPR003451); Has 30201 Blast hits to 17322
proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396;
Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G34350"
/db_xref="Araport:AT4G34350"
intron_pos 93:1 (1/9)
intron_pos 159:0 (2/9)
intron_pos 219:0 (3/9)
intron_pos 263:0 (4/9)
intron_pos 288:0 (5/9)
intron_pos 323:1 (6/9)
intron_pos 355:0 (7/9)
intron_pos 417:0 (8/9)
intron_pos 446:0 (9/9)
BEGIN
1 MAVALQFSRL CVRPDTFVRE NHLSGSGSLR RRKALSVRCS SGDENAPSPS VVMDSDFDAK
61 VFRKNLTRSD NYNRKGFGHK EETLKLMNRE YTSDILETLK TNGYTYSWGD VTVKLAKAYG
121 FCWGVERAVQ IAYEARKQFP EERLWITNEI IHNPTVNKRL EDMDVKIIPV EDSKKQFDVV
181 EKDDVVILPA FGAGVDEMYV LNDKKVQIVD TTCPWVTKVW NTVEKHKKGE YTSVIHGKYN
241 HEETIATASF AGKYIIVKNM KEANYVCDYI LGGQYDGSSS TKEEFMEKFK YAISKGFDPD
301 NDLVKVGIAN QTTMLKGETE EIGRLLETTM MRKYGVENVS GHFISFNTIC DATQERQDAI
361 YELVEEKIDL MLVVGGWNSS NTSHLQEISE ARGIPSYWID SEKRIGPGNK IAYKLHYGEL
421 VEKENFLPKG PITIGVTSGA STPDKVVEDA LVKVFDIKRE ELLQLA
//