LOCUS AEE85947.1 188 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana ribosomal protein S6 protein.
ACCESSION CP002687-5790
PROTEIN_ID AEE85947.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="RPS6"
/locus_tag="AT4G31700"
/gene_synonym="AtRPS6"
/gene_synonym="F28M20.110"
/gene_synonym="F28M20_110"
/gene_synonym="ribosomal protein S6"
/gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN S6"
/gene_synonym="RPS6A"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:ES009606.1,INSD:BP648837.1,INSD:ES007702.1,
INSD:EL983752.1,INSD:EL201051.1,INSD:ES161700.1,
INSD:ES092125.1,INSD:EL017131.1,INSD:EH917478.1,
INSD:ES171541.1,INSD:ES135316.1,INSD:ES176528.1,
INSD:EL174174.1,INSD:ES087986.1,INSD:ES151350.1,
INSD:DR375328.1,INSD:BP641264.1,INSD:ES135185.1,
INSD:EL223301.1,INSD:EL121011.1,INSD:EL984436.1,
INSD:AV555414.1,INSD:ES123096.1,INSD:EL996763.1,
INSD:ES012692.1,INSD:BP791686.1,INSD:EL995192.1,
INSD:EG444328.1,INSD:ES105593.1,INSD:EL124338.1,
INSD:Z26511.1,INSD:EH834570.1,INSD:BP657995.1,
INSD:ES044916.1,INSD:AI100228.1,INSD:BP577131.1,
INSD:EG472245.1,INSD:EL253803.1,INSD:AV791144.1,
INSD:EL171099.1,INSD:EL321221.1,INSD:EH888595.1,
INSD:EL016535.1,INSD:ES034912.1,INSD:EL295713.1,
INSD:EL998515.1,INSD:EH965030.1,INSD:EG439875.1,
INSD:EL008042.1,INSD:ES102158.1,INSD:BP793261.1,
INSD:EL325211.1,INSD:AV804183.1,INSD:ES101571.1,
INSD:EL066626.1,INSD:ES203956.1,INSD:ES075634.1,
INSD:ES093007.1,INSD:BP793808.1,INSD:CK118498.1,
INSD:ES094316.1,INSD:EL051822.1,INSD:EL142417.1,
INSD:ES147528.1,INSD:ES011077.1,INSD:DR333653.1,
INSD:DR336326.1,INSD:EH906377.1,INSD:ES095542.1,
INSD:CK119198.1,INSD:EL131095.1,INSD:EL065927.1,
INSD:BP781854.1,INSD:EL263453.1,INSD:EL055040.1,
INSD:EL997196.1,INSD:EH929887.1,INSD:BP663057.1,
INSD:EL982946.1,INSD:EL015105.1,INSD:ES109693.1,
INSD:ES125141.1,INSD:ES061976.1,INSD:ES166553.1,
INSD:EL980701.1,INSD:ES169778.1,INSD:EL996761.1,
INSD:ES069046.1,INSD:EL326049.1,INSD:EL272107.1,
INSD:ES059687.1,INSD:ES130324.1,INSD:EL970780.1,
INSD:EH869918.1,INSD:BP586474.1,INSD:EL166972.1,
INSD:ES084742.1,INSD:ES104914.1,INSD:EL987965.1,
INSD:EH877669.1,INSD:EL992133.1,INSD:EL993136.1,
INSD:EH884456.1,INSD:EL061732.1,INSD:BP789206.1,
INSD:EH913496.1,INSD:ES006740.1,INSD:EH865701.1,
INSD:EH833256.1,INSD:ES166304.1,INSD:ES065445.1,
INSD:ES047552.1,INSD:ES024896.1,INSD:EL969422.1,
INSD:EL275243.1,INSD:ES156065.1,INSD:EH968441.1,
INSD:EL338661.1,INSD:EL335123.1,INSD:EH934111.1,
INSD:ES060998.1,INSD:AV800990.1,INSD:ES058734.1,
INSD:ES011915.1,INSD:EL975344.1,INSD:EL268285.1,
INSD:EG480811.1,INSD:ES020097.1,INSD:EH974079.1,
INSD:ES172063.1,INSD:EL334469.1,INSD:EL998257.1,
INSD:ES211564.1,INSD:DR336327.1,INSD:ES159504.1,
INSD:EL193077.1,INSD:EL006643.1,INSD:EL286577.1,
INSD:ES161201.1,INSD:EH968934.1,INSD:ES082599.1,
INSD:EH921753.1,INSD:EL976828.1,INSD:ES032106.1,
INSD:EG439876.1,INSD:EL981106.1,INSD:EH958358.1,
INSD:ES180740.1,INSD:DR375238.1,INSD:EH907515.1,
INSD:EL985364.1,INSD:ES147764.1,INSD:ES212198.1,
INSD:ES137010.1,INSD:AV814810.1,INSD:EG422230.1,
INSD:EL977195.1,INSD:ES010774.1,INSD:ES026956.1,
INSD:DR333659.1,INSD:ES188794.1,INSD:EL231591.1,
INSD:EL199523.1,INSD:ES015304.1,INSD:EL968390.1,
INSD:EL148253.1,INSD:EL986211.1,INSD:EL030129.1,
INSD:EL272433.1,INSD:EL310798.1,INSD:BP782916.1,
INSD:EL287802.1,INSD:EL986783.1,INSD:EL102962.1,
INSD:EL998972.1,INSD:EH802691.1,INSD:EH858550.1,
INSD:Z26048.1,INSD:EH926032.1,INSD:EL187193.1,
INSD:ES068625.1,INSD:ES153510.1,INSD:DR333699.1,
INSD:ES043019.1,INSD:ES023016.1,INSD:EL970392.1,
INSD:EL135999.1,INSD:ES014424.1,INSD:ES205702.1,
INSD:ES113403.1,INSD:ES097960.1,INSD:ES160737.1,
INSD:EL144816.1,INSD:ES209700.1,INSD:EL107903.1,
INSD:EG468951.1,INSD:EL976491.1,INSD:EL025148.1,
INSD:ES101958.1,INSD:EL982210.1,INSD:ES106109.1,
INSD:EL990999.1,INSD:BP793805.1,INSD:EL094907.1,
INSD:ES075347.1,INSD:AV549246.1,INSD:ES214269.1,
INSD:AV537918.1,INSD:ES043532.1,INSD:AV808855.1,
INSD:EL300963.1,INSD:EG480810.1,INSD:EG468940.1,
INSD:ES201060.1,INSD:ES201831.1,INSD:ES143446.1,
INSD:AV791312.1,INSD:EH843211.1,INSD:EH965554.1,
INSD:ES065450.1,INSD:AV567584.1,INSD:EG439277.1,
INSD:ES118832.1,INSD:ES190218.1,INSD:ES090366.1,
INSD:ES152761.1,INSD:EL127483.1,INSD:DR377056.1,
INSD:EL983438.1,INSD:EH880629.1,INSD:ES007525.1,
INSD:EL990892.1,INSD:EL995565.1,INSD:ES160706.1,
INSD:EG445041.1,INSD:BP780993.1,INSD:ES184258.1,
INSD:EH796272.1,INSD:DR333650.1,INSD:AV799241.1,
INSD:EL149345.1,INSD:BP778907.1,INSD:EL325793.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX827692.1,INSD:BX828344.1"
/note="ribosomal protein S6 (RPS6); FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: growth,
translation; LOCATED IN: cytosolic small ribosomal
subunit, plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 28 plant
structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS
InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S6e
(InterPro:IPR001377); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: Ribosomal protein S6e (TAIR:AT5G10360.1); Has
870 Blast hits to 868 proteins in 314 species: Archae -
19; Bacteria - 0; Metazoa - 402; Fungi - 166; Plants -
138; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 145 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G31700"
/db_xref="Araport:AT4G31700"
intron_pos 18:1 (1/2)
intron_pos 109:1 (2/2)
BEGIN
1 MKQGVLTPGR VRLLLHRGTP CFRGHGRRTG ERRRKSVRGC IVSPDLSVLN LVIVKKGEND
61 LPGLTDTEKP RMRGPKRASK IRKLFNLKKE DDVRTYVNTY RRKFTNKKGK EVSKAPKIQR
121 LVTPLTLQRK RARIADKKKK IAKANSDAAD YQKLLASRLK EQRDRRSESL AKKRSRLSSA
181 AAKPSVTA
//