LOCUS AEE85580.1 953 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana elongation factor Ts family protein protein.
ACCESSION CP002687-5289
PROTEIN_ID AEE85580.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="emb2726"
/locus_tag="AT4G29060"
/gene_synonym="embryo defective 2726"
/gene_synonym="F19B15.90"
/gene_synonym="F19B15_90"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH884446.1,INSD:EL210138.1,INSD:EL191882.1,
INSD:ES049214.1,INSD:BP607193.1,INSD:EL089755.1,
INSD:EL309674.1,INSD:EL300240.1,INSD:EL027064.1,
INSD:AV792773.1,INSD:EH838258.1,INSD:EL229737.1,
INSD:EL262671.1,INSD:EL266843.1,INSD:AV814756.1,
INSD:N96661.1,INSD:EL126996.1,INSD:ES001986.1,
INSD:EL227712.1,INSD:EH911741.1,INSD:EL095894.1,
INSD:EL013952.1,INSD:EL186726.1,INSD:EL292653.1,
INSD:EL288977.1,INSD:AV831088.1,INSD:EH929699.1,
INSD:BP618908.1,INSD:EL093960.1,INSD:EH960771.1,
INSD:EL253458.1,INSD:EG454337.1,INSD:EH908731.1,
INSD:EH961036.1,INSD:EH885709.1,INSD:EL298701.1,
INSD:EL153987.1,INSD:EL108609.1,INSD:EH973978.1,
INSD:EL039906.1,INSD:EH827883.1,INSD:EL073266.1,
INSD:ES190698.1,INSD:EG454338.1,INSD:EH890845.1,
INSD:AV440565.1,INSD:EL164232.1,INSD:ES136802.1,
INSD:EL149074.1,INSD:EL262237.1,INSD:EL010834.1,
INSD:EL082521.1,INSD:EL334088.1,INSD:EL022801.1,
INSD:EL095235.1,INSD:EL175659.1,INSD:W43841.1,
INSD:EH798488.1,INSD:EH941216.1,INSD:EH911865.1,
INSD:EL239216.1,INSD:EH862550.1,INSD:EL124470.1,
INSD:BP791361.1,INSD:EL085744.1,INSD:ES034409.1,
INSD:EL150736.1,INSD:EL111463.1,INSD:EL166400.1,
INSD:EL215905.1,INSD:EL016097.1,INSD:ES198031.1,
INSD:EH815106.1,INSD:BP785825.1,INSD:ES164114.1,
INSD:BP780079.1,INSD:EL007655.1,INSD:EL001737.1,
INSD:EH808138.1,INSD:EL212844.1,INSD:EH987928.1,
INSD:EL153141.1,INSD:EL186385.1,INSD:EL222066.1,
INSD:EH813103.1,INSD:EH877098.1,INSD:AV555490.1,
INSD:EH957202.1,INSD:EL077457.1,INSD:W43663.1,
INSD:EH958296.1,INSD:EL225144.1,INSD:EL196492.1,
INSD:EL181766.1,INSD:EH919535.1,INSD:ES095804.1,
INSD:EH883359.1,INSD:EL249203.1,INSD:EH833946.1,
INSD:EH816517.1,INSD:EH907986.1,INSD:EH929151.1,
INSD:EL013625.1,INSD:EH808624.1,INSD:EH991250.1,
INSD:EL042547.1,INSD:EH855566.1,INSD:EL168074.1,
INSD:EL199765.1,INSD:EH843529.1,INSD:EH944167.1,
INSD:EH846565.1,INSD:EH827174.1,INSD:ES074187.1,
INSD:EL305221.1,INSD:EH844466.1,INSD:EL247218.1,
INSD:ES156296.1,INSD:EL110507.1,INSD:EH969974.1,
INSD:EH804735.1,INSD:BP777542.1,INSD:EL341194.1,
INSD:EH873185.1,INSD:ES005780.1,INSD:AV827800.1,
INSD:EL247992.1,INSD:AI999729.1,INSD:EL201134.1,
INSD:ES213408.1,INSD:ES153699.1,INSD:AV785961.1,
INSD:EH991440.1,INSD:EL048397.1,INSD:EL166258.1,
INSD:EL080169.1,INSD:EL286490.1,INSD:EH973928.1,
INSD:EL062274.1,INSD:BP793950.1,INSD:EL338614.1,
INSD:AV830205.1,INSD:EL253431.1,INSD:EL262023.1,
INSD:AV810626.1,INSD:ES081672.1,INSD:EL153008.1,
INSD:EH848373.1,INSD:EL211099.1,INSD:EL314846.1,
INSD:EL278810.1,INSD:EL244844.1,INSD:EL330002.1,
INSD:BP590871.1,INSD:EL003612.1,INSD:EL127579.1,
INSD:EL159834.1,INSD:EL156580.1,INSD:AV830654.1,
INSD:EH932753.1,INSD:EL157401.1,INSD:BP782583.1,
INSD:AV823551.1,INSD:EL229601.1,INSD:BP778074.1,
INSD:ES124616.1,INSD:DR359410.1,INSD:EL268673.1,
INSD:EL039859.1,INSD:EH816244.1,INSD:EH892632.1,
INSD:EL147893.1,INSD:AV799459.1,INSD:EL225945.1,
INSD:EL236176.1,INSD:EH828775.1,INSD:EL218801.1,
INSD:EL049226.1,INSD:EL254696.1,INSD:EL115587.1,
INSD:EL262046.1,INSD:EL132947.1,INSD:EH808729.1,
INSD:EH844590.1,INSD:EL242578.1,INSD:EL075202.1,
INSD:EL171310.1,INSD:EL024717.1,INSD:EH798510.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AK226393.1,INSD:BX828821.1,INSD:AY056792.1,
INSD:AK226820.1"
/note="embryo defective 2726 (emb2726); FUNCTIONS IN: RNA
binding, translation elongation factor activity; INVOLVED
IN: translational elongation, response to cadmium ion,
embryo development ending in seed dormancy; LOCATED IN:
chloroplast stroma, chloroplast, chloroplast envelope;
EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleic
acid-binding, OB-fold (InterPro:IPR012340),
Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B,
N-terminal (InterPro:IPR000449), Ribosomal protein S1,
RNA-binding domain (InterPro:IPR003029), Translation
elongation factor EFTs/EF1B (InterPro:IPR001816),
Translation elongation factor EFTs/EF1B, dimerisation
(InterPro:IPR014039), Nucleic acid-binding, OB-fold-like
(InterPro:IPR016027), Translation elongation factor Ts,
conserved site (InterPro:IPR018101), UBA-like
(InterPro:IPR009060); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: translation elongation factor Ts (EF-Ts),
putative (TAIR:AT4G11120.1); Has 30201 Blast hits to 17322
proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396;
Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G29060"
/db_xref="Araport:AT4G29060"
intron_pos 449:1 (1/5)
intron_pos 518:1 (2/5)
intron_pos 616:0 (3/5)
intron_pos 751:2 (4/5)
intron_pos 860:0 (5/5)
BEGIN
1 MATITPSSIS NAWLIPGASF TVKKSDCSIK CSFSRKAGKQ ILSSTQRLVL PLSTSLRLFP
61 THGRQFVLHP HRRATGTDVV AAVEEQDSTP VVAEDKETVA SEKSDAPAPT SQSRGTARPG
121 RKSEMPAVKN EELVPGATFT GKVRAIQPFG AFVDFGAFTD GLVHVSQLSD NFVKDVSSVV
181 TIGQEVKVRL VEADIESKRI SLTMRENDDP PKRQSGGSDK PRSGGKRDGS KGGGQRKGEG
241 FNSKFAKGQM LDGVVKNLTR SGAFITIGEG EEGFLPTAEE ADDGIGSMMM GGSSLQAGQE
301 VKVRVLRIAR GRVTLTMKEE DDGKFDETTT QGVVHTATNP FMLAFRKNEE IAAFLDKREE
361 EAEKPPVETP VEPEAEASVT SAEVEESVCV PAEVTSEEVP SSETPKVVEE EVIATKAEDD
421 SPEKEEQTET LAAAAEAEEV VPPIPETKSE EEIVENSIPP NSATDEVSSP EALASEEVEK
481 EQVVAETPVD EVKTPAPVVT EASSEESGNT ATAESIKGIS PALVKQLREE TGAGMMDCKN
541 ALSESEGDMV KAQEYLRKKG LASADKKASR ATSEGRIGAY IHDSRIGVLL EVNCETDFVS
601 RGDIFKELVD DLAMQVAACP QVEYLVTEDV SEEIVKKEKE IEMQKEDLLS KPEQIREKIV
661 DGRIKKRLDS LALLEQPYIK DDKVIVKDLV KQRIATIGEN IKVKRFVRYT LGEGLEKKSQ
721 DFAAEVAAQT AAKPKAKEEP KAEEAKEAVA SPPTTVVSAA LVKQLREETG AGMMDCKKAL
781 AATGGDLEKA QEFLRKKGLS SADKKSSRLA SEGRIGSYIH DSRIGVLIEV NCETDFVGRS
841 EKFKELVDDL AMQAVANPQV QYVSIEDIPE EIKQKEKEIE MQREDLLSKP ENIREKIVEG
901 RISKRLGEWA LLEQPYIKDD SVLVKDLVKQ TVATLGENIK VRRFVKFTLG EDN
//