LOCUS AEE85260.1 442 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana GDP-L-galactose phosphorylase 1 protein.
ACCESSION CP002687-4854
PROTEIN_ID AEE85260.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="VTC2"
/locus_tag="AT4G26850"
/gene_synonym="F10M23.190"
/gene_synonym="F10M23_190"
/gene_synonym="vitamin c defective 2"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL085999.1,INSD:EG519306.1,INSD:BP778360.1,
INSD:EH958812.1,INSD:EL050181.1,INSD:EH855112.1,
INSD:BP866802.1,INSD:BP646484.1,INSD:AA404925.1,
INSD:AV817087.1,INSD:AV800390.1,INSD:EL107274.1,
INSD:BP640145.1,INSD:EL060590.1,INSD:EH822044.1,
INSD:AV790095.1,INSD:EL318280.1,INSD:EL338647.1,
INSD:EL087564.1,INSD:BP588869.1,INSD:AA605436.1,
INSD:EG498730.1,INSD:BP785694.1,INSD:BP651332.1,
INSD:EL277957.1,INSD:ES201637.1,INSD:EH976433.1,
INSD:BE037566.1,INSD:AV799837.1,INSD:EL020946.1,
INSD:EL186836.1,INSD:AI997404.1,INSD:EH926486.1,
INSD:EH858960.1,INSD:EH825131.1,INSD:DR354478.1,
INSD:EH938620.1,INSD:EL036067.1,INSD:EH908109.1,
INSD:BP865842.1,INSD:EH954880.1,INSD:BP834757.1,
INSD:AV797325.1,INSD:EL185114.1,INSD:AV818611.1,
INSD:EL297725.1,INSD:EL313244.1,INSD:EH827284.1,
INSD:EL171429.1,INSD:EL175780.1,INSD:AV524815.2,
INSD:EG518441.1,INSD:EH806832.1,INSD:AV791582.1,
INSD:EH797239.1,INSD:EL150510.1,INSD:BP781238.1,
INSD:EH858228.1,INSD:BU635587.1,INSD:AV831598.1,
INSD:EL312388.1,INSD:BP628097.1,INSD:BP786520.1,
INSD:BP812318.1,INSD:EH816228.1,INSD:EH899922.1,
INSD:ES168153.1,INSD:EH961621.1,INSD:BP808643.1,
INSD:BP791952.1,INSD:ES157274.1,INSD:AV805579.1,
INSD:EL165239.1,INSD:BP793481.1,INSD:EH896445.1,
INSD:BP827238.1,INSD:AV809580.1,INSD:AA598191.1,
INSD:EH896001.1,INSD:EL282575.1,INSD:EL089340.1,
INSD:AV518363.1,INSD:AV788831.1,INSD:EH823713.1,
INSD:AV792156.1,INSD:EH961159.1,INSD:EL069446.1,
INSD:AV816712.1,INSD:EH821456.1,INSD:BP634649.1,
INSD:EL312220.1,INSD:ES023858.1,INSD:EH960452.1,
INSD:BP791623.1,INSD:EH958743.1,INSD:EH955717.1,
INSD:AV808158.1,INSD:BP562241.1,INSD:EH831270.1,
INSD:BP781416.1,INSD:EH800748.1,INSD:BP790193.1,
INSD:BP814572.1,INSD:BP591365.1,INSD:EH995101.1,
INSD:EH869289.1,INSD:AV803047.1,INSD:BP585738.1,
INSD:BP787516.1,INSD:EH873769.1,INSD:EL027714.1,
INSD:CB262933.1,INSD:EL266844.1,INSD:BP788344.1,
INSD:AV798447.1,INSD:EH817311.1,INSD:BP629380.1,
INSD:EL262759.1,INSD:BP815764.2,INSD:BP784475.1,
INSD:EH836983.1,INSD:EL005091.1,INSD:BP831080.2,
INSD:BP787423.1,INSD:EL159902.1,INSD:EH795310.1,
INSD:BE526543.1,INSD:EL294952.1,INSD:BP827368.2,
INSD:AV786666.1,INSD:EL022308.1,INSD:EL313172.1,
INSD:DR359561.1,INSD:DR281485.1,INSD:EL105682.1,
INSD:AV793246.1,INSD:EL337563.1,INSD:BE522392.1,
INSD:EL993696.1,INSD:BP597441.1,INSD:BP789287.1,
INSD:EL337518.1,INSD:BP792658.1,INSD:EH884451.1,
INSD:AV789831.1,INSD:BP821707.1,INSD:AV816934.1,
INSD:EH942334.1,INSD:EH810611.1,INSD:H36924.1,
INSD:EH991477.1,INSD:EL027574.1,INSD:ES076373.1,
INSD:EL183826.1,INSD:BP785997.1,INSD:EH907221.1,
INSD:BP596421.1,INSD:EL263681.1,INSD:AV815595.1,
INSD:BP817862.1,INSD:EL057374.1,INSD:EH861353.1,
INSD:BP814476.1,INSD:EH862427.1,INSD:EL177512.1,
INSD:EH982630.1,INSD:BU635601.1,INSD:EH890533.1,
INSD:BP838042.1,INSD:EL293710.1,INSD:BP782673.1,
INSD:BP777802.1,INSD:EL287934.1,INSD:EL335018.1,
INSD:CA781959.1,INSD:BP786607.1,INSD:EL124845.1,
INSD:EL043197.1,INSD:BP794796.1,INSD:EL186342.1,
INSD:AV796273.1,INSD:BP638555.1,INSD:EL082885.1,
INSD:BP644800.1,INSD:BP592634.1,INSD:BP784844.1,
INSD:EL143253.1,INSD:BP811672.1,INSD:EL230125.1,
INSD:EG481864.1,INSD:AI993313.1,INSD:EH924655.1,
INSD:EL300410.1,INSD:BP814256.1,INSD:EL172872.1,
INSD:EG518452.1,INSD:EL025065.1,INSD:EH972871.1,
INSD:AV803480.1,INSD:BP784428.1,INSD:EL023887.1,
INSD:EL287354.1,INSD:N96762.1,INSD:EH817983.1,
INSD:BP610864.1,INSD:AV530690.1,INSD:AV806967.1,
INSD:AV801434.1,INSD:EH915989.1,INSD:CB264746.1,
INSD:BP815067.1,INSD:BP648951.1,INSD:BP842470.1,
INSD:BP590884.1,INSD:EL289933.1,INSD:EH928937.1,
INSD:EL311899.1,INSD:EL261491.1,INSD:BP846014.1,
INSD:EH992942.1,INSD:EH896897.1,INSD:EH959147.1,
INSD:EL068549.1,INSD:EH920436.1,INSD:EL052179.1,
INSD:BP857912.1,INSD:ES091522.1,INSD:EH920381.1,
INSD:BE522393.1,INSD:BP786627.1,INSD:EH837447.1,
INSD:BP862090.1,INSD:ES009319.1,INSD:AV807025.1,
INSD:AV788367.1,INSD:DR281487.1,INSD:EH913142.1,
INSD:EL323952.1,INSD:EH947858.1,INSD:AV440220.1,
INSD:DR354477.1,INSD:ES152630.1,INSD:EH797406.1,
INSD:EH951663.1,INSD:BP782573.1,INSD:BP793323.1,
INSD:BP788005.1,INSD:EL325954.1,INSD:BP792329.1,
INSD:EL297801.1,INSD:AV795819.1,INSD:BP594868.1,
INSD:EH820544.1,INSD:N96667.1,INSD:BP613193.1,
INSD:BE528507.1,INSD:EL131893.1,INSD:EL030619.1,
INSD:EH875600.1,INSD:BP794497.1,INSD:T75861.1,
INSD:EL160514.1,INSD:BU635331.1,INSD:BP601199.1,
INSD:DR227977.1,INSD:BP653327.1,INSD:AV810371.1,
INSD:EH963800.1,INSD:BP792850.1,INSD:EH879090.1,
INSD:EH850122.1,INSD:EH940132.1,INSD:EH935804.1,
INSD:BP866793.1,INSD:BP813950.1,INSD:EL107015.1,
INSD:EL135103.1,INSD:ES157825.1,INSD:EH937024.1,
INSD:EH944551.1,INSD:EL007042.1,INSD:EL277928.1,
INSD:BP784838.1,INSD:EL067173.1,INSD:EL338521.1,
INSD:EH843850.1,INSD:BP780393.1,INSD:BP784207.1,
INSD:EL311004.1,INSD:AV828423.1,INSD:BP787790.1,
INSD:BP779407.1,INSD:EG481875.1,INSD:AV813983.1,
INSD:EL044651.1,INSD:EL136304.1,INSD:EL124485.1,
INSD:AV519616.1,INSD:EH860719.1,INSD:BE526072.1,
INSD:BP856116.1,INSD:AV799127.1,INSD:DR281486.1,
INSD:EL002433.1,INSD:EH916006.1,INSD:EL310074.1,
INSD:AV811762.1,INSD:BP632873.1,INSD:EH843979.1,
INSD:BP661941.1,INSD:EH922086.1,INSD:BP588016.1,
INSD:EL179188.1,INSD:BP792769.1,INSD:EL202282.1,
INSD:EL071531.1,INSD:BP591240.1,INSD:AV792891.1,
INSD:BP786640.1,INSD:EL259513.1,INSD:BP785486.1,
INSD:BP793925.1,INSD:EH899026.1,INSD:EL189773.1,
INSD:BP662701.1,INSD:EL102385.1,INSD:EH883419.1,
INSD:EL065158.1,INSD:BP831389.1,INSD:EL121752.1,
INSD:EL176242.1,INSD:AA651325.1,INSD:R90050.1,
INSD:EG525210.1,INSD:EH972911.1,INSD:EL242814.1,
INSD:AV807157.1,INSD:EL161479.1,INSD:BP792714.1,
INSD:EH973406.1,INSD:EH920910.1,INSD:N96025.1,
INSD:BP791508.1,INSD:BP794280.1,INSD:BP824517.2,
INSD:N96167.1,INSD:EL182297.1,INSD:AV799387.1,
INSD:EH885660.1,INSD:BP672163.1,INSD:EL033171.1,
INSD:AV525141.1,INSD:EL110078.1,INSD:EL334514.1,
INSD:EH822565.1,INSD:EL318342.1,INSD:EL146278.1,
INSD:EL068771.1,INSD:EH938557.1,INSD:AV816072.1,
INSD:EL292107.1,INSD:EL288085.1,INSD:EL209331.1,
INSD:AV829365.1,INSD:EL157262.1,INSD:EH871747.1,
INSD:DR281483.1,INSD:ES065774.1,INSD:BP601640.1,
INSD:EH967713.1,INSD:EL045302.1,INSD:EL097366.1,
INSD:EH975818.1,INSD:EH892394.1,INSD:EH976703.1,
INSD:EL162212.1,INSD:EH952333.1,INSD:BP827678.1,
INSD:BP812707.1,INSD:EL026109.1,INSD:EH895098.1,
INSD:AV814181.1,INSD:BP785361.1,INSD:EH882835.1,
INSD:BP665296.1,INSD:BP783975.1,INSD:DR281484.1,
INSD:BP781321.1,INSD:AV814563.1,INSD:BP844134.1,
INSD:EL314813.1,INSD:EL158751.1,INSD:EL153627.1,
INSD:EL133426.1,INSD:EL260130.1,INSD:EL046238.1,
INSD:EH932306.1,INSD:EL059966.1,INSD:AV531024.1,
INSD:ES035964.1,INSD:EL329973.1,INSD:CB259198.1,
INSD:EH931522.1,INSD:BP594199.1,INSD:BP592642.1,
INSD:BP832563.1,INSD:ES055150.1,INSD:BP780869.1,
INSD:EL249982.1,INSD:AV524639.1,INSD:AV795989.1,
INSD:EL009857.1,INSD:EL281871.1,INSD:EH978627.1,
INSD:CB265146.1,INSD:EL049761.1,INSD:BP586408.1,
INSD:EL166377.1,INSD:EL251860.1,INSD:EL127069.1,
INSD:EH873335.1,INSD:AV784547.1,INSD:EH964733.1,
INSD:EL001283.1,INSD:EL205645.1,INSD:BP654650.1,
INSD:EL041026.1,INSD:AV793215.1,INSD:BP786635.1,
INSD:BP629443.1,INSD:BP777739.1,INSD:EH981745.1,
INSD:AV817972.1,INSD:AV823553.1,INSD:EL112347.1,
INSD:EL196589.1,INSD:EH991229.1,INSD:EL115725.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY093138.1,INSD:AY056134.1,INSD:AK226394.1,
INSD:BT006589.1"
/note="vitamin c defective 2 (VTC2); FUNCTIONS IN: in 8
functions; INVOLVED IN: response to jasmonic acid
stimulus, L-ascorbic acid biosynthetic process, defense
response to bacterium, response to heat, defense response
by callose deposition in cell wall; LOCATED IN:
cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant
structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; BEST
Arabidopsis thaliana protein match is:
galactose-1-phosphate guanylyltransferase
(GDP)s;GDP-D-glucose phosphorylases;quercetin
4'-O-glucosyltransferases (TAIR:AT5G55120.1); Has 30201
Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12;
Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants -
5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G26850"
/db_xref="Araport:AT4G26850"
intron_pos 38:1 (1/6)
intron_pos 78:0 (2/6)
intron_pos 98:0 (3/6)
intron_pos 179:0 (4/6)
intron_pos 241:0 (5/6)
intron_pos 324:0 (6/6)
BEGIN
1 MLKIKRVPTV VSNYQKDDGA EDPVGCGRNC LGACCLNGAR LPLYACKNLV KSGEKLVISH
61 EAIEPPVAFL ESLVLGEWED RFQRGLFRYD VTACETKVIP GKYGFVAQLN EGRHLKKRPT
121 EFRVDKVLQS FDGSKFNFTK VGQEELLFQF EAGEDAQVQF FPCMPIDPEN SPSVVAINVS
181 PIEYGHVLLI PRVLDCLPQR IDHKSLLLAV HMAAEAANPY FRLGYNSLGA FATINHLHFQ
241 AYYLAMPFPL EKAPTKKITT TVSGVKISEL LSYPVRSLLF EGGSSMQELS DTVSDCCVCL
301 QNNNIPFNIL ISDCGRQIFL MPQCYAEKQA LGEVSPEVLE TQVNPAVWEI SGHMVLKRKE
361 DYEGASEDNA WRLLAEASLS EERFKEVTAL AFEAIGCSNQ EEDLEGTIVH QQNSSGNVNQ
421 KSNRTHGGPI TNGTAAECLV LQ
//