LOCUS AEE84794.1 151 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Polyketide cyclase/dehydrase and
lipid transport superfamily protein protein.
ACCESSION CP002687-4195
PROTEIN_ID AEE84794.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT4G23680"
/gene_synonym="F9D16.150"
/gene_synonym="F9D16_150"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL114475.1,INSD:EH919307.1,INSD:DR255003.1,
INSD:DR254930.1,INSD:DR254960.1,INSD:ES082802.1,
INSD:BP802376.1,INSD:DR246895.1,INSD:DR254965.1,
INSD:DR255116.1,INSD:DR255062.1,INSD:DR254974.1,
INSD:EL203445.1,INSD:DR255018.1,INSD:DR254916.1,
INSD:DR255127.1,INSD:DR255077.1,INSD:DR254894.1,
INSD:DR242306.1,INSD:EG520768.1,INSD:DR255087.1,
INSD:DR254957.1,INSD:DR254921.1,INSD:DR255052.1,
INSD:DR254907.1,INSD:DR255122.1,INSD:DR254886.1,
INSD:DR255099.1,INSD:DR255072.1,INSD:DR254904.1,
INSD:DR255060.1,INSD:DR255076.1,INSD:DR254934.1,
INSD:DR243507.1,INSD:DR242920.1,INSD:BP847085.1,
INSD:DR254942.1,INSD:DR255041.1,INSD:DR255053.1,
INSD:DR254964.1,INSD:DR255130.1,INSD:DR254906.1,
INSD:EL311114.1,INSD:DR255078.1,INSD:EL196617.1,
INSD:DR254941.1,INSD:EL163434.1,INSD:DR254890.1,
INSD:DR255067.1,INSD:DR254903.1,INSD:EL028695.1,
INSD:EL135009.1,INSD:DR254971.1,INSD:DR254990.1,
INSD:DR255113.1,INSD:DR255120.1,INSD:DR255008.1,
INSD:EL056214.1,INSD:DR254956.1,INSD:DR255068.1,
INSD:ES181328.1,INSD:DR255028.1,INSD:EH818445.1,
INSD:DR255010.1,INSD:DR254976.1,INSD:DR255115.1,
INSD:DR255029.1,INSD:DR255109.1,INSD:DR254950.1,
INSD:DR254897.1,INSD:DR255095.1,INSD:EL184283.1,
INSD:DR254868.1,INSD:DR254948.1,INSD:DR266082.1,
INSD:EL060064.1,INSD:DR254895.1,INSD:DR254878.1,
INSD:DR254998.1,INSD:DR255022.1,INSD:DR242919.1,
INSD:DR254912.1,INSD:DR254887.1,INSD:DR254997.1,
INSD:DR254978.1,INSD:DR254944.1,INSD:DR254954.1,
INSD:EL298109.1,INSD:DR266088.1,INSD:DR241448.1,
INSD:DR255082.1,INSD:DR254879.1,INSD:EL179118.1,
INSD:DR254958.1,INSD:DR255066.1,INSD:DR254883.1,
INSD:DR255009.1,INSD:DR255097.1,INSD:EL250533.1,
INSD:DR255134.1,INSD:EL040932.1,INSD:H76858.1,
INSD:DR255088.1,INSD:DR254955.1,INSD:DR254981.1,
INSD:DR255035.1,INSD:EL286870.1,INSD:EH931003.1,
INSD:EL282878.1,INSD:DR254969.1,INSD:EH802948.1,
INSD:AA389841.1,INSD:BP580177.1,INSD:EL163049.1,
INSD:DR254889.1,INSD:EL072883.1,INSD:DR254945.1,
INSD:DR255031.1,INSD:DR254996.1,INSD:DR254909.1,
INSD:DR213739.1,INSD:DR254947.1,INSD:DR255044.1,
INSD:DR254911.1,INSD:ES095580.1,INSD:EL335835.1,
INSD:DR254884.1,INSD:DR225132.1,INSD:DR255016.1,
INSD:DR254928.1,INSD:DR254967.1,INSD:DR254880.1,
INSD:BP591307.1,INSD:DR213736.1,INSD:DR255019.1,
INSD:EL126291.1,INSD:DR242291.1,INSD:EH945643.1,
INSD:DR255123.1,INSD:DR255080.1,INSD:EL275953.1,
INSD:EH848105.1,INSD:DR255004.1,INSD:H37415.1,
INSD:DR255049.1,INSD:DR255100.1,INSD:EL236108.1,
INSD:DR255039.1,INSD:DR254915.1,INSD:EL118273.1,
INSD:DR254959.1,INSD:DR255101.1,INSD:DR254881.1,
INSD:EH979627.1,INSD:DR266087.1,INSD:DR255092.1,
INSD:DR242921.1,INSD:EH992498.1,INSD:EH922685.1,
INSD:DR254871.1,INSD:DR374966.1,INSD:EH959118.1,
INSD:DR254968.1,INSD:EL084334.1,INSD:DR255015.1,
INSD:ES144601.1,INSD:DR254952.1,INSD:DR255121.1,
INSD:DR255061.1,INSD:DR255017.1,INSD:EL010545.1,
INSD:DR255038.1,INSD:DR255055.1,INSD:EH974145.1,
INSD:EH950675.1,INSD:DR254896.1,INSD:DR255133.1,
INSD:DR254892.1,INSD:DR380067.1,INSD:DR255023.1,
INSD:DR255033.1,INSD:DR255011.1,INSD:DR255118.1,
INSD:T76076.1,INSD:DR255091.1,INSD:EH886262.1,
INSD:DR242934.1,INSD:BP568867.1,INSD:DR254929.1,
INSD:DR255036.1,INSD:DR254924.1,INSD:DR254982.1,
INSD:DR255046.1,INSD:DR255117.1,INSD:DR255013.1,
INSD:DR254898.1,INSD:BP628258.1,INSD:EH885229.1,
INSD:DR254973.1,INSD:DR255024.1,INSD:EH909471.1,
INSD:DR255079.1,INSD:DR254994.1,INSD:DR254913.1,
INSD:EL201511.1,INSD:DR254991.1,INSD:DR255105.1,
INSD:EL278675.1,INSD:DR254972.1,INSD:DR255027.1,
INSD:DR254963.1,INSD:ES202908.1,INSD:DR255020.1,
INSD:DR255042.1,INSD:ES143351.1,INSD:DR255111.1,
INSD:DR255063.1,INSD:DR255059.1,INSD:DR255025.1,
INSD:DR255102.1,INSD:DR254893.1,INSD:DR241556.1,
INSD:DR254908.1,INSD:DR255037.1,INSD:DR255074.1,
INSD:DR213740.1,INSD:EH976706.1,INSD:DR254946.1,
INSD:BP641482.1,INSD:DR254902.1,INSD:DR254901.1,
INSD:DR255006.1,INSD:DR255103.1,INSD:DR255070.1,
INSD:DR255119.1,INSD:EH856390.1,INSD:DR266084.1,
INSD:EL215078.1,INSD:DR255056.1,INSD:BP606202.1,
INSD:DR255106.1,INSD:EH800443.1,INSD:DR255058.1,
INSD:DR255047.1,INSD:EL296624.1,INSD:DR254987.1,
INSD:DR254940.1,INSD:DR254877.1,INSD:DR254966.1,
INSD:DR255124.1,INSD:DR254961.1,INSD:EL173354.1,
INSD:DR254977.1,INSD:EL066514.1,INSD:DR255104.1,
INSD:DR254922.1,INSD:DR254938.1,INSD:EH852274.1,
INSD:DR255128.1,INSD:DR254983.1,INSD:DR254939.1,
INSD:DR255043.1,INSD:DR225133.1,INSD:DR213737.1,
INSD:DR213738.1,INSD:DR255065.1,INSD:EL148724.1,
INSD:DR255094.1,INSD:DR254931.1,INSD:DR255098.1,
INSD:EL000155.1,INSD:DR254989.1,INSD:EL975861.1,
INSD:DR254995.1,INSD:DR254962.1,INSD:EL055485.1,
INSD:DR255064.1,INSD:DR255045.1,INSD:DR255096.1,
INSD:H76383.1,INSD:DR241555.1,INSD:EL313432.1,
INSD:DR255084.1,INSD:DR254914.1,INSD:DR347668.1,
INSD:DR255069.1,INSD:DR255093.1,INSD:DR255012.1,
INSD:DR255108.1,INSD:DR255048.1,INSD:EL323198.1,
INSD:DR266085.1,INSD:DR255007.1,INSD:DR255131.1,
INSD:DR254926.1,INSD:EH831868.1,INSD:AV789752.1,
INSD:DR255030.1,INSD:EH982514.1,INSD:EL033582.1,
INSD:EL250836.1,INSD:DR254970.1,INSD:DR255032.1,
INSD:DR254949.1,INSD:T21424.1,INSD:DR254869.1,
INSD:DR254920.1,INSD:DR255001.1,INSD:DR254975.1,
INSD:EH884837.1,INSD:DR255081.1,INSD:DR255114.1,
INSD:BE039523.1,INSD:DR254979.1,INSD:DR254943.1,
INSD:EL040451.1,INSD:DR255075.1,INSD:DR254882.1,
INSD:DR255125.1,INSD:DR255090.1,INSD:DR255040.1,
INSD:DR254984.1,INSD:DR254927.1,INSD:DR255051.1,
INSD:DR266080.1,INSD:DR255034.1,INSD:BP801935.1,
INSD:DR242929.1,INSD:DR254992.1,INSD:DR255073.1,
INSD:DR254910.1,INSD:DR254900.1,INSD:EL039249.1,
INSD:DR254885.1,INSD:DR254953.1,INSD:EL046682.1,
INSD:AV781401.1,INSD:DR255014.1,INSD:DR255085.1,
INSD:DR255112.1,INSD:DR254936.1,INSD:DR266083.1,
INSD:DR242304.1,INSD:DR255057.1,INSD:DR254935.1,
INSD:DR254888.1,INSD:EH986586.1,INSD:DR210697.1,
INSD:DR254872.1,INSD:DR255089.1,INSD:ES083653.1,
INSD:DR254985.1,INSD:DR242305.1,INSD:DR255086.1,
INSD:DR254874.1,INSD:EL009777.1,INSD:DR254918.1,
INSD:EL293081.1,INSD:DR254933.1,INSD:DR254917.1,
INSD:DR254905.1,INSD:DR255126.1,INSD:DR254899.1,
INSD:DR254925.1,INSD:DR254993.1,INSD:DR254919.1,
INSD:DR255132.1,INSD:DR254876.1,INSD:DR254923.1,
INSD:EL135445.1,INSD:DR255026.1,INSD:DR255054.1,
INSD:DR254988.1,INSD:DR254932.1,INSD:DR255110.1,
INSD:DR254937.1,INSD:BP560441.2,INSD:DR254875.1,
INSD:EH951992.1,INSD:DR193121.1,INSD:DR254986.1,
INSD:DR254873.1,INSD:DR241554.1,INSD:EH806493.1,
INSD:DR255002.1,INSD:DR254870.1,INSD:DR255107.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AF361838.1,INSD:AY142055.1"
/note="Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport
superfamily protein; FUNCTIONS IN: molecular_function
unknown; INVOLVED IN: response to biotic stimulus, defense
response; LOCATED IN: cellular_component unknown;
EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 9
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Bet v I
allergen (InterPro:IPR000916); BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: Polyketide cyclase/dehydrase and lipid
transport superfamily protein (TAIR:AT4G23670.1); Has 354
Blast hits to 327 proteins in 40 species: Archae - 0;
Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 354;
Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G23680"
/db_xref="Araport:AT4G23680"
intron_pos 63:1 (1/1)
BEGIN
1 MATSGTYVTE VPLKGSAEKY YKRWKNENHV FPDAIGHHIQ NVTVHEGEHD SHGSIRSWNY
61 TWDGKEEVFK ERREIDDETK TLTLRGLEGH VMEQLKVYDV VYQFIPKSED TCIGKITLIW
121 EKRNDDSPEP SGYMKFVKSL VADMGNHVSK T
//