LOCUS AEE84677.1 321 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana PGR5-LIKE A protein.
ACCESSION CP002687-4030
PROTEIN_ID AEE84677.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="PGR5-LIKE A"
/locus_tag="AT4G22890"
/gene_synonym="F7H19.70"
/gene_synonym="F7H19_70"
/gene_synonym="PGRL1A"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:AA586044.1,INSD:EL288099.1,INSD:EL033120.1,
INSD:EL303356.1,INSD:EL320320.1,INSD:EH950514.1,
INSD:EH988341.1,INSD:EL162274.1,INSD:EH803239.1,
INSD:AV519265.1,INSD:AV530581.1,INSD:EL086903.1,
INSD:EL065345.1,INSD:EL132663.1,INSD:EH973131.1,
INSD:EL200228.1,INSD:EL333228.1,INSD:EL126864.1,
INSD:EL226158.1,INSD:ES061028.1,INSD:EH860004.1,
INSD:EH956751.1,INSD:EL334515.1,INSD:EH880212.1,
INSD:EL075292.1,INSD:ES181197.1,INSD:EH921433.1,
INSD:EH993113.1,INSD:EL091057.1,INSD:EH900051.1,
INSD:EL231643.1,INSD:EL060540.1,INSD:EH951076.1,
INSD:EL302400.1,INSD:EL097927.1,INSD:AV791014.1,
INSD:DR239628.1,INSD:EH802658.1,INSD:EL125404.1,
INSD:EL175008.1,INSD:BP782064.1,INSD:EH945701.1,
INSD:EL157558.1,INSD:EL075931.1,INSD:EL293966.1,
INSD:EL038273.1,INSD:BP788316.1,INSD:EH962870.1,
INSD:EL142740.1,INSD:EL064552.1,INSD:EL127222.1,
INSD:EH805086.1,INSD:EH884941.1,INSD:EL072482.1,
INSD:EH929530.1,INSD:EL137275.1,INSD:EL259900.1,
INSD:EL180512.1,INSD:BP781924.1,INSD:EL328815.1,
INSD:DR378463.1,INSD:EH954814.1,INSD:EL327236.1,
INSD:AV520634.1,INSD:EL015902.1,INSD:EL146008.1,
INSD:EH954259.1,INSD:EH859199.1,INSD:EH853837.1,
INSD:EH815993.1,INSD:DR239624.1,INSD:EH903043.1,
INSD:EL327819.1,INSD:EH970506.1,INSD:EL265835.1,
INSD:EL331076.1,INSD:EL126741.1,INSD:EH887821.1,
INSD:EH964931.1,INSD:EL110643.1,INSD:BP664666.1,
INSD:EL989226.1,INSD:EH933172.1,INSD:EL029933.1,
INSD:EL282192.1,INSD:EL296121.1,INSD:EL258339.1,
INSD:EL053873.1,INSD:EL219929.1,INSD:EL034039.1,
INSD:ES058143.1,INSD:EH855113.1,INSD:EL172787.1,
INSD:BP649449.1,INSD:AI995402.1,INSD:EL309773.1,
INSD:EL097032.1,INSD:EL333922.1,INSD:EH819641.1,
INSD:EH951855.1,INSD:EL131915.1,INSD:EL038343.1,
INSD:DR324224.1,INSD:EL297848.1,INSD:EL021352.1,
INSD:EL295699.1,INSD:EL134934.1,INSD:EL046407.1,
INSD:EL045430.1,INSD:EL288043.1,INSD:EL215811.1,
INSD:EH843222.1,INSD:EH814338.1,INSD:EH958051.1,
INSD:EL219135.1,INSD:EL063927.1,INSD:EL049643.1,
INSD:ES026056.1,INSD:EL015837.1,INSD:EL144695.1,
INSD:BP778701.1,INSD:EL266807.1,INSD:ES009421.1,
INSD:ES037286.1,INSD:DR372074.1,INSD:EL003049.1,
INSD:EL181262.1,INSD:EL241913.1,INSD:EL163574.1,
INSD:EL222769.1,INSD:EL114945.1,INSD:EH901876.1,
INSD:EH984643.1,INSD:EH864503.1,INSD:BP780271.1,
INSD:EH973951.1,INSD:EH965524.1,INSD:BE038774.1,
INSD:EH835389.1,INSD:EL098453.1,INSD:EL084305.1,
INSD:EL162952.1,INSD:EL113708.1,INSD:EH935082.1,
INSD:EL102641.1,INSD:EL251548.1,INSD:EL340645.1,
INSD:EL014403.1,INSD:EL233291.1,INSD:EH970590.1,
INSD:EL261324.1,INSD:EH911474.1,INSD:EL045777.1,
INSD:EL043893.1,INSD:EL180192.1,INSD:DR368002.1,
INSD:EH816738.1,INSD:EL171639.1,INSD:EL290934.1,
INSD:EH939637.1,INSD:EL087924.1,INSD:EL006599.1,
INSD:EH861992.1,INSD:EL218972.1,INSD:BP783385.1,
INSD:EH994882.1,INSD:EL148940.1,INSD:EL127950.1,
INSD:EH863734.1,INSD:BP641574.1,INSD:BP783604.1,
INSD:EH826021.1,INSD:EL338513.1,INSD:EL210661.1,
INSD:EL149380.1,INSD:EL183086.1,INSD:EH941636.1,
INSD:EL295667.1,INSD:EL149941.1,INSD:EL315817.1,
INSD:EL288892.1,INSD:BP592263.1,INSD:ES003172.1,
INSD:DR225055.1,INSD:EL029955.1,INSD:EL131367.1,
INSD:DR328202.1,INSD:EH925053.1,INSD:EL160597.1,
INSD:EH894283.1,INSD:BP636141.1,INSD:EH819022.1,
INSD:EL049566.1,INSD:EH847317.1,INSD:EL084420.1,
INSD:EH835921.1,INSD:BP625708.1,INSD:BP641173.1,
INSD:EL319263.1,INSD:EL120745.1,INSD:EL041992.1,
INSD:EL284526.1,INSD:EL251895.1,INSD:EL010042.1,
INSD:ES124350.1,INSD:EL077889.1,INSD:EH884675.1"
/note="PGR5-LIKE A; FUNCTIONS IN: molecular_function
unknown; INVOLVED IN: photosynthetic electron transport in
photosystem I, photosynthesis; LOCATED IN: thylakoid,
chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN:
22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages;
BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PGR5-like B
(TAIR:AT4G11960.1); Has 112 Blast hits to 112 proteins in
25 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1; Fungi -
0; Plants - 101; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 10
(source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G22890"
/db_xref="Araport:AT4G22890"
intron_pos 67:1 (1/8)
intron_pos 102:0 (2/8)
intron_pos 134:1 (3/8)
intron_pos 168:0 (4/8)
intron_pos 187:0 (5/8)
intron_pos 212:2 (6/8)
intron_pos 267:0 (7/8)
intron_pos 299:2 (8/8)
BEGIN
1 MGSKMLFSLT SPRLFSAVSR KPSSSFSPSP PSPSSRTQWT QLSPGKSISL RRRVFLLPAK
61 ATTEQSGGDN VDSNVLPYCS INKAEKKTIG EMEQEFLQAL QSFYYDGKAI MSNEEFDNLK
121 EELMWEGSSV VMLSSDEQRF LEASMAYVSG NPILNDEEYD KLKLKLKIDG SDIVSEGPRC
181 SLRSKKVYSD LAVDYFKMLL LNVPATVVAL GLFFFLDDIT GFEITYIMEL PEPYSFIFTW
241 FAAVPVIVYL ALSITKLIIK DFLILKGPCP NCGTENTSFF GTILSISSGG KTNTVKCTNC
301 GTAMVYDSGS RLITLPEGSQ A
//