LOCUS AEE83919.1 262 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Chlorophyll A-B binding family protein
protein.
ACCESSION CP002687-2999
PROTEIN_ID AEE83919.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="LIL3:1"
/locus_tag="AT4G17600"
/gene_synonym="DL4835W"
/gene_synonym="FCAALL.30"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL042864.1,INSD:EL290169.1,INSD:EL137445.1,
INSD:EL223009.1,INSD:EH946950.1,INSD:EL101492.1,
INSD:EL323345.1,INSD:EL001702.1,INSD:DR214918.1,
INSD:EL014503.1,INSD:EL139869.1,INSD:EH861280.1,
INSD:EH879550.1,INSD:EL185961.1,INSD:EH859469.1,
INSD:BP593056.1,INSD:EL196823.1,INSD:EL318440.1,
INSD:EL325683.1,INSD:EL158645.1,INSD:T04209.1,
INSD:ES101234.1,INSD:EL289496.1,INSD:EL166594.1,
INSD:EH863252.1,INSD:ES003436.1,INSD:EL194102.1,
INSD:EH962003.1,INSD:EL131024.1,INSD:ES172180.1,
INSD:DR214920.1,INSD:EL260987.1,INSD:AV782873.1,
INSD:EL224297.1,INSD:EL133626.1,INSD:EL302375.1,
INSD:EL045210.1,INSD:BP625752.1,INSD:EH848915.1,
INSD:EH964125.1,INSD:EH903228.1,INSD:EL169813.1,
INSD:EL209220.1,INSD:DR231788.1,INSD:EL071379.1,
INSD:DR214917.1,INSD:EL290374.1,INSD:EL104789.1,
INSD:EL332564.1,INSD:ES001057.1,INSD:EH917897.1,
INSD:EL256257.1,INSD:EH830387.1,INSD:EL077110.1,
INSD:EL201075.1,INSD:EL186731.1,INSD:EH864580.1,
INSD:EL065714.1,INSD:EL156260.1,INSD:CB262750.1,
INSD:EL306057.1,INSD:EL285337.1,INSD:AV789928.1,
INSD:T04424.1,INSD:EL266204.1,INSD:EL005038.1,
INSD:EL173815.1,INSD:BP844497.1,INSD:EH972672.1,
INSD:EH959142.1,INSD:EL083611.1,INSD:EL172721.1,
INSD:BP623827.1,INSD:F15412.1,INSD:DR214922.1,
INSD:EH973216.1,INSD:EH940756.1,INSD:AV832179.1,
INSD:BU635052.1,INSD:DR214908.1,INSD:EH829084.1,
INSD:EH929434.1,INSD:EH848754.1,INSD:EH897659.1,
INSD:ES105893.1,INSD:EL041349.1,INSD:EH935842.1,
INSD:ES093816.1,INSD:EH802585.1,INSD:DR383791.1,
INSD:EL132174.1,INSD:EL209586.1,INSD:EH918608.1,
INSD:EL014928.1,INSD:AA042604.1,INSD:EH946874.1,
INSD:DR231789.1,INSD:EH861139.1,INSD:EL060335.1,
INSD:EL000168.1,INSD:EL125109.1,INSD:EH801893.1,
INSD:EG498727.1,INSD:ES105399.1,INSD:EL292372.1,
INSD:EL222389.1,INSD:EL015215.1,INSD:Z29050.1,
INSD:DR374440.1,INSD:EL105995.1,INSD:EL240398.1,
INSD:DR214909.1,INSD:EL290279.1,INSD:ES190164.1,
INSD:EL228871.1,INSD:EL153424.1,INSD:EL083888.1,
INSD:EL272492.1,INSD:EH957216.1,INSD:EH802352.1,
INSD:EL135571.1,INSD:EH975349.1,INSD:DR214921.1,
INSD:ES149863.1,INSD:EH933682.1,INSD:ES150367.1,
INSD:DR214916.1,INSD:EH883113.1,INSD:EL303961.1,
INSD:AV566591.1,INSD:EH958646.1,INSD:EH814462.1,
INSD:EH827298.1,INSD:DR214911.1,INSD:EL232239.1,
INSD:EH909150.1,INSD:EH800752.1,INSD:EH967562.1,
INSD:EL125765.1,INSD:EH834816.1,INSD:EH824619.1,
INSD:EL338295.1,INSD:EL034386.1,INSD:BP630410.1,
INSD:EL262511.1,INSD:DR225614.1,INSD:EL152410.1,
INSD:DR214919.1,INSD:EL235129.1,INSD:EL275622.1,
INSD:EL310976.1,INSD:T41551.1,INSD:AV787909.1,
INSD:EL249913.1,INSD:EH888114.1,INSD:EH877771.1,
INSD:EL335264.1,INSD:EH966190.1,INSD:EL136873.1,
INSD:ES109152.1,INSD:EH875569.1,INSD:EL106068.1,
INSD:EL032672.1,INSD:EL199221.1,INSD:EL079989.1,
INSD:DR214907.1,INSD:BP788652.1,INSD:EL049563.1,
INSD:EH959841.1,INSD:AV819503.1,INSD:EL034846.1,
INSD:EH916668.1,INSD:BP596597.1,INSD:EH820262.1,
INSD:EL116402.1,INSD:AV832328.1,INSD:ES089256.1,
INSD:EH818381.1,INSD:ES166748.1,INSD:T43080.1,
INSD:EL275984.1,INSD:EH799771.1,INSD:EL058626.1,
INSD:EH973367.1,INSD:EL276130.1,INSD:EH865676.1,
INSD:DR214915.1,INSD:EL028288.1,INSD:EL188045.1,
INSD:Z34738.1,INSD:EH888127.1,INSD:BP627674.1,
INSD:EH992874.1,INSD:EH902376.1,INSD:AV822187.1,
INSD:EL252465.1,INSD:EH896799.1,INSD:EH842284.1,
INSD:AV820688.1,INSD:EH933709.1,INSD:EL117197.1,
INSD:EL084260.1,INSD:EL035620.1,INSD:EL234484.1,
INSD:EL258502.1,INSD:EL250751.1,INSD:ES124444.1,
INSD:DR214910.1,INSD:BP622060.1,INSD:EH909784.1,
INSD:EL238048.1,INSD:EH902218.1,INSD:EL265451.1,
INSD:EL092961.1,INSD:EL322833.1,INSD:EL242601.1,
INSD:EL307529.1,INSD:EL321524.1,INSD:ES095659.1,
INSD:EH902140.1,INSD:DR214914.1,INSD:EL289202.1,
INSD:F15414.1,INSD:EL323981.1,INSD:EL303590.1,
INSD:EL318799.1,INSD:EL074968.1,INSD:EL012306.1,
INSD:EL013837.1,INSD:EH992608.1,INSD:EL099169.1,
INSD:EL326364.1,INSD:ES098064.1,INSD:EH835106.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY136323.1,INSD:AY086891.1,INSD:BX829203.1,
INSD:BT000425.1,INSD:AF375427.1,INSD:AF134133.1,
INSD:BT002185.1,INSD:BT000402.1,INSD:AY074821.1"
/note="LIL3:1; FUNCTIONS IN: sequence-specific DNA binding
transcription factor activity; INVOLVED IN: regulation of
transcription; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane,
chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED
DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: Chlorophyll A-B binding family protein
(TAIR:AT5G47110.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins
in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa -
17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other
Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G17600"
/db_xref="Araport:AT4G17600"
intron_pos 132:1 (1/2)
intron_pos 178:1 (2/2)
BEGIN
1 MALFSPPISS SSLQNPNFIP KFSFSLLSSN RFSLLSVTRA SSDSGSTSPT AAVSVEAPEP
61 VEVIVKEPPQ STPAVKKEET ATAKNVAVEG EEMKTTESVV KFQDARWING TWDLKQFEKD
121 GKTDWDSVIV AEAKRRKWLE ENPETTSNDE PVLFDTSIIP WWAWIKRYHL PEAELLNGRA
181 AMIGFFMAYF VDSLTGVGLV DQMGNFFCKT LLFVAVAGVL FIRKNEDVDK LKNLFDETTL
241 YDKQWQAAWK NDDDESLGSK KK
//