LOCUS AEE82470.1 229 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana ubiquitin 11 protein.
ACCESSION CP002687-933
PROTEIN_ID AEE82470.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Mayer,K., Schuller,C., Wambutt,R., Murphy,G., Volckaert,G.,
Pohl,T., Dusterhoft,A., Stiekema,W., Entian,K.D., Terryn,N.,
Harris,B., Ansorge,W., Brandt,P., Grivell,L., Rieger,M.,
Weichselgartner,M., de Simone,V., Obermaier,B., Mache,R.,
Muller,M., Kreis,M., Delseny,M., Puigdomenech,P., Watson,M.,
Schmidtheini,T., Reichert,B., Portatelle,D., Perez-Alonso,M.,
Boutry,M., Bancroft,I., Vos,P., Hoheisel,J., Zimmermann,W.,
Wedler,H., Ridley,P., Langham,S.A., McCullagh,B., Bilham,L.,
Robben,J., Van der Schueren,J., Grymonprez,B., Chuang,Y.J.,
Vandenbussche,F., Braeken,M., Weltjens,I., Voet,M., Bastiaens,I.,
Aert,R., Defoor,E., Weitzenegger,T., Bothe,G., Ramsperger,U.,
Hilbert,H., Braun,M., Holzer,E., Brandt,A., Peters,S., van
Staveren,M., Dirske,W., Mooijman,P., Klein Lankhorst,R., Rose,M.,
Hauf,J., Kotter,P., Berneiser,S., Hempel,S., Feldpausch,M.,
Lamberth,S., Van den Daele,H., De Keyser,A., Buysshaert,C.,
Gielen,J., Villarroel,R., De Clercq,R., Van Montagu,M., Rogers,J.,
Cronin,A., Quail,M., Bray-Allen,S., Clark,L., Doggett,J., Hall,S.,
Kay,M., Lennard,N., McLay,K., Mayes,R., Pettett,A.,
Rajandream,M.A., Lyne,M., Benes,V., Rechmann,S., Borkova,D.,
Blocker,H., Scharfe,M., Grimm,M., Lohnert,T.H., Dose,S., de
Haan,M., Maarse,A., Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M.,
Fartmann,B., Granderath,K., Dauner,D., Herzl,A., Neumann,S.,
Argiriou,A., Vitale,D., Liguori,R., Piravandi,E., Massenet,O.,
Quigley,F., Clabauld,G., Mundlein,A., Felber,R., Schnabl,S.,
Hiller,R., Schmidt,W., Lecharny,A., Aubourg,S., Chefdor,F.,
Cooke,R., Berger,C., Montfort,A., Casacuberta,E., Gibbons,T.,
Weber,N., Vandenbol,M., Bargues,M., Terol,J., Torres,A.,
Perez-Perez,A., Purnelle,B., Bent,E., Johnson,S., Tacon,D.,
Jesse,T., Heijnen,L., Schwarz,S., Scholler,P., Heber,S., Francs,P.,
Bielke,C., Frishman,D., Haase,D., Lemcke,K., Mewes,H.W.,
Stocker,S., Zaccaria,P., Bevan,M., Wilson,R.K., de la Bastide,M.,
Habermann,K., Parnell,L., Dedhia,N., Gnoj,L., Schutz,K., Huang,E.,
Spiegel,L., Sehkon,M., Murray,J., Sheet,P., Cordes,M.,
Abu-Threideh,J., Stoneking,T., Kalicki,J., Graves,T., Harmon,G.,
Edwards,J., Latreille,P., Courtney,L., Cloud,J., Abbott,A.,
Scott,K., Johnson,D., Minx,P., Bentley,D., Fulton,B., Miller,N.,
Greco,T., Kemp,K., Kramer,J., Fulton,L., Mardis,E., Dante,M.,
Pepin,K., Hillier,L., Nelson,J., Spieth,J., Ryan,E., Andrews,S.,
Geisel,C., Layman,D., Du,H., Ali,J., Berghoff,A., Jones,K.,
Drone,K., Cotton,M., Joshu,C., Antonoiu,B., Zidanic,M., Strong,C.,
Sun,H., Lamar,B., Yordan,C., Ma,P., Zhong,J., Preston,R., Vil,D.,
Shekher,M., Matero,A., Shah,R., Swaby,I.K., O'Shaughnessy,A.,
Rodriguez,M., Hoffmann,J., Till,S., Granat,S., Shohdy,N.,
Hasegawa,A., Hameed,A., Lodhi,M., Johnson,A., Chen,E., Marra,M.,
Martienssen,R. and McCombie,W.R.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 4 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 769-777 (1999)
PUBMED 10617198
REFERENCE 2 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 18585056)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="4"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="UBQ11"
/locus_tag="AT4G05050"
/gene_synonym="C17L7.6"
/gene_synonym="ubiquitin 11"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH920643.1,INSD:EL039380.1,INSD:EH871199.1,
INSD:EL177665.1,INSD:EL110350.1,INSD:EL141800.1,
INSD:ES108629.1,INSD:BP636362.1,INSD:AV787879.1,
INSD:EL291083.1,INSD:EL213672.1,INSD:T46276.1,
INSD:ES014641.1,INSD:BP630724.1,INSD:AV545608.1,
INSD:EH837778.1,INSD:ES159050.1,INSD:AV545387.1,
INSD:EL134683.1,INSD:BP829438.1,INSD:AV560282.1,
INSD:EL164483.1,INSD:CD532681.1,INSD:EH985042.1,
INSD:EL211122.1,INSD:EL206721.1,INSD:EG490873.1,
INSD:AV782777.1,INSD:EH949644.1,INSD:BP831921.1,
INSD:BP630677.1,INSD:EL131857.1,INSD:AV537380.1,
INSD:EL097811.1,INSD:EL097506.1,INSD:BP615719.1,
INSD:ES053672.1,INSD:EL118561.1,INSD:AV537661.1,
INSD:BP623518.1,INSD:BP659481.1,INSD:AV537269.1,
INSD:BP613642.1,INSD:AA712611.1,INSD:EL072154.1,
INSD:EL330097.1,INSD:EL987873.1,INSD:EL217523.1,
INSD:EL195972.1,INSD:EL128323.1,INSD:EL194938.1,
INSD:EL164143.1,INSD:BP630861.1,INSD:BP590820.1,
INSD:EL320290.1,INSD:BP648413.1,INSD:BP654115.1,
INSD:EH952627.1,INSD:EL002464.1,INSD:AV805936.1,
INSD:BP616656.1,INSD:EL307249.1,INSD:EL264355.1,
INSD:EL001611.1,INSD:EL310888.1,INSD:EL140956.1,
INSD:ES172464.1,INSD:ES088562.1,INSD:EH995229.1,
INSD:ES051926.1,INSD:EH846241.1,INSD:BP636498.1,
INSD:EH825279.1,INSD:EH953233.1,INSD:EL170417.1,
INSD:CK118603.1,INSD:T75754.1,INSD:EL293908.1,
INSD:EL209068.1,INSD:AV787146.1,INSD:BP581783.1,
INSD:ES117081.1,INSD:BP564871.1,INSD:EL036245.1,
INSD:EH885300.1,INSD:AV561073.1,INSD:AV566235.1,
INSD:BP634658.1,INSD:ES087480.1,INSD:EL275617.1,
INSD:EL070659.1,INSD:EH967256.1,INSD:EL031610.1,
INSD:DR370814.1,INSD:EH900137.1,INSD:ES012536.1,
INSD:EL217722.1,INSD:CB260631.1,INSD:DR382398.1,
INSD:AV786545.1,INSD:EL064804.1,INSD:BP614776.1,
INSD:EH961290.1,INSD:EL303047.1,INSD:EL261855.1,
INSD:EL039297.1,INSD:EL204563.1,INSD:EL145958.1,
INSD:BP584024.1,INSD:EG442424.1,INSD:EL329018.1,
INSD:BP645447.1,INSD:EL129442.1,INSD:ES137963.1,
INSD:EL100588.1,INSD:EL045406.1,INSD:EL107499.1,
INSD:AV534791.1,INSD:EH988873.1,INSD:T46210.1,
INSD:BP623117.1,INSD:DR381803.1,INSD:EL188984.1,
INSD:CD529983.1,INSD:BP607635.1,INSD:EL187864.1,
INSD:EG442427.1,INSD:Z29165.1,INSD:EL086008.1,
INSD:EH984600.1,INSD:EL199555.1,INSD:AV784686.1,
INSD:EL010004.1,INSD:EL044787.1,INSD:BP618065.1,
INSD:ES210233.1,INSD:ES020780.1,INSD:DR349799.1,
INSD:AV787617.1,INSD:EL330826.1,INSD:EH914803.1,
INSD:EL205972.1,INSD:AV543477.1,INSD:EL041744.1,
INSD:AV558337.1,INSD:BP627141.1,INSD:EL275501.1,
INSD:BP808093.1,INSD:AV555329.1,INSD:BP623242.1,
INSD:EL258237.1,INSD:AV799617.1,INSD:EH847075.1,
INSD:ES001068.1,INSD:DR349798.1,INSD:BP575767.1,
INSD:AV812303.1,INSD:EH873512.1,INSD:AA597581.1,
INSD:EL326076.1,INSD:BP639570.1,INSD:EH962022.1,
INSD:EL015901.1,INSD:ES048879.1,INSD:ES196124.1,
INSD:EL262968.1,INSD:EL106837.1,INSD:BP590331.1,
INSD:EL222881.1,INSD:EH841246.1,INSD:EL142340.1,
INSD:EL268615.1,INSD:EL252549.1,INSD:EG490875.1,
INSD:EL111367.1,INSD:EH844800.1,INSD:T04682.1,
INSD:CF774307.1,INSD:BE662764.1,INSD:EL274194.1,
INSD:EH828025.1,INSD:BP575912.1,INSD:BP651753.1,
INSD:EH954113.1,INSD:BP672070.1,INSD:ES069275.1,
INSD:EL272533.1,INSD:BP583285.1,INSD:BP660939.1,
INSD:EL045223.1,INSD:EH889238.1,INSD:BP643704.1,
INSD:EH805297.1,INSD:EL051144.1,INSD:EL211215.1,
INSD:EH958380.1,INSD:EL167618.1,INSD:EL186172.1,
INSD:ES051506.1,INSD:EH822538.1,INSD:CK120124.1,
INSD:ES208872.1,INSD:BP579832.1,INSD:BP598923.1,
INSD:EL053086.1,INSD:EL110235.1,INSD:BP625372.1,
INSD:ES114149.1,INSD:BP571015.1,INSD:ES180907.1,
INSD:EL185729.1,INSD:EL049617.1,INSD:DR377776.1,
INSD:ES028642.1,INSD:ES118943.1,INSD:EL318556.1,
INSD:EL316624.1,INSD:EL196964.1,INSD:EL284974.1,
INSD:EL224359.1,INSD:AV816973.1,INSD:AV788675.1,
INSD:AV555713.1,INSD:BP625835.1,INSD:AV532973.1,
INSD:BP629783.1,INSD:EH876931.1,INSD:EL237393.1,
INSD:EH939988.1,INSD:EL026427.1,INSD:ES127148.1,
INSD:EL302227.1,INSD:EH976894.1,INSD:AV565932.1,
INSD:EL221520.1,INSD:AA597358.1,INSD:AV820693.1,
INSD:AA712110.1,INSD:EL070846.1,INSD:AV803401.1,
INSD:EL248230.1,INSD:BP609532.1,INSD:T14154.1,
INSD:EL043415.1,INSD:AV556189.1,INSD:EL012492.1,
INSD:ES049659.1,INSD:BP572002.1,INSD:AV808826.1,
INSD:BP621093.1,INSD:EL979145.1,INSD:AV787943.1,
INSD:EL038731.1,INSD:EL301927.1,INSD:EL261038.1,
INSD:ES100784.1,INSD:EL124148.1,INSD:ES058595.1,
INSD:AV543042.1,INSD:EL315837.1,INSD:EL263445.1,
INSD:BP656471.1,INSD:BP660503.1,INSD:AV555628.1,
INSD:EL065377.1,INSD:EL340074.1,INSD:EL151297.1,
INSD:CD529038.1,INSD:EH933074.1,INSD:EL136130.1,
INSD:EH922776.1,INSD:EH987562.1,INSD:BE845392.1,
INSD:AV557478.1,INSD:EL062494.1,INSD:T42370.1,
INSD:EH993063.1,INSD:BP593548.1,INSD:EH953035.1,
INSD:EH941326.1,INSD:EL968974.1,INSD:ES100672.1,
INSD:ES075832.1,INSD:ES118046.1,INSD:EH892755.1,
INSD:EL017612.1,INSD:EH826957.1,INSD:ES012456.1,
INSD:BP785606.1,INSD:ES008467.1,INSD:BP586134.1,
INSD:BP600887.1,INSD:EL241531.1,INSD:AV799265.1,
INSD:BP589893.1,INSD:BP597226.1,INSD:BP623059.1,
INSD:ES128060.1,INSD:BE527225.1,INSD:AV818373.1,
INSD:EH879383.1,INSD:AV806661.1,INSD:BP568424.1,
INSD:BE525759.1,INSD:EL101637.1,INSD:CD531689.1,
INSD:BP590405.1,INSD:BP613552.1,INSD:BP572321.1,
INSD:ES208123.1,INSD:AV796107.1,INSD:EL095221.1,
INSD:EL019880.1,INSD:CB260373.1,INSD:AV558128.1,
INSD:AV819088.1,INSD:BP607203.1,INSD:EL003299.1,
INSD:EL056502.1,INSD:BP565515.1,INSD:AV530319.1,
INSD:AA712123.1,INSD:EL284002.1,INSD:AV787823.1,
INSD:EH835376.1,INSD:AV537728.1,INSD:BP568391.1,
INSD:BE528544.1,INSD:DR376912.1,INSD:ES099723.1,
INSD:DR381392.1,INSD:DR370488.1,INSD:BP816254.1,
INSD:ES064492.1,INSD:AV544287.1,INSD:AI099633.1,
INSD:AA712376.1,INSD:EH900159.1,INSD:AV782109.1,
INSD:EL021633.1,INSD:BP630502.1,INSD:EG495168.1,
INSD:BP592202.1,INSD:AV798142.1,INSD:DR377481.1,
INSD:BP625824.1,INSD:BP629823.1,INSD:EH902703.1,
INSD:AV546223.1,INSD:BP785852.1,INSD:EL202127.1,
INSD:ES095324.1,INSD:ES089178.1,INSD:BP784728.1,
INSD:AV816270.1,INSD:ES028088.1,INSD:EL071432.1,
INSD:EL291067.1,INSD:ES012824.1,INSD:EG497637.1,
INSD:EL047303.1,INSD:EH817125.1,INSD:EL314009.1,
INSD:AV544199.1,INSD:AV522479.1,INSD:EH800515.1,
INSD:EL205911.1,INSD:EL186990.1,INSD:EH832471.1,
INSD:AI100010.1,INSD:BP592549.1,INSD:EH850091.1,
INSD:EH990725.1,INSD:EL256391.1,INSD:CK118849.1,
INSD:EL303951.1,INSD:CK119841.1,INSD:EH884462.1,
INSD:EL257237.1,INSD:BP655028.1,INSD:BP611922.1,
INSD:EL097812.1,INSD:AA597994.1,INSD:ES099815.1,
INSD:AV531146.1,INSD:BP628957.1,INSD:DR301680.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY098958.1,INSD:DQ793134.1"
/note="ubiquitin 11 (UBQ11); CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Ubiquitin subgroup (InterPro:IPR019956), Ubiquitin
conserved site (InterPro:IPR019954), Ubiquitin
(InterPro:IPR000626), Ubiquitin supergroup
(InterPro:IPR019955); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: polyubiquitin 10 (TAIR:AT4G05320.4); Has 30201
Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12;
Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants -
5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT4G05050"
/db_xref="Araport:AT4G05050"
BEGIN
1 MQIFVKTLTG KTITLEVESS DTIDNVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGRTLADYN
61 IQKESTLHLV LRLRGGMQIF VKTLTGKTIT LEVESSDTID NVKAKIQDKE GIPPDQQRLI
121 FAGKQLEDGR TLADYNIQKE STLHLVLRLR GGMQIFVKTL TGKTITLEVE SSDTIDNVKA
181 KIQDKEGIPP DQQRLIFAGK QLEDGRTLAD YNIQKESTLH LVLRLRGGF
//