LOCUS AEE80440.1 406 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana chloroplast stem-loop binding protein
of 41 kDa protein.
ACCESSION CP002686-9387
PROTEIN_ID AEE80440.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="CSP41A"
/locus_tag="AT3G63140"
/gene_synonym="chloroplast stem-loop binding protein of 41
kDa"
/gene_synonym="chloroplast stem-loop binding protein of 41
kDa"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH965731.1,INSD:EH821012.1,INSD:EL006958.1,
INSD:EL121736.1,INSD:EH953226.1,INSD:DR369386.1,
INSD:EH871750.1,INSD:EL105930.1,INSD:EL025698.1,
INSD:EL162804.1,INSD:BE039470.1,INSD:EL213716.1,
INSD:EL290595.1,INSD:EG505787.1,INSD:EL119521.1,
INSD:DR369379.1,INSD:EL090052.1,INSD:EL247805.1,
INSD:EL110988.1,INSD:EL228617.1,INSD:EL044376.1,
INSD:EH956080.1,INSD:EH954677.1,INSD:EL128455.1,
INSD:DR369384.1,INSD:BP847949.1,INSD:EL292090.1,
INSD:EL041721.1,INSD:EL067158.1,INSD:EH923293.1,
INSD:EH967048.1,INSD:EH934294.1,INSD:EH947573.1,
INSD:EL245082.1,INSD:EL099339.1,INSD:EL223737.1,
INSD:BP639133.1,INSD:AV817045.1,INSD:EL334653.1,
INSD:EL099618.1,INSD:EL209716.1,INSD:EL051028.1,
INSD:AV808290.1,INSD:EH855930.1,INSD:BP839564.1,
INSD:EL332973.1,INSD:EL183098.1,INSD:EH941041.1,
INSD:EL188215.1,INSD:AV810981.1,INSD:BP778996.1,
INSD:EL022489.1,INSD:EL242394.1,INSD:EL174180.1,
INSD:BP562270.2,INSD:EH959043.1,INSD:AV439794.1,
INSD:EL201119.1,INSD:EH896473.1,INSD:EL305397.1,
INSD:EL218275.1,INSD:EL258656.1,INSD:EL048802.1,
INSD:EL172896.1,INSD:EL210639.1,INSD:DR369381.1,
INSD:EL115955.1,INSD:EL338531.1,INSD:EL239687.1,
INSD:EL209087.1,INSD:EH850904.1,INSD:EL278236.1,
INSD:EL267472.1,INSD:EL288779.1,INSD:AV807362.1,
INSD:EL133285.1,INSD:AV809330.1,INSD:EL070051.1,
INSD:BP793998.1,INSD:DR369376.1,INSD:EL305938.1,
INSD:EL124187.1,INSD:EH914573.1,INSD:EL324144.1,
INSD:DR369371.1,INSD:EG513502.1,INSD:EL330452.1,
INSD:EH821971.1,INSD:EH817891.1,INSD:EL050448.1,
INSD:BP784029.1,INSD:EH841744.1,INSD:EH924207.1,
INSD:EH895854.1,INSD:EG506941.1,INSD:EH948328.1,
INSD:EL326211.1,INSD:EH968170.1,INSD:EL095350.1,
INSD:EL106744.1,INSD:EG499245.1,INSD:EL123613.1,
INSD:DR369378.1,INSD:EH849755.1,INSD:EL127993.1,
INSD:CF773752.1,INSD:EL178579.1,INSD:AV810135.1,
INSD:EH941481.1,INSD:EL045473.1,INSD:EH982799.1,
INSD:EG516402.1,INSD:EL283359.1,INSD:EL221164.1,
INSD:BP781039.1,INSD:EL247378.1,INSD:AV816372.1,
INSD:AV813318.1,INSD:EL016961.1,INSD:EH882810.1,
INSD:AV806382.1,INSD:BP792856.1,INSD:EG505785.1,
INSD:EL214956.1,INSD:EH903657.1,INSD:EL011377.1,
INSD:EL289701.1,INSD:EH869839.1,INSD:EL056304.1,
INSD:EH865782.1,INSD:EL123158.1,INSD:EH925114.1,
INSD:EL197830.1,INSD:EH977335.1,INSD:EG499771.1,
INSD:EH854351.1,INSD:EL260962.1,INSD:EH943411.1,
INSD:EL304799.1,INSD:EL099880.1,INSD:EL161854.1,
INSD:EL304070.1,INSD:BP795759.1,INSD:EH882672.1,
INSD:EL244908.1,INSD:EL242886.1,INSD:EH884120.1,
INSD:EH829146.1,INSD:EL142003.1,INSD:AV791918.1,
INSD:EL127404.1,INSD:EL115505.1,INSD:EL339141.1,
INSD:EH953319.1,INSD:EH805041.1,INSD:BP590060.1,
INSD:AV813473.1,INSD:EH799054.1,INSD:EG519455.1,
INSD:EL223104.1,INSD:EL288377.1,INSD:EL333617.1,
INSD:EH887318.1,INSD:AV802633.1,INSD:EH829615.1,
INSD:EH982667.1,INSD:EH980290.1,INSD:EH797156.1,
INSD:EH831478.1,INSD:EG472573.1,INSD:BP784191.1,
INSD:EL243279.1,INSD:EH963267.1,INSD:EL265304.1,
INSD:EH813863.1,INSD:EL311634.1,INSD:EL296626.1,
INSD:EL127326.1,INSD:EL017912.1,INSD:EH840724.1,
INSD:EL080217.1,INSD:EH981842.1,INSD:EL028709.1,
INSD:EH887930.1,INSD:EH904717.1,INSD:ES151263.1,
INSD:EH992162.1,INSD:EH890095.1,INSD:EL080873.1,
INSD:EL321031.1,INSD:BP782144.1,INSD:EL156989.1,
INSD:EH893886.1,INSD:EL071988.1,INSD:EL303705.1,
INSD:EL312973.1,INSD:EL276453.1,INSD:DR369377.1,
INSD:EG448449.1,INSD:ES092719.1,INSD:EL119561.1,
INSD:EL084977.1,INSD:EL015862.1,INSD:EL185765.1,
INSD:EH867609.1,INSD:EL109741.1,INSD:BP780056.1,
INSD:EH913315.1,INSD:EL086742.1,INSD:DR369375.1,
INSD:EL038865.1,INSD:EL251789.1,INSD:BP653532.1,
INSD:EH831592.1,INSD:EL296937.1,INSD:EL308965.1,
INSD:EH798813.1,INSD:EH827313.1,INSD:EL330467.1,
INSD:EH796901.1,INSD:EL084545.1,INSD:EH888583.1,
INSD:EL012777.1,INSD:EH919955.1,INSD:EL121358.1,
INSD:EH834493.1,INSD:EH809276.1,INSD:EH965007.1,
INSD:EL152369.1,INSD:EH903109.1,INSD:EH971772.1,
INSD:EH835662.1,INSD:EH868549.1,INSD:EL142228.1,
INSD:EL322929.1,INSD:EL199599.1,INSD:EL262588.1,
INSD:EL009248.1,INSD:DR369383.1,INSD:BP788590.1,
INSD:EH982828.1,INSD:EL217610.1,INSD:EL295962.1,
INSD:BP780843.1,INSD:EL320459.1,INSD:EH844883.1,
INSD:AV813092.1,INSD:EL297157.1,INSD:EL012904.1,
INSD:EH892190.1,INSD:EL302713.1,INSD:EL008139.1,
INSD:EH847237.1,INSD:DR369382.1,INSD:EL144165.1,
INSD:EL187867.1,INSD:EH810819.1,INSD:EH854453.1,
INSD:EL221588.1,INSD:EL289152.1,INSD:EH874797.1,
INSD:EL022648.1,INSD:EH894172.1,INSD:EL164442.1,
INSD:EL235142.1,INSD:EL303205.1,INSD:EL160069.1,
INSD:EL160252.1,INSD:AV811821.1,INSD:BP790861.1,
INSD:EH951175.1,INSD:EH837302.1,INSD:EL238711.1,
INSD:EH993671.1,INSD:EL181168.1,INSD:EL155175.1,
INSD:EL021649.1,INSD:EH948211.1,INSD:EH912551.1,
INSD:Z30873.1,INSD:EH948349.1,INSD:EL223819.1,
INSD:EL278326.1,INSD:EL199902.1,INSD:BP779027.1,
INSD:EH901012.1,INSD:EH946216.1,INSD:EL183710.1,
INSD:BP857302.1,INSD:CK120151.1,INSD:EL327789.1,
INSD:EL003143.1,INSD:EH989826.1,INSD:EH955282.1,
INSD:ES035802.1,INSD:EL214119.1,INSD:AV814994.1,
INSD:EL015423.1,INSD:EH879829.1,INSD:AV795186.1,
INSD:EL048116.1,INSD:EL204647.1,INSD:EL207060.1,
INSD:EH936676.1,INSD:EL245332.1,INSD:EH960167.1,
INSD:EL194957.1,INSD:EL124999.1,INSD:EL266027.1,
INSD:EH982015.1,INSD:CB263669.1,INSD:EH949397.1,
INSD:EL269981.1,INSD:EL217382.1,INSD:AV795380.1,
INSD:EL030060.1,INSD:EH815206.1,INSD:EL292228.1,
INSD:EL190976.1,INSD:EL238297.1,INSD:EH894230.1,
INSD:AV781673.1,INSD:EH838352.1,INSD:EL173216.1,
INSD:EH837977.1,INSD:BP792391.1,INSD:BP788550.1,
INSD:EH945212.1,INSD:AV813768.1,INSD:EL049625.1,
INSD:EH861753.1,INSD:AI996938.1,INSD:AV786853.1,
INSD:EH805696.1,INSD:EG519446.1,INSD:BP785185.1,
INSD:EG519456.1,INSD:EH970512.1,INSD:EL050271.1,
INSD:BP783614.1,INSD:EL173432.1,INSD:EL224208.1,
INSD:EH915791.1,INSD:AV534563.1,INSD:EL239321.1,
INSD:EH799794.1,INSD:EL068912.1,INSD:EL301362.1,
INSD:EH981930.1,INSD:EH809800.1,INSD:EL202842.1,
INSD:EL002037.1,INSD:AV441848.1,INSD:EL073950.1,
INSD:EG519445.1,INSD:EL141680.1,INSD:EL048868.1,
INSD:AV566896.1,INSD:EL241808.1,INSD:EL033979.1,
INSD:DR369373.1,INSD:AV796183.1,INSD:EH977526.1,
INSD:EL338752.1,INSD:EH873800.1,INSD:EH897987.1,
INSD:EH801849.1,INSD:EL289608.1,INSD:EG516401.1,
INSD:EL339280.1,INSD:EL313095.1,INSD:AV829938.1,
INSD:EL201021.1,INSD:DR369387.1,INSD:EL284265.1,
INSD:EH980894.1,INSD:DR359864.1,INSD:EH929761.1,
INSD:EH874662.1,INSD:EH873156.1,INSD:EL118962.1,
INSD:EL036681.1,INSD:BP819863.1,INSD:EL050236.1,
INSD:EH846675.1,INSD:DR369372.1,INSD:BP792213.1,
INSD:EL230135.1,INSD:EH816690.1,INSD:EH937656.1,
INSD:ES038877.1,INSD:EH847829.1,INSD:BP846620.1,
INSD:EH946151.1,INSD:EH870882.1,INSD:EL030764.1,
INSD:EL099327.1,INSD:EH824599.1,INSD:EH904645.1,
INSD:EL177924.1,INSD:EL017282.1,INSD:BP643681.1,
INSD:EL261770.1,INSD:EH913821.1,INSD:DR369374.1,
INSD:EH812428.1,INSD:EH860257.1,INSD:EL182081.1,
INSD:EL160226.1,INSD:EL241220.1,INSD:EL184268.1,
INSD:EH969636.1,INSD:ES154416.1,INSD:EH896986.1,
INSD:EH922695.1,INSD:EH814752.1,INSD:EH893823.1,
INSD:AV791585.1,INSD:EL298594.1,INSD:EL205162.1,
INSD:EL118233.1,INSD:EL199164.1,INSD:BE845068.1,
INSD:EH894989.1,INSD:EH906583.1,INSD:AV800267.1,
INSD:EL028713.1,INSD:EH852741.1,INSD:EH911190.1,
INSD:EL148024.1,INSD:EL322052.1,INSD:EL130125.1,
INSD:AV811259.1,INSD:EL172484.1,INSD:EH984756.1,
INSD:EL143771.1,INSD:BP793869.1,INSD:EL334375.1,
INSD:EL166263.1,INSD:EL276880.1,INSD:EL150749.1,
INSD:EL030251.1,INSD:EH977001.1,INSD:EH823106.1,
INSD:EL144272.1,INSD:AV787648.1,INSD:EH902834.1,
INSD:EL330250.1,INSD:EH841048.1,INSD:EG448451.1,
INSD:T42687.1,INSD:EL115825.1,INSD:BP638623.1,
INSD:EL194905.1,INSD:EL172071.1,INSD:EL210325.1,
INSD:EL260004.1,INSD:EL123298.1,INSD:EL173602.1,
INSD:BP781908.1,INSD:EL008847.1,INSD:AV782185.1,
INSD:EL234314.1,INSD:EL331856.1,INSD:EH906779.1,
INSD:EH811123.1,INSD:EG506940.1,INSD:EL033081.1,
INSD:EL006898.1,INSD:EL151621.1,INSD:EH855706.1,
INSD:EL132059.1,INSD:EL189423.1,INSD:EL249442.1,
INSD:EH920254.1,INSD:EL202602.1,INSD:EL300165.1,
INSD:EG499246.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX823615.1,INSD:BX825974.1,INSD:BX823827.1,
INSD:AY059887.1,INSD:AY128804.1,INSD:AF428269.1"
/note="chloroplast stem-loop binding protein of 41 kDa
(CSP41A); FUNCTIONS IN: mRNA binding, poly(U) RNA binding;
INVOLVED IN: rRNA processing; LOCATED IN: in 6 components;
EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NAD-dependent
epimerase/dehydratase (InterPro:IPR001509), NAD(P)-binding
domain (InterPro:IPR016040); BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: chloroplast RNA binding
(TAIR:AT1G09340.1); Has 1047 Blast hits to 1047 proteins
in 372 species: Archae - 70; Bacteria - 649; Metazoa - 6;
Fungi - 5; Plants - 106; Viruses - 0; Other Eukaryotes -
211 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G63140"
/db_xref="Araport:AT3G63140"
intron_pos 133:0 (1/5)
intron_pos 173:2 (2/5)
intron_pos 208:0 (3/5)
intron_pos 254:1 (4/5)
intron_pos 347:0 (5/5)
BEGIN
1 MAALSSSSLF FSSKTTSPIS NLLIPPSLHR FSLPSSSSSF SSLSSSSSSS SSLLTFSLRT
61 SRRLSPQKFT VKASSVGEKK NVLIVNTNSG GHAVIGFYFA KELLSAGHAV TILTVGDESS
121 EKMKKPPFNR FSEIVSGGGK TVWGNPANVA NVVGGETFDV VLDNNGKDLD TVRPVVDWAK
181 SSGVKQFLFI SSAGIYKSTE QPPHVEGDAV KADAGHVVVE KYLAETFGNW ASFRPQYMIG
241 SGNNKDCEEW FFDRIVRDRA VPIPGSGLQL TNISHVRDLS SMLTSAVANP EAASGNIFNC
301 VSDRAVTLDG MAKLCAAAAG KTVEIVHYDP KAIGVDAKKA FLFRNMHFYA EPRAAKDLLG
361 WESKTNLPED LKERFEEYVK IGRDKKEIKF ELDDKILEAL KTPVAA
//