LOCUS AEE80361.1 221 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana ARM repeat superfamily protein protein.
ACCESSION CP002686-9282
PROTEIN_ID AEE80361.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT3G62530"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:ES000594.1,INSD:EL163215.1,INSD:EL324659.1,
INSD:BP844339.1,INSD:Z26411.1,INSD:EL987293.1,
INSD:EL169474.1,INSD:EL245573.1,INSD:EL308643.1,
INSD:ES069301.1,INSD:EL177361.1,INSD:EH949931.1,
INSD:ES195165.1,INSD:ES108153.1,INSD:BP854970.1,
INSD:EL157445.1,INSD:EH839165.1,INSD:EG506348.1,
INSD:EL121310.1,INSD:EL066592.1,INSD:EH983147.1,
INSD:ES169838.1,INSD:EH873819.1,INSD:EH981626.1,
INSD:EL111792.1,INSD:EL312024.1,INSD:EL034676.1,
INSD:BP563091.1,INSD:ES199331.1,INSD:ES006303.1,
INSD:EL309518.1,INSD:ES184858.1,INSD:AI995886.1,
INSD:ES126753.1,INSD:EH875784.1,INSD:BP823870.1,
INSD:ES137199.1,INSD:EL260643.1,INSD:ES010091.1,
INSD:BP627017.1,INSD:T44405.1,INSD:BP659910.1,
INSD:EL252304.1,INSD:ES074904.1,INSD:EL283949.1,
INSD:BP634087.1,INSD:AV822509.1,INSD:ES025714.1,
INSD:ES176612.1,INSD:BP813973.1,INSD:ES046222.1,
INSD:EL245850.1,INSD:BP860607.1,INSD:EH861039.1,
INSD:EH832845.1,INSD:DR355735.1,INSD:EL029028.1,
INSD:EL201090.1,INSD:EL986304.1,INSD:BP787313.1,
INSD:EH888644.1,INSD:EL198822.1,INSD:EL009397.1,
INSD:ES168249.1,INSD:BP661734.1,INSD:EL064769.1,
INSD:ES195305.1,INSD:BP860762.1,INSD:EH904604.1,
INSD:EG504228.1,INSD:AV815105.1,INSD:EH865565.1,
INSD:ES193560.1,INSD:EL242177.1,INSD:BP784101.1,
INSD:EL175539.1,INSD:EH969526.1,INSD:ES009297.1,
INSD:EL178149.1,INSD:EL235654.1,INSD:DR355733.1,
INSD:EL220617.1,INSD:ES100893.1,INSD:EL203147.1,
INSD:EL005617.1,INSD:ES116374.1,INSD:AV789182.1,
INSD:ES054215.1,INSD:ES124056.1,INSD:ES197061.1,
INSD:ES053034.1,INSD:ES005183.1,INSD:EL973277.1,
INSD:EL997997.1,INSD:EH881591.1,INSD:EL314030.1,
INSD:EL241255.1,INSD:EL321544.1,INSD:EH867351.1,
INSD:EL236035.1,INSD:EL269888.1,INSD:EH818732.1,
INSD:ES064694.1,INSD:ES078757.1,INSD:EL054596.1,
INSD:EL167851.1,INSD:EL128838.1,INSD:EH851583.1,
INSD:ES076589.1,INSD:EH938258.1,INSD:EL165624.1,
INSD:EL081327.1,INSD:ES106151.1,INSD:ES190948.1,
INSD:CF652823.1,INSD:EL191978.1,INSD:EH866384.1,
INSD:ES031014.1,INSD:EL176787.1,INSD:EH873599.1,
INSD:EL176020.1,INSD:ES116016.1,INSD:EL989807.1,
INSD:EL033509.1,INSD:EH816316.1,INSD:EL050500.1,
INSD:EL218284.1,INSD:EH961504.1,INSD:EH990083.1,
INSD:EH959315.1,INSD:EL986935.1,INSD:EL222911.1,
INSD:EH944032.1,INSD:EL264681.1,INSD:BP867190.1,
INSD:EH931528.1,INSD:EL048788.1,INSD:ES073896.1,
INSD:AV562326.1,INSD:BP779333.1,INSD:EH894246.1,
INSD:EH962099.1,INSD:BP630838.1,INSD:ES063875.1,
INSD:AV787724.1,INSD:EL284386.1,INSD:AV783293.1,
INSD:ES057493.1,INSD:EL184665.1,INSD:EL116706.1,
INSD:ES185806.1,INSD:ES134688.1,INSD:EL149377.1,
INSD:ES138518.1,INSD:EL190216.1,INSD:Z30500.1,
INSD:DR260464.1,INSD:EH985771.1,INSD:EG506346.1,
INSD:EH976309.1,INSD:EH952862.1,INSD:EL211909.1,
INSD:EH899210.1,INSD:EH885682.1,INSD:ES022212.1,
INSD:ES092204.1,INSD:EL075196.1,INSD:EL263647.1,
INSD:EL020936.1,INSD:ES134316.1,INSD:EL138232.1,
INSD:EH899848.1,INSD:BP671868.1,INSD:EL984814.1,
INSD:EL219862.1,INSD:ES086239.1,INSD:EG504199.1,
INSD:EH909327.1,INSD:EL317130.1,INSD:BP637440.1,
INSD:EL151209.1,INSD:EL080532.1,INSD:EH810226.1,
INSD:ES132146.1,INSD:EH890407.1,INSD:EG470101.1,
INSD:EL317730.1,INSD:AU230881.1,INSD:ES205372.1,
INSD:CB262332.1,INSD:EL237751.1,INSD:EL285414.1,
INSD:EH961481.1,INSD:EL973451.1,INSD:CF652822.1,
INSD:EL011199.1,INSD:DR355736.1,INSD:EL320541.1,
INSD:BP840706.1,INSD:EL307739.1,INSD:EL310275.1,
INSD:ES203334.1,INSD:EH972397.1,INSD:ES169947.1,
INSD:ES104807.1,INSD:EL327948.1,INSD:EL311130.1,
INSD:BP631730.1,INSD:DR355732.1,INSD:EL072912.1,
INSD:EL078337.1,INSD:BP589758.1,INSD:EL283561.1,
INSD:EL299620.1,INSD:BP825979.1,INSD:EL154985.1,
INSD:ES152164.1,INSD:EH832404.1,INSD:EL331938.1,
INSD:EH893646.1,INSD:EL241992.1,INSD:EL214593.1,
INSD:ES065271.1,INSD:EL217810.1,INSD:EH850985.1,
INSD:EL241909.1,INSD:BP664186.1,INSD:EL130253.1,
INSD:CF773950.1,INSD:EL299016.1,INSD:EH827978.1,
INSD:EH958196.1,INSD:ES130434.1,INSD:EL213060.1,
INSD:ES186473.1,INSD:EL266385.1,INSD:EL280304.1,
INSD:EL176768.1,INSD:ES059428.1,INSD:EL178397.1,
INSD:EL026947.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX825368.1,INSD:AY063090.1,INSD:AK229677.1,
INSD:BX825451.1,INSD:AF370303.1"
/note="ARM repeat superfamily protein; FUNCTIONS IN: lyase
activity, zinc ion binding, metal ion binding; INVOLVED
IN: biological_process unknown; LOCATED IN: mitochondrion,
nucleolus, chloroplast, phycobilisome; CONTAINS InterPro
DOMAIN/s: Armadillo-like helical (InterPro:IPR011989),
Armadillo-type fold (InterPro:IPR016024), PBS lyase
HEAT-like repeat (InterPro:IPR004155); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: ARM repeat superfamily protein
(TAIR:AT3G58180.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins
in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa -
17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other
Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G62530"
/db_xref="Araport:AT3G62530"
intron_pos 91:2 (1/3)
intron_pos 138:0 (2/3)
intron_pos 180:1 (3/3)
BEGIN
1 MFLSQFRSCK PLLESRLPLL RLSLSKCLDQ SFKTTASSEY GSKINKVTKH VNEEDGATFY
61 VTRRGAIDSS APAESKAYPK AANISSIHSM RESLLEETEE DYYRRLALFA LRNHGGEDAI
121 NVIIESLGVE SSMIRIEAAF VLGQLESKTA IASLSKILRD VKEHPMVRVE AAKALGFIAD
181 EKSREVLQEL SGDLDPIIAK GCDSSLSILE FKNSKKYDPL I
//