LOCUS AEE80297.1 260 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana rotamase CYP 4 protein.
ACCESSION CP002686-9200
PROTEIN_ID AEE80297.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="ROC4"
/locus_tag="AT3G62030"
/gene_synonym="cyclophilin 20-3"
/gene_synonym="CYP20-3"
/gene_synonym="PEPTIDYLPROLYL ISOMERASE ROC4"
/gene_synonym="rotamase CYP 4"
/gene_synonym="T17J13.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH973946.1,INSD:EH841533.1,INSD:EH803781.1,
INSD:EH864966.1,INSD:EH843423.1,INSD:EL156486.1,
INSD:EL274525.1,INSD:DR267546.1,INSD:EL152691.1,
INSD:DR267517.1,INSD:AV786722.1,INSD:EL145379.1,
INSD:EL230914.1,INSD:EH798620.1,INSD:EL272760.1,
INSD:EH919239.1,INSD:DR203027.1,INSD:EL323538.1,
INSD:EH914844.1,INSD:EL067124.1,INSD:EL341545.1,
INSD:CB262570.1,INSD:EH893174.1,INSD:EL184703.1,
INSD:EH892770.1,INSD:EL075142.1,INSD:EL074311.1,
INSD:EH819638.1,INSD:EL330648.1,INSD:EL111930.1,
INSD:ES084700.1,INSD:DR267556.1,INSD:EH799388.1,
INSD:BP612700.1,INSD:EH886847.1,INSD:EL088644.1,
INSD:EL213245.1,INSD:EL293545.1,INSD:EH923135.1,
INSD:EL123720.1,INSD:EL205310.1,INSD:EL339056.1,
INSD:EL227121.1,INSD:EL202593.1,INSD:EH906929.1,
INSD:EH806279.1,INSD:BP647897.1,INSD:EH914579.1,
INSD:EL039020.1,INSD:EL237538.1,INSD:EL180172.1,
INSD:EH891228.1,INSD:EH864941.1,INSD:EL260760.1,
INSD:CB262402.1,INSD:EL070322.1,INSD:EH934620.1,
INSD:EL110346.1,INSD:DR377214.1,INSD:EL230646.1,
INSD:EL265633.1,INSD:EH858815.1,INSD:EH805854.1,
INSD:EL215554.1,INSD:EL307468.1,INSD:EH798467.1,
INSD:EL205883.1,INSD:EH954876.1,INSD:EH825076.1,
INSD:DR267545.1,INSD:EL312156.1,INSD:ES022740.1,
INSD:EL309043.1,INSD:EL109719.1,INSD:ES115084.1,
INSD:ES197880.1,INSD:BP605999.1,INSD:EH992762.1,
INSD:EH920092.1,INSD:EL308979.1,INSD:EL262826.1,
INSD:EL141749.1,INSD:EL111788.1,INSD:EH970572.1,
INSD:EL138553.1,INSD:EL317026.1,INSD:ES154396.1,
INSD:DR267522.1,INSD:EH827866.1,INSD:EL192873.1,
INSD:EL073322.1,INSD:EL263485.1,INSD:EH897940.1,
INSD:EL306188.1,INSD:EL333283.1,INSD:EL293898.1,
INSD:EL260725.1,INSD:EL167717.1,INSD:EL103792.1,
INSD:EL212543.1,INSD:EL315325.1,INSD:EL173601.1,
INSD:EH845229.1,INSD:EL309728.1,INSD:EL295331.1,
INSD:EH919419.1,INSD:EL119638.1,INSD:AV820833.1,
INSD:AV792314.1,INSD:EL051256.1,INSD:EG497554.1,
INSD:EL129695.1,INSD:AV521840.1,INSD:EL158119.1,
INSD:BP659158.1,INSD:EL247866.1,INSD:EL054436.1,
INSD:EH957534.1,INSD:EL190970.1,INSD:EL189175.1,
INSD:BP788616.1,INSD:EL083617.1,INSD:EL222028.1,
INSD:EL084186.1,INSD:EH889983.1,INSD:AV795774.1,
INSD:EL026453.1,INSD:EL105283.1,INSD:EL288751.1,
INSD:ES169693.1,INSD:EL225503.1,INSD:EL168577.1,
INSD:BP778202.1,INSD:EL220206.1,INSD:BP789440.1,
INSD:EH811160.1,INSD:EG508494.1,INSD:EL145989.1,
INSD:BP655501.1,INSD:EL328370.1,INSD:CB263139.1,
INSD:EL032549.1,INSD:DR267555.1,INSD:AV793005.1,
INSD:EH907071.1,INSD:EH858984.1,INSD:EL226065.1,
INSD:EH960776.1,INSD:EL317079.1,INSD:EL186133.1,
INSD:EL311201.1,INSD:BX838558.1,INSD:EL149990.1,
INSD:EL269219.1,INSD:EH814182.1,INSD:EH914069.1,
INSD:EL297387.1,INSD:EL245707.1,INSD:EH950034.1,
INSD:CB262040.1,INSD:BP663118.1,INSD:AV786190.1,
INSD:EG491033.1,INSD:EL021511.1,INSD:DR267529.1,
INSD:DR267552.1,INSD:EH827401.1,INSD:EL130268.1,
INSD:EL288494.1,INSD:EL223224.1,INSD:BP633957.1,
INSD:EH843418.1,INSD:EL332520.1,INSD:EL068494.1,
INSD:DR267560.1,INSD:EH974240.1,INSD:EL044534.1,
INSD:EL104804.1,INSD:EL041092.1,INSD:EL123841.1,
INSD:AV795776.1,INSD:EL279360.1,INSD:ES155560.1,
INSD:EL283419.1,INSD:EH864374.1,INSD:EL026012.1,
INSD:EL061114.1,INSD:EL108827.1,INSD:EL030808.1,
INSD:EL298409.1,INSD:DR267547.1,INSD:EL303533.1,
INSD:EH835575.1,INSD:EL336683.1,INSD:BE845391.1,
INSD:EL047476.1,INSD:EH891141.1,INSD:EH880869.1,
INSD:EH814584.1,INSD:EL306326.1,INSD:EH818420.1,
INSD:EL135597.1,INSD:EL261259.1,INSD:EL281349.1,
INSD:EH955353.1,INSD:EH977808.1,INSD:EL241812.1,
INSD:EL008952.1,INSD:EL028322.1,INSD:EL090829.1,
INSD:EL269110.1,INSD:BP652794.1,INSD:EL026238.1,
INSD:EL280862.1,INSD:EL175561.1,INSD:EL162261.1,
INSD:EL071450.1,INSD:EL218650.1,INSD:DR267513.1,
INSD:EL043923.1,INSD:BP795310.1,INSD:EH872190.1,
INSD:DR355417.1,INSD:EL041094.1,INSD:EH840023.1,
INSD:AV799622.1,INSD:EL202648.1,INSD:BP786902.1,
INSD:EL213704.1,INSD:DR267521.1,INSD:EL148765.1,
INSD:EH931911.1,INSD:EL170823.1,INSD:EH850068.1,
INSD:EL257185.1,INSD:EL100314.1,INSD:EL134761.1,
INSD:EL125771.1,INSD:EL093327.1,INSD:EL264308.1,
INSD:EH871072.1,INSD:EL304094.1,INSD:AV787080.1,
INSD:EH823349.1,INSD:EH854426.1,INSD:EL024715.1,
INSD:EH804144.1,INSD:EL317992.1,INSD:EL120355.1,
INSD:EL153675.1,INSD:EH916978.1,INSD:AV801085.1,
INSD:DR267551.1,INSD:EL055846.1,INSD:EL072366.1,
INSD:AV565112.1,INSD:ES155582.1,INSD:EH902944.1,
INSD:EH805347.1,INSD:EL150752.1,INSD:EH918191.1,
INSD:EL247880.1,INSD:BP668052.1,INSD:EH928664.1,
INSD:EL199313.1,INSD:EL128427.1,INSD:EL117657.1,
INSD:ES156385.1,INSD:EL109525.1,INSD:AV814647.1,
INSD:EL273117.1,INSD:EH865907.1,INSD:EH845492.1,
INSD:CA781834.1,INSD:DR267520.1,INSD:EH944333.1,
INSD:EL153547.1,INSD:EH933028.1,INSD:EH884946.1,
INSD:ES016031.1,INSD:EL202104.1,INSD:EH836085.1,
INSD:EH808988.1,INSD:EG508493.1,INSD:BU635422.1,
INSD:EL265728.1,INSD:EL197215.1,INSD:AV795901.1,
INSD:EH953101.1,INSD:ES015961.1,INSD:EH844144.1,
INSD:EL217174.1,INSD:EH810176.1,INSD:EL168244.1,
INSD:AV787725.1,INSD:EH815877.1,INSD:EH855883.1,
INSD:EL293721.1,INSD:EL178141.1,INSD:EL204979.1,
INSD:DR267544.1,INSD:DR267558.1,INSD:EL206826.1,
INSD:EL215267.1,INSD:R64740.1,INSD:BP618909.1,
INSD:EH814211.1,INSD:EH988385.1,INSD:BP639862.1,
INSD:EL281569.1,INSD:EL332781.1,INSD:EL011705.1,
INSD:EH889743.1,INSD:EL076797.1,INSD:DR267532.1,
INSD:EG491080.1,INSD:EL114405.1,INSD:DR267542.1,
INSD:DR374453.1,INSD:BP625245.1,INSD:EH862089.1,
INSD:EL201628.1,INSD:EL301015.1,INSD:EH917675.1,
INSD:EL055771.1,INSD:CD532360.1,INSD:EL062643.1,
INSD:EL194729.1,INSD:EL255094.1,INSD:DR267550.1,
INSD:EL324724.1,INSD:EL011400.1,INSD:EH822050.1,
INSD:DR267516.1,INSD:AV788255.1,INSD:EH862066.1,
INSD:EL114241.1,INSD:EH889404.1,INSD:EL204671.1,
INSD:EH973387.1,INSD:BP629708.1,INSD:EL212384.1,
INSD:EH962714.1,INSD:EH908063.1,INSD:EL166063.1,
INSD:BP599103.1,INSD:EL127322.1,INSD:EL252322.1,
INSD:EH888393.1,INSD:EL086813.1,INSD:Z37672.1,
INSD:DR267518.1,INSD:EH955094.1,INSD:BP647396.1,
INSD:EL251002.1,INSD:EL104946.1,INSD:EL127671.1,
INSD:EL021127.1,INSD:EH869908.1,INSD:DR267543.1,
INSD:EL024355.1,INSD:EL049697.1,INSD:EH910889.1,
INSD:EL180039.1,INSD:EH939485.1,INSD:EL042368.1,
INSD:EH946298.1,INSD:EL218680.1,INSD:DR224982.1,
INSD:BP781634.1,INSD:EL172199.1,INSD:EH826796.1,
INSD:EH890613.1,INSD:DR267536.1,INSD:BP834242.1,
INSD:EL141413.1,INSD:EL182029.1,INSD:EL335631.1,
INSD:DR267514.1,INSD:ES054224.1,INSD:EH950672.1,
INSD:EL017391.1,INSD:EL110660.1,INSD:EL292641.1,
INSD:EH836233.1,INSD:EL260013.1,INSD:EL059347.1,
INSD:EL059093.1,INSD:EH815125.1,INSD:EL247749.1,
INSD:EL295539.1,INSD:EH808113.1,INSD:EL253401.1,
INSD:EH976277.1,INSD:EG516807.1,INSD:EL145127.1,
INSD:EL139760.1,INSD:BP836158.1,INSD:EL204761.1,
INSD:EL214541.1,INSD:EL248516.1,INSD:EL015064.1,
INSD:EL305234.1,INSD:BP628386.1,INSD:EH888892.1,
INSD:AV527435.1,INSD:EL136746.1,INSD:BP862953.1,
INSD:EH984527.1,INSD:EH968374.1,INSD:EH957805.1,
INSD:EL289827.1,INSD:AV558249.1,INSD:EL119354.1,
INSD:EL159437.1,INSD:EL032036.1,INSD:EL253143.1,
INSD:EH817804.1,INSD:EL255319.1,INSD:EG480673.1,
INSD:EL073362.1,INSD:EH862858.1,INSD:AV825197.1,
INSD:EL036937.1,INSD:EL045724.1,INSD:EH933223.1,
INSD:EH934450.1,INSD:EH823398.1,INSD:EH893570.1,
INSD:ES002091.1,INSD:EH832333.1,INSD:EL082817.1,
INSD:EH943531.1,INSD:EL179962.1,INSD:EH969770.1,
INSD:EL155934.1,INSD:EH957619.1,INSD:EL010616.1,
INSD:BP829303.1,INSD:ES216051.1,INSD:EL025368.1,
INSD:AV785978.1,INSD:EL168658.1,INSD:EL136813.1,
INSD:EL080000.1,INSD:EH903820.1,INSD:EL301603.1,
INSD:EH814837.1,INSD:EH864607.1,INSD:AV795226.1,
INSD:EL004676.1,INSD:EH809839.1,INSD:EH830921.1,
INSD:ES129408.1,INSD:EH938296.1,INSD:EL037914.1,
INSD:EL174477.1,INSD:EH821302.1,INSD:EH848981.1,
INSD:ES073717.1,INSD:BP626769.1,INSD:EL151102.1,
INSD:DR267557.1,INSD:DR267525.1,INSD:EH827506.1,
INSD:EL122727.1,INSD:AV795228.1,INSD:EG514420.1,
INSD:EL160938.1,INSD:DR267519.1,INSD:EL270288.1,
INSD:EL228014.1,INSD:ES017520.1,INSD:EG514655.1,
INSD:EH945034.1,INSD:EL332398.1,INSD:AV819118.1,
INSD:EH831725.1,INSD:EL246605.1,INSD:DR267523.1,
INSD:EL305006.1,INSD:EH848701.1,INSD:EL079784.1,
INSD:EH983610.1,INSD:EL216926.1,INSD:EL202213.1,
INSD:DR267526.1,INSD:EL278201.1,INSD:EH915325.1,
INSD:EL104975.1,INSD:EL301893.1,INSD:EL238373.1,
INSD:EL269633.1,INSD:EH867275.1,INSD:EH987577.1,
INSD:EL200162.1,INSD:EL029954.1,INSD:EL188078.1,
INSD:EL252551.1,INSD:DR267527.1,INSD:EL245994.1,
INSD:EL038846.1,INSD:EL064509.1,INSD:EL224681.1,
INSD:EL253164.1,INSD:EL311254.1,INSD:ES153293.1,
INSD:EL251952.1,INSD:EL168947.1,INSD:EL139998.1,
INSD:EH884286.1,INSD:DR267549.1,INSD:EH952267.1,
INSD:DR267528.1,INSD:EH900405.1,INSD:EL064317.1,
INSD:EL074337.1,INSD:EL159925.1,INSD:EL259863.1,
INSD:EL046290.1,INSD:EL257394.1,INSD:EH896464.1,
INSD:EL050863.1,INSD:DR267537.1,INSD:Z37673.1,
INSD:BP777875.1,INSD:ES178012.1,INSD:EL243014.1,
INSD:EL105862.1,INSD:EH863025.1,INSD:DR267538.1,
INSD:EL260294.1,INSD:EL125316.1,INSD:BP844028.1,
INSD:EL278541.1,INSD:EH906969.1,INSD:EH836528.1,
INSD:DR267541.1,INSD:DR267548.1,INSD:EL128353.1,
INSD:EL015848.1,INSD:EL171844.1,INSD:EL249834.1,
INSD:EH944511.1,INSD:EL224036.1,INSD:EL320759.1,
INSD:EL007987.1,INSD:EH837798.1,INSD:EH953400.1,
INSD:EH796844.1,INSD:EL217703.1,INSD:EH928420.1,
INSD:EL230461.1,INSD:AV556739.1,INSD:EH969145.1,
INSD:EH809190.1,INSD:EL023125.1,INSD:EL299416.1,
INSD:EL081926.1,INSD:EH842941.1,INSD:EL128332.1,
INSD:EL239723.1,INSD:EL335061.1,INSD:EL251842.1,
INSD:ES200426.1,INSD:DR267515.1,INSD:EG487013.1,
INSD:ES185703.1,INSD:DR267554.1,INSD:EL089149.1,
INSD:EH810519.1,INSD:AV786892.1,INSD:EH874251.1,
INSD:AV790457.1,INSD:EL313247.1,INSD:EL016082.1,
INSD:EL150662.1,INSD:EH992827.1,INSD:EL183009.1,
INSD:AV825765.1,INSD:EH816367.1,INSD:AI099968.1,
INSD:EG497553.1,INSD:EL139748.1,INSD:EH901069.1,
INSD:EL079345.1,INSD:EH988858.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AF325026.2,INSD:AY093284.1,INSD:L14845.1,
INSD:AY086899.1,INSD:BX822116.1,INSD:BX822280.1,
INSD:AY059843.1,INSD:BX822252.1"
/note="rotamase CYP 4 (ROC4); FUNCTIONS IN:
peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity; INVOLVED IN:
in 9 processes; LOCATED IN: in 8 components; EXPRESSED IN:
26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages;
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclophilin-like
(InterPro:IPR015891), Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase,
cyclophilin-type (InterPro:IPR002130), Peptidyl-prolyl
cis-trans isomerase, cyclophilin-type, conserved site
(InterPro:IPR020892); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: cyclophilin 20-2 (TAIR:AT5G13120.1); Has 16567
Blast hits to 16531 proteins in 2704 species: Archae -
108; Bacteria - 6870; Metazoa - 2913; Fungi - 1380; Plants
- 1296; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 3996 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G62030"
/db_xref="Araport:AT3G62030"
intron_pos 19:0 (1/6)
intron_pos 82:0 (2/6)
intron_pos 133:1 (3/6)
intron_pos 163:0 (4/6)
intron_pos 181:1 (5/6)
intron_pos 210:0 (6/6)
BEGIN
1 MASSSSMQMV HTSRSIAQIG FGVKSQLVSA NRTTQSVCFG ARSSGIALSS RLHYASPIKQ
61 FSGVYATTKH QRTACVKSMA AEEEEVIEPQ AKVTNKVYFD VEIGGEVAGR IVMGLFGEVV
121 PKTVENFRAL CTGEKKYGYK GSSFHRIIKD FMIQGGDFTE GNGTGGISIY GAKFEDENFT
181 LKHTGPGILS MANAGPNTNG SQFFICTVKT SWLDNKHVVF GQVIEGMKLV RTLESQETRA
241 FDVPKKGCRI YACGELPLDA
//