LOCUS AEE80106.1 151 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Ribosomal protein S13/S15 protein.
ACCESSION CP002686-8946
PROTEIN_ID AEE80106.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT3G60770"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR362317.1,INSD:ES133718.1,INSD:BP835747.1,
INSD:ES208011.1,INSD:EL261627.1,INSD:ES182715.1,
INSD:EH939586.1,INSD:DR362284.1,INSD:EL993864.1,
INSD:EL329314.1,INSD:EH918390.1,INSD:ES111720.1,
INSD:DR362345.1,INSD:DR362281.1,INSD:ES211136.1,
INSD:AV821293.1,INSD:ES049967.1,INSD:ES191230.1,
INSD:EG500872.1,INSD:BP627259.1,INSD:EL293525.1,
INSD:DR362318.1,INSD:EL976818.1,INSD:ES105255.1,
INSD:EH803573.1,INSD:EL178227.1,INSD:ES120478.1,
INSD:DR362313.1,INSD:EL272331.1,INSD:ES059065.1,
INSD:AV539522.1,INSD:EL253999.1,INSD:ES215648.1,
INSD:CF652641.1,INSD:EG528757.1,INSD:ES038925.1,
INSD:BP797630.1,INSD:ES127823.1,INSD:ES193575.1,
INSD:EL259354.1,INSD:EL031708.1,INSD:T45050.1,
INSD:DR362301.1,INSD:ES197589.1,INSD:ES117322.1,
INSD:EL970316.1,INSD:ES164637.1,INSD:ES178878.1,
INSD:EL043746.1,INSD:DR362336.1,INSD:ES198717.1,
INSD:BP569756.1,INSD:DR362315.1,INSD:ES150580.1,
INSD:T45604.1,INSD:ES206442.1,INSD:BP580310.1,
INSD:DR362287.1,INSD:ES000500.1,INSD:EH943838.1,
INSD:EH820707.1,INSD:BU635700.1,INSD:EL041473.1,
INSD:BP569162.1,INSD:ES132993.1,INSD:DR362332.1,
INSD:ES097831.1,INSD:EL974184.1,INSD:EL967598.1,
INSD:DR362283.1,INSD:DR362353.1,INSD:EH813900.1,
INSD:BP804253.1,INSD:DR376907.1,INSD:EH847158.1,
INSD:EL988333.1,INSD:DR362341.1,INSD:CA781345.1,
INSD:AV818672.1,INSD:AV558208.1,INSD:ES213323.1,
INSD:EG528752.1,INSD:BP566299.1,INSD:ES090546.1,
INSD:R90069.1,INSD:EL242816.1,INSD:EL994910.1,
INSD:N97193.1,INSD:EH948458.1,INSD:BP629898.1,
INSD:ES062137.1,INSD:BP606530.1,INSD:EG528754.1,
INSD:ES150872.1,INSD:ES072800.1,INSD:CB263788.1,
INSD:DR362344.1,INSD:ES095355.1,INSD:AV540301.1,
INSD:EG500889.1,INSD:EL133003.1,INSD:DR362314.1,
INSD:EG490543.1,INSD:BP562374.2,INSD:DR362293.1,
INSD:EL281199.1,INSD:DR362282.1,INSD:AV533935.1,
INSD:ES085981.1,INSD:ES065383.1,INSD:EG528760.1,
INSD:ES103468.1,INSD:EL048666.1,INSD:AV824152.1,
INSD:BP581942.1,INSD:DR362308.1,INSD:BP869101.1,
INSD:DR362321.1,INSD:AV804053.1,INSD:EL102748.1,
INSD:ES019774.1,INSD:CF652782.1,INSD:DR362350.1,
INSD:EH908419.1,INSD:DR362297.1,INSD:EG490544.1,
INSD:EL213198.1,INSD:ES161254.1,INSD:BP591242.1,
INSD:EH870839.1,INSD:ES197616.1,INSD:BP632337.1,
INSD:DR362325.1,INSD:EL282738.1,INSD:ES121641.1,
INSD:ES173172.1,INSD:BP798996.1,INSD:ES166860.1,
INSD:BP797987.2,INSD:BE038325.1,INSD:ES063793.1,
INSD:DR377649.1,INSD:AV804150.1,INSD:ES189387.1,
INSD:ES068705.1,INSD:DR362352.1,INSD:EH817131.1,
INSD:EL302186.1,INSD:ES186918.1,INSD:EL170869.1,
INSD:BP857220.1,INSD:EG528753.1,INSD:EL311924.1,
INSD:ES059212.1,INSD:DR362292.1,INSD:EL337418.1,
INSD:BP611834.1,INSD:EG528751.1,INSD:AV781654.1,
INSD:ES176796.1,INSD:EH837205.1,INSD:EL219699.1,
INSD:ES091907.1,INSD:EH811303.1,INSD:EL149952.1,
INSD:DR362295.1,INSD:BP800745.1,INSD:ES037199.1,
INSD:DR362347.1,INSD:ES168853.1,INSD:EH909489.1,
INSD:CK121723.1,INSD:CB254288.1,INSD:BP624302.1,
INSD:DR362354.1,INSD:ES074746.1,INSD:ES083028.1,
INSD:BP568074.1,INSD:BP573820.1,INSD:EH973011.1,
INSD:DR362289.1,INSD:BP566758.1,INSD:ES026333.1,
INSD:ES209604.1,INSD:ES118320.1,INSD:EH843209.1,
INSD:EH817179.1,INSD:EL967958.1,INSD:BP572334.1,
INSD:EL971996.1,INSD:BP564378.1,INSD:EG528761.1,
INSD:EL001161.1,INSD:DR362334.1,INSD:EL217202.1,
INSD:DR362348.1,INSD:EL971187.1,INSD:EH831801.1,
INSD:DR362343.1,INSD:BP595004.1,INSD:BP625860.1,
INSD:BP570202.1,INSD:AV785667.1,INSD:EL983221.1,
INSD:ES048231.1,INSD:ES147193.1,INSD:EL224652.1,
INSD:DR362339.1,INSD:EG528765.1,INSD:EG455459.1,
INSD:DR362356.1,INSD:AV531559.1,INSD:DR362355.1,
INSD:ES049835.1,INSD:EL087798.1,INSD:ES059235.1,
INSD:EH948746.1,INSD:EL212903.1,INSD:ES105081.1,
INSD:EH801466.1,INSD:DR362298.1,INSD:DR362306.1,
INSD:EL063607.1,INSD:ES131881.1,INSD:ES112912.1,
INSD:EL981322.1,INSD:EL249479.1,INSD:DR362285.1,
INSD:ES177924.1,INSD:EL050496.1,INSD:ES017752.1,
INSD:BP584058.1,INSD:ES113590.1,INSD:EH823135.1,
INSD:EL048512.1,INSD:DR362324.1,INSD:EL989293.1,
INSD:EG466476.1,INSD:DR362309.1,INSD:ES064375.1,
INSD:DR362351.1,INSD:ES103100.1,INSD:ES052608.1,
INSD:BP836770.1,INSD:EL215813.1,INSD:DR362340.1,
INSD:BP619822.1,INSD:BP865104.1,INSD:BP631249.1,
INSD:BP560549.1,INSD:T42244.1,INSD:ES079277.1,
INSD:AV553405.1,INSD:EL148962.1,INSD:DR362303.1,
INSD:DR362346.1,INSD:EG528756.1,INSD:BP811755.1,
INSD:DR362290.1,INSD:ES141460.1,INSD:EL206816.1,
INSD:ES035417.1,INSD:ES167601.1,INSD:DR362326.1,
INSD:EH881262.1,INSD:AV532031.1,INSD:EG466475.1,
INSD:DR372267.1,INSD:EL176364.1,INSD:ES186358.1,
INSD:ES109612.1,INSD:EH839498.1,INSD:EL263999.1,
INSD:DR362328.1,INSD:EL088109.1,INSD:EH973115.1,
INSD:EH846175.1,INSD:BP830716.1,INSD:EG500890.1,
INSD:BP571027.1,INSD:DR362333.1,INSD:EL232895.1,
INSD:BP578717.1,INSD:EL973755.1,INSD:EH811683.1,
INSD:ES206382.1,INSD:AV785317.1,INSD:ES096224.1,
INSD:DR362311.1,INSD:EL268009.1,INSD:EL969027.1,
INSD:BP641209.1,INSD:ES181153.1,INSD:ES019988.1,
INSD:ES123759.1,INSD:EL245774.1,INSD:DR362359.1,
INSD:AV789787.1,INSD:AI099916.1,INSD:EG528767.1,
INSD:CF651958.1,INSD:ES097591.1,INSD:ES004921.1,
INSD:BP817806.1,INSD:DR362305.1,INSD:ES115178.1,
INSD:ES141015.1,INSD:Z17784.1,INSD:ES168511.1,
INSD:CF651765.1,INSD:DR362323.1,INSD:ES038440.1,
INSD:EL177048.1,INSD:EL194101.1,INSD:ES028282.1,
INSD:DR362349.1,INSD:ES037176.1,INSD:BP584451.1,
INSD:BP562752.3,INSD:CB257706.1,INSD:DR362294.1,
INSD:BX840637.1,INSD:BP821984.1,INSD:ES031503.1,
INSD:DR362358.1,INSD:ES022868.1,INSD:AA712540.1,
INSD:ES100103.1,INSD:ES164020.1,INSD:EL137388.1,
INSD:ES078228.1,INSD:EH851803.1,INSD:BP587286.1,
INSD:ES077661.1,INSD:ES037537.1,INSD:EL985593.1,
INSD:ES134734.1,INSD:BP567653.1,INSD:EL175476.1,
INSD:EL221920.1,INSD:BP588587.1,INSD:ES191881.1,
INSD:EL306658.1,INSD:BP853499.1,INSD:ES133470.1,
INSD:CA781448.1,INSD:DR362330.1,INSD:DR362286.1,
INSD:DR362302.1,INSD:DR362300.1,INSD:CB259725.1,
INSD:DR362331.1,INSD:DR362299.1,INSD:EH804857.1,
INSD:DR362338.1,INSD:EG528748.1,INSD:EL188249.1,
INSD:DR362304.1,INSD:DR362296.1,INSD:EL284522.1,
INSD:EL109495.1,INSD:BP811690.1,INSD:EL303928.1,
INSD:EL223954.1,INSD:EH928888.1,INSD:ES017884.1,
INSD:EL160242.1,INSD:EH859011.1,INSD:ES028116.1,
INSD:DR362337.1,INSD:CB257574.1,INSD:EL122661.1,
INSD:ES172300.1,INSD:DR362291.1,INSD:DR362307.1,
INSD:ES133159.1,INSD:ES020130.1,INSD:ES013084.1,
INSD:ES097398.1,INSD:ES184751.1,INSD:ES130070.1,
INSD:DR362319.1,INSD:BP850702.2,INSD:EH963253.1,
INSD:EL086867.1,INSD:EL243908.1,INSD:EL181364.1,
INSD:BP648331.1,INSD:DR362342.1,INSD:DR362327.1,
INSD:N38444.1,INSD:DR362316.1,INSD:DR362357.1,
INSD:BP591775.1,INSD:ES205935.1,INSD:BP638201.1,
INSD:DR362312.1,INSD:BP848278.1,INSD:AV806205.1,
INSD:EL969574.1,INSD:DR362329.1,INSD:BP837532.1,
INSD:T43897.1,INSD:EH913869.1,INSD:BP845507.1,
INSD:ES019274.1,INSD:ES086327.1,INSD:BP581544.1,
INSD:EL977070.1,INSD:EH966620.1,INSD:EG500871.1,
INSD:ES190173.1,INSD:EL094844.1,INSD:DR362335.1,
INSD:DR362320.1,INSD:CB263787.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY052731.1,INSD:AF378861.1,INSD:AY090366.1,
INSD:AY056088.1,INSD:AF380636.1,INSD:BX823053.1"
/note="Ribosomal protein S13/S15; FUNCTIONS IN: structural
constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED
IN: cytosolic small ribosomal subunit, cytosolic ribosome,
nucleolus, cell wall, chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant
structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS
InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S13/S15, N-terminal
(InterPro:IPR012606), Ribosomal protein S15
(InterPro:IPR000589), S15/NS1, RNA-binding
(InterPro:IPR009068); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: ribosomal protein S13A (TAIR:AT4G00100.1); Has
1099 Blast hits to 1099 proteins in 415 species: Archae -
259; Bacteria - 0; Metazoa - 342; Fungi - 146; Plants -
139; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 213 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G60770"
/db_xref="Araport:AT3G60770"
intron_pos 8:2 (1/4)
intron_pos 33:0 (2/4)
intron_pos 79:1 (3/4)
intron_pos 141:2 (4/4)
BEGIN
1 MGRMHSRGKG ISASALPYKR SSPSWLKTTP QDVDESICKF AKKGLTPSQI GVILRDSHGI
61 PQVKSVTGSK ILRILKAHGL APEIPEDLYH LIKKAVAIRK HLERNRKDKD SKFRLILVES
121 RIHRLARYYK KTKKLPPVWK YESTTASTLV A
//