LOCUS AEE79589.1 409 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana dicarboxylate diiron protein, putative
(Crd1) protein.
ACCESSION CP002686-8230
PROTEIN_ID AEE79589.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="CRD1"
/locus_tag="AT3G56940"
/gene_synonym="ACSF"
/gene_synonym="CHL27"
/gene_synonym="COPPER RESPONSE DEFECT 1"
/gene_synonym="T8M16.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR255865.1,INSD:EL314199.1,INSD:EH803002.1,
INSD:EH837049.1,INSD:BP855405.1,INSD:AV522128.1,
INSD:EL144446.1,INSD:T21847.1,INSD:EH863472.1,
INSD:AV563030.1,INSD:AV559918.1,INSD:BP635110.1,
INSD:AV518028.1,INSD:EL980772.1,INSD:EL251739.1,
INSD:AV533397.1,INSD:AV534849.1,INSD:AV527886.1,
INSD:BP597578.1,INSD:EH989106.1,INSD:BP562207.2,
INSD:DR305909.1,INSD:ES093806.1,INSD:EL258771.1,
INSD:AV530391.1,INSD:AI100375.1,INSD:EL102260.1,
INSD:BP846500.1,INSD:ES004971.1,INSD:BP663272.1,
INSD:DR255896.1,INSD:AV525838.1,INSD:EL022888.1,
INSD:EL324305.1,INSD:EH916667.1,INSD:DR255887.1,
INSD:DR255867.1,INSD:AV519643.1,INSD:EL286912.1,
INSD:EL253064.1,INSD:T21755.1,INSD:CB264172.1,
INSD:ES131766.1,INSD:EL118476.1,INSD:AV519110.1,
INSD:BP643385.1,INSD:EL234301.1,INSD:EH963797.1,
INSD:EH827669.1,INSD:AV538923.1,INSD:EL303754.1,
INSD:AV535025.1,INSD:ES031138.1,INSD:BP833361.1,
INSD:T41669.1,INSD:EH956814.1,INSD:T45292.1,
INSD:BP821103.1,INSD:BP657818.1,INSD:EH807833.1,
INSD:EL185900.1,INSD:AV782534.1,INSD:AV819223.1,
INSD:AV518361.1,INSD:EL098297.1,INSD:BP805477.1,
INSD:DR255883.1,INSD:DR255879.1,INSD:AV524664.1,
INSD:AV524753.1,INSD:BP606261.1,INSD:DR374919.1,
INSD:DR255868.1,INSD:EL112053.1,INSD:EH881707.1,
INSD:EH831502.1,INSD:EH982901.1,INSD:DR255875.1,
INSD:AV795494.1,INSD:AV561192.1,INSD:EH981572.1,
INSD:DR255903.1,INSD:T42653.1,INSD:EL206223.1,
INSD:EH970097.1,INSD:AV559863.1,INSD:H76752.1,
INSD:AV524992.1,INSD:EL029572.1,INSD:EH826202.1,
INSD:EH856901.1,INSD:EL288379.1,INSD:EL165042.1,
INSD:EL255610.1,INSD:EH869610.1,INSD:EH826392.1,
INSD:EH917985.1,INSD:DR255878.1,INSD:EL190321.1,
INSD:DR255866.1,INSD:EL303544.1,INSD:AV530311.1,
INSD:AV561975.1,INSD:AV518666.1,INSD:BP617679.1,
INSD:EH870630.1,INSD:BP647765.1,INSD:AV518409.1,
INSD:AV781831.1,INSD:AV521424.1,INSD:EL290807.1,
INSD:DR255890.1,INSD:EL247059.1,INSD:EL160532.1,
INSD:AV525698.1,INSD:AV524980.1,INSD:EH797327.1,
INSD:CB259708.1,INSD:EH911163.1,INSD:EL005849.1,
INSD:AV440113.1,INSD:Z26238.1,INSD:AV531547.1,
INSD:EL044335.1,INSD:EL207504.1,INSD:AV440889.1,
INSD:EL010435.1,INSD:EL177844.1,INSD:BP634513.1,
INSD:AV526540.1,INSD:EH923656.1,INSD:AV524783.1,
INSD:EH917103.1,INSD:EL107011.1,INSD:EH939813.1,
INSD:EL072752.1,INSD:BP619644.1,INSD:DR255891.1,
INSD:AV566570.1,INSD:BP823109.1,INSD:EH841187.1,
INSD:AV524671.1,INSD:BP642753.1,INSD:BP814951.1,
INSD:AI993080.1,INSD:AV525741.1,INSD:AV518902.1,
INSD:EH797542.1,INSD:BP636912.1,INSD:BP863434.1,
INSD:AV524791.1,INSD:EL149447.1,INSD:BP867921.1,
INSD:EL033573.1,INSD:EH912572.1,INSD:BP830809.1,
INSD:ES042491.1,INSD:BP577603.1,INSD:DR255892.1,
INSD:AV522449.1,INSD:AV527275.1,INSD:BP848988.1,
INSD:ES080813.1,INSD:BP652971.1,INSD:CB257656.1,
INSD:EL201771.1,INSD:EL329151.1,INSD:DR255872.1,
INSD:BP654952.1,INSD:DR372309.1,INSD:BP815574.1,
INSD:DR255904.1,INSD:ES102877.1,INSD:EL170128.1,
INSD:EH878221.1,INSD:EL138801.1,INSD:EL055067.1,
INSD:EL165280.1,INSD:AV530648.1,INSD:AV525200.1,
INSD:EL079492.1,INSD:AA404750.1,INSD:ES013070.1,
INSD:EL012514.1,INSD:DR263160.1,INSD:AV518500.1,
INSD:EL114110.1,INSD:EL121213.1,INSD:BP586904.1,
INSD:BP843654.1,INSD:EH941375.1,INSD:DR255905.1,
INSD:ES184910.1,INSD:AV522560.1,INSD:ES114519.1,
INSD:EH983292.1,INSD:EL076475.1,INSD:EL054114.1,
INSD:EL117816.1,INSD:EH927878.1,INSD:AV526955.1,
INSD:AV442329.1,INSD:ES119791.1,INSD:EH986665.1,
INSD:DR255870.1,INSD:ES196708.1,INSD:EL293433.1,
INSD:ES209401.1,INSD:EH830931.1,INSD:EH881319.1,
INSD:EL081707.1,INSD:EL182101.1,INSD:EL016555.1,
INSD:BP622675.1,INSD:EH801038.1,INSD:AV439714.1,
INSD:EL196613.1,INSD:EL109218.1,INSD:EH824903.1,
INSD:AV518953.1,INSD:DR255874.1,INSD:ES081793.1,
INSD:DR255880.1,INSD:AV533703.1,INSD:EH811845.1,
INSD:AV518530.1,INSD:EL196295.1,INSD:ES142618.1,
INSD:AV518561.1,INSD:AV531598.1,INSD:DR255888.1,
INSD:BP855273.1,INSD:ES057118.1,INSD:EL262057.1,
INSD:EL976250.1,INSD:EL067232.1,INSD:DR255884.1,
INSD:DR255886.1,INSD:AV556827.1,INSD:EL196503.1,
INSD:BP638872.1,INSD:BP833667.1,INSD:CK117887.1,
INSD:EL124147.1,INSD:AV565625.1,INSD:EH853364.1,
INSD:EL143091.1,INSD:AV784990.1,INSD:BP632529.1,
INSD:BP651490.1,INSD:EH832464.1,INSD:EH807151.1,
INSD:EL119791.1,INSD:BP624456.1,INSD:EL304711.1,
INSD:DR255873.1,INSD:DR255882.1,INSD:EH870266.1,
INSD:EH939346.1,INSD:EL319235.1,INSD:AV526064.1,
INSD:BP839262.1,INSD:EL153080.1,INSD:EL324814.1,
INSD:EH933379.1,INSD:EH833507.1,INSD:AV519167.1,
INSD:EH906924.1,INSD:BP631185.1,INSD:EL060147.1,
INSD:DR263164.1,INSD:AV530403.1,INSD:BP829294.1,
INSD:EH828743.1,INSD:BP816163.1,INSD:AV823908.1,
INSD:AV527688.1,INSD:AV520175.1,INSD:ES076404.1,
INSD:AV518152.1,INSD:DR255898.1,INSD:EH850093.1,
INSD:DR255894.1,INSD:BP631924.1,INSD:BP640716.1,
INSD:AV530355.1,INSD:AV522226.1,INSD:AV518191.1,
INSD:AV520588.1,INSD:AV519550.1,INSD:DR263161.1,
INSD:EH970110.1,INSD:EH980484.1,INSD:AV562730.1,
INSD:EL191594.1,INSD:T13819.1,INSD:DR255893.1,
INSD:DR255897.1,INSD:EH820902.1,INSD:AV558899.1,
INSD:EH862149.1,INSD:EH950854.1,INSD:EL275875.1,
INSD:EH903571.1,INSD:EL287109.1,INSD:DR255871.1,
INSD:EL283811.1,INSD:DR255895.1,INSD:EL173976.1,
INSD:DR255901.1,INSD:DR255889.1,INSD:BP821861.1,
INSD:Z25659.1,INSD:AV518539.1,INSD:EH850073.1,
INSD:AV525537.1,INSD:AV558197.1,INSD:EH859219.1,
INSD:ES093112.1,INSD:AV526300.1,INSD:BP587474.1,
INSD:EL032634.1,INSD:EL122914.1,INSD:DR255902.1,
INSD:AV519741.1,INSD:AV561826.1,INSD:EH824981.1,
INSD:EL193677.1,INSD:ES010127.1,INSD:AA597758.1,
INSD:AV533328.1,INSD:EG501590.1,INSD:ES038823.1,
INSD:EH812224.1,INSD:AV534948.1,INSD:ES101745.1,
INSD:BP589770.1,INSD:AV558842.1,INSD:ES172688.1,
INSD:EH908843.1,INSD:BP832064.1,INSD:ES080340.1,
INSD:EL237401.1,INSD:EL194772.1,INSD:EL176885.1,
INSD:AV519390.1,INSD:AV564456.1,INSD:BP631498.1,
INSD:AV558931.1,INSD:EL250609.1,INSD:BP854756.1,
INSD:EL236863.1,INSD:AV533818.1,INSD:EL079709.1,
INSD:EH812170.1,INSD:EL054965.1,INSD:AV524852.1,
INSD:ES204270.1,INSD:DR255877.1,INSD:AV541085.1,
INSD:ES190809.1,INSD:AV518931.1,INSD:DR255881.1,
INSD:AV527439.1,INSD:AA713011.1,INSD:EH923024.1,
INSD:AV440422.1,INSD:EH869455.1,INSD:EL225757.1,
INSD:BP817585.1,INSD:EH922469.1,INSD:BP655878.1,
INSD:BP596584.1,INSD:BP820437.1,INSD:EL146918.1,
INSD:DR263162.1,INSD:EL003847.1,INSD:DR255900.1,
INSD:EL272755.1,INSD:BP653072.1,INSD:EH820666.1,
INSD:T41924.1,INSD:CB261570.1,INSD:EL124560.1,
INSD:AV519430.1,INSD:AV519451.1,INSD:EL158764.1,
INSD:CB258743.1,INSD:AV565137.1,INSD:AV525136.1,
INSD:EG516926.1,INSD:EL139028.1,INSD:DR255876.1,
INSD:AV565295.1,INSD:EL971810.1,INSD:BE525697.1,
INSD:EG482339.1,INSD:AV564159.1,INSD:EL290319.1,
INSD:EL005852.1,INSD:CB257918.1,INSD:EH962741.1,
INSD:BP659957.1,INSD:BP659363.1,INSD:AV519448.1,
INSD:EL173566.1,INSD:BP812327.1,INSD:DR384070.1,
INSD:AV518659.1,INSD:DR255885.1,INSD:EH893682.1,
INSD:EL011807.1,INSD:EL255634.1,INSD:EL132590.1,
INSD:EL004560.1,INSD:DR255899.1,INSD:AV530887.1,
INSD:EL181084.1,INSD:DR263163.1,INSD:DR255869.1,
INSD:AV524940.1,INSD:N96540.1,INSD:BP826861.1,
INSD:BP859943.1,INSD:EL035487.1,INSD:EL978887.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:U38232.1,INSD:AF236101.1,INSD:U75599.1"
/note="COPPER RESPONSE DEFECT 1 (CRD1); FUNCTIONS IN:
magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative)
cyclase activity, DNA binding; INVOLVED IN: chlorophyll
biosynthetic process, oxidation reduction, photosynthesis;
LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast,
chloroplast inner membrane, chloroplast envelope;
EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic
oxidative cyclase (InterPro:IPR008434),
Ferritin/ribonucleotide reductase-like
(InterPro:IPR009078), Rubrerythrin (InterPro:IPR003251);
Has 877 Blast hits to 876 proteins in 230 species: Archae
- 0; Bacteria - 301; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 215;
Viruses - 0; Other Eukaryotes - 361 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G56940"
/db_xref="Araport:AT3G56940"
intron_pos 159:0 (1/4)
intron_pos 180:2 (2/4)
intron_pos 290:0 (3/4)
intron_pos 323:0 (4/4)
BEGIN
1 MAAEMALVKP ISKFSSPKLS NPSKFLSGRR FSTVIRMSAS SSPPPPTTAT SKSKKGTKKE
61 IQESLLTPRF YTTDFEEMEQ LFNTEINKNL NEAEFEALLQ EFKTDYNQTH FVRNKEFKEA
121 ADKLQGPLRQ IFVEFLERSC TAEFSGFLLY KELGRRLKKT NPVVAEIFSL MSRDEARHAG
181 FLNKGLSDFN LALDLGFLTK ARKYTFFKPK FIFYATYLSE KIGYWRYITI YRHLKENPEF
241 QCYPIFKYFE NWCQDENRHG DFFSALMKAQ PQFLNDWQAK LWSRFFCLSV YVTMYLNDCQ
301 RTNFYEGIGL NTKEFDMHVI IETNRTTARI FPAVLDVENP EFKRKLDRMV VSYEKLLAIG
361 ETDDASFIKT LKRIPLVTSL ASEILAAYLM PPVESGSVDF AEFEPNLVY
//