LOCUS AEE79135.1 112 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Ribosomal protein L36e family protein protein.
ACCESSION CP002686-7595
PROTEIN_ID AEE79135.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT3G53740"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:ES084506.1,INSD:EL173459.1,INSD:ES109563.1,
INSD:DR333104.1,INSD:EL080260.1,INSD:DR333064.1,
INSD:DR333053.1,INSD:BP569583.1,INSD:BP589402.1,
INSD:ES190232.1,INSD:ES070268.1,INSD:DR333140.1,
INSD:ES145411.1,INSD:AV534535.1,INSD:BP671201.1,
INSD:DR333144.1,INSD:DR333127.1,INSD:ES125702.1,
INSD:BP651709.1,INSD:ES029963.1,INSD:EH827733.1,
INSD:EL149916.1,INSD:EL318917.1,INSD:BP571932.1,
INSD:EH933627.1,INSD:DR333137.1,INSD:ES024949.1,
INSD:EL149461.1,INSD:AV532808.1,INSD:EH953212.1,
INSD:EL021022.1,INSD:ES171605.1,INSD:DR333072.1,
INSD:AV782958.1,INSD:DR333116.1,INSD:DR333135.1,
INSD:DR333060.1,INSD:DR333100.1,INSD:EG525095.1,
INSD:CB261344.1,INSD:ES140636.1,INSD:ES127348.1,
INSD:EL982277.1,INSD:BP847621.1,INSD:DR333090.1,
INSD:BP637446.1,INSD:DR333058.1,INSD:EL175381.1,
INSD:BP597727.1,INSD:AA712324.1,INSD:BP653092.1,
INSD:DR333133.1,INSD:ES189483.1,INSD:BP641271.1,
INSD:ES148281.1,INSD:ES209658.1,INSD:EL967809.1,
INSD:EL264270.1,INSD:BP626606.1,INSD:DR333075.1,
INSD:T13794.1,INSD:EH951232.1,INSD:ES028111.1,
INSD:DR333079.1,INSD:ES176671.1,INSD:ES035147.1,
INSD:EL276460.1,INSD:EL103661.1,INSD:EL987747.1,
INSD:ES173921.1,INSD:EH868069.1,INSD:DR333066.1,
INSD:ES135682.1,INSD:ES196774.1,INSD:DR333115.1,
INSD:ES078972.1,INSD:BP627997.1,INSD:ES044295.1,
INSD:EL985713.1,INSD:ES133451.1,INSD:AA713180.1,
INSD:EH918213.1,INSD:EL271305.1,INSD:BP659354.1,
INSD:BP814589.1,INSD:DR333142.1,INSD:ES137865.1,
INSD:EL977995.1,INSD:BP650797.1,INSD:DR333092.1,
INSD:EL287340.1,INSD:DR377314.1,INSD:EH863453.1,
INSD:ES123854.1,INSD:BP844076.1,INSD:AV798417.1,
INSD:BP823513.1,INSD:EL968625.1,INSD:EL971296.1,
INSD:AV790010.1,INSD:DR333120.1,INSD:CB261345.1,
INSD:EL995996.1,INSD:EH803529.1,INSD:DR333130.1,
INSD:ES042251.1,INSD:ES055982.1,INSD:EH927377.1,
INSD:EH919811.1,INSD:ES072447.1,INSD:EL180755.1,
INSD:EL052605.1,INSD:AV823748.2,INSD:EL975113.1,
INSD:AV532172.1,INSD:EH991988.1,INSD:EH927772.1,
INSD:EG476781.1,INSD:DR333068.1,INSD:ES010291.1,
INSD:DR333098.1,INSD:BP857297.1,INSD:EH826556.1,
INSD:EL099422.1,INSD:BP586649.1,INSD:ES033034.1,
INSD:AA597641.1,INSD:DR333073.1,INSD:EL137561.1,
INSD:BP621963.1,INSD:BP786391.1,INSD:BP579487.1,
INSD:EL299360.1,INSD:EL976945.1,INSD:ES215136.1,
INSD:EH921074.1,INSD:EH935528.1,INSD:EL052953.1,
INSD:ES027032.1,INSD:BP834722.1,INSD:ES100412.1,
INSD:BP813862.1,INSD:BP567283.1,INSD:ES150050.1,
INSD:EL058849.1,INSD:DR333088.1,INSD:EL968511.1,
INSD:BP619067.1,INSD:EL196220.1,INSD:ES102887.1,
INSD:EL021506.1,INSD:EL117579.1,INSD:DR333057.1,
INSD:ES210329.1,INSD:EH919912.1,INSD:EL156006.1,
INSD:EH982417.1,INSD:DR333069.1,INSD:EL083641.1,
INSD:BP651448.1,INSD:ES164647.1,INSD:EH851812.1,
INSD:ES005540.1,INSD:ES058608.1,INSD:EL994727.1,
INSD:EL052508.1,INSD:BP581526.1,INSD:AV784783.1,
INSD:EL045011.1,INSD:EL256784.1,INSD:BP639597.1,
INSD:ES052486.1,INSD:BP863782.1,INSD:EH892314.1,
INSD:DR333074.1,INSD:DR333141.1,INSD:ES007322.1,
INSD:ES051516.1,INSD:ES142993.1,INSD:ES047637.1,
INSD:ES158420.1,INSD:EL289675.1,INSD:DR333094.1,
INSD:EG456938.1,INSD:AV532000.1,INSD:DR333080.1,
INSD:EL047946.1,INSD:EG480496.1,INSD:W43056.1,
INSD:EL975759.1,INSD:EL314188.1,INSD:BP632437.1,
INSD:EH888397.1,INSD:ES088510.1,INSD:EL338316.1,
INSD:ES023518.1,INSD:EL337409.1,INSD:EL184274.1,
INSD:DR333076.1,INSD:DR333143.1,INSD:ES165393.1,
INSD:ES102906.1,INSD:EL199875.1,INSD:ES122440.1,
INSD:BP563533.1,INSD:EL983152.1,INSD:ES094977.1,
INSD:ES052215.1,INSD:EL052249.1,INSD:EL097603.1,
INSD:BP802798.1,INSD:ES126441.1,INSD:DR333114.1,
INSD:CB254127.1,INSD:DR333139.1,INSD:DR333099.1,
INSD:EH813265.1,INSD:BP837663.1,INSD:EH910484.1,
INSD:ES086163.1,INSD:EL299936.1,INSD:DR333093.1,
INSD:BP626605.1,INSD:DR333102.1,INSD:DR333065.1,
INSD:ES211932.1,INSD:ES074480.1,INSD:EH966786.1,
INSD:BP826480.1,INSD:ES103875.1,INSD:EL981951.1,
INSD:EL160194.1,INSD:EL253635.1,INSD:BP833006.1,
INSD:EL970496.1,INSD:AV533313.1,INSD:AV530385.1,
INSD:DR333136.1,INSD:EL986170.1,INSD:CB255367.1,
INSD:EL060070.1,INSD:BP647174.1,INSD:DR333126.1,
INSD:T45037.1,INSD:BP813858.1,INSD:AV531736.1,
INSD:ES115259.1,INSD:EL320302.1,INSD:AA721932.1,
INSD:EL103417.1,INSD:EH835276.1,INSD:EL003253.1,
INSD:ES205655.1,INSD:AV543810.1,INSD:EL153480.1,
INSD:DR333106.1,INSD:EL263679.1,INSD:EL095736.1,
INSD:EL109322.1,INSD:EL165450.1,INSD:EL968184.1,
INSD:EL150266.1,INSD:EH804616.1,INSD:ES182121.1,
INSD:AV533686.1,INSD:BP624500.1,INSD:EL083777.1,
INSD:EL030818.1,INSD:EH870032.1,INSD:DR373982.1,
INSD:AV794863.1,INSD:EL338188.1,INSD:EH811547.1,
INSD:EH936239.1,INSD:AA712792.1,INSD:EH987034.1,
INSD:ES077571.1,INSD:BE038990.1,INSD:ES050768.1,
INSD:EH987246.1,INSD:DR333062.1,INSD:DR333055.1,
INSD:ES038776.1,INSD:BP611877.1,INSD:ES146705.1,
INSD:EL038367.1,INSD:DR333101.1,INSD:DR333091.1,
INSD:EH926876.1,INSD:ES215829.1,INSD:ES115231.1,
INSD:AV533586.1,INSD:DR333113.1,INSD:EL162829.1,
INSD:ES215637.1,INSD:EH968967.1,INSD:ES007585.1,
INSD:EG486282.1,INSD:ES043634.1,INSD:BP632316.1,
INSD:DR333081.1,INSD:EH815301.1,INSD:ES207842.1,
INSD:EL973761.1,INSD:EG525093.1,INSD:EL093664.1,
INSD:BP622772.1,INSD:ES153761.1,INSD:AM111142.1,
INSD:BP659473.1,INSD:ES161157.1,INSD:DR333138.1,
INSD:EH893536.1,INSD:BP610179.1,INSD:EL235694.1,
INSD:BP822660.1,INSD:EL336506.1,INSD:ES036480.1,
INSD:ES089849.1,INSD:EG493816.1,INSD:DR333085.1,
INSD:ES200380.1,INSD:EL274599.1,INSD:ES021460.1,
INSD:ES063907.1,INSD:EL016353.1,INSD:DR333108.1,
INSD:EH967372.1,INSD:EL340653.1,INSD:ES059535.1,
INSD:BP845004.1,INSD:EL119210.1,INSD:BP583594.1,
INSD:BP627603.1,INSD:DR333112.1,INSD:T46121.1,
INSD:EL247530.1,INSD:DR333132.1,INSD:DR333125.1,
INSD:ES013723.1,INSD:DR333078.1,INSD:BP814107.1,
INSD:EL317478.1,INSD:BP567957.1,INSD:EL102727.1,
INSD:DR333054.1,INSD:EL054952.1,INSD:EH905680.1,
INSD:BP653164.1,INSD:EL049239.1,INSD:BP861810.1,
INSD:DR333129.1,INSD:EL133033.1,INSD:EH905512.1,
INSD:EL998992.1,INSD:EL245117.1,INSD:AV535530.1,
INSD:ES092029.1,INSD:EL012447.1,INSD:EL989845.1,
INSD:EL098859.1,INSD:BP861568.1,INSD:EL007536.1,
INSD:ES212762.1,INSD:BP861210.1,INSD:EL270055.1,
INSD:DR333117.1,INSD:ES195457.1,INSD:AA713332.1,
INSD:ES139019.1,INSD:EL258249.1,INSD:EH932886.1,
INSD:EG496229.1,INSD:EL123396.1,INSD:DR333111.1,
INSD:ES191102.1,INSD:BP604881.1,INSD:BP816491.1,
INSD:BP813173.1,INSD:BP630736.1,INSD:BP800996.1,
INSD:DR333131.1,INSD:BP574437.1,INSD:ES038504.1,
INSD:ES034360.1,INSD:EH866132.1,INSD:EH937320.1,
INSD:DR333121.1,INSD:EH964512.1,INSD:EL214333.1,
INSD:BP650210.1,INSD:EL014848.1,INSD:DR333128.1,
INSD:EL244695.1,INSD:DR333059.1,INSD:EL054848.1,
INSD:EH968911.1,INSD:ES084407.1,INSD:DR333089.1,
INSD:ES127041.1,INSD:AV532489.1,INSD:ES210724.1,
INSD:EL090055.1,INSD:DR333082.1,INSD:ES121686.1,
INSD:BP812672.1,INSD:EL267920.1,INSD:DR333071.1,
INSD:EH829966.1,INSD:BP640861.1,INSD:EL058243.1,
INSD:DR333086.1,INSD:ES104392.1,INSD:ES026183.1,
INSD:ES093394.1,INSD:EH901049.1,INSD:ES056442.1,
INSD:EL010739.1,INSD:DR333096.1,INSD:DR333083.1,
INSD:ES174451.1,INSD:EL187117.1,INSD:EL147714.1,
INSD:EH802977.1,INSD:ES018708.1,INSD:DR333067.1,
INSD:ES149207.1,INSD:EL975096.1,INSD:EL033350.1,
INSD:ES114762.1,INSD:BP858207.1,INSD:ES193260.1,
INSD:ES073498.1,INSD:EL235197.1,INSD:EL092291.1,
INSD:ES190001.1,INSD:EL987433.1,INSD:EL083030.1,
INSD:ES173135.1,INSD:EL045442.1,INSD:EL132415.1,
INSD:EL979167.1,INSD:ES101372.1,INSD:EH949083.1,
INSD:EL055495.1,INSD:DR333084.1,INSD:AV533199.1,
INSD:AV530916.1,INSD:BP868569.1,INSD:EL268427.1,
INSD:DR333087.1,INSD:ES005011.1,INSD:EH826812.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY062791.1,INSD:AY081579.1,INSD:BX822668.1"
/note="Ribosomal protein L36e family protein; FUNCTIONS
IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN:
translation; LOCATED IN: cytosolic ribosome, ribosome,
cytosolic large ribosomal subunit, plasma membrane,
membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED
DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Ribosomal protein L36e (InterPro:IPR000509); BEST
Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein
L36e family protein (TAIR:AT2G37600.2); Has 756 Blast hits
to 755 proteins in 262 species: Archae - 0; Bacteria - 0;
Metazoa - 356; Fungi - 139; Plants - 140; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 121 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G53740"
/db_xref="Araport:AT3G53740"
intron_pos 35:0 (1/2)
intron_pos 101:2 (2/2)
BEGIN
1 MTTPQVKTGL FVGLNKGHVV TRRELAPRPR SRKGKTSKRT IFIRNLIKEV AGQAPYEKRI
61 TELLKVGKDK RALKVAKRKL GTHKRAKRKR EEMSSVLRKM RSGGGGATEK KK
//