LOCUS AEE78831.1 213 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana saposin B domain-containing protein protein.
ACCESSION CP002686-7210
PROTEIN_ID AEE78831.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT3G51730"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:BP606566.1,INSD:EH884590.1,INSD:EL176018.1,
INSD:EL307917.1,INSD:EH980193.1,INSD:T41615.1,
INSD:CD533044.1,INSD:DR261865.1,INSD:EG508705.1,
INSD:BP634269.1,INSD:CB260856.1,INSD:EL092183.1,
INSD:EH829889.1,INSD:EH871878.1,INSD:CK121359.1,
INSD:ES213842.1,INSD:EL005819.1,INSD:AV818942.1,
INSD:BP800848.1,INSD:EL027988.1,INSD:EH970699.1,
INSD:EH858881.1,INSD:EL971004.1,INSD:EL264802.1,
INSD:DR261866.1,INSD:EL025245.1,INSD:EH866699.1,
INSD:EL296006.1,INSD:EL168140.1,INSD:DR261910.1,
INSD:EL260742.1,INSD:DR261909.1,INSD:EL061600.1,
INSD:EL264872.1,INSD:DR261891.1,INSD:EH805245.1,
INSD:EL297082.1,INSD:ES104730.1,INSD:BP639073.1,
INSD:AV794508.1,INSD:EH817512.1,INSD:ES123622.1,
INSD:EL017461.1,INSD:EH909642.1,INSD:EL005460.1,
INSD:EH839804.1,INSD:ES189898.1,INSD:EH936677.1,
INSD:EL973529.1,INSD:EH973512.1,INSD:BP847491.1,
INSD:EL101100.1,INSD:BP862948.1,INSD:BP617922.1,
INSD:BP856518.1,INSD:EL183908.1,INSD:BP574264.1,
INSD:EG486676.1,INSD:EH830894.1,INSD:DR261926.1,
INSD:EH805269.1,INSD:DR378537.1,INSD:BP568337.1,
INSD:EL014349.1,INSD:ES113677.1,INSD:EL163117.1,
INSD:DR261890.1,INSD:EL175540.1,INSD:ES014845.1,
INSD:EL137717.1,INSD:EL200130.1,INSD:EL020879.1,
INSD:AV785419.1,INSD:EL251185.1,INSD:BP611705.1,
INSD:EL097983.1,INSD:DR261914.1,INSD:BP599091.1,
INSD:EH895737.1,INSD:EL283545.1,INSD:BP581546.1,
INSD:ES106276.1,INSD:AV810933.1,INSD:T20645.1,
INSD:DR261875.1,INSD:AV799719.1,INSD:EL290387.1,
INSD:EL068415.1,INSD:EL254586.1,INSD:DR261873.1,
INSD:EL249272.1,INSD:ES182160.1,INSD:EL174043.1,
INSD:ES116794.1,INSD:BP801196.1,INSD:DR261911.1,
INSD:BP797814.1,INSD:EL282443.1,INSD:EL020061.1,
INSD:BP850900.1,INSD:EL052386.1,INSD:EH847015.1,
INSD:EH959741.1,INSD:EL323507.1,INSD:EL220629.1,
INSD:BP856893.1,INSD:DR261912.1,INSD:EH816195.1,
INSD:EH962575.1,INSD:EL328728.1,INSD:F13835.1,
INSD:BP628706.1,INSD:EL978431.1,INSD:EL084421.1,
INSD:EL286746.1,INSD:ES056889.1,INSD:BP801974.1,
INSD:EL242399.1,INSD:BP608626.1,INSD:EL189465.1,
INSD:DR261879.1,INSD:EG485658.1,INSD:EH961338.1,
INSD:AV824221.1,INSD:DR261924.1,INSD:EL155995.1,
INSD:EL018927.1,INSD:EL166778.1,INSD:ES076663.1,
INSD:ES092001.1,INSD:EL045553.1,INSD:EH854693.1,
INSD:CD528932.1,INSD:BP804575.1,INSD:EL259831.1,
INSD:AA597326.1,INSD:CK118319.1,INSD:CF773693.1,
INSD:DR261908.1,INSD:EH985191.1,INSD:DR261889.1,
INSD:EL308861.1,INSD:EH944340.1,INSD:EH863722.1,
INSD:DR261884.1,INSD:EH911643.1,INSD:DR261880.1,
INSD:EL119101.1,INSD:BP816170.1,INSD:EH927866.1,
INSD:EL230673.1,INSD:BP575786.1,INSD:DR261901.1,
INSD:BE525981.1,INSD:DR261894.1,INSD:EH848650.1,
INSD:ES130068.1,INSD:BP612063.1,INSD:DR261867.1,
INSD:EH889212.1,INSD:EH877552.1,INSD:EL192603.1,
INSD:EH971926.1,INSD:AV795752.1,INSD:ES150940.1,
INSD:BP803837.1,INSD:EL299785.1,INSD:BP586544.1,
INSD:EL032865.1,INSD:EL332446.1,INSD:EH964127.1,
INSD:EH843026.1,INSD:EH969246.1,INSD:DR261900.1,
INSD:EL089887.1,INSD:BP567536.1,INSD:BP619247.1,
INSD:BU634943.1,INSD:EG485653.1,INSD:EH924094.1,
INSD:EL131715.1,INSD:ES058761.1,INSD:EL106717.1,
INSD:EL229594.1,INSD:ES084285.1,INSD:EL071924.1,
INSD:DR261906.1,INSD:EH892610.1,INSD:EH986539.1,
INSD:AA712972.1,INSD:DR261870.1,INSD:EL996427.1,
INSD:CD529093.1,INSD:EH884482.1,INSD:DR261916.1,
INSD:EH852223.1,INSD:EL313679.1,INSD:EL967766.1,
INSD:ES178247.1,INSD:EL140251.1,INSD:EH942676.1,
INSD:EH804948.1,INSD:T43497.1,INSD:EH803430.1,
INSD:EL052164.1,INSD:DR261913.1,INSD:BP618643.1,
INSD:CD533594.1,INSD:EL134866.1,INSD:ES065150.1,
INSD:BP603004.1,INSD:ES021701.1,INSD:EL341721.1,
INSD:CD528995.1,INSD:T22017.1,INSD:EL011894.1,
INSD:EH907235.1,INSD:EH865798.1,INSD:EL306367.1,
INSD:EL174900.1,INSD:AA597329.1,INSD:ES213217.1,
INSD:EL994767.1,INSD:DR261877.1,INSD:EL056668.1,
INSD:ES043287.1,INSD:EL028822.1,INSD:EH958979.1,
INSD:EL134084.1,INSD:EL307010.1,INSD:EH864197.1,
INSD:EH989565.1,INSD:EH918011.1,INSD:EH965549.1,
INSD:DR261925.1,INSD:EL162240.1,INSD:EL184004.1,
INSD:DR261903.1,INSD:EH812367.1,INSD:EH811059.1,
INSD:EL277833.1,INSD:ES158920.1,INSD:AV820285.1,
INSD:DR261922.1,INSD:EL204241.1,INSD:BP627827.1,
INSD:EH921087.1,INSD:ES181169.1,INSD:EL208710.1,
INSD:EH953774.1,INSD:EL250767.1,INSD:EL310968.1,
INSD:DR261917.1,INSD:DR261919.1,INSD:BP634882.1,
INSD:EL145344.1,INSD:EL026104.1,INSD:AA650687.1,
INSD:DR261878.1,INSD:DR261864.1,INSD:BP609697.1,
INSD:DR261887.1,INSD:CB259341.1,INSD:EH924977.1,
INSD:DR261898.1,INSD:EH821451.1,INSD:DR261869.1,
INSD:EH801534.1,INSD:BP856046.1,INSD:DR261915.1,
INSD:DR261920.1,INSD:DR378325.1,INSD:EH844399.1,
INSD:EH870371.1,INSD:EL336785.1,INSD:EL318991.1,
INSD:EH848439.1,INSD:EH992245.1,INSD:EL204741.1,
INSD:BP600668.1,INSD:ES013400.1,INSD:DR261888.1,
INSD:EL108888.1,INSD:EH943832.1,INSD:EH883992.1,
INSD:EL022323.1,INSD:EL103644.1,INSD:AI994438.1,
INSD:DR261883.1,INSD:BP801565.1,INSD:EH949927.1,
INSD:EL247944.1,INSD:EH975558.1,INSD:BP666366.1,
INSD:DR261876.1,INSD:DR261897.1,INSD:ES125341.1,
INSD:EH805728.1,INSD:EH898238.1,INSD:EH822165.1,
INSD:EL081802.1,INSD:DR261882.1,INSD:T42438.1,
INSD:EL180464.1,INSD:EH956755.1,INSD:EH870921.1,
INSD:BP860832.2,INSD:DR261918.1,INSD:ES108267.1,
INSD:AI099719.1,INSD:R30395.1,INSD:EL156750.1,
INSD:DR261881.1,INSD:EL254226.1,INSD:ES116124.1,
INSD:DR261902.1,INSD:EL983769.1,INSD:EH989296.1,
INSD:EL099220.1,INSD:EL225651.1,INSD:BP852114.1,
INSD:EH966621.1,INSD:DR261905.1,INSD:EH826247.1,
INSD:EH851701.1,INSD:EL285518.1,INSD:CD529295.1,
INSD:ES025748.1,INSD:ES003961.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX823894.1,INSD:AY143821.1,INSD:AY125518.1,
INSD:AY088736.1"
/note="saposin B domain-containing protein; FUNCTIONS IN:
molecular_function unknown; INVOLVED IN: lipid metabolic
process; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 23 plant
structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS
InterPro DOMAIN/s: Saposin B (InterPro:IPR008139),
Saposin-like (InterPro:IPR011001), Saposin-like type B, 1
(InterPro:IPR007856), Saposin-like type B, 2
(InterPro:IPR008138); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: saposin B domain-containing protein
(TAIR:AT5G01800.1); Has 951 Blast hits to 460 proteins in
88 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 738; Fungi
- 0; Plants - 102; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 111
(source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G51730"
/db_xref="Araport:AT3G51730"
intron_pos 31:1 (1/4)
intron_pos 81:0 (2/4)
intron_pos 147:0 (3/4)
intron_pos 167:0 (4/4)
BEGIN
1 MGLKAGTFVL LLLGLILVSD ARSFVDSTIS EKVSNKEDVC TLCEEYVTDA LSYLEKNVTQ
61 AEIIEDLHDR CSQLRGYSQQ CISLVDYYVP LFFLQLESFQ PHYFCKRMNL CGKVVALVEE
121 ARQDSCGVCH RTVSEILIKL QDPDTQLDIV ELLIKGCKSL KNYEKKCKTL VFEYGPLILV
181 NAEEFLVKND VCTLLRACPP EKSVLRQPEL ADS
//