LOCUS AEE78372.1 88 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana B12D protein protein.
ACCESSION CP002686-6596
PROTEIN_ID AEE78372.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT3G48140"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR255951.1,INSD:EG518856.1,INSD:DR263941.1,
INSD:BP581517.1,INSD:EL162620.1,INSD:CF652956.1,
INSD:DR255954.1,INSD:DR255972.1,INSD:BP583937.1,
INSD:DR255994.1,INSD:DR260317.1,INSD:DR256005.1,
INSD:DR256011.1,INSD:AI999368.1,INSD:ES175491.1,
INSD:AV817564.1,INSD:DR256019.1,INSD:EL311195.1,
INSD:DR317807.1,INSD:DR255957.1,INSD:ES095370.1,
INSD:DR263923.1,INSD:AV533086.1,INSD:DR255998.1,
INSD:DR255950.1,INSD:F19976.1,INSD:BP842754.1,
INSD:DR317803.1,INSD:BP579923.1,INSD:EH988116.1,
INSD:DR260330.1,INSD:DR255963.1,INSD:DR263921.1,
INSD:DR264669.1,INSD:DR255981.1,INSD:DR263932.1,
INSD:BP861416.1,INSD:EL281654.1,INSD:BP852227.1,
INSD:DR255993.1,INSD:DR255946.1,INSD:EH878322.1,
INSD:ES196686.1,INSD:BP621327.1,INSD:EH807639.1,
INSD:BP830647.1,INSD:DR255973.1,INSD:DR317806.1,
INSD:EH923518.1,INSD:EL034522.1,INSD:BP648317.1,
INSD:EL981362.1,INSD:EL255117.1,INSD:DR255975.1,
INSD:DR263955.1,INSD:DR317814.1,INSD:EL145963.1,
INSD:DR263956.1,INSD:ES215584.1,INSD:EL316993.1,
INSD:BP800588.1,INSD:EH958053.1,INSD:EH961646.1,
INSD:EH860087.1,INSD:EL252888.1,INSD:AV815897.1,
INSD:DR255947.1,INSD:BP568627.1,INSD:DR256004.1,
INSD:ES180416.1,INSD:DR260320.1,INSD:CD531690.1,
INSD:EH943011.1,INSD:BP866931.1,INSD:EL204034.1,
INSD:CF652945.1,INSD:BP867750.1,INSD:ES063915.1,
INSD:BP798968.1,INSD:DR255986.1,INSD:ES158265.1,
INSD:BP569804.1,INSD:EH926955.1,INSD:DR256010.1,
INSD:BP814220.1,INSD:EL034469.1,INSD:DR255976.1,
INSD:BP852788.1,INSD:EH909027.1,INSD:EL214839.1,
INSD:BP648749.1,INSD:ES086876.1,INSD:DR263949.1,
INSD:DR256018.1,INSD:CD528978.1,INSD:DR263920.1,
INSD:BP861926.1,INSD:DR260326.1,INSD:DR263978.1,
INSD:EH925307.1,INSD:AA041056.1,INSD:DR256028.1,
INSD:DR255944.1,INSD:DR263975.1,INSD:DR255985.1,
INSD:DR263952.1,INSD:DR264668.1,INSD:DR317809.1,
INSD:BP803066.1,INSD:DR263968.1,INSD:EL322950.1,
INSD:CD529716.1,INSD:EL069519.1,INSD:DR255965.1,
INSD:DR255945.1,INSD:ES022745.1,INSD:DR263977.1,
INSD:DR255984.1,INSD:EH920384.1,INSD:BP847741.1,
INSD:BP594390.1,INSD:DR260319.1,INSD:Z34751.1,
INSD:BP819406.1,INSD:DR263960.1,INSD:BP621943.1,
INSD:DR263929.1,INSD:BP852258.1,INSD:DR263965.1,
INSD:DR263970.1,INSD:CD529268.1,INSD:DR260323.1,
INSD:DR255953.1,INSD:DR256026.1,INSD:BP798280.1,
INSD:DR256013.1,INSD:BP568137.1,INSD:DR263974.1,
INSD:DR260325.1,INSD:DR255942.1,INSD:BP573335.1,
INSD:DR256021.1,INSD:DR263937.1,INSD:EH822232.1,
INSD:DR260318.1,INSD:EL154618.1,INSD:DR263917.1,
INSD:DR255989.1,INSD:DR263922.1,INSD:EL195803.1,
INSD:BP573823.1,INSD:EL300617.1,INSD:EL252043.1,
INSD:EL336225.1,INSD:BP830176.1,INSD:DR256016.1,
INSD:BP579194.1,INSD:DR256014.1,INSD:AV531217.1,
INSD:EH985360.1,INSD:BP811417.1,INSD:BP571086.1,
INSD:ES206258.1,INSD:DR263943.1,INSD:BP659764.1,
INSD:EL171062.1,INSD:DR255977.1,INSD:DR256008.1,
INSD:DR260324.1,INSD:DR263944.1,INSD:DR264666.1,
INSD:EL155329.1,INSD:DR255967.1,INSD:DR317800.1,
INSD:DR260321.1,INSD:AV535997.1,INSD:BP576382.1,
INSD:EL069311.1,INSD:BP855460.1,INSD:BP633422.1,
INSD:DR263959.1,INSD:EL213844.1,INSD:BP652669.1,
INSD:DR263928.1,INSD:H76985.1,INSD:ES141248.1,
INSD:AV522607.1,INSD:DR255970.1,INSD:DR256020.1,
INSD:DR263946.1,INSD:CF651613.1,INSD:DR264670.1,
INSD:DR263940.1,INSD:DR317799.1,INSD:CD534548.1,
INSD:EH892520.1,INSD:AV535322.1,INSD:DR317801.1,
INSD:BP635906.1,INSD:BP669472.1,INSD:DR263942.1,
INSD:DR317813.1,INSD:ES177465.1,INSD:DR255974.1,
INSD:DR256022.1,INSD:BP846585.1,INSD:DR263947.1,
INSD:DR255961.1,INSD:DR263950.1,INSD:ES034761.1,
INSD:DR255980.1,INSD:CD532906.1,INSD:CB260267.1,
INSD:EH959722.1,INSD:CD530489.1,INSD:DR255971.1,
INSD:DR263967.1,INSD:AV533207.1,INSD:DR317812.1,
INSD:BP654296.1,INSD:EG455512.1,INSD:EL136450.1,
INSD:CD529385.1,INSD:DR263972.1,INSD:DR263927.1,
INSD:DR377145.1,INSD:BP846903.1,INSD:DR263969.1,
INSD:EL122101.1,INSD:EL231282.1,INSD:EL020467.1,
INSD:R30285.1,INSD:DR263935.1,INSD:DR256027.1,
INSD:AA597712.1,INSD:BP827567.1,INSD:DR255939.1,
INSD:EL093365.1,INSD:EL154368.1,INSD:AV819053.1,
INSD:DR263918.1,INSD:DR255968.1,INSD:EH850948.1,
INSD:DR255941.1,INSD:BP842344.1,INSD:BP847238.1,
INSD:ES202220.1,INSD:AI099801.1,INSD:DR374246.1,
INSD:BP797072.1,INSD:DR260322.1,INSD:BP565269.1,
INSD:DR255979.1,INSD:DR264673.1,INSD:EL295544.1,
INSD:DR255958.1,INSD:DR317808.1,INSD:ES087441.1,
INSD:DR256025.1,INSD:DR263951.1,INSD:CB264154.1,
INSD:CD532907.1,INSD:BP867999.1,INSD:EL083321.1,
INSD:EH851946.1,INSD:BP825117.1,INSD:DR260328.1,
INSD:DR263966.1,INSD:DR256024.1,INSD:DR263938.1,
INSD:DR264667.1,INSD:EL272013.1,INSD:BP655863.1,
INSD:CD533918.1,INSD:DR263958.1,INSD:ES040635.1,
INSD:DR317805.1,INSD:AV801487.1,INSD:DR255999.1,
INSD:DR263948.1,INSD:EL321811.1,INSD:EL250943.1,
INSD:AV786835.1,INSD:ES091385.1,INSD:DR263976.1,
INSD:EL062987.1,INSD:BP837743.1,INSD:EL015469.1,
INSD:DR255952.1,INSD:BP580905.1,INSD:EH985787.1,
INSD:DR256023.1,INSD:DR255964.1,INSD:EG455513.1,
INSD:BP667412.1,INSD:DR263963.1,INSD:DR255988.1,
INSD:Z34825.1,INSD:DR263954.1,INSD:AV823674.1,
INSD:DR264665.1,INSD:EL978594.1,INSD:EH871790.1,
INSD:BP822490.1,INSD:BP576044.1,INSD:ES006793.1,
INSD:DR263930.1,INSD:DR255995.1,INSD:EH865315.1,
INSD:DR256009.1,INSD:ES111966.1,INSD:DR256000.1,
INSD:CD529713.1,INSD:BP854363.1,INSD:EH973038.1,
INSD:BP864416.1,INSD:BP645360.1,INSD:EL073519.1,
INSD:EL000581.1,INSD:EL314459.1,INSD:DR255962.1,
INSD:DR256017.1,INSD:CD530282.1,INSD:EH843894.1,
INSD:EH844861.1,INSD:BP842748.1,INSD:DR255966.1,
INSD:DR213748.1,INSD:DR263964.1,INSD:EL063712.1,
INSD:EL102288.1,INSD:BP610848.1,INSD:DR263961.1,
INSD:ES012618.1,INSD:DR255960.1,INSD:DR255955.1,
INSD:DR263934.1,INSD:BP837198.1,INSD:ES086919.1,
INSD:DR263962.1,INSD:DR317810.1,INSD:CD532908.1,
INSD:DR263931.1,INSD:EL269326.1,INSD:CD532925.1,
INSD:EL269350.1,INSD:DR382520.1,INSD:BP859338.1,
INSD:BP582064.1,INSD:DR255948.1,INSD:EL328259.1,
INSD:BP842786.1,INSD:EH874088.1,INSD:EL099438.1,
INSD:BP863661.1,INSD:DR317802.1,INSD:BP841619.1,
INSD:ES095583.1,INSD:DR263973.1,INSD:EG518855.1,
INSD:BP856463.1,INSD:ES032523.1,INSD:DR260329.1,
INSD:AV784685.1,INSD:EL089286.1,INSD:DR263924.1,
INSD:EL036225.1,INSD:DR264674.1,INSD:BP583757.1,
INSD:EH800363.1,INSD:EH840967.1,INSD:DR256006.1,
INSD:DR263933.1,INSD:BP860404.1,INSD:BP627756.1,
INSD:BP856486.1,INSD:DR255943.1,INSD:DR255959.1,
INSD:DR256001.1,INSD:DR255992.1,INSD:EL265771.1,
INSD:EH845454.1,INSD:EL213052.1,INSD:EL097293.1,
INSD:DR256003.1,INSD:DR255983.1,INSD:DR255987.1,
INSD:EL181047.1,INSD:DR255969.1,INSD:EL020907.1,
INSD:EH906867.1,INSD:BP864143.1,INSD:BP854583.1,
INSD:DR263919.1,INSD:EL035540.1,INSD:DR263953.1,
INSD:EL252305.1,INSD:DR255996.1,INSD:CD533554.1,
INSD:T44377.1,INSD:CD534142.1,INSD:DR263971.1,
INSD:DR263945.1,INSD:CD529021.1,INSD:ES046271.1,
INSD:DR263926.1,INSD:DR317811.1,INSD:DR263936.1,
INSD:CD532924.1,INSD:BP867165.1,INSD:DR255940.1,
INSD:EH953620.1,INSD:EL098843.1,INSD:BP824623.1,
INSD:BP573181.1,INSD:EH923670.1,INSD:BP610098.1,
INSD:BP662500.1,INSD:BP602696.1,INSD:DR255997.1,
INSD:DR256015.1,INSD:DR317804.1,INSD:DR263957.1,
INSD:ES108523.1,INSD:DR263925.1,INSD:EL983882.1,
INSD:DR256002.1,INSD:DR255990.1,INSD:DR264672.1,
INSD:BP863444.1,INSD:DR255991.1,INSD:ES092885.1,
INSD:EL003693.1,INSD:DR256007.1,INSD:DR255978.1,
INSD:DR255956.1,INSD:BP802820.1,INSD:BP848849.1,
INSD:BP638889.1,INSD:DR377457.1,INSD:BP601769.1,
INSD:DR264671.1,INSD:BP856987.1,INSD:AV533738.1,
INSD:DR255982.1,INSD:DR263939.1,INSD:DR255949.1,
INSD:BP801187.1,INSD:BP798185.1,INSD:DR373736.1,
INSD:EL984278.1,INSD:DR256012.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX842237.1,INSD:BT001183.1,INSD:AY081326.1,
INSD:BX826078.1"
/note="B12D protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: B12D
(InterPro:IPR010530); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: B12D protein (TAIR:AT3G29970.1); Has 143 Blast
hits to 143 proteins in 25 species: Archae - 0; Bacteria -
0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 143; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G48140"
/db_xref="Araport:AT3G48140"
intron_pos 10:0 (1/2)
intron_pos 39:2 (2/2)
BEGIN
1 MASRWLRPEV YPLFAATGVA VGICAFSLIR NITGNPEVRC TKENRAAGIL DNHAEGEKYK
61 ENFLRKFVRN KKPEIMPGLN KFFTDPTY
//