LOCUS AEE77019.1 301 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana ribosomal protein L5 protein.
ACCESSION CP002686-4730
PROTEIN_ID AEE77019.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="ATL5"
/locus_tag="AT3G25520"
/gene_synonym="OLI5"
/gene_synonym="OLIGOCELLULA 5"
/gene_synonym="PGY3"
/gene_synonym="PIGGYBACK3"
/gene_synonym="ribosomal protein L5"
/gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN L5"
/gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN L5 A"
/gene_synonym="RPL5A"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH944709.1,INSD:ES146669.1,INSD:EH954502.1,
INSD:BE526893.1,INSD:EL161227.1,INSD:EL999469.1,
INSD:AV819063.1,INSD:DR333886.1,INSD:CF772989.1,
INSD:EL173185.1,INSD:EH906937.1,INSD:ES132445.1,
INSD:EL254711.1,INSD:EL972756.1,INSD:ES118289.1,
INSD:EL080737.1,INSD:EH887150.1,INSD:ES080290.1,
INSD:BP847618.1,INSD:AV832351.1,INSD:ES139530.1,
INSD:AV827992.1,INSD:EL031956.1,INSD:BP847500.1,
INSD:ES097177.1,INSD:ES211281.1,INSD:EL159565.1,
INSD:EL115418.1,INSD:EH928964.1,INSD:EL129527.1,
INSD:BP843034.1,INSD:EH815963.1,INSD:T46713.1,
INSD:EL127477.1,INSD:BP670223.1,INSD:AV789841.1,
INSD:BP847564.1,INSD:BP843167.1,INSD:EH825398.1,
INSD:EH869288.1,INSD:ES097387.1,INSD:ES163061.1,
INSD:BP831933.1,INSD:DR333894.1,INSD:BP567177.1,
INSD:EL139852.1,INSD:ES184133.1,INSD:ES068792.1,
INSD:ES104212.1,INSD:EL170004.1,INSD:ES110928.1,
INSD:EH959504.1,INSD:EH822142.1,INSD:EL259455.1,
INSD:EL269994.1,INSD:ES181933.1,INSD:ES170676.1,
INSD:AV562296.1,INSD:BP608263.1,INSD:ES035963.1,
INSD:ES165009.1,INSD:BP834699.1,INSD:ES022472.1,
INSD:BP631487.1,INSD:AV809540.1,INSD:AV820968.1,
INSD:BP848834.1,INSD:DR333870.1,INSD:EL089380.1,
INSD:ES110065.1,INSD:BP858409.1,INSD:ES204397.1,
INSD:BP866841.1,INSD:ES215102.1,INSD:ES122749.1,
INSD:EL277179.1,INSD:EL284653.1,INSD:AV832361.1,
INSD:EL032276.1,INSD:EH834445.1,INSD:ES068129.1,
INSD:EH819843.1,INSD:ES209648.1,INSD:EL319063.1,
INSD:ES192511.1,INSD:BP634105.1,INSD:BP852972.1,
INSD:DR333909.1,INSD:AV557399.1,INSD:EH970653.1,
INSD:EL018488.1,INSD:BP851724.1,INSD:BP653360.1,
INSD:ES033006.1,INSD:EL152486.1,INSD:EH881266.1,
INSD:ES040512.1,INSD:EL324836.1,INSD:DR333902.1,
INSD:EL334535.1,INSD:EL967291.1,INSD:DR333888.1,
INSD:ES175308.1,INSD:BP841994.1,INSD:ES088635.1,
INSD:BP579800.1,INSD:EL241031.1,INSD:EH910956.1,
INSD:ES144240.1,INSD:EH945501.1,INSD:ES073703.1,
INSD:EL141115.1,INSD:BP583924.1,INSD:EL198508.1,
INSD:EL046596.1,INSD:ES185352.1,INSD:EL969946.1,
INSD:BP564892.1,INSD:EG426807.1,INSD:ES073069.1,
INSD:BP566083.1,INSD:ES142435.1,INSD:AA597596.1,
INSD:ES128028.1,INSD:ES136671.1,INSD:BP644479.1,
INSD:EH860270.1,INSD:ES090293.1,INSD:BP853764.1,
INSD:ES012616.1,INSD:EL967997.1,INSD:EH964431.1,
INSD:EL274439.1,INSD:BP635525.1,INSD:BP862861.1,
INSD:BP863758.1,INSD:BP593505.1,INSD:ES211578.1,
INSD:DR333864.1,INSD:BP818044.1,INSD:BP669505.1,
INSD:EH986121.1,INSD:EL296649.1,INSD:EL263593.1,
INSD:EL207898.1,INSD:ES134900.1,INSD:ES053638.1,
INSD:BP843529.1,INSD:EL188121.1,INSD:BP572912.1,
INSD:AV832239.1,INSD:EL177064.1,INSD:EL301519.1,
INSD:ES119627.1,INSD:ES101139.1,INSD:EL988845.1,
INSD:EL005154.1,INSD:BP650716.1,INSD:ES187771.1,
INSD:CB257550.1,INSD:ES057819.1,INSD:EL985046.1,
INSD:EL153479.1,INSD:EL003829.1,INSD:ES044029.1,
INSD:AV820876.1,INSD:EH866542.1,INSD:AV803881.1,
INSD:EH850961.1,INSD:ES051346.1,INSD:ES055382.1,
INSD:AV798285.1,INSD:DR333865.1,INSD:EL228160.1,
INSD:BP849239.1,INSD:DR333899.1,INSD:EH923273.1,
INSD:EL054607.1,INSD:BP665279.1,INSD:ES034779.1,
INSD:ES044250.1,INSD:EL978324.1,INSD:EL224677.1,
INSD:CF773711.1,INSD:EL101187.1,INSD:ES053928.1,
INSD:ES198181.1,INSD:DR333907.1,INSD:EL203744.1,
INSD:EL312882.1,INSD:ES018965.1,INSD:ES068506.1,
INSD:ES194723.1,INSD:ES003340.1,INSD:EH801453.1,
INSD:BP825179.1,INSD:DR333898.1,INSD:EL092123.1,
INSD:EL180945.1,INSD:DR333912.1,INSD:EL262904.1,
INSD:EL192682.1,INSD:ES122123.1,INSD:BP803709.1,
INSD:EL987480.1,INSD:EL035880.1,INSD:BP668053.1,
INSD:ES089921.1,INSD:EH923507.1,INSD:DR333878.1,
INSD:AV803229.1,INSD:AV806316.1,INSD:DR333872.1,
INSD:EL332744.1,INSD:EL205553.1,INSD:ES054434.1,
INSD:BP631159.1,INSD:ES188117.1,INSD:EL989634.1,
INSD:EG426819.1,INSD:BP590831.1,INSD:EL077703.1,
INSD:ES084365.1,INSD:DR333890.1,INSD:BP570200.1,
INSD:ES202890.1,INSD:BP843190.2,INSD:ES118118.1,
INSD:CB260331.1,INSD:T42387.1,INSD:DR333883.1,
INSD:BP818536.1,INSD:EL032766.1,INSD:EG510381.1,
INSD:EL111476.1,INSD:BP834883.1,INSD:EL001327.1,
INSD:EL151282.1,INSD:ES132697.1,INSD:DR333900.1,
INSD:EL974582.1,INSD:BP857767.1,INSD:ES173436.1,
INSD:ES130109.1,INSD:DR333871.1,INSD:BP798891.1,
INSD:EL968393.1,INSD:EL092058.1,INSD:CB258684.1,
INSD:DR333911.1,INSD:ES152876.1,INSD:CB185650.1,
INSD:ES069949.1,INSD:EL992820.1,INSD:EL318956.1,
INSD:ES182175.1,INSD:ES061706.1,INSD:EH960836.1,
INSD:ES144073.1,INSD:AV814570.1,INSD:BP807121.1,
INSD:EH848110.1,INSD:BP813903.1,INSD:BP580017.1,
INSD:ES016366.1,INSD:BP634846.1,INSD:EL165138.1,
INSD:ES009308.1,INSD:ES108348.1,INSD:DR333893.1,
INSD:AV798150.1,INSD:BP813263.1,INSD:BP671622.1,
INSD:AV805267.1,INSD:DR333874.1,INSD:EL321397.1,
INSD:AV820820.1,INSD:EL262927.1,INSD:BP574726.1,
INSD:ES080885.1,INSD:EH963701.1,INSD:EL054673.1,
INSD:ES213127.1,INSD:EL259048.1,INSD:BP579927.1,
INSD:ES187761.1,INSD:BP569205.1,INSD:EL125257.1,
INSD:EL971289.1,INSD:DR333873.1,INSD:ES096756.1,
INSD:EL280936.1,INSD:ES190250.1,INSD:ES171431.1,
INSD:ES127173.1,INSD:ES073773.1,INSD:EL098480.1,
INSD:EL260312.1,INSD:EL147817.1,INSD:DR333880.1,
INSD:DR333869.1,INSD:ES185702.1,INSD:BP625396.1,
INSD:EL064497.1,INSD:EL311412.1,INSD:EL264644.1,
INSD:EL082771.1,INSD:BP650541.1,INSD:EL970246.1,
INSD:DR333884.1,INSD:BP861168.1,INSD:EL284106.1,
INSD:BP840765.1,INSD:EH973842.1,INSD:EL073336.1,
INSD:ES034400.1,INSD:EH947191.1,INSD:ES014385.1,
INSD:ES063143.1,INSD:EH803720.1,INSD:EH984308.1,
INSD:BP844457.1,INSD:ES043788.1,INSD:BP561995.2,
INSD:BP864320.1,INSD:BP633382.1,INSD:BP567721.1,
INSD:BP574825.1,INSD:ES105618.1,INSD:DR333910.1,
INSD:EH842076.1,INSD:EL019810.1,INSD:ES019338.1,
INSD:EH981608.1,INSD:ES088615.1,INSD:ES104869.1,
INSD:BP655711.1,INSD:AV828282.1,INSD:EL983617.1,
INSD:EL330248.1,INSD:EL970960.1,INSD:ES030022.1,
INSD:AI993017.1,INSD:EH951779.1,INSD:EL293559.1,
INSD:DR333881.1,INSD:EH967733.1,INSD:BP611257.1,
INSD:BP588342.1,INSD:EH924043.1,INSD:ES175161.1,
INSD:DR333889.1,INSD:EL146929.1,INSD:ES119815.1,
INSD:ES061744.1,INSD:ES083946.1,INSD:EL048137.1,
INSD:ES179113.1,INSD:EL235877.1,INSD:AV784860.1,
INSD:EG497686.1,INSD:EL982875.1,INSD:ES124620.1,
INSD:ES090812.1,INSD:CB258704.1,INSD:EL008193.1,
INSD:DR333877.1,INSD:DR333895.1,INSD:ES204335.1,
INSD:ES159853.1,INSD:BP632655.1,INSD:BP640262.1,
INSD:ES033794.1,INSD:BP569225.1,INSD:EL214640.1,
INSD:EL323797.1,INSD:ES097325.1,INSD:BP866467.1,
INSD:ES174967.1,INSD:ES039309.1,INSD:BP626304.1,
INSD:ES066208.1,INSD:BP569747.1,INSD:BP800980.1,
INSD:EL223494.1,INSD:ES040544.1,INSD:EH849646.1,
INSD:EH820301.1,INSD:BP655740.1,INSD:ES135413.1,
INSD:EL224420.1,INSD:AV799376.1,INSD:DR333906.1,
INSD:ES113202.1,INSD:ES210506.1,INSD:EL041742.1,
INSD:AV800948.1,INSD:EL243034.1,INSD:EL129856.1,
INSD:BP667948.1,INSD:EL311517.1,INSD:ES167049.1,
INSD:EH830316.1,INSD:AA067541.1,INSD:ES050463.1,
INSD:ES195364.1,INSD:DR333908.1,INSD:ES145576.1,
INSD:ES134878.1,INSD:ES042240.1,INSD:ES036565.1,
INSD:EH802686.1,INSD:AV803677.1,INSD:ES085908.1,
INSD:ES065226.1,INSD:ES176141.1,INSD:EL147255.1,
INSD:ES074911.1,INSD:EL230802.1,INSD:EH871961.1,
INSD:ES178200.1,INSD:ES192264.1,INSD:EL994524.1,
INSD:DR333887.1,INSD:ES021871.1,INSD:EL265337.1,
INSD:ES030506.1,INSD:ES051923.1,INSD:EL217838.1,
INSD:EL165972.1,INSD:EL272060.1,INSD:AV823805.1,
INSD:BP652170.1,INSD:DR333868.1,INSD:ES045103.1,
INSD:AV813769.1,INSD:EL096032.1,INSD:EL148278.1,
INSD:ES015395.1,INSD:DR333897.1,INSD:EH909652.1,
INSD:BP847217.1,INSD:EH945886.1,INSD:EH924767.1,
INSD:ES008235.1,INSD:EL284825.1,INSD:AV809975.1,
INSD:AV539392.1,INSD:EL281959.1,INSD:EL151935.1,
INSD:ES187796.1,INSD:EL292697.1,INSD:EL273579.1,
INSD:H37047.1,INSD:BP799900.1,INSD:EH839737.1,
INSD:BP848960.1,INSD:ES179954.1,INSD:EL095656.1,
INSD:EG453221.1,INSD:EL023780.1,INSD:BP634525.1,
INSD:AA712834.1,INSD:EL235889.1,INSD:DR333882.1,
INSD:BP860988.1,INSD:EL990811.1,INSD:EL280841.1,
INSD:AV810493.1,INSD:EL043363.1,INSD:DR333892.1,
INSD:EG497687.1,INSD:EL227608.1,INSD:ES028750.1,
INSD:BP832367.1,INSD:DR333879.1,INSD:AV800107.1,
INSD:ES007440.1,INSD:EL205184.1,INSD:EL025417.1,
INSD:BP804501.1,INSD:BP855165.1,INSD:ES003491.1,
INSD:BP855908.1,INSD:EL259184.1,INSD:EL010727.1,
INSD:ES002776.1,INSD:EH900417.1,INSD:DR333904.1,
INSD:ES062303.1,INSD:BP590885.1,INSD:EH986384.1,
INSD:EL297439.1,INSD:DR333866.1,INSD:DR333896.1,
INSD:EL255041.1,INSD:BP573087.1,INSD:DR333905.1,
INSD:BU635117.1,INSD:DR333875.1,INSD:EL019742.1,
INSD:ES161226.1,INSD:AV566088.1,INSD:BP854059.1,
INSD:EL308347.1,INSD:BU636485.1,INSD:ES122909.1,
INSD:EL025983.1,INSD:EL305149.1,INSD:EH833772.1,
INSD:EH881768.1,INSD:EH975894.1,INSD:DR333903.1,
INSD:EG510382.1,INSD:BP641558.1,INSD:EH976030.1,
INSD:AV564586.1,INSD:EL180442.1,INSD:BP867884.1,
INSD:DR333885.1,INSD:EH833074.1,INSD:ES067973.1,
INSD:BP839103.1,INSD:EH842409.1,INSD:ES145634.1,
INSD:EL224947.1,INSD:EL089512.1,INSD:AV557222.1,
INSD:ES123443.1,INSD:BP575336.1,INSD:BP863233.1,
INSD:ES007547.1,INSD:AV541419.1,INSD:EL044134.1,
INSD:AV819778.1,INSD:BP846011.1,INSD:ES124216.1,
INSD:EL970520.1,INSD:ES059928.1,INSD:ES095221.1,
INSD:EL233564.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY136319.1,INSD:AY087197.1,INSD:AY065103.1,
INSD:AK221847.1,INSD:AY054161.1,INSD:BT002427.1,
INSD:BX823967.1"
/note="ribosomal protein L5 (ATL5); FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome, 5S rRNA binding;
INVOLVED IN: in 7 processes; LOCATED IN: in 10 components;
EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal
protein L5, eukaryotic (InterPro:IPR005485), Ribosomal
protein L18/L5 (InterPro:IPR005484); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: ribosomal protein L5 B
(TAIR:AT5G39740.2); Has 1450 Blast hits to 1449 proteins
in 545 species: Archae - 345; Bacteria - 5; Metazoa - 620;
Fungi - 157; Plants - 121; Viruses - 0; Other Eukaryotes -
202 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G25520"
/db_xref="Araport:AT3G25520"
intron_pos 2:0 (1/6)
intron_pos 25:1 (2/6)
intron_pos 98:1 (3/6)
intron_pos 125:0 (4/6)
intron_pos 164:0 (5/6)
intron_pos 265:2 (6/6)
BEGIN
1 MVFVKSTKSN AYFKRYQVKF RRRRDGKTDY RARIRLINQD KNKYNTPKYR FVVRFTNKDI
61 VAQIVSASIA GDIVKASAYA HELPQYGLTV GLTNYAAAYC TGLLLARRVL KMLEMDDEYE
121 GNVEATGEDF SVEPTDSRRP FRALLDVGLI RTTTGNRVFG ALKGALDGGL DIPHSDKRFA
181 GFHKENKQLD AEIHRNYIYG GHVSNYMKLL GEDEPEKLQT HFSAYIKKGV EAESIEELYK
241 KVHAAIRADP NPKKTVKPAP KQHKRYNLKK LTYEERKNKL IERVKALNGA GGDDDDEDDE
301 E
//