LOCUS AEE76760.1 105 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Zinc-binding ribosomal protein family
protein protein.
ACCESSION CP002686-4365
PROTEIN_ID AEE76760.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT3G23390"
/gene_synonym="RPL36a A"
/gene_synonym="RPL36aA"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR299900.1,INSD:DR299955.1,INSD:ES095453.1,
INSD:DR299913.1,INSD:DR299875.1,INSD:DR299942.1,
INSD:BP580245.1,INSD:ES048875.1,INSD:AV787034.1,
INSD:EH968896.1,INSD:EL041933.1,INSD:DR299909.1,
INSD:DR299877.1,INSD:ES202464.1,INSD:EL229263.1,
INSD:DR299952.1,INSD:DR299863.1,INSD:EH819377.1,
INSD:ES087398.1,INSD:Z29118.1,INSD:EL986186.1,
INSD:ES202460.1,INSD:DR299930.1,INSD:DR299911.1,
INSD:BP566837.1,INSD:ES210559.1,INSD:ES012805.1,
INSD:DR257409.1,INSD:EH866423.1,INSD:EL036089.1,
INSD:ES050247.1,INSD:DR299869.1,INSD:ES061806.1,
INSD:DR299906.1,INSD:EL324159.1,INSD:ES094425.1,
INSD:DR299854.1,INSD:EL174550.1,INSD:ES033912.1,
INSD:ES167247.1,INSD:DR299948.1,INSD:EH828583.1,
INSD:EH835860.1,INSD:EL005301.1,INSD:EL018583.1,
INSD:EG520780.1,INSD:EH896025.1,INSD:DR299865.1,
INSD:EH913934.1,INSD:EL004318.1,INSD:BP665335.1,
INSD:DR299915.1,INSD:DR299935.1,INSD:DR299950.1,
INSD:EL129516.1,INSD:EH915740.1,INSD:DR299894.1,
INSD:DR299838.1,INSD:Z47611.1,INSD:DR299851.1,
INSD:ES202415.1,INSD:AI099561.1,INSD:DR299843.1,
INSD:AV784861.1,INSD:BP663737.1,INSD:EL247488.1,
INSD:ES124582.1,INSD:BP572584.1,INSD:DR299888.1,
INSD:BP566054.1,INSD:EH935973.1,INSD:DR299940.1,
INSD:EL244079.1,INSD:EL190849.1,INSD:DR299862.1,
INSD:ES151885.1,INSD:DR299897.1,INSD:ES158128.1,
INSD:EL039306.1,INSD:EH928670.1,INSD:ES025971.1,
INSD:DR299844.1,INSD:ES036385.1,INSD:EL062128.1,
INSD:ES210693.1,INSD:DR299847.1,INSD:EL275327.1,
INSD:BP570725.1,INSD:EH887365.1,INSD:BP842934.1,
INSD:ES173980.1,INSD:DR299933.1,INSD:ES144815.1,
INSD:EL992612.1,INSD:ES054416.1,INSD:EL971190.1,
INSD:EL085687.1,INSD:EH920111.1,INSD:EH854073.1,
INSD:DR299874.1,INSD:EL264756.1,INSD:BP579854.1,
INSD:ES012758.1,INSD:DR299925.1,INSD:DR299855.1,
INSD:ES000923.1,INSD:DR299893.1,INSD:DR299872.1,
INSD:EL035245.1,INSD:EL315832.1,INSD:DR299938.1,
INSD:ES175898.1,INSD:DR299849.1,INSD:ES108566.1,
INSD:ES144640.1,INSD:T04626.1,INSD:ES013980.1,
INSD:DR299949.1,INSD:ES035719.1,INSD:DR299879.1,
INSD:ES204342.1,INSD:BP812631.1,INSD:DR299904.1,
INSD:EL054100.1,INSD:ES146525.1,INSD:ES079187.1,
INSD:DR299943.1,INSD:DR299905.1,INSD:DR299858.1,
INSD:ES038460.1,INSD:EH949493.1,INSD:EL050004.1,
INSD:DR299926.1,INSD:DR299898.1,INSD:EL111019.1,
INSD:DR299939.1,INSD:EL002845.1,INSD:ES185687.1,
INSD:DR299850.1,INSD:EL990439.1,INSD:EH974003.1,
INSD:DR299932.1,INSD:BP580035.1,INSD:DR299951.1,
INSD:DR299886.1,INSD:BP579791.1,INSD:EL194249.1,
INSD:EH932179.1,INSD:ES039265.1,INSD:DR299861.1,
INSD:ES205794.1,INSD:EL174675.1,INSD:ES053019.1,
INSD:DR299927.1,INSD:DR299866.1,INSD:DR299860.1,
INSD:ES200782.1,INSD:DR299902.1,INSD:ES216353.1,
INSD:DR299937.1,INSD:DR299883.1,INSD:ES169745.1,
INSD:EH928029.1,INSD:EH922108.1,INSD:DR299903.1,
INSD:EL262682.1,INSD:EH903026.1,INSD:ES001808.1,
INSD:DR299917.1,INSD:EL202804.1,INSD:EH932436.1,
INSD:DR299947.1,INSD:EH874547.1,INSD:DR299891.1,
INSD:BP577744.1,INSD:DR299916.1,INSD:DR299870.1,
INSD:EL987147.1,INSD:DR299918.1,INSD:EL140779.1,
INSD:DR299945.1,INSD:DR299890.1,INSD:DR299892.1,
INSD:EL263014.1,INSD:EL094442.1,INSD:EH929303.1,
INSD:DR299857.1,INSD:EL219909.1,INSD:DR299931.1,
INSD:CK118443.1,INSD:DR299899.1,INSD:AV823806.1,
INSD:EL976634.1,INSD:DR299912.1,INSD:DR257410.1,
INSD:EL123580.1,INSD:EL181747.1,INSD:DR299848.1,
INSD:EH973877.1,INSD:ES060291.1,INSD:ES101154.1,
INSD:EL296357.1,INSD:EL193884.1,INSD:EL102536.1,
INSD:ES159822.1,INSD:DR299922.1,INSD:DR299864.1,
INSD:DR299846.1,INSD:EH873000.1,INSD:DR299882.1,
INSD:ES162661.1,INSD:EL317867.1,INSD:ES069723.1,
INSD:EL137534.1,INSD:T88421.1,INSD:ES190024.1,
INSD:DR299837.1,INSD:EL097475.1,INSD:ES071786.1,
INSD:EL150143.1,INSD:EL001027.1,INSD:EL337407.1,
INSD:BP842945.1,INSD:EL216758.1,INSD:DR299953.1,
INSD:DR299853.1,INSD:BP868801.1,INSD:EL983737.1,
INSD:BP816497.1,INSD:ES107018.1,INSD:BP821058.1,
INSD:DR299924.1,INSD:DR299856.1,INSD:DR299929.1,
INSD:EL290900.1,INSD:EH926342.1,INSD:DR299921.1,
INSD:DR245241.1,INSD:DR299920.1,INSD:ES093896.1,
INSD:DR299836.1,INSD:EL075001.1,INSD:ES073996.1,
INSD:AA394754.1,INSD:ES008948.1,INSD:DR299841.1,
INSD:DR257411.1,INSD:EH914503.1,INSD:DR372129.1,
INSD:ES002964.1,INSD:EL229740.1,INSD:ES060785.1,
INSD:BP851782.2,INSD:EL974429.1,INSD:DR299885.1,
INSD:EL279802.1,INSD:DR299884.1,INSD:ES068502.1,
INSD:DR299914.1,INSD:DR299944.1,INSD:BP669179.1,
INSD:EL234353.1,INSD:DR382308.1,INSD:BP802093.1,
INSD:EL208285.1,INSD:DR299919.1,INSD:DR299896.1,
INSD:ES151673.1,INSD:EL083624.1,INSD:ES154835.1,
INSD:DR299873.1,INSD:EH901425.1,INSD:DR299923.1,
INSD:ES151552.1,INSD:AV789431.1,INSD:ES075710.1,
INSD:AA650779.1,INSD:DR299936.1,INSD:EL248677.1,
INSD:ES201479.1,INSD:DR299910.1,INSD:ES210025.1,
INSD:EL066057.1,INSD:ES141137.1,INSD:EL325500.1,
INSD:DR299954.1,INSD:DR299907.1,INSD:EL126842.1,
INSD:BP581693.1,INSD:DR299878.1,INSD:EH868526.1,
INSD:ES158082.1,INSD:ES074106.1,INSD:DR299842.1,
INSD:BP570554.1,INSD:AV541635.1,INSD:EL283335.1,
INSD:BP822785.1,INSD:DR299876.1,INSD:DR299928.1,
INSD:DR299934.1,INSD:EL187372.1,INSD:DR299946.1,
INSD:EL004071.1,INSD:DR245240.1,INSD:DR299840.1,
INSD:BP569551.1,INSD:DR299901.1,INSD:EL304920.1,
INSD:EH858918.1,INSD:DR299881.1,INSD:DR299889.1,
INSD:DR299908.1,INSD:DR299871.1,INSD:ES149240.1,
INSD:DR299845.1,INSD:DR299887.1,INSD:ES027307.1,
INSD:ES089672.1,INSD:DR299867.1,INSD:BP856398.1,
INSD:BP665631.1,INSD:EL246244.1,INSD:ES155103.1,
INSD:EL996976.1,INSD:EL316756.1,INSD:EL058497.1,
INSD:ES138172.1,INSD:DR299880.1,INSD:EL971029.1,
INSD:AI993455.1,INSD:DR299839.1,INSD:DR299895.1,
INSD:DR299941.1,INSD:BP565429.1,INSD:DR299859.1,
INSD:EL068852.1,INSD:AA650768.1,INSD:EH860414.1,
INSD:ES095078.1,INSD:ES011815.1,INSD:EL105352.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY085174.1,INSD:AY062855.1"
/note="Zinc-binding ribosomal protein family protein;
FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED
IN: translation; LOCATED IN: ribosome, cytosolic large
ribosomal subunit; EXPRESSED IN: 24 plant structures;
EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro
DOMAIN/s: Ribosomal protein L44e (InterPro:IPR000552),
Ribosomal protein, zinc-binding domain
(InterPro:IPR011332); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: Zinc-binding ribosomal protein family protein
(TAIR:AT4G14320.1); Has 1023 Blast hits to 1019 proteins
in 360 species: Archae - 169; Bacteria - 1; Metazoa - 377;
Fungi - 167; Plants - 132; Viruses - 0; Other Eukaryotes -
177 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G23390"
/db_xref="Araport:AT3G23390"
intron_pos 2:0 (1/3)
intron_pos 62:0 (2/3)
intron_pos 87:0 (3/3)
BEGIN
1 MVNIPKTKNT YCKNKECKKH TLHKVTQYKK GKDSLAAQGK RRYDRKQSGY GGQTKPVFHK
61 KAKTTKKIVL RLQCQSCKHF SQRPIKRCKH FEIGGDKKGK GTSLF
//