LOCUS AEE76700.1 370 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana hypothetical protein (DUF506) protein.
ACCESSION CP002686-4282
PROTEIN_ID AEE76700.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT3G22970"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:BP586934.1,INSD:BX835102.1,INSD:EL237684.1,
INSD:BP801121.1,INSD:ES163440.1,INSD:ES107718.1,
INSD:EL056472.1,INSD:EL099022.1,INSD:EL337798.1,
INSD:EL196785.1,INSD:EL275564.1,INSD:EL201317.1,
INSD:ES079573.1,INSD:EH901149.1,INSD:ES152076.1,
INSD:EH975824.1,INSD:EH891841.1,INSD:ES111755.1,
INSD:AA657295.1,INSD:BP632480.1,INSD:ES118122.1,
INSD:BE527025.1,INSD:EH884826.1,INSD:BX838495.1,
INSD:ES109399.1,INSD:CD529118.1,INSD:EL238590.1,
INSD:DR278906.1,INSD:ES040486.1,INSD:ES087881.1,
INSD:EL289954.1,INSD:ES182888.1,INSD:EH848580.1,
INSD:EH843179.1,INSD:EH994847.1,INSD:EL144323.1,
INSD:EH856677.1,INSD:ES010243.1,INSD:ES214439.1,
INSD:EH952362.1,INSD:EL239273.1,INSD:EL982768.1,
INSD:AV825771.1,INSD:EL017449.1,INSD:ES167991.1,
INSD:ES011678.1,INSD:AA395282.1,INSD:EL303648.1,
INSD:T42393.1,INSD:ES111650.1,INSD:EL153013.1,
INSD:EL231793.1,INSD:ES138450.1,INSD:EL204872.1,
INSD:BP671644.1,INSD:EH811889.1,INSD:ES135438.1,
INSD:BP867230.1,INSD:AV547988.1,INSD:ES052334.1,
INSD:ES118884.1,INSD:BX836834.1,INSD:T42887.1,
INSD:EL216791.1,INSD:EH967843.1,INSD:BU635318.1,
INSD:ES089895.1,INSD:ES158421.1,INSD:ES096827.1,
INSD:EL250388.1,INSD:CA781741.1,INSD:EL096689.1,
INSD:BP869120.1,INSD:EL022663.1,INSD:EL281310.1,
INSD:ES114349.1,INSD:EL205556.1,INSD:EH986166.1,
INSD:EH890937.1,INSD:EL166909.1,INSD:T41857.1,
INSD:BX834252.1,INSD:ES122337.1,INSD:BP583681.1,
INSD:ES094173.1,INSD:AI993959.1,INSD:ES095921.1,
INSD:EL229997.1,INSD:ES108468.1,INSD:BP626308.1,
INSD:AA713068.1,INSD:EH858735.1,INSD:EL298406.1,
INSD:CB260387.1,INSD:BP591030.1,INSD:BP573353.1,
INSD:BP810268.1,INSD:BP580728.1,INSD:EL338380.1,
INSD:ES090678.1,INSD:EL327414.1,INSD:BP801094.1,
INSD:EH816199.1,INSD:EL262308.1,INSD:EH817254.1,
INSD:BP591872.1,INSD:EH835846.1,INSD:EH865566.1,
INSD:AV792344.1,INSD:ES097988.1,INSD:EL009292.1,
INSD:EL220402.1,INSD:ES077633.1,INSD:DR278904.1,
INSD:ES066773.1,INSD:DR379324.1,INSD:AV805112.1,
INSD:ES214273.1,INSD:DR278905.1,INSD:ES085319.1,
INSD:EL257189.1,INSD:EH859591.1,INSD:BP567123.1,
INSD:EL025181.1,INSD:EL318172.1,INSD:EH821264.1,
INSD:EL143821.1,INSD:ES161821.1,INSD:EL203758.1,
INSD:EH825594.1,INSD:ES140169.1,INSD:EL173843.1,
INSD:EH869117.1,INSD:ES126806.1,INSD:EH940518.1,
INSD:BP590074.1,INSD:ES101533.1,INSD:ES095861.1,
INSD:ES202757.1,INSD:ES000067.1,INSD:EH978208.1,
INSD:EH908280.1,INSD:ES108820.1,INSD:EL042391.1,
INSD:ES096568.1,INSD:EL149136.1,INSD:EH845284.1,
INSD:ES051495.1,INSD:N38259.1,INSD:ES060639.1,
INSD:ES049406.1,INSD:EL335784.1,INSD:EL326781.1,
INSD:ES082010.1,INSD:ES049858.1,INSD:BP632631.1,
INSD:EL151306.1,INSD:EL988860.1,INSD:EL992990.1,
INSD:EL278401.1,INSD:ES125720.1,INSD:EH889384.1,
INSD:ES095218.1,INSD:EL036470.1,INSD:EH903446.1,
INSD:AV560849.1,INSD:EL296469.1,INSD:EL229457.1,
INSD:EL234556.1,INSD:EH963127.1,INSD:DR291385.1,
INSD:EH837943.1,INSD:BP570223.1,INSD:EL999393.1,
INSD:EL293985.1,INSD:BX837126.1,INSD:EL335910.1,
INSD:EL134537.1,INSD:EL221752.1,INSD:EL230167.1,
INSD:DR291386.1,INSD:BP795776.1,INSD:EL285904.1,
INSD:AV806027.1,INSD:EH832417.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BT024897.1,INSD:BX822581.1,INSD:BX823639.1,
INSD:BT003335.1"
/note="Protein of unknown function (DUF506); FUNCTIONS IN:
molecular_function unknown; INVOLVED IN:
biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast;
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function
DUF506, plant (InterPro:IPR006502); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: Protein of unknown function
(DUF506) (TAIR:AT4G14620.1); Has 397 Blast hits to 394
proteins in 24 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa
- 0; Fungi - 0; Plants - 395; Viruses - 0; Other
Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G22970"
/db_xref="Araport:AT3G22970"
intron_pos 136:0 (1/2)
intron_pos 199:1 (2/2)
BEGIN
1 MPFTMKIQPI DIDSSPTVAR AESGNKPVLK SRLKRLFDRP FTNVLRNSTT TTTEKPFVVT
61 GGEVQCGGVV TEFEPSSVCL AKMVQNFIEE NNEKQAKCGR NRCNCFNGNN DGSSDDESDL
121 FGGSIDGCDA SDHLKSLIPC TTVGERNLLA DAAKIVDKNK SVKRKDDMKK IVNEGLLSLN
181 YNSSICKSKW DKSPSFPAGE YEYIDVIIGE ERLIIDVDFR SEFDIARQTS GYKVLLQSLP
241 FIFVGKSDRL SQIVFLISEA AKQSLKKKGM PFPPWRKAEY MRSKWLSSYT RASVVVVDET
301 VTVTDVTAAD AAVEKEVDSV EIELVFEEKC LSPRVIVNSS SSPTDGDDDV AVEREVKAVT
361 GLASLFKEKP
//