LOCUS AEE76607.1 135 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Ribosomal L27e protein family protein.
ACCESSION CP002686-4160
PROTEIN_ID AEE76607.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT3G22230"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:BP847469.1,INSD:ES107059.1,INSD:ES037710.1,
INSD:ES019629.1,INSD:ES174707.1,INSD:EL133879.1,
INSD:EH879878.1,INSD:EH833164.1,INSD:ES107047.1,
INSD:EL152819.1,INSD:BP592178.1,INSD:EG499896.1,
INSD:ES059392.1,INSD:EG509702.1,INSD:EL988464.1,
INSD:EH804121.1,INSD:EL268389.1,INSD:AV556587.1,
INSD:EL195289.1,INSD:BP627621.1,INSD:ES021429.1,
INSD:AV550432.1,INSD:EL144038.1,INSD:EH837238.1,
INSD:ES065689.1,INSD:EL284390.1,INSD:ES078749.1,
INSD:EL041873.1,INSD:EL040943.1,INSD:EL282657.1,
INSD:ES029843.1,INSD:ES160207.1,INSD:EL333514.1,
INSD:ES039650.1,INSD:AA712439.1,INSD:ES101942.1,
INSD:EH904080.1,INSD:EL220066.1,INSD:EL972685.1,
INSD:EG517288.1,INSD:EL067362.1,INSD:EH986419.1,
INSD:ES172726.1,INSD:ES190332.1,INSD:EL260347.1,
INSD:ES053512.1,INSD:EL969676.1,INSD:EL040016.1,
INSD:ES098144.1,INSD:AV819234.1,INSD:ES116170.1,
INSD:ES043703.1,INSD:EL200932.1,INSD:EH946464.1,
INSD:EL991091.1,INSD:AW004270.1,INSD:Z35628.1,
INSD:EL134215.1,INSD:EL231661.1,INSD:ES014900.1,
INSD:EH820676.1,INSD:ES186970.1,INSD:AV533552.1,
INSD:EG517280.1,INSD:ES011899.1,INSD:ES062127.1,
INSD:EL105961.1,INSD:EL989376.1,INSD:EL177265.1,
INSD:EG512903.1,INSD:AV531326.1,INSD:EL968217.1,
INSD:DR301276.1,INSD:EL174070.1,INSD:ES004755.1,
INSD:EL001124.1,INSD:EL179178.1,INSD:EL102283.1,
INSD:EH958475.1,INSD:ES095638.1,INSD:EL273963.1,
INSD:EL250383.1,INSD:ES029869.1,INSD:EL137971.1,
INSD:EL037782.1,INSD:EG512881.1,INSD:EL078049.1,
INSD:ES074848.1,INSD:EL973452.1,INSD:ES036778.1,
INSD:ES189200.1,INSD:EH933043.1,INSD:EL995036.1,
INSD:ES137485.1,INSD:ES190956.1,INSD:ES152562.1,
INSD:DR264067.1,INSD:ES197522.1,INSD:EL247480.1,
INSD:ES095443.1,INSD:EL110444.1,INSD:ES051100.1,
INSD:ES094999.1,INSD:EL997230.1,INSD:BU636000.1,
INSD:EL108221.1,INSD:EL313040.1,INSD:ES160460.1,
INSD:ES124172.1,INSD:EH797363.1,INSD:EH988993.1,
INSD:EH986108.1,INSD:EH957941.1,INSD:AV790568.1,
INSD:EL306181.1,INSD:EL195219.1,INSD:EL135742.1,
INSD:EL157453.1,INSD:EL017692.1,INSD:EH803922.1,
INSD:EL318070.1,INSD:ES174579.1,INSD:BP627432.1,
INSD:EL008130.1,INSD:ES081849.1,INSD:ES058502.1,
INSD:EH830929.1,INSD:ES161528.1,INSD:ES117626.1,
INSD:EL975837.1,INSD:EL289345.1,INSD:ES204208.1,
INSD:EL010821.1,INSD:ES032155.1,INSD:EG512905.1,
INSD:EG480771.1,INSD:ES086553.1,INSD:EL998362.1,
INSD:BP865840.2,INSD:ES207321.1,INSD:ES203048.1,
INSD:BP561380.1,INSD:EL140743.1,INSD:EL072803.1,
INSD:EH894036.1,INSD:ES141858.1,INSD:AV826784.1,
INSD:EL189838.1,INSD:EL298205.1,INSD:EH842303.1,
INSD:EH933328.1,INSD:ES128565.1,INSD:EL069778.1,
INSD:EL993479.1,INSD:EH885928.1,INSD:BP622312.1,
INSD:AV796250.1,INSD:ES133571.1,INSD:EL152776.1,
INSD:ES008879.1,INSD:EH816174.1,INSD:ES205292.1,
INSD:EG518491.1,INSD:EH993197.1,INSD:EL260947.1,
INSD:EL011579.1,INSD:EL226637.1,INSD:ES086433.1,
INSD:EH800883.1,INSD:ES064829.1,INSD:EG499864.1,
INSD:EL060022.1,INSD:EH798132.1,INSD:EL298155.1,
INSD:DR264065.1,INSD:ES184330.1,INSD:ES170653.1,
INSD:EH929892.1,INSD:EL340727.1,INSD:DR264063.1,
INSD:EH832461.1,INSD:ES014603.1,INSD:ES095254.1,
INSD:EL979626.1,INSD:ES204418.1,INSD:EL330570.1,
INSD:EL215857.1,INSD:ES173929.1,INSD:EG509543.1,
INSD:ES109607.1,INSD:ES083284.1,INSD:EL298785.1,
INSD:ES078514.1,INSD:ES000556.1,INSD:BP852427.1,
INSD:EL192466.1,INSD:ES214276.1,INSD:ES178298.1,
INSD:EL968317.1,INSD:EL068966.1,INSD:DR264073.1,
INSD:BP592678.1,INSD:ES007645.1,INSD:DR373991.1,
INSD:EH954976.1,INSD:EL268551.1,INSD:ES009432.1,
INSD:AA712799.1,INSD:EL200488.1,INSD:EL299132.1,
INSD:ES088815.1,INSD:ES213318.1,INSD:EG512879.1,
INSD:ES196261.1,INSD:ES192671.1,INSD:ES142457.1,
INSD:BP859448.1,INSD:ES067515.1,INSD:EG481337.1,
INSD:EL210398.1,INSD:EH896255.1,INSD:EL091235.1,
INSD:T46687.1,INSD:EL330806.1,INSD:EH915331.1,
INSD:EL271165.1,INSD:ES034429.1,INSD:BE039287.1,
INSD:CK120911.1,INSD:EL971095.1,INSD:EL146462.1,
INSD:ES020819.1,INSD:ES072641.1,INSD:EL281195.1,
INSD:EH829538.1,INSD:ES060219.1,INSD:ES046723.1,
INSD:ES042300.1,INSD:EL184842.1,INSD:ES171396.1,
INSD:EL987930.1,INSD:EH935391.1,INSD:EH830594.1,
INSD:ES086226.1,INSD:EL094135.1,INSD:BP567889.1,
INSD:EL064701.1,INSD:EL283814.1,INSD:EG480769.1,
INSD:ES194301.1,INSD:EH926175.1,INSD:EL222488.1,
INSD:ES108268.1,INSD:EL081942.1,INSD:EH985588.1,
INSD:ES140939.1,INSD:AV792502.1,INSD:ES199796.1,
INSD:BP850720.1,INSD:EL973190.1,INSD:ES175728.1,
INSD:EH860473.1,INSD:EH830158.1,INSD:ES030366.1,
INSD:EL118966.1,INSD:EL991171.1,INSD:EL203499.1,
INSD:ES153509.1,INSD:ES129591.1,INSD:EL338532.1,
INSD:ES177143.1,INSD:ES104413.1,INSD:EL021024.1,
INSD:EL277535.1,INSD:ES151459.1,INSD:EL031532.1,
INSD:Z17507.1,INSD:ES065323.1,INSD:DR264074.1,
INSD:ES177561.1,INSD:EL984234.1,INSD:EL340615.1,
INSD:EL982114.1,INSD:ES123466.1,INSD:EL074045.1,
INSD:ES205920.1,INSD:DR264068.1,INSD:EH962804.1,
INSD:EL316079.1,INSD:EH955420.1,INSD:EH940584.1,
INSD:EL004013.1,INSD:BP867860.1,INSD:EL295562.1,
INSD:ES145156.1,INSD:EL067751.1,INSD:EL205931.1,
INSD:ES148227.1,INSD:ES165189.1,INSD:ES146957.1,
INSD:EH988379.1,INSD:ES064684.1,INSD:EH983116.1,
INSD:ES026799.1,INSD:EL193896.1,INSD:EL992665.1,
INSD:EL006969.1,INSD:ES089071.1,INSD:EL275426.1,
INSD:EH853043.1,INSD:EL236098.1,INSD:ES063595.1,
INSD:ES085422.1,INSD:EG509699.1,INSD:ES017230.1,
INSD:ES021980.1,INSD:EL254869.1,INSD:EG517281.1,
INSD:EH869716.1,INSD:EL986970.1,INSD:EL186667.1,
INSD:EL987158.1,INSD:EL130203.1,INSD:EL065613.1,
INSD:EH877913.1,INSD:EL294304.1,INSD:EH938459.1,
INSD:ES091153.1,INSD:EH980330.1,INSD:EG518492.1,
INSD:EH852863.1,INSD:EL200959.1,INSD:ES150281.1,
INSD:ES143744.1,INSD:ES036289.1,INSD:ES000640.1,
INSD:ES182257.1,INSD:ES183847.1,INSD:EL104191.1,
INSD:ES057267.1,INSD:EL059118.1,INSD:ES192483.1,
INSD:EL254308.1,INSD:ES165238.1,INSD:EL125301.1,
INSD:BP860803.1,INSD:ES175632.1,INSD:EH928293.1,
INSD:ES096361.1,INSD:EH858221.1,INSD:EL040369.1,
INSD:EL025536.1,INSD:DR264061.1,INSD:BE844684.1,
INSD:EH957182.1,INSD:EG481339.1,INSD:EL008948.1,
INSD:AA712785.1,INSD:EL168280.1,INSD:AV820497.1,
INSD:EL013365.1,INSD:BP593043.1,INSD:EL053746.1,
INSD:EH915250.1,INSD:ES002354.1,INSD:EL245713.1,
INSD:EL066094.1,INSD:EH989379.1,INSD:ES072752.1,
INSD:EH822909.1,INSD:ES112273.1,INSD:EL334112.1,
INSD:ES082466.1,INSD:EL059388.1,INSD:EH857976.1,
INSD:ES197083.1,INSD:ES179925.1,INSD:EL017163.1,
INSD:EL151523.1,INSD:ES063833.1,INSD:ES077043.1,
INSD:ES103006.1,INSD:ES000107.1,INSD:ES057133.1,
INSD:EH984401.1,INSD:ES177084.1,INSD:EL137835.1,
INSD:EL069546.1,INSD:EH867185.1,INSD:ES205896.1,
INSD:ES207912.1,INSD:ES001137.1,INSD:DR264069.1,
INSD:BP641057.1,INSD:EH993432.1,INSD:ES212723.1,
INSD:DR264064.1,INSD:EL247251.1,INSD:ES150221.1,
INSD:EH926806.1,INSD:ES139129.1,INSD:EH911409.1,
INSD:EL227044.1,INSD:EL057825.1,INSD:EH796610.1,
INSD:DR301273.1,INSD:EL062956.1,INSD:EL025882.1,
INSD:EH986699.1,INSD:ES052654.1,INSD:ES152190.1,
INSD:ES067003.1,INSD:ES007968.1,INSD:EL221053.1,
INSD:EL213645.1,INSD:ES053905.1,INSD:EL037299.1,
INSD:ES202285.1,INSD:Z35388.1,INSD:R90673.1,
INSD:EL002956.1,INSD:ES109891.1,INSD:ES182984.1,
INSD:DR264075.1,INSD:AV832306.1,INSD:EL058858.1,
INSD:ES093380.1,INSD:EG523871.1,INSD:ES201289.1,
INSD:EL980529.1,INSD:EL303311.1,INSD:EH841758.1,
INSD:ES110009.1,INSD:AV534559.1,INSD:EL982261.1,
INSD:EH836813.1,INSD:ES137969.1,INSD:ES042599.1,
INSD:EL244764.1,INSD:ES194888.1,INSD:ES174895.1,
INSD:ES016188.1,INSD:EL969328.1,INSD:EH887238.1,
INSD:EL002808.1,INSD:ES201316.1,INSD:ES060185.1,
INSD:ES213684.1,INSD:EH821962.1,INSD:EL224824.1,
INSD:EH944935.1,INSD:ES032051.1,INSD:EG512877.1,
INSD:ES171434.1,INSD:EL987339.1,INSD:ES142591.1,
INSD:ES047996.1,INSD:EL297713.1,INSD:EH818001.1,
INSD:EL194066.1,INSD:ES044101.1,INSD:EH923607.1,
INSD:DR264066.1,INSD:ES172162.1,INSD:EL987441.1,
INSD:EH913009.1,INSD:EL992834.1,INSD:EH811021.1,
INSD:ES174392.1,INSD:EL278464.1,INSD:ES020893.1,
INSD:EL981015.1,INSD:EL301803.1,INSD:ES069234.1,
INSD:EL243960.1,INSD:EL070472.1,INSD:ES036902.1,
INSD:EH951048.1,INSD:EL250844.1,INSD:ES080562.1,
INSD:BP627032.1,INSD:EH983569.1,INSD:EL991959.1,
INSD:EL976640.1,INSD:ES006702.1,INSD:EL989579.1,
INSD:ES075397.1,INSD:EL148004.1,INSD:EH841269.1,
INSD:ES187676.1,INSD:EH879365.1,INSD:EL044406.1,
INSD:EL147829.1,INSD:DR264062.1,INSD:ES134205.1,
INSD:BP568131.1,INSD:ES121693.1,INSD:ES170259.1,
INSD:ES215252.1,INSD:EH883679.1,INSD:EH964258.1,
INSD:EL332717.1,INSD:ES198576.1,INSD:EH828614.1,
INSD:EL003291.1,INSD:EH818778.1,INSD:EH867711.1,
INSD:ES007553.1,INSD:ES026653.1,INSD:CK117981.1,
INSD:EH856541.1,INSD:EH902674.1,INSD:ES155009.1,
INSD:ES172076.1,INSD:EH881130.1,INSD:EH972643.1,
INSD:ES081419.1,INSD:EG499863.1,INSD:ES207011.1,
INSD:EL289722.1,INSD:ES188596.1,INSD:EL055150.1,
INSD:EL994517.1,INSD:DR264071.1,INSD:EH869033.1,
INSD:ES167103.1,INSD:DR264070.1,INSD:EG512874.1,
INSD:EG523872.1,INSD:EL230953.1,INSD:DR264072.1,
INSD:DR264076.1,INSD:BP841924.1,INSD:EL125187.1,
INSD:ES150937.1,INSD:EH881577.1,INSD:EL254371.1,
INSD:EL130514.1,INSD:EL078419.1,INSD:ES204414.1,
INSD:EL145184.1,INSD:ES049679.1,INSD:ES214866.1,
INSD:ES137053.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX823175.1,INSD:AY091218.1,INSD:AY093389.1,
INSD:AY136321.1,INSD:AY086536.1,INSD:BX822979.1,
INSD:AY063860.1,INSD:AY062617.1,INSD:BT000418.1"
/note="Ribosomal L27e protein family; FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome; INVOLVED IN:
translation, ribosome biogenesis; LOCATED IN: cytosolic
ribosome, ribosome, cytosolic large ribosomal subunit;
EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal
protein L27e, conserved site (InterPro:IPR018262),
Ribosomal protein L27e (InterPro:IPR001141); BEST
Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal L27e
protein family (TAIR:AT4G15000.1); Has 765 Blast hits to
765 proteins in 292 species: Archae - 0; Bacteria - 0;
Metazoa - 342; Fungi - 149; Plants - 139; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 135 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G22230"
/db_xref="Araport:AT3G22230"
BEGIN
1 MVKFLKQNKA VILLQGRYAG KKAVIIKSFD DGTSDRRYGH CLVAGLKKYP SKVIRKDSAK
61 KTAKKSRVKC FIKLVNYQHL MPTRYTLDVD LKEVATLDAL KSKDKKVTAL KEAKAKLEER
121 FKTGKNRWFF TKLRF
//