LOCUS AEE75832.1 276 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Legume lectin family protein protein.
ACCESSION CP002686-3082
PROTEIN_ID AEE75832.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT3G16530"
/gene_synonym="MDC8.19"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL172689.1,INSD:EH991067.1,INSD:EL079738.1,
INSD:EL019730.1,INSD:EH801761.1,INSD:EL061374.1,
INSD:EL077838.1,INSD:EL266460.1,INSD:EH960841.1,
INSD:EL315425.1,INSD:EH976392.1,INSD:EL011847.1,
INSD:EL220345.1,INSD:EL045633.1,INSD:EH816037.1,
INSD:EL070315.1,INSD:AV442370.1,INSD:EL101872.1,
INSD:EL083461.1,INSD:EH886319.1,INSD:EH813636.1,
INSD:EH888013.1,INSD:EL083447.1,INSD:EL233762.1,
INSD:EH852744.1,INSD:EL293379.1,INSD:BP855331.1,
INSD:EL331876.1,INSD:EL255639.1,INSD:EL014273.1,
INSD:EL327716.1,INSD:EL311154.1,INSD:EL054859.1,
INSD:EH862155.1,INSD:BP843982.1,INSD:CB261741.1,
INSD:EL248870.1,INSD:BP663170.1,INSD:EL089872.1,
INSD:EL259798.1,INSD:AV521509.1,INSD:EG517579.1,
INSD:BP862264.1,INSD:BP860615.1,INSD:EH837060.1,
INSD:EH879636.1,INSD:EL010117.1,INSD:BP670965.1,
INSD:EL058659.1,INSD:EL132938.1,INSD:EL164006.1,
INSD:AV828027.1,INSD:EH956025.1,INSD:EH968532.1,
INSD:CB185502.1,INSD:H37303.1,INSD:CD531271.1,
INSD:EH828415.1,INSD:EL028577.1,INSD:EH967340.1,
INSD:EH974360.1,INSD:EH994436.1,INSD:EH848016.1,
INSD:EL088071.1,INSD:EG517580.1,INSD:EL063640.1,
INSD:EL082517.1,INSD:EL005942.1,INSD:AI993358.1,
INSD:EH928543.1,INSD:EH884284.1,INSD:EH829250.1,
INSD:EH915630.1,INSD:EL138122.1,INSD:EL071730.1,
INSD:AV800203.1,INSD:EG504713.1,INSD:EL020022.1,
INSD:EH900410.1,INSD:EL274031.1,INSD:EL017786.1,
INSD:EL229356.1,INSD:EL075200.1,INSD:EH862372.1,
INSD:EL322499.1,INSD:EL317022.1,INSD:EL253616.1,
INSD:EL083229.1,INSD:EL137380.1,INSD:EL050687.1,
INSD:EL207482.1,INSD:EL001936.1,INSD:EH828376.1,
INSD:EH989642.1,INSD:EH810933.1,INSD:EL287168.1,
INSD:EL276307.1,INSD:EL045246.1,INSD:EL221913.1,
INSD:EH864673.1,INSD:EH810252.1,INSD:EH878134.1,
INSD:EH890368.1,INSD:EL071579.1,INSD:EH863810.1,
INSD:EL250580.1,INSD:EL127425.1,INSD:EL330338.1,
INSD:EL018886.1,INSD:EL201221.1,INSD:BP671124.1,
INSD:EL168461.1,INSD:BP860658.1,INSD:EL238806.1,
INSD:EH847113.1,INSD:EL156463.1,INSD:EL154306.1,
INSD:EH965292.1,INSD:EH868759.1,INSD:EH898808.1,
INSD:EH905306.1,INSD:EL124498.1,INSD:EL135610.1,
INSD:EH994881.1,INSD:EH869060.1,INSD:EL086924.1,
INSD:EH925043.1,INSD:N37631.1,INSD:EL331666.1,
INSD:EL299221.1,INSD:EL280296.1,INSD:EH938106.1,
INSD:EH889649.1,INSD:EL088191.1,INSD:EH872349.1,
INSD:BP842898.1,INSD:EL055833.1,INSD:EH816432.1,
INSD:EL220366.1,INSD:EL131238.1,INSD:EL263917.1,
INSD:EL005606.1,INSD:EL176779.1,INSD:BP782548.1,
INSD:EL175502.1,INSD:EH953540.1,INSD:EL119274.1,
INSD:EL160728.1,INSD:EL301218.1,INSD:EL174866.1,
INSD:EL286486.1,INSD:EL254412.1,INSD:EH974438.1,
INSD:EL013683.1,INSD:BP632195.1,INSD:EL061056.1,
INSD:EL323956.1,INSD:EL020625.1,INSD:EH891189.1,
INSD:EH879758.1,INSD:EH992968.1,INSD:EH862039.1,
INSD:EL187941.1,INSD:BP856438.1,INSD:EL070170.1,
INSD:EL217794.1,INSD:EL030148.1,INSD:EL331176.1,
INSD:EH831055.1,INSD:EH967699.1,INSD:EL179947.1,
INSD:EH842856.1,INSD:EH903717.1,INSD:AV811687.1,
INSD:EH984747.1,INSD:EL214060.1,INSD:EL159198.1,
INSD:AV537258.1,INSD:BP854377.1,INSD:EL114751.1,
INSD:EL245940.1,INSD:EH842969.1,INSD:EL281793.1,
INSD:EL002005.1,INSD:EL263733.1,INSD:EH941425.1,
INSD:EL306422.1,INSD:BP855734.1,INSD:EH973475.1,
INSD:EL123034.1,INSD:EL050067.1,INSD:EL187929.1,
INSD:DR368974.1,INSD:EH981387.1,INSD:EH849094.1,
INSD:EH959168.1,INSD:EL070106.1,INSD:EH827744.1,
INSD:EL161299.1,INSD:EL119117.1,INSD:EH857740.1,
INSD:EH925265.1,INSD:EL151070.1,INSD:EL322269.1,
INSD:EH798433.1,INSD:EH889719.1,INSD:BP852652.1,
INSD:BP664751.1,INSD:EL280582.1,INSD:EL234846.1,
INSD:EL310659.1,INSD:EL238301.1,INSD:EL079236.1,
INSD:EH907057.1,INSD:EH874631.1,INSD:EH856618.1,
INSD:AV830406.1,INSD:EL179220.1,INSD:EL016995.1,
INSD:EH820000.1,INSD:EH884434.1,INSD:EL059086.1,
INSD:EL058783.1,INSD:EL212051.1,INSD:EH853067.1,
INSD:BP842854.1,INSD:BP668720.1,INSD:EL319836.1,
INSD:EL107145.1,INSD:EL165938.1,INSD:EL285526.1,
INSD:EH812531.1,INSD:T75902.1,INSD:EG504712.1,
INSD:BP851234.1,INSD:EG487810.1,INSD:AV441248.1,
INSD:EL303153.1,INSD:EL205288.1,INSD:EL325676.1,
INSD:BP662787.1,INSD:BP844982.1,INSD:EL067921.1,
INSD:EL087795.1,INSD:EL007122.1,INSD:EL069327.1,
INSD:EL259997.1,INSD:EL087441.1,INSD:EL185175.1,
INSD:EL200733.1,INSD:EL311868.1,INSD:EL142285.1,
INSD:EH928780.1,INSD:EL225206.1,INSD:EL121518.1,
INSD:EH986949.1,INSD:EH820975.1,INSD:EL012903.1,
INSD:EL337690.1,INSD:EL107780.1,INSD:EH827525.1,
INSD:EH916009.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AF428361.1,INSD:AY066032.1,INSD:AY054194.1"
/note="Legume lectin family protein; FUNCTIONS IN:
carbohydrate binding, binding; INVOLVED IN: response to
chitin; LOCATED IN: apoplast, cell wall, nucleus,
plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 16 plant structures;
EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro
DOMAIN/s: Legume lectin, beta chain (InterPro:IPR001220),
Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
(InterPro:IPR013320), Concanavalin A-like lectin/glucanase
(InterPro:IPR008985), Lectin (InterPro:IPR016363); BEST
Arabidopsis thaliana protein match is: Legume lectin
family protein (TAIR:AT3G15356.1); Has 2027 Blast hits to
2006 proteins in 125 species: Archae - 0; Bacteria - 24;
Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 1986; Viruses - 0; Other
Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G16530"
/db_xref="Araport:AT3G16530"
BEGIN
1 MQIHKLCFLV LFLANAAFAV KFNFDSFDGS NLLFLGDAEL GPSSDGVSRS GALSMTRDEN
61 PFSHGQGLYI NQIPFKPSNT SSPFSFETSF TFSITPRTKP NSGQGFAFII TPEADNSGAS
121 DGGYLGILNK TNDGKPENHI LAIEFDTFQN KEFLDISGNH VGVNINSMTS LVAEKAGYWV
181 QTRVGKRKVW SFKDVNLSSG ERFKAWVEFR NKDSTITVTL APENVKKPKR ALIEAPRVLN
241 EVLLQNMYAG FAGSMGRAVE RHDIWSWSFE NAAKNN
//